PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=553-D7-P23)

Interfaces in PDB 1d8t crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 2.35 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF ELONGATION FACTOR, TU (EF-TU-MGGDP) COMPLEXED WITH GE2270A, A THIAZOLYL PEPTIDE ANTIBIOTIC

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`91`	`27`	`17547`	`◊`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`91`	`27`	`17547`	`797.0`	`5.1`	`0.870`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
2	`2`		C	`72`	`14`	`1505`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`88`	`23`	`17547`	`719.6`	`-14.9`	`0.524`	`4`	`0`	`0`	`0.350`
	`3`		D	`69`	`14`	`1517`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`90`	`23`	`17122`	`688.2`	`-14.1`	`0.494`	`5`	`0`	`0`	`0.350`
	*Average:*													`703.9`	`-14.5`	`0.509`	`5`	`0`	`0`	`0.350`
3	`4`		B	`43`	`15`	`17122`	`◊`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`48`	`14`	`17547`	`420.9`	`-5.1`	`0.146`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
	`5`		B	`47`	`14`	`17122`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`43`	`17`	`17547`	`404.7`	`-4.9`	`0.159`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`412.8`	`-5.0`	`0.152`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
4	`6`		B	`44`	`13`	`17122`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`44`	`13`	`17122`	`416.4`	`-3.0`	`0.323`	`6`	`2`	`0`	`0.000`
5	`7`		[GDP]B:999	`25`	`1`	`567`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`47`	`17`	`17122`	`334.7`	`-5.8`	`0.513`	`15`	`0`	`0`	`0.268`
	`8`		[GDP]A:999	`27`	`1`	`565`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`44`	`17`	`17547`	`331.7`	`-6.3`	`0.475`	`15`	`0`	`0`	`0.268`
	*Average:*													`333.2`	`-6.1`	`0.494`	`15`	`0`	`0`	`0.268`
6	`9`		A	`29`	`11`	`17547`	`x`	A	-x+1,y-1,-z+1	`2_646`	`31`	`11`	`17547`	`272.9`	`-2.9`	`0.255`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`10`		A	`29`	`10`	`17547`	`x`	A	x,y-1,z	`1_545`	`31`	`9`	`17547`	`243.9`	`0.9`	`0.648`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`11`		A	`22`	`5`	`17547`	`x`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`27`	`9`	`17547`	`213.1`	`0.3`	`0.564`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		B	`22`	`5`	`17122`	`x`	B	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`26`	`8`	`17122`	`212.4`	`0.2`	`0.602`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`212.8`	`0.2`	`0.583`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
9	`13`		B	`24`	`10`	`17122`	`x`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`27`	`11`	`17122`	`202.3`	`-2.8`	`0.233`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`14`		A	`20`	`7`	`17547`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`21`	`5`	`17122`	`190.0`	`0.3`	`0.614`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
11	`15`		B	`14`	`4`	`17122`	`x`	B	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`15`	`4`	`17122`	`112.8`	`1.3`	`0.768`	`1`	`4`	`0`	`0.000`
12	`16`		[ACT]A:3007	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`17547`	`112.8`	`-0.9`	`0.543`	`1`	`0`	`0`	`0.026`
13	`17`		[ACT]A:3003	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`17547`	`112.3`	`-0.6`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
14	`18`		[ACT]A:3026	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`17547`	`106.4`	`-0.4`	`0.622`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
15	`19`		[ACT]A:3030	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`17547`	`105.3`	`-1.0`	`0.493`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
16	`20`		[ACT]B:3014	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`17122`	`103.9`	`-0.5`	`0.641`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
17	`21`		[ACT]A:3022	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`17547`	`103.3`	`0.2`	`0.705`	`2`	`0`	`0`	`0.014`
18	`22`		[ACT]B:3015	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`17122`	`103.3`	`-0.2`	`0.632`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`23`		[ACT]A:3005	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`17547`	`97.4`	`0.6`	`0.779`	`2`	`0`	`0`	`0.005`
20	`24`		[ACT]B:3029	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`17122`	`95.9`	`-0.0`	`0.664`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`25`		[ACT]A:3010	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`17547`	`92.6`	`-0.4`	`0.561`	`1`	`0`	`0`	`0.017`
22	`26`		[ACT]A:3013	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`17547`	`90.0`	`-0.4`	`0.631`	`1`	`0`	`0`	`0.016`
23	`27`		[ACT]B:3008	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`17122`	`87.3`	`0.7`	`0.801`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
24	`28`		[ACT]B:3027	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`17122`	`85.3`	`0.4`	`0.679`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
25	`29`		[ACT]A:3019	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`17547`	`85.1`	`0.3`	`0.766`	`2`	`0`	`0`	`0.011`
26	`30`		[ACT]A:3028	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`17547`	`83.3`	`-0.4`	`0.590`	`1`	`0`	`0`	`0.016`
27	`31`		[ACT]A:3023	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`17547`	`82.7`	`-0.4`	`0.637`	`1`	`0`	`0`	`0.016`
28	`32`		[ACT]A:3025	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`17547`	`81.8`	`-1.2`	`0.513`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
29	`33`		[ACT]A:3021	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`17547`	`80.9`	`-0.9`	`0.572`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
30	`34`		[ACT]B:3012	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`17122`	`80.5`	`0.4`	`0.668`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`35`		[ACT]B:3011	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`17122`	`78.7`	`-0.9`	`0.555`	`1`	`0`	`0`	`0.029`
32	`36`		[ACT]B:3009	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`17122`	`77.2`	`0.2`	`0.676`	`4`	`0`	`0`	`0.034`
33	`37`		D	`8`	`3`	`1517`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`7`	`2`	`17122`	`75.6`	`-2.1`	`0.292`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`38`		C	`9`	`2`	`1505`	`◊`	A	-x+1,y-1,-z+1	`2_646`	`8`	`4`	`17547`	`75.2`	`-1.1`	`0.480`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`39`		[ACT]A:3002	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`17547`	`71.0`	`0.7`	`0.760`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
36	`40`		[ACT]B:3001	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`17122`	`70.5`	`1.1`	`0.861`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
37	`41`		[ACT]B:3018	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`17122`	`68.2`	`-0.6`	`0.511`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
38	`42`		[ACT]B:3011	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`8`	`3`	`17547`	`67.7`	`-0.7`	`0.526`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`43`		[ACT]A:3016	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`17547`	`65.8`	`0.6`	`0.769`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`44`		[ACT]A:3006	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`17547`	`65.2`	`0.2`	`0.636`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
41	`45`		[ACT]B:3024	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`17122`	`64.9`	`0.0`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`46`		[ACT]A:3020	`4`	`1`	`184`	`f`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`7`	`4`	`17547`	`62.3`	`0.4`	`0.721`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`47`		[ACT]A:3004	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`17547`	`61.3`	`-1.2`	`0.475`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
44	`48`		[ACT]A:3017	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`17547`	`58.3`	`0.7`	`0.803`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`49`		B	`6`	`2`	`17122`	`◊`	D	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`4`	`2`	`1517`	`53.9`	`-1.5`	`0.416`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		A	`6`	`2`	`17547`	`◊`	C	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`4`	`2`	`1505`	`45.8`	`-1.1`	`0.432`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`49.8`	`-1.3`	`0.424`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`51`		[ACT]B:3009	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`17547`	`52.9`	`-0.3`	`0.573`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`52`		[NH2]D:15	`1`	`1`	`117`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`1517`	`49.7`	`0.2`	`0.876`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		[NH2]C:15	`1`	`1`	`117`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`1505`	`49.4`	`0.1`	`0.869`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`49.5`	`0.1`	`0.873`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`54`		[ACT]A:3020	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`17547`	`48.1`	`0.5`	`0.719`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`55`		C	`4`	`1`	`1505`	`◊`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`2`	`2`	`17547`	`46.0`	`-1.2`	`0.149`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`56`		[MG]B:998	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`17122`	`45.7`	`-6.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.138`
	`57`		[MG]A:998	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`17547`	`41.6`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.138`
	*Average:*													`43.7`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.138`
51	`58`		[ACT]B:3015	`1`	`1`	`185`	`f`	B	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`5`	`2`	`17122`	`34.0`	`-1.1`	`0.244`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
52	`59`		[ACT]A:3005	`3`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`17122`	`32.1`	`0.1`	`0.785`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`60`		[ACT]A:3004	`3`	`1`	`183`	`◊`	[ACT]A:3028	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`3`	`1`	`184`	`31.6`	`0.5`	`0.802`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`61`		[NH2]C:15	`1`	`1`	`117`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`17547`	`30.2`	`0.6`	`0.876`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[NH2]D:15	`1`	`1`	`117`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`17122`	`30.0`	`0.3`	`0.723`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`30.1`	`0.4`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`63`		[GDP]B:999	`4`	`1`	`567`	`f`	[MG]B:998	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.2`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	`64`		[GDP]A:999	`4`	`1`	`565`	`f`	[MG]A:998	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`29.3`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	*Average:*													`29.7`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
56	`65`		[ACT]A:3023	`3`	`1`	`183`	`◊`	C	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`2`	`1`	`1505`	`29.1`	`0.2`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`66`		[ACT]A:3023	`3`	`1`	`183`	`f`	[ACT]A:3013	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`185`	`28.8`	`0.2`	`0.776`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`67`		[ACT]B:3009	`3`	`1`	`183`	`◊`	[ACT]A:3010	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`183`	`27.6`	`-0.4`	`0.639`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`68`		[ACT]B:3008	`2`	`1`	`184`	`f`	[ACT]B:3001	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`184`	`27.0`	`-0.3`	`0.586`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
60	`69`		[ACT]A:3002	`1`	`1`	`184`	`f`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`2`	`1`	`17547`	`27.0`	`-0.7`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
61	`70`		[ACT]B:3012	`3`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`1517`	`26.1`	`-0.4`	`0.583`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
62	`71`		[ACT]A:3004	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`3`	`1`	`17547`	`24.9`	`0.2`	`0.759`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
63	`72`		[ACT]A:3010	`1`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`17122`	`23.5`	`-0.2`	`0.631`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`73`		[ACT]A:3019	`2`	`1`	`184`	`f`	[ACT]A:3013	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`185`	`22.2`	`-0.7`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
65	`74`		[ACT]B:3001	`1`	`1`	`184`	`f`	B	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`2`	`1`	`17122`	`21.9`	`-0.7`	`0.317`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
66	`75`		D	`2`	`1`	`1517`	`f`	[ACT]B:3029	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`183`	`20.5`	`-0.6`	`0.539`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
67	`76`		[ACT]A:3019	`2`	`1`	`184`	`◊`	[ACT]A:3002	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`184`	`19.9`	`0.4`	`0.810`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`77`		[NH2]C:15	`1`	`1`	`117`	`◊`	A	-x+1,y-1,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`17547`	`19.4`	`-0.1`	`0.326`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`78`		[ACT]B:3029	`2`	`1`	`183`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`1`	`1`	`17122`	`18.3`	`0.0`	`0.672`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`79`		[ACT]A:3013	`3`	`1`	`185`	`◊`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`1`	`1`	`17547`	`15.2`	`0.6`	`0.814`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`80`		[ACT]A:3023	`3`	`1`	`183`	`◊`	A	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`1`	`1`	`17547`	`14.1`	`0.7`	`0.812`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`81`		[ACT]A:3021	`3`	`1`	`184`	`f`	[MG]A:998	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.3`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
73	`82`		B	`1`	`1`	`17122`	`x`	B	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`17122`	`11.8`	`0.2`	`0.773`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`83`		[ACT]A:3021	`2`	`1`	`184`	`f`	[GDP]A:999	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`565`	`11.6`	`-0.5`	`0.555`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
75	`84`		[ACT]B:3009	`1`	`1`	`183`	`◊`	[ACT]A:3005	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`6.9`	`-0.0`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`85`		[ACT]A:3010	`1`	`1`	`183`	`f`	[ACT]A:3005	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`6.5`	`0.1`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`86`		[ACT]B:3018	`1`	`1`	`184`	`◊`	[ACT]B:3001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`5.8`	`-0.2`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`87`		A	`3`	`2`	`17547`	`◊`	[ACT]A:3022	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`184`	`4.8`	`-0.1`	`0.553`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`88`		[GDP]B:999	`1`	`1`	`567`	`◊`	B	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`2`	`1`	`17122`	`4.4`	`-0.3`	`0.451`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`89`		B	`2`	`1`	`17122`	`◊`	[ACT]B:3029	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`2`	`1`	`183`	`4.0`	`-0.1`	`0.599`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
81	`90`		[ACT]A:3025	`1`	`1`	`183`	`◊`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`1`	`1`	`17547`	`3.0`	`0.1`	`0.640`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
82	`91`		[ACT]A:3004	`1`	`1`	`183`	`◊`	[ACT]A:3002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`2.8`	`-0.0`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
83	`92`		[ACT]A:3013	`1`	`1`	`185`	`◊`	C	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`1`	`1`	`1505`	`2.0`	`-0.0`	`0.567`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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