ID BAF13536; SV 2; linear; genomic DNA; CON; PLN; 696 BP. XX PA AP008209.2 XX PR Project:PRJNA13141; XX DT 02-FEB-2005 (Rel. 82, Created) DT 27-AUG-2009 (Rel. 101, Last updated, Version 8) XX DE Oryza sativa Japonica Group (Japanese rice) hypothetical protein XX KW . XX OS Oryza sativa Japonica Group (Japanese rice) OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; OC Spermatophyta; Magnoliopsida; Liliopsida; Poales; Poaceae; BOP clade; OC Oryzoideae; Oryzeae; Oryzinae; Oryza; Oryza sativa. XX RN [1] RA Sasaki T.; RT ; RL Submitted (25-OCT-2004) to the INSDC. RL Contact:Takuji Sasaki National Institute of Agrobiological Sciences, Rice RL Genome Research Program; Kannondai 2-1-2, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, Japan RL URL :http://rgp.dna.affrc.go.jp/ XX RN [2] RG IRGSP(International Rice Genome Sequencing Project) RA ; RT "Oryza sativa nipponbare(GA3) genomic DNA, chromosome 3"; RL Unpublished. XX RN [3] RG International Rice Genome Sequencing Project RA Matsumoto T., Wu J., Kanamori H., Katayose Y., Fujisawa M., Namiki N., RA Mizuno H., Yamamoto K., Antonio B.A., Baba T., Sakata K., Nagamura Y., RA Aoki H., Arikawa K., Arita K., Bito T., Chiden Y., Fujitsuka N., RA Fukunaka R., Hamada M., Harada C., Hayashi A., Hijishita S., Honda M., RA Hosokawa S., Ichikawa Y., Idonuma A., Iijima M., Ikeda M., Ikeno M., RA Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K., RA Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H., Kobayashi N., RA Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T., Mukai Y., Nagasaki H., RA Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y., Nakamichi Y., Nakamura M., RA Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T., Okamoto M., Ono N., Saji S., RA Sakaguchi M., Sakai K., Shibata M., Shimokawa T., Song J., Takazaki Y., RA Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K., Ueda S., Waki K., Yamagata H., RA Yamamoto M., Yamamoto S., Yamane H., Yoshiki S., Yoshihara R., Yukawa K., RA Zhong H., Yano M., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Jones K.M., Gansberger K., RA Moffat K., Hill J., Bera J., Fadrosh D., Jin S., Johri S., Kim M., RA Overton L., Reardon M., Tsitrin T., Vuong H., Weaver B., Ciecko A., RA Tallon L., Jackson J., Pai G., Aken S.V., Utterback T., Reidmuller S., RA Feldblyum T., Hsiao J., Zismann V., Iobst S., de Vazeille A.R., Buell C.R., RA Ying K., Li Y., Lu T., Huang Y., Zhao Q., Feng Q., Zhang L., Zhu J., RA Weng Q., Mu J., Lu Y., Fan D., Liu Y., Guan J., Zhang Y., Yu S., Liu X., RA Zhang Y., Hong G., Han B., Choisne N., Demange N., Orjeda G., Samain S., RA Cattolico L., Pelletier E., Couloux A., Segurens B., Wincker P., D'Hont A., RA Scarpelli C., Weissenbach J., Salanoubat M., Quetier F., Yu Y., Kim H.R., RA Rambo T., Currie J., Collura K., Luo M., Yang T., Ammiraju J.S.S., RA Engler F., Soderlund C., Wing R.A., Palmer L.E., de la Bastide M., RA Spiegel L., Nascimento L., Zutavern T., O'Shaughnessy A., Dike S., RA Dedhia N., Preston R., Balija V., McCombie W.R., Chow T., Chen H., RA Chung M., Chen C., Shaw J., Wu H., Hsiao K., Chao Y., Chu M., Cheng C., RA Hour A., Lee P., Lin S., Lin Y., Liou J., Liu S., Hsing Y., Raghuvanshi S., RA Mohanty A., Bharti A.K., Gaur A., Gupta V., Kumar D., Ravi V., Vij S., RA Kapur A., Khurana P., Khurana P., Khurana J.P., Tyagi A.K., Gaikwad K., RA Singh A., Dalal V., Srivastava S., Dixit A., Pal A.K., Ghazi I.A., RA Yadav M., Pandit A., Bhargava A., Sureshbabu K., Batra K., Sharma T.R., RA Mohapatra T., Singh N.K., Messing J., Nelson A.B., Fuks G., Kavchok S., RA Keizer G., Linton E., Llaca V., Song R., Tanyolac B., Young S., Ho-Il K., RA Hahn J.H., Sangsakoo G., Vanavichit A., de Mattos Luiz.A.T., Zimmer P.D., RA Malone G., Dellagostin O., de Oliveira A.C., Bevan M., Bancroft I., RA Minx P., Cordum H., Wilson R., Cheng Z., Jin W., Jiang J., Leong S.A., RA Iwama H., Gojobori T., Itoh T., Niimura Y., Fujii Y., Habara T., Sakai H., RA Sato Y., Wilson G., Kumar K., McCouch S., Juretic N., Hoen D., Wright S., RA Bruskiewich R., Bureau T., Miyao A., Hirochika H., Nishikawa T., RA Kadowaki K., Sugiura M., Burr B., Sasaki T.; RT "The map-based sequence of the rice genome"; RL Nature 436:793-800(2005). XX RN [4] RG The Rice Annotation Project (RAP) RA ; RT "The Second Rice Annotation Project Meeting (RAP2)"; RL Unpublished. XX RN [5] RX DOI; 10.1093/nar/gkj094. RX PUBMED; 16381971. RA Ohyanagi H., Tanaka T., Sakai H., Shigemoto Y., Yamaguchi K., Habara T., RA Fujii Y., Antonio B.A., Nagamura Y., Imanishi T., Ikeo K., Itoh T., RA Gojobori T., Sasaki T.; RT "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): hub for Oryza sativa ssp. RT japonica genome information"; RL Nucleic Acids Res. 34(Database issue):D741-D744(2006). XX RN [6] RG The Rice Annotation Project (RAP) RA Itoh T., Tanaka T., Barrero R.A., Yamasaki C., Fujii Y., Hilton P.B., RA Antonio B.A., Aono H., Apweiler R., Bruskiewich R., Bureau T., Burr F., RA Costa de Oliveira A., Fuks G., Habara T., Haberer G., Han B., Harada E., RA Hiraki A.T., Hirochika H., Hoen D., Hokari H., Hosokawa S., Hsing Y., RA Ikawa H., Ikeo K., Imanishi T., Ito Y., Jaiswal P., Kanno M., Kawahara Y., RA Kawamura T., Kawashima H., Khurana J.P., Kikuchi S., Komatsu S., RA Koyanagi K.O., Kubooka H., Lieberherr D., Lin Y.C., Lonsdale D., RA Matsumoto T., Matsuya A., McCombie W.R., Messing J., Miyao A., Mulder N., RA Nagamura Y., Nam J., Namiki N., Numa H., Nurimoto S., O'donovan C., RA Ohyanagi H., Okido T., Oota S., Osato N., Palmer L.E., Quetier F., RA Raghuvanshi S., Saichi N., Sakai H., Sakai Y., Sakata K., Sakurai T., RA Sato F., Sato Y., Schoof H., Seki M., Shibata M., Shimizu Y., Shinozaki K., RA Shinso Y., Singh N.K., Smith-White B., Takeda J., Tanino M., Tatusova T., RA Thongjuea S., Todokoro F., Tsugane M., Tyagi A.K., Vanavichit A., Wang A., RA Wing R.A., Yamaguchi K., Yamamoto M., Yamamoto N., Yu Y., Zhang H., RA Zhao Q., Higo K., Burr B., Gojobori T., Sasaki T.; RT "Curated Genome Annotation of Oryza sativa ssp. japonica and Comparative RT Genome Analysis with Arabidopsis thaliana"; RL Genome Res. 17:175-183(2007). XX RN [7] RG The Rice Annotation Project (RAP) RA Tanaka T., Antonio B.A., Kikuchi S., Matsumoto T., Nagamura Y., Numa H., RA Sakai H., Wu J., Itoh T., Sasaki T., Aono R., Fujii Y., Habara T., RA Harada E., Kanno M., Kawahara Y., Kawashima H., Kubooka H., Matsuya A., RA Nakaoka H., Saichi N., Sanbonmatsu R., Sato Y., Shinso Y., Suzuki M., RA Takeda J., Tanino M., Todokoro F., Yamaguchi K., Yamamoto N., Yamasaki C., RA Imanishi T., Okido T., Tada M., Ikeo K., Tateno Y., Gojobori T., Lin Y.C., RA Wei F.J., Hsing Y.I., Zhao Q., Han B., Kramer M.R., McCombie R.W., RA Lonsdale D., O'Donovan C.C., Whitfield E.J., Apweiler R., Koyanagi K.O., RA Khurana J.P., Raghuvanshi S., Singh N.K., Tyagi A.K., Haberer G., RA Fujisawa M., Hosokawa S., Ito Y., Ikawa H., Shibata M., Yamamoto M., RA Bruskiewich R.M., Hoen D.R., Bureau TE., Namiki N., Ohyanagi H., Sakai Y., RA Nobushima S., Sakata K., Barrero R.A., Sato Y., Souvorov A., RA Smith-White B., Tatusova T., An S., An G., OOta S., Fuks G., Messing J., RA Christie K.R., Lieberherr D., Kim H., Zuccolo A., Wing R.A., Nobuta K., RA Green P.J., Lu C., Meyers BC., Chaparro C., Piegu B., Panaud O., RA Echeverria M.; RT "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): 2008 update"; RL Nucleic Acids Res. 36:D1028-D1033(2008). XX DR MD5; 9a95339e6ad48430a1e09b46cb811f70. XX FH Key Location/Qualifiers FH FT source 1..696 FT /organism="Oryza sativa Japonica Group" FT /chromosome="3" FT /cultivar="Nipponbare" FT /mol_type="genomic DNA" FT /db_xref="taxon:39947" FT CDS AP008209.2:34441872..34442567 FT /codon_start=1 FT /transl_table=1 FT /gene="Os03g0804700" FT /note="Similar to Germin-like protein subfamily T member 1 FT precursor" FT /note="ab initio prediction with EST support" FT /note="contains InterPro domain(s): IPR001929, IPR006045, FT IPR007113, IPR011051" FT /note="has GO asignment(s): GO:0045735" FT /db_xref="GOA:Q75HJ4" FT /db_xref="InterPro:IPR001929" FT /db_xref="InterPro:IPR006045" FT /db_xref="InterPro:IPR011051" FT /db_xref="InterPro:IPR014710" FT /db_xref="InterPro:IPR019780" FT /db_xref="UniProtKB/Swiss-Prot:Q75HJ4" FT /protein_id="BAF13536.2" FT /translation="MEHTGAMSRTSSAPLLVLSAALAVLASTCIADPEPVQDFCVAVVP FT RAGDAAAAACPAYPGFPCKPASTVVSDDFFFAGLAVASDTDNRFGFNVTAANAETFPGL FT NTLGVSIGRVDLAPGGVNPLHSHPRATELIHVVAGRVLAGFVSTAGEFYSKVLGEGETF FT VVPRGMIHFQYNVGGVAAQVITAFNSQMPGVVAAGSTLFGSDPEIPDAVLAKSFQVDAK FT IIKLLKSKF" XX SQ Sequence 696 BP; 98 A; 259 C; 228 G; 111 T; 0 other; atggagcaca ccggagccat gtcgaggaca tcgtcggcgc cactgctcgt cctgtcggcg 60 gcgctcgccg tgctagcctc cacctgcatc gccgaccctg agccggtgca ggacttctgc 120 gtggccgtcg tcccccgcgc cggcgacgcc gcggcggcgg cgtgcccggc ctacccgggc 180 ttcccgtgca agccggcgtc cacggtcgtc tccgacgact tcttcttcgc cggcctcgcc 240 gtcgccagcg acacggacaa ccggttcggg ttcaacgtga cggcggcgaa cgcggagacg 300 ttcccggggc tgaacacgct cggcgtctcc atcggccgcg tcgaccttgc ccccggcggc 360 gtcaacccgc tgcacagcca cccgcgcgcc accgagctga tccacgtcgt cgctgggagg 420 gtgctcgccg ggttcgtgag cacggcgggg gagttctact ccaaggtgct cggcgagggg 480 gagacgttcg tcgtgccgcg cgggatgatc cacttccagt acaacgtcgg cggcgtcgcc 540 gcccaggtca tcacggcgtt caacagccag atgcccggcg tcgtggccgc cgggtcgacg 600 ctgttcggct ccgacccgga gatacccgac gccgtcctcg ccaagagctt ccaggtggac 660 gccaagatca tcaagctcct caagtccaag ttctag 696 //