PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=968-EM-1EJ)

Interfaces in PDB 1xon crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.72 Å

CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN PHOSPHODIESTERASE 4D IN COMPLEX WITH PICLAMILAST

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`76`	`20`	`15215`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`79`	`20`	`15069`	`688.6`	`-1.4`	`0.540`	`15`	`10`	`0`	`0.000`
2	`2`		B	`49`	`16`	`15215`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`65`	`21`	`15069`	`479.3`	`0.4`	`0.642`	`6`	`3`	`0`	`0.000`
3	`3`		[PIL]B:502	`25`	`1`	`578`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`60`	`22`	`15215`	`402.0`	`-7.5`	`0.322`	`2`	`0`	`0`	`0.024`
	`4`		[PIL]A:501	`25`	`1`	`578`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`61`	`23`	`15069`	`377.0`	`-7.1`	`0.335`	`2`	`0`	`0`	`0.024`
	*Average:*													`389.5`	`-7.3`	`0.328`	`2`	`0`	`0`	`0.024`
4	`5`		B	`51`	`14`	`15215`	`◊`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`36`	`12`	`15069`	`384.8`	`1.2`	`0.661`	`7`	`4`	`0`	`0.000`
5	`6`		A	`26`	`9`	`15069`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`31`	`10`	`15215`	`226.6`	`2.1`	`0.794`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
6	`7`		A	`23`	`6`	`15069`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`30`	`9`	`15069`	`221.8`	`0.8`	`0.644`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
7	`8`		[B3P]A:601	`13`	`1`	`488`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`7`	`15069`	`186.7`	`3.4`	`0.429`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		[EDO]A:720	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`15069`	`112.7`	`3.6`	`0.587`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		[EDO]B:717	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`15215`	`100.8`	`3.1`	`0.561`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`106.7`	`3.4`	`0.574`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`11`		[EDO]A:715	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`15069`	`111.7`	`3.4`	`0.477`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
10	`12`		[EDO]A:716	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`9`	`15069`	`111.0`	`3.3`	`0.405`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`13`		[EDO]A:745	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`15069`	`110.2`	`3.6`	`0.607`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`14`		[EDO]B:730	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`15215`	`109.4`	`3.6`	`0.604`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`15`		[EDO]B:708	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`15215`	`108.9`	`2.7`	`0.315`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`16`		[EDO]A:722	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`15069`	`108.8`	`2.6`	`0.309`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`17`		B	`12`	`4`	`15215`	`f`	[B3P]A:601	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`12`	`1`	`488`	`106.2`	`1.1`	`0.272`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`18`		[EDO]B:741	`4`	`1`	`182`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`15215`	`101.7`	`2.7`	`0.445`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`19`		[EDO]B:726	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`15215`	`100.5`	`3.0`	`0.470`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
18	`20`		[EDO]B:701	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`15215`	`97.2`	`3.5`	`0.494`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`21`		[EDO]A:704	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`15069`	`96.9`	`2.5`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`22`		[EDO]B:734	`4`	`1`	`181`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`15215`	`95.5`	`3.4`	`0.493`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
21	`23`		[EDO]B:706	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`15215`	`95.4`	`2.7`	`0.287`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
22	`24`		[EDO]A:723	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`15069`	`94.4`	`1.3`	`0.140`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`25`		[EDO]A:739	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`15069`	`92.1`	`2.3`	`0.252`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`26`		[EDO]A:733	`4`	`1`	`182`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`15069`	`91.9`	`2.5`	`0.273`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`27`		[EDO]A:719	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`15069`	`91.8`	`3.1`	`0.509`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
26	`28`		[EDO]A:732	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`15069`	`91.4`	`3.0`	`0.476`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
27	`29`		[EDO]A:736	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`15069`	`90.1`	`2.5`	`0.265`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`30`		[EDO]A:724	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`15069`	`90.0`	`0.9`	`0.130`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`31`		[EDO]A:712	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`8`	`15069`	`89.1`	`2.5`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		[EDO]B:718	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`15215`	`89.1`	`2.1`	`0.376`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
31	`33`		[EDO]A:744	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`15069`	`88.5`	`0.8`	`0.123`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		[EDO]B:728	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`15215`	`87.5`	`2.3`	`0.405`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[EDO]B:725	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`15215`	`85.6`	`3.2`	`0.303`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
34	`36`		[EDO]A:729	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`15069`	`84.6`	`2.3`	`0.273`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		[EDO]B:740	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`15215`	`84.1`	`2.2`	`0.245`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		[EDO]A:702	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`15069`	`83.8`	`2.7`	`0.290`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
37	`39`		A	`8`	`3`	`15069`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`12`	`5`	`15215`	`82.9`	`-0.8`	`0.372`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`40`		[EDO]A:707	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`15069`	`78.7`	`2.6`	`0.320`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
39	`41`		[EDO]A:731	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15069`	`77.3`	`2.3`	`0.278`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`42`		[EDO]B:727	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`15215`	`73.5`	`2.0`	`0.336`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`43`		B	`11`	`5`	`15215`	`◊`	[EDO]A:707	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`183`	`70.0`	`2.5`	`0.559`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
42	`44`		B	`11`	`4`	`15215`	`◊`	[EDO]A:742	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`4`	`1`	`183`	`63.0`	`1.9`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`45`		[EDO]B:709	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`15215`	`60.1`	`0.9`	`0.523`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
44	`46`		[EDO]A:744	`4`	`1`	`184`	`f`	[PIL]A:501	x,y,z	`1_555`	`11`	`1`	`578`	`52.8`	`0.3`	`0.763`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`47`		[MG]A:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`9`	`15069`	`52.5`	`-7.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`48`		[MG]B:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`9`	`15215`	`52.2`	`-7.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	*Average:*													`52.4`	`-7.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
46	`49`		[EDO]A:731	`3`	`1`	`183`	`f`	B	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`8`	`2`	`15215`	`50.6`	`1.2`	`0.767`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
47	`50`		[EDO]B:727	`3`	`1`	`183`	`◊`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`6`	`3`	`15069`	`49.4`	`1.5`	`0.295`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`51`		B	`4`	`1`	`15215`	`x`	B	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`8`	`4`	`15215`	`45.2`	`0.8`	`0.784`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
49	`52`		[EDO]A:702	`3`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`15215`	`45.0`	`1.6`	`0.289`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`53`		B	`5`	`1`	`15215`	`◊`	[EDO]A:729	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`4`	`1`	`185`	`43.6`	`1.8`	`0.919`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
51	`54`		[EDO]B:725	`3`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`15069`	`43.2`	`1.5`	`0.281`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`55`		[EDO]A:742	`3`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`15069`	`43.0`	`0.8`	`0.808`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
53	`56`		[EDO]B:743	`3`	`1`	`184`	`◊`	[EDO]A:742	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`4`	`1`	`183`	`42.4`	`1.8`	`1.000`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
54	`57`		B	`9`	`4`	`15215`	`f`	[EDO]A:739	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`4`	`1`	`183`	`42.2`	`0.7`	`0.578`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`58`		[ZN]B:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`15215`	`40.9`	`-29.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
	`59`		[ZN]A:1001	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`15069`	`40.8`	`-30.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
	*Average:*													`40.9`	`-30.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
56	`60`		[EDO]B:743	`4`	`1`	`184`	`◊`	[EDO]B:709	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`39.6`	`1.8`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`61`		[EDO]B:718	`3`	`1`	`185`	`f`	[EDO]B:717	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`183`	`39.2`	`1.6`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
58	`62`		[EDO]A:712	`3`	`1`	`184`	`f`	B	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`6`	`3`	`15215`	`38.6`	`0.8`	`0.781`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
59	`63`		[EDO]A:732	`3`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`15215`	`36.7`	`1.7`	`0.930`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`64`		A	`5`	`2`	`15069`	`◊`	[EDO]B:726	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`185`	`36.3`	`1.3`	`0.917`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
61	`65`		[EDO]B:743	`3`	`1`	`184`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`8`	`2`	`15069`	`35.0`	`0.5`	`0.740`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`66`		[EDO]B:743	`3`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`15215`	`34.2`	`0.4`	`0.717`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`67`		[EDO]B:728	`4`	`1`	`183`	`f`	[EDO]B:727	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`33.8`	`1.5`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
64	`68`		A	`4`	`2`	`15069`	`f`	[EDO]B:734	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`4`	`1`	`181`	`28.3`	`0.2`	`0.480`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`69`		[EDO]A:744	`2`	`1`	`184`	`f`	[EDO]A:723	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`184`	`25.5`	`0.9`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
66	`70`		B	`2`	`2`	`15215`	`◊`	[EDO]A:715	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`2`	`1`	`183`	`23.4`	`0.4`	`0.390`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`71`		[EDO]B:718	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`15069`	`19.6`	`0.9`	`0.897`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`72`		[EDO]A:723	`1`	`1`	`184`	`f`	[PIL]A:501	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`578`	`18.7`	`0.8`	`0.763`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`73`		[EDO]B:734	`2`	`1`	`181`	`◊`	[EDO]B:726	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`185`	`17.7`	`0.7`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`74`		[EDO]A:742	`2`	`1`	`183`	`◊`	[EDO]A:729	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`185`	`17.4`	`0.7`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`75`		[PIL]B:502	`3`	`1`	`578`	`f`	[MG]B:1002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`17.3`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
	`76`		[PIL]A:501	`3`	`1`	`578`	`f`	[MG]A:1002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`16.2`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
	*Average:*													`16.8`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
72	`77`		A	`3`	`2`	`15069`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`2`	`15069`	`15.1`	`-0.3`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`78`		[EDO]B:743	`3`	`1`	`184`	`◊`	[EDO]A:729	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`185`	`14.0`	`0.6`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`79`		[MG]A:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]A:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.6`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
75	`80`		[MG]B:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]B:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.5`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
76	`81`		[PIL]B:502	`4`	`1`	`578`	`f`	[ZN]B:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.8`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
	`82`		[PIL]A:501	`4`	`1`	`578`	`f`	[ZN]A:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.1`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
	*Average:*													`11.5`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
77	`83`		[EDO]B:718	`2`	`1`	`185`	`f`	[EDO]A:732	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`184`	`11.3`	`0.6`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`84`		[EDO]A:724	`1`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`15215`	`9.8`	`-0.0`	`0.594`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`85`		[EDO]A:744	`1`	`1`	`184`	`f`	[EDO]A:722	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`183`	`9.8`	`0.6`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`86`		[EDO]A:733	`1`	`1`	`182`	`f`	[EDO]A:724	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`183`	`9.3`	`0.4`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
81	`87`		[EDO]B:709	`1`	`1`	`183`	`◊`	[EDO]A:729	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`2`	`1`	`185`	`8.5`	`0.5`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
82	`88`		B	`3`	`1`	`15215`	`f`	[EDO]A:745	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`2`	`1`	`183`	`8.4`	`0.4`	`0.862`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
83	`89`		[EDO]B:701	`2`	`1`	`183`	`f`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`2`	`1`	`15069`	`6.3`	`0.1`	`0.667`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
84	`90`		[EDO]A:722	`3`	`1`	`183`	`f`	[PIL]A:501	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`578`	`5.8`	`0.0`	`0.617`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
85	`91`		[EDO]B:708	`3`	`1`	`184`	`f`	[PIL]B:502	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`578`	`5.5`	`0.0`	`0.665`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
86	`92`		[EDO]A:742	`1`	`1`	`183`	`◊`	[EDO]A:707	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`183`	`3.6`	`0.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
87	`93`		[EDO]B:709	`1`	`1`	`183`	`f`	[EDO]A:742	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`2`	`1`	`183`	`3.3`	`0.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
88	`94`		[EDO]A:715	`1`	`1`	`183`	`f`	[EDO]A:707	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`183`	`1.0`	`0.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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