PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=514-E0-61B)

Interfaces in PDB 1tb7 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.63 Å

CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN PHOSPHODIESTERASE 4D IN COMPLEX WITH AMP

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`76`	`21`	`15336`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`77`	`20`	`14994`	`687.4`	`-2.5`	`0.453`	`15`	`12`	`0`	`0.000`
2	`2`		B	`49`	`15`	`15336`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`54`	`18`	`14994`	`427.6`	`-2.9`	`0.307`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
3	`3`		A	`35`	`11`	`14994`	`◊`	B	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`51`	`13`	`15336`	`383.4`	`0.8`	`0.655`	`7`	`4`	`0`	`0.000`
4	`4`		[AMP]A:1003	`23`	`1`	`473`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`46`	`21`	`14994`	`294.4`	`-0.5`	`0.566`	`4`	`0`	`0`	`0.009`
	`5`		[AMP]B:1003	`23`	`1`	`474`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`48`	`21`	`15336`	`287.6`	`-1.5`	`0.439`	`4`	`0`	`0`	`0.009`
	*Average:*													`291.0`	`-1.0`	`0.503`	`4`	`0`	`0`	`0.009`
5	`6`		A	`28`	`10`	`14994`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`29`	`9`	`15336`	`240.3`	`1.9`	`0.782`	`1`	`4`	`0`	`0.000`
6	`7`		A	`24`	`7`	`14994`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`31`	`9`	`14994`	`226.3`	`-0.7`	`0.525`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
7	`8`		[B3P]A:601	`14`	`1`	`476`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`14994`	`184.3`	`3.1`	`0.426`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		[B3P]A:601	`11`	`1`	`476`	`f`	B	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`12`	`4`	`15336`	`117.0`	`1.3`	`0.317`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		[EDO]A:520	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`14994`	`114.5`	`3.5`	`0.594`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		[EDO]B:517	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`15336`	`111.8`	`3.5`	`0.566`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`12`		[EDO]A:515	`4`	`1`	`182`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`14994`	`109.4`	`3.0`	`0.472`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`13`		[EDO]A:516	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`9`	`14994`	`108.8`	`3.5`	`0.586`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`14`		[EDO]B:503	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`15336`	`108.4`	`3.8`	`0.518`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
14	`15`		[EDO]A:522	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`14994`	`106.6`	`2.6`	`0.308`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`16`		[EDO]B:508	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`15336`	`104.6`	`2.2`	`0.302`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`17`		[EDO]B:526	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`9`	`15336`	`103.3`	`3.1`	`0.473`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
17	`18`		[EDO]A:536	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`14994`	`101.9`	`4.0`	`0.532`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
18	`19`		[EDO]A:521	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`14994`	`99.7`	`2.9`	`0.548`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		[EDO]B:534	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`15336`	`99.7`	`3.2`	`0.478`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
20	`21`		[EDO]A:523	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`14994`	`98.3`	`2.7`	`0.473`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		[EDO]B:542	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`15336`	`95.0`	`2.2`	`0.393`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		[EDO]B:543	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`15336`	`93.4`	`2.2`	`0.383`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		[EDO]A:538	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`14994`	`93.2`	`2.7`	`0.416`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`25`		[EDO]B:535	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`10`	`15336`	`93.0`	`2.6`	`0.477`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
25	`26`		[EDO]B:501	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`15336`	`92.8`	`3.2`	`0.501`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`27`		[EDO]A:539	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`14994`	`89.4`	`2.9`	`0.503`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
27	`28`		[EDO]A:533	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`14994`	`86.7`	`2.4`	`0.407`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`29`		[EDO]A:540	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`14994`	`86.3`	`2.2`	`0.378`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`30`		A	`9`	`3`	`14994`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`12`	`5`	`15336`	`85.0`	`-0.8`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`31`		B	`10`	`5`	`15336`	`x`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`8`	`2`	`15336`	`84.7`	`2.1`	`0.883`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
31	`32`		[EDO]B:525	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`15336`	`82.8`	`2.8`	`0.296`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		[EDO]A:502	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`14994`	`80.3`	`2.4`	`0.280`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`81.5`	`2.6`	`0.288`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		[EDO]B:509	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`15336`	`80.6`	`1.3`	`0.621`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[EDO]A:519	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`14994`	`79.6`	`2.4`	`0.268`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
34	`36`		[EDO]B:524	`4`	`1`	`182`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`14994`	`77.9`	`1.7`	`0.188`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		[EDO]A:537	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`11`	`4`	`15336`	`76.6`	`2.0`	`0.328`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		[EDO]B:541	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`15336`	`70.7`	`1.5`	`0.762`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
37	`39`		[EDO]B:524	`4`	`1`	`182`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`15336`	`63.8`	`0.6`	`0.569`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`40`		[EDO]A:537	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`14994`	`50.1`	`1.5`	`0.833`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`41`		[EDO]B:525	`3`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`14994`	`44.0`	`1.6`	`0.283`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		[EDO]A:502	`3`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`15336`	`39.2`	`1.1`	`0.696`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`41.6`	`1.3`	`0.490`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`43`		[MG]B:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`15336`	`41.1`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	`44`		[MG]A:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`14994`	`41.0`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	*Average:*													`41.0`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
41	`45`		[EDO]A:536	`2`	`1`	`183`	`f`	B	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`3`	`1`	`15336`	`38.9`	`0.8`	`0.417`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
42	`46`		[EDO]B:503	`2`	`1`	`184`	`f`	[EDO]B:501	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`184`	`38.0`	`1.8`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
43	`47`		[ZN]A:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`14994`	`34.6`	`-24.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.083`
	`48`		[ZN]B:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`15336`	`34.3`	`-24.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.083`
	*Average:*													`34.4`	`-24.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.083`
44	`49`		[EDO]A:523	`3`	`1`	`184`	`f`	[AMP]A:1003	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`473`	`32.9`	`0.3`	`0.620`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`50`		A	`3`	`1`	`14994`	`◊`	[EDO]B:526	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`2`	`1`	`183`	`29.3`	`1.0`	`0.876`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`51`		[EDO]B:535	`3`	`1`	`184`	`f`	[AMP]B:1003	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`474`	`28.5`	`0.1`	`0.625`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`52`		B	`2`	`2`	`15336`	`f`	[EDO]A:515	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`2`	`1`	`182`	`28.1`	`0.5`	`0.241`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`53`		[EDO]B:542	`4`	`1`	`183`	`f`	[EDO]B:541	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`28.0`	`1.0`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
49	`54`		A	`3`	`1`	`14994`	`f`	[EDO]B:534	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`4`	`1`	`183`	`27.9`	`0.2`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`55`		[AMP]A:1003	`3`	`1`	`473`	`f`	[ZN]A:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`24.9`	`-10.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
	`56`		[AMP]B:1003	`3`	`1`	`474`	`f`	[ZN]B:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`24.5`	`-10.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
	*Average:*													`24.7`	`-10.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
51	`57`		[AMP]A:1003	`4`	`1`	`473`	`f`	[MG]A:1002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`24.6`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
	`58`		[AMP]B:1003	`4`	`1`	`474`	`f`	[MG]B:1002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`24.4`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
	*Average:*													`24.5`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
52	`59`		B	`3`	`2`	`15336`	`f`	[EDO]A:539	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`3`	`1`	`184`	`24.1`	`0.1`	`0.571`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`60`		[EDO]B:543	`2`	`1`	`184`	`f`	[AMP]B:1003	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`474`	`23.6`	`-0.2`	`0.623`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`61`		[EDO]B:534	`1`	`1`	`183`	`◊`	[EDO]B:526	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`183`	`20.7`	`0.8`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`62`		[EDO]B:543	`2`	`1`	`184`	`f`	[EDO]B:535	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`184`	`19.5`	`0.9`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`63`		[EDO]B:543	`2`	`1`	`184`	`f`	[EDO]B:508	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`184`	`18.6`	`1.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`64`		[EDO]B:508	`3`	`1`	`184`	`f`	[AMP]B:1003	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`474`	`16.1`	`-0.1`	`0.595`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`65`		[EDO]A:522	`2`	`1`	`183`	`f`	[EDO]A:521	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`183`	`15.5`	`0.7`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`66`		A	`2`	`1`	`14994`	`f`	[EDO]B:501	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`2`	`1`	`184`	`13.9`	`0.0`	`0.572`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`67`		[EDO]A:521	`3`	`1`	`183`	`f`	[AMP]A:1003	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`473`	`13.6`	`-0.3`	`0.574`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`68`		[EDO]A:522	`2`	`1`	`183`	`f`	[AMP]A:1003	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`473`	`12.7`	`-0.4`	`0.548`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
62	`69`		[MG]A:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]A:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.7`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
63	`70`		[MG]B:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]B:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.6`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
64	`71`		[EDO]A:523	`2`	`1`	`184`	`f`	[MG]A:1002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`9.7`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
65	`72`		[EDO]B:535	`1`	`1`	`184`	`f`	[MG]B:1002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`9.7`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
66	`73`		A	`2`	`2`	`14994`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`2`	`14994`	`7.1`	`-0.1`	`0.522`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`74`		[EDO]A:523	`2`	`1`	`184`	`f`	[EDO]A:521	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`183`	`6.6`	`0.3`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`75`		[EDO]B:525	`1`	`1`	`184`	`f`	[EDO]B:509	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`184`	`2.5`	`0.1`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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