PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=233-9A-EB5)

Interfaces in PDB 1lof crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 2.30 Å

X-RAY STRUCTURE OF A BIANTENNARY OCTASACCHARIDE-LECTIN COMPLEX AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`346`	`52`	`6276`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`455`	`112`	`11334`	`3909.0`	`-39.0`	`0.424`	`90`	`2`	`0`	`1.000`
	`2`		B	`330`	`47`	`5897`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`445`	`112`	`11471`	`3800.8`	`-39.1`	`0.449`	`87`	`3`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`3854.9`	`-39.0`	`0.437`	`89`	`3`	`0`	`1.000`
2	`3`		C	`85`	`24`	`11334`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`81`	`23`	`11471`	`707.7`	`-0.5`	`0.796`	`18`	`0`	`0`	`0.005`
3	`4`		D	`25`	`6`	`6276`	`◊`	D	-x,y,-z+1	`2_556`	`25`	`6`	`6276`	`201.3`	`-1.5`	`0.713`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		B	`21`	`6`	`5897`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`27`	`6`	`11471`	`193.4`	`-1.0`	`0.666`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		C	`15`	`4`	`11334`	`◊`	A	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`15`	`7`	`11471`	`147.7`	`1.2`	`0.815`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`7`		D	`16`	`5`	`6276`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`11471`	`147.2`	`-1.1`	`0.521`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
	`8`		B	`13`	`3`	`5897`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`5`	`11334`	`110.0`	`-1.4`	`0.459`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`128.6`	`-1.3`	`0.490`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
7	`9`		[GAL]A:506	`9`	`1`	`287`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`11471`	`123.5`	`2.7`	`0.397`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`10`		[NAG]C:515	`11`	`1`	`361`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`11334`	`120.9`	`3.8`	`0.460`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		[NAG]A:505	`9`	`1`	`359`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`11471`	`114.8`	`3.4`	`0.509`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`117.8`	`3.6`	`0.485`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`12`		C	`14`	`7`	`11334`	`x`	C	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`12`	`2`	`11334`	`113.4`	`0.9`	`0.807`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
	`13`		A	`11`	`2`	`11471`	`x`	A	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`15`	`7`	`11471`	`113.1`	`0.1`	`0.687`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`113.2`	`0.5`	`0.747`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
10	`14`		[MAN]C:511	`8`	`1`	`287`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`11334`	`100.8`	`1.1`	`0.323`	`4`	`0`	`0`	`0.007`
	`15`		[MAN]A:501	`8`	`1`	`290`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`10`	`11471`	`95.7`	`1.2`	`0.344`	`3`	`0`	`0`	`0.007`
	*Average:*													`98.3`	`1.2`	`0.334`	`4`	`0`	`0`	`0.007`
11	`16`		[NAG]A:504	`11`	`1`	`357`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`11471`	`99.7`	`1.1`	`0.188`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`17`		A	`12`	`5`	`11471`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`12`	`5`	`11471`	`87.8`	`0.8`	`0.799`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`18`		[NAG]A:504	`9`	`1`	`357`	`cf`	[MAN]A:503	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`293`	`69.4`	`2.3`	`0.128`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`19`		[GAL]A:506	`8`	`1`	`287`	`cf`	[NAG]A:504	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`357`	`68.3`	`1.8`	`0.111`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`20`		[MN]C:458	`1`	`1`	`123`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`11334`	`68.1`	`-7.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.099`
	`21`		[MN]A:228	`1`	`1`	`123`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`11471`	`67.4`	`-7.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.099`
	*Average:*													`67.7`	`-7.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.099`
16	`22`		[NAG]A:508	`8`	`1`	`371`	`f`	[MAN]A:503	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`293`	`67.7`	`3.0`	`0.140`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`23`		C	`13`	`6`	`11334`	`◊`	C	-x,y,-z+1	`2_556`	`13`	`6`	`11334`	`65.7`	`2.0`	`0.911`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`24`		[GAL]A:507	`7`	`1`	`292`	`cf`	[NAG]A:505	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`359`	`63.4`	`1.1`	`0.085`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`25`		[NAG]A:505	`10`	`1`	`359`	`cf`	[MAN]A:501	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`290`	`63.3`	`2.1`	`0.110`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		[NAG]C:515	`9`	`1`	`361`	`cf`	[MAN]C:511	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`287`	`61.3`	`2.2`	`0.127`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`62.3`	`2.2`	`0.119`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`27`		[MAN]C:511	`7`	`1`	`287`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`6276`	`62.8`	`0.3`	`0.242`	`5`	`0`	`0`	`0.021`
	`28`		[MAN]A:501	`6`	`1`	`290`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`5897`	`57.1`	`0.4`	`0.330`	`4`	`0`	`0`	`0.021`
	*Average:*													`59.9`	`0.4`	`0.286`	`5`	`0`	`0`	`0.021`
21	`29`		[NAG]A:508	`8`	`1`	`371`	`cf`	[BMA]A:502	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`291`	`60.9`	`1.4`	`0.100`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`30`		D	`6`	`2`	`6276`	`◊`	C	-x,y,-z+1	`2_556`	`4`	`2`	`11334`	`57.7`	`0.6`	`0.796`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`31`		[MAN]C:512	`6`	`1`	`289`	`cf`	[MAN]C:511	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`287`	`55.0`	`1.8`	`0.194`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`32`		[NAG]A:504	`9`	`1`	`357`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`5897`	`54.7`	`1.4`	`0.290`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`33`		[NAG]C:515	`6`	`1`	`361`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`6276`	`52.0`	`0.5`	`0.258`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		[NAG]A:505	`5`	`1`	`359`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`5897`	`48.6`	`0.7`	`0.332`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`50.3`	`0.6`	`0.295`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`35`		[BMA]A:502	`6`	`1`	`291`	`cf`	[MAN]A:501	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`290`	`48.5`	`1.5`	`0.184`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`36`		[BMA]A:502	`2`	`1`	`291`	`cf`	[MAN]A:503	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`293`	`47.0`	`2.5`	`0.530`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`37`		[NAG]A:504	`5`	`1`	`357`	`f`	[BMA]A:502	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`291`	`42.8`	`1.7`	`0.252`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`38`		[CA]C:457	`1`	`1`	`85`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`11334`	`42.4`	`-11.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.156`
	`39`		[CA]A:227	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`11471`	`39.3`	`-11.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.156`
	*Average:*													`40.8`	`-11.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.156`
30	`40`		[NAG]C:515	`8`	`1`	`361`	`f`	[MAN]C:512	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`289`	`42.3`	`1.1`	`0.142`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`41`		[NAG]A:505	`6`	`1`	`359`	`f`	[BMA]A:502	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`291`	`38.1`	`0.8`	`0.154`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`42`		[MAN]C:512	`4`	`1`	`289`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`11334`	`35.8`	`-0.8`	`0.110`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
33	`43`		[MAN]C:512	`4`	`1`	`289`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`6276`	`35.7`	`0.3`	`0.258`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`44`		C	`3`	`1`	`11334`	`◊`	B	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`4`	`2`	`5897`	`31.1`	`0.8`	`0.874`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`45`		D	`3`	`1`	`6276`	`◊`	A	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`3`	`1`	`11471`	`20.5`	`0.6`	`0.832`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`25.8`	`0.7`	`0.853`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
35	`46`		C	`6`	`2`	`11334`	`◊`	D	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`3`	`2`	`6276`	`27.5`	`-0.4`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`47`		[BMA]A:502	`4`	`1`	`291`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`11471`	`26.1`	`-0.5`	`0.120`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
37	`48`		[BMA]A:502	`5`	`1`	`291`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`5897`	`22.7`	`0.1`	`0.222`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`49`		[GAL]A:507	`3`	`1`	`292`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`11471`	`18.2`	`0.6`	`0.419`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`50`		C	`3`	`2`	`11334`	`x`	C	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`4`	`2`	`11334`	`16.8`	`-0.4`	`0.433`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`51`		[GAL]A:506	`2`	`1`	`287`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`5897`	`15.8`	`0.5`	`0.469`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`52`		A	`3`	`1`	`11471`	`◊`	[MAN]A:503	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`4`	`1`	`293`	`15.7`	`0.1`	`0.249`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`53`		[MAN]A:503	`2`	`1`	`293`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`11471`	`6.1`	`0.1`	`0.329`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`54`		[CA]A:227	`1`	`1`	`85`	`◊`	[MAN]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`290`	`4.4`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
	`55`		[CA]C:457	`1`	`1`	`85`	`◊`	[MAN]C:511	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`287`	`1.8`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
	*Average:*													`3.1`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
44	`56`		[MN]A:228	`1`	`1`	`123`	`f`	[CA]A:227	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`4.2`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
45	`57`		[MN]C:458	`1`	`1`	`123`	`f`	[CA]C:457	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`4.1`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
46	`58`		[GAL]A:506	`2`	`1`	`287`	`f`	[MAN]A:503	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`293`	`2.3`	`0.1`	`0.206`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`59`		[NAG]A:508	`1`	`1`	`371`	`f`	[NAG]A:504	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`357`	`1.4`	`0.1`	`0.138`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`60`		[NAG]A:508	`1`	`1`	`371`	`f`	[MAN]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`290`	`1.0`	`-0.0`	`0.156`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`61`		[NAG]A:508	`1`	`1`	`371`	`f`	[NAG]A:505	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`359`	`0.8`	`-0.0`	`0.138`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`62`		[NAG]A:504	`1`	`1`	`357`	`f`	[MAN]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`290`	`0.1`	`0.0`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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