ID   BAF13536; SV 2; linear; genomic DNA; CON; PLN; 696 BP.
XX
PA   AP008209.2
XX
PR   Project:PRJNA13141;
XX
DT   02-FEB-2005 (Rel. 82, Created)
DT   27-AUG-2009 (Rel. 101, Last updated, Version 8)
XX
DE   Oryza sativa Japonica Group (Japanese rice) hypothetical protein
XX
KW   .
XX
OS   Oryza sativa Japonica Group (Japanese rice)
OC   Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC   Spermatophyta; Magnoliopsida; Liliopsida; Poales; Poaceae; BOP clade;
OC   Oryzoideae; Oryzeae; Oryzinae; Oryza; Oryza sativa.
XX
RN   [1]
RA   Sasaki T.;
RT   ;
RL   Submitted (25-OCT-2004) to the INSDC.
RL   Contact:Takuji Sasaki National Institute of Agrobiological Sciences, Rice
RL   Genome Research Program; Kannondai 2-1-2, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, Japan
RL   URL :http://rgp.dna.affrc.go.jp/
XX
RN   [2]
RG   IRGSP(International Rice Genome Sequencing Project)
RA   ;
RT   "Oryza sativa nipponbare(GA3) genomic DNA, chromosome 3";
RL   Unpublished.
XX
RN   [3]
RG   International Rice Genome Sequencing Project
RA   Matsumoto T., Wu J., Kanamori H., Katayose Y., Fujisawa M., Namiki N.,
RA   Mizuno H., Yamamoto K., Antonio B.A., Baba T., Sakata K., Nagamura Y.,
RA   Aoki H., Arikawa K., Arita K., Bito T., Chiden Y., Fujitsuka N.,
RA   Fukunaka R., Hamada M., Harada C., Hayashi A., Hijishita S., Honda M.,
RA   Hosokawa S., Ichikawa Y., Idonuma A., Iijima M., Ikeda M., Ikeno M.,
RA   Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K.,
RA   Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H., Kobayashi N.,
RA   Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T., Mukai Y., Nagasaki H.,
RA   Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y., Nakamichi Y., Nakamura M.,
RA   Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T., Okamoto M., Ono N., Saji S.,
RA   Sakaguchi M., Sakai K., Shibata M., Shimokawa T., Song J., Takazaki Y.,
RA   Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K., Ueda S., Waki K., Yamagata H.,
RA   Yamamoto M., Yamamoto S., Yamane H., Yoshiki S., Yoshihara R., Yukawa K.,
RA   Zhong H., Yano M., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Jones K.M., Gansberger K.,
RA   Moffat K., Hill J., Bera J., Fadrosh D., Jin S., Johri S., Kim M.,
RA   Overton L., Reardon M., Tsitrin T., Vuong H., Weaver B., Ciecko A.,
RA   Tallon L., Jackson J., Pai G., Aken S.V., Utterback T., Reidmuller S.,
RA   Feldblyum T., Hsiao J., Zismann V., Iobst S., de Vazeille A.R., Buell C.R.,
RA   Ying K., Li Y., Lu T., Huang Y., Zhao Q., Feng Q., Zhang L., Zhu J.,
RA   Weng Q., Mu J., Lu Y., Fan D., Liu Y., Guan J., Zhang Y., Yu S., Liu X.,
RA   Zhang Y., Hong G., Han B., Choisne N., Demange N., Orjeda G., Samain S.,
RA   Cattolico L., Pelletier E., Couloux A., Segurens B., Wincker P., D'Hont A.,
RA   Scarpelli C., Weissenbach J., Salanoubat M., Quetier F., Yu Y., Kim H.R.,
RA   Rambo T., Currie J., Collura K., Luo M., Yang T., Ammiraju J.S.S.,
RA   Engler F., Soderlund C., Wing R.A., Palmer L.E., de la Bastide M.,
RA   Spiegel L., Nascimento L., Zutavern T., O'Shaughnessy A., Dike S.,
RA   Dedhia N., Preston R., Balija V., McCombie W.R., Chow T., Chen H.,
RA   Chung M., Chen C., Shaw J., Wu H., Hsiao K., Chao Y., Chu M., Cheng C.,
RA   Hour A., Lee P., Lin S., Lin Y., Liou J., Liu S., Hsing Y., Raghuvanshi S.,
RA   Mohanty A., Bharti A.K., Gaur A., Gupta V., Kumar D., Ravi V., Vij S.,
RA   Kapur A., Khurana P., Khurana P., Khurana J.P., Tyagi A.K., Gaikwad K.,
RA   Singh A., Dalal V., Srivastava S., Dixit A., Pal A.K., Ghazi I.A.,
RA   Yadav M., Pandit A., Bhargava A., Sureshbabu K., Batra K., Sharma T.R.,
RA   Mohapatra T., Singh N.K., Messing J., Nelson A.B., Fuks G., Kavchok S.,
RA   Keizer G., Linton E., Llaca V., Song R., Tanyolac B., Young S., Ho-Il K.,
RA   Hahn J.H., Sangsakoo G., Vanavichit A., de Mattos Luiz.A.T., Zimmer P.D.,
RA   Malone G., Dellagostin O., de Oliveira A.C., Bevan M., Bancroft I.,
RA   Minx P., Cordum H., Wilson R., Cheng Z., Jin W., Jiang J., Leong S.A.,
RA   Iwama H., Gojobori T., Itoh T., Niimura Y., Fujii Y., Habara T., Sakai H.,
RA   Sato Y., Wilson G., Kumar K., McCouch S., Juretic N., Hoen D., Wright S.,
RA   Bruskiewich R., Bureau T., Miyao A., Hirochika H., Nishikawa T.,
RA   Kadowaki K., Sugiura M., Burr B., Sasaki T.;
RT   "The map-based sequence of the rice genome";
RL   Nature 436:793-800(2005).
XX
RN   [4]
RG   The Rice Annotation Project (RAP)
RA   ;
RT   "The Second Rice Annotation Project Meeting (RAP2)";
RL   Unpublished.
XX
RN   [5]
RX   DOI; 10.1093/nar/gkj094.
RX   PUBMED; 16381971.
RA   Ohyanagi H., Tanaka T., Sakai H., Shigemoto Y., Yamaguchi K., Habara T.,
RA   Fujii Y., Antonio B.A., Nagamura Y., Imanishi T., Ikeo K., Itoh T.,
RA   Gojobori T., Sasaki T.;
RT   "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): hub for Oryza sativa ssp.
RT   japonica genome information";
RL   Nucleic Acids Res. 34(Database issue):D741-D744(2006).
XX
RN   [6]
RG   The Rice Annotation Project (RAP)
RA   Itoh T., Tanaka T., Barrero R.A., Yamasaki C., Fujii Y., Hilton P.B.,
RA   Antonio B.A., Aono H., Apweiler R., Bruskiewich R., Bureau T., Burr F.,
RA   Costa de Oliveira A., Fuks G., Habara T., Haberer G., Han B., Harada E.,
RA   Hiraki A.T., Hirochika H., Hoen D., Hokari H., Hosokawa S., Hsing Y.,
RA   Ikawa H., Ikeo K., Imanishi T., Ito Y., Jaiswal P., Kanno M., Kawahara Y.,
RA   Kawamura T., Kawashima H., Khurana J.P., Kikuchi S., Komatsu S.,
RA   Koyanagi K.O., Kubooka H., Lieberherr D., Lin Y.C., Lonsdale D.,
RA   Matsumoto T., Matsuya A., McCombie W.R., Messing J., Miyao A., Mulder N.,
RA   Nagamura Y., Nam J., Namiki N., Numa H., Nurimoto S., O'donovan C.,
RA   Ohyanagi H., Okido T., Oota S., Osato N., Palmer L.E., Quetier F.,
RA   Raghuvanshi S., Saichi N., Sakai H., Sakai Y., Sakata K., Sakurai T.,
RA   Sato F., Sato Y., Schoof H., Seki M., Shibata M., Shimizu Y., Shinozaki K.,
RA   Shinso Y., Singh N.K., Smith-White B., Takeda J., Tanino M., Tatusova T.,
RA   Thongjuea S., Todokoro F., Tsugane M., Tyagi A.K., Vanavichit A., Wang A.,
RA   Wing R.A., Yamaguchi K., Yamamoto M., Yamamoto N., Yu Y., Zhang H.,
RA   Zhao Q., Higo K., Burr B., Gojobori T., Sasaki T.;
RT   "Curated Genome Annotation of Oryza sativa ssp. japonica and Comparative
RT   Genome Analysis with Arabidopsis thaliana";
RL   Genome Res. 17:175-183(2007).
XX
RN   [7]
RG   The Rice Annotation Project (RAP)
RA   Tanaka T., Antonio B.A., Kikuchi S., Matsumoto T., Nagamura Y., Numa H.,
RA   Sakai H., Wu J., Itoh T., Sasaki T., Aono R., Fujii Y., Habara T.,
RA   Harada E., Kanno M., Kawahara Y., Kawashima H., Kubooka H., Matsuya A.,
RA   Nakaoka H., Saichi N., Sanbonmatsu R., Sato Y., Shinso Y., Suzuki M.,
RA   Takeda J., Tanino M., Todokoro F., Yamaguchi K., Yamamoto N., Yamasaki C.,
RA   Imanishi T., Okido T., Tada M., Ikeo K., Tateno Y., Gojobori T., Lin Y.C.,
RA   Wei F.J., Hsing Y.I., Zhao Q., Han B., Kramer M.R., McCombie R.W.,
RA   Lonsdale D., O'Donovan C.C., Whitfield E.J., Apweiler R., Koyanagi K.O.,
RA   Khurana J.P., Raghuvanshi S., Singh N.K., Tyagi A.K., Haberer G.,
RA   Fujisawa M., Hosokawa S., Ito Y., Ikawa H., Shibata M., Yamamoto M.,
RA   Bruskiewich R.M., Hoen D.R., Bureau TE., Namiki N., Ohyanagi H., Sakai Y.,
RA   Nobushima S., Sakata K., Barrero R.A., Sato Y., Souvorov A.,
RA   Smith-White B., Tatusova T., An S., An G., OOta S., Fuks G., Messing J.,
RA   Christie K.R., Lieberherr D., Kim H., Zuccolo A., Wing R.A., Nobuta K.,
RA   Green P.J., Lu C., Meyers BC., Chaparro C., Piegu B., Panaud O.,
RA   Echeverria M.;
RT   "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): 2008 update";
RL   Nucleic Acids Res. 36:D1028-D1033(2008).
XX
DR   MD5; 9a95339e6ad48430a1e09b46cb811f70.
XX
FH   Key             Location/Qualifiers
FH
FT   source          1..696
FT                   /organism="Oryza sativa Japonica Group"
FT                   /chromosome="3"
FT                   /cultivar="Nipponbare"
FT                   /mol_type="genomic DNA"
FT                   /db_xref="taxon:39947"
FT   CDS             AP008209.2:34441872..34442567
FT                   /codon_start=1
FT                   /transl_table=1
FT                   /gene="Os03g0804700"
FT                   /note="Similar to Germin-like protein subfamily T member 1
FT                   precursor"
FT                   /note="ab initio prediction with EST support"
FT                   /note="contains InterPro domain(s): IPR001929, IPR006045,
FT                   IPR007113, IPR011051"
FT                   /note="has GO asignment(s): GO:0045735"
FT                   /db_xref="GOA:Q75HJ4"
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FT                   /protein_id="BAF13536.2"
FT                   /translation="MEHTGAMSRTSSAPLLVLSAALAVLASTCIADPEPVQDFCVAVVP
FT                   RAGDAAAAACPAYPGFPCKPASTVVSDDFFFAGLAVASDTDNRFGFNVTAANAETFPGL
FT                   NTLGVSIGRVDLAPGGVNPLHSHPRATELIHVVAGRVLAGFVSTAGEFYSKVLGEGETF
FT                   VVPRGMIHFQYNVGGVAAQVITAFNSQMPGVVAAGSTLFGSDPEIPDAVLAKSFQVDAK
FT                   IIKLLKSKF"
XX
SQ   Sequence 696 BP; 98 A; 259 C; 228 G; 111 T; 0 other;
     atggagcaca ccggagccat gtcgaggaca tcgtcggcgc cactgctcgt cctgtcggcg        60
     gcgctcgccg tgctagcctc cacctgcatc gccgaccctg agccggtgca ggacttctgc       120
     gtggccgtcg tcccccgcgc cggcgacgcc gcggcggcgg cgtgcccggc ctacccgggc       180
     ttcccgtgca agccggcgtc cacggtcgtc tccgacgact tcttcttcgc cggcctcgcc       240
     gtcgccagcg acacggacaa ccggttcggg ttcaacgtga cggcggcgaa cgcggagacg       300
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     gtcaacccgc tgcacagcca cccgcgcgcc accgagctga tccacgtcgt cgctgggagg       420
     gtgctcgccg ggttcgtgag cacggcgggg gagttctact ccaaggtgct cggcgagggg       480
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     gcccaggtca tcacggcgtt caacagccag atgcccggcg tcgtggccgc cgggtcgacg       600
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//