PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=913-EP-8CO)

Interfaces in PDB 1y66 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.65 Å

DIOXANE CONTRIBUTES TO THE ALTERED CONFORMATION AND OLIGOMERIZATION STATE OF A DESIGNED ENGRAILED HOMEODOMAIN VARIANT

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`106`	`22`	`4700`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`109`	`25`	`5067`	`973.9`	`-14.9`	`0.253`	`5`	`2`	`0`	`1.000`
	`2`		D	`105`	`23`	`4696`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`102`	`21`	`4558`	`921.1`	`-15.4`	`0.408`	`4`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`947.5`	`-15.2`	`0.330`	`5`	`1`	`0`	`1.000`
2	`3`		D	`51`	`18`	`4696`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`60`	`19`	`5067`	`567.7`	`-10.3`	`0.190`	`1`	`2`	`0`	`1.000`
3	`4`		B	`57`	`15`	`4700`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`53`	`13`	`4696`	`546.2`	`0.2`	`0.920`	`5`	`10`	`0`	`0.000`
4	`5`		D	`27`	`9`	`4696`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`29`	`8`	`4700`	`266.2`	`-5.2`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		C	`30`	`8`	`4558`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`9`	`5067`	`256.3`	`-3.6`	`0.384`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`261.2`	`-4.4`	`0.363`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
5	`7`		C	`27`	`10`	`4558`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`30`	`13`	`4700`	`263.4`	`-4.7`	`0.333`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		B	`29`	`7`	`4700`	`◊`	A	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`26`	`7`	`5067`	`228.1`	`-2.6`	`0.528`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
7	`9`		C	`26`	`5`	`4558`	`◊`	A	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`23`	`8`	`5067`	`203.1`	`-0.9`	`0.698`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
8	`10`		C	`10`	`4`	`4558`	`x`	C	-x+1/2,-y+2,z-1/2	`2_574`	`16`	`5`	`4558`	`120.3`	`-1.2`	`0.571`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`11`		A	`19`	`4`	`5067`	`◊`	D	-x+3/2,-y+2,z-1/2	`2_674`	`12`	`4`	`4696`	`105.6`	`-0.2`	`0.712`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`12`		[DIO]B:190	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`5067`	`94.6`	`2.2`	`0.083`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`13`		[DIO]D:188	`6`	`1`	`218`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`4558`	`94.1`	`2.4`	`0.099`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`14`		[DIO]C:187	`6`	`1`	`217`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`4696`	`92.6`	`2.7`	`0.104`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`15`		[DIO]C:181	`6`	`1`	`218`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`4558`	`86.7`	`2.8`	`0.258`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`16`		[DIO]C:187	`6`	`1`	`217`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`4558`	`85.2`	`2.5`	`0.106`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`17`		[DIO]D:189	`5`	`1`	`217`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`4696`	`84.7`	`2.3`	`0.367`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`18`		[DIO]B:190	`6`	`1`	`218`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`4700`	`82.6`	`2.7`	`0.104`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`19`		B	`8`	`3`	`4700`	`◊`	A	x-1/2,-y+3/2,-z	`4_465`	`9`	`3`	`5067`	`82.4`	`2.1`	`0.912`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
18	`20`		C	`12`	`4`	`4558`	`◊`	B	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`9`	`3`	`4700`	`82.0`	`2.6`	`0.947`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
19	`21`		[DIO]B:184	`5`	`1`	`218`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`4700`	`81.5`	`2.2`	`0.131`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`22`		[DIO]B:184	`6`	`1`	`218`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`4558`	`81.5`	`3.3`	`0.117`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`23`		[DIO]D:188	`5`	`1`	`218`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`4696`	`81.2`	`2.6`	`0.171`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`24`		[DIO]C:183	`5`	`1`	`219`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`4558`	`74.7`	`1.7`	`0.130`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`25`		[DIO]C:182	`6`	`1`	`220`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`4558`	`71.6`	`1.6`	`0.088`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`26`		[DIO]B:185	`6`	`1`	`217`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`4700`	`68.7`	`1.4`	`0.084`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`27`		[DIO]C:186	`5`	`1`	`216`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`4696`	`65.9`	`1.3`	`0.159`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`28`		[DIO]D:189	`6`	`1`	`217`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`5067`	`65.9`	`1.8`	`0.087`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`29`		[DIO]C:186	`5`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`4558`	`64.5`	`1.1`	`0.139`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`30`		A	`6`	`1`	`5067`	`x`	A	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`5`	`3`	`5067`	`62.3`	`0.2`	`0.621`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`31`		B	`11`	`4`	`4700`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`8`	`4`	`4558`	`60.9`	`1.1`	`0.868`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
30	`32`		[DIO]B:185	`6`	`1`	`217`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`5067`	`59.6`	`1.0`	`0.076`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`33`		[DIO]C:183	`6`	`1`	`219`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`4700`	`59.5`	`1.6`	`0.028`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		C	`8`	`2`	`4558`	`◊`	A	x-1/2,-y+3/2,-z	`4_465`	`9`	`2`	`5067`	`56.7`	`-0.5`	`0.590`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		B	`4`	`1`	`4700`	`◊`	D	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`6`	`2`	`4696`	`55.0`	`-0.1`	`0.476`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`36`		[DIO]C:182	`6`	`1`	`220`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`4700`	`47.3`	`0.8`	`0.025`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		[DIO]C:181	`4`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`5067`	`47.0`	`1.1`	`0.063`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		[CD]C:172	`1`	`1`	`112`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`4696`	`38.8`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		[CD]C:172	`1`	`1`	`112`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`4558`	`28.2`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		[CD]A:171	`1`	`1`	`112`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`5067`	`27.9`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		[CD]A:171	`1`	`1`	`112`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`4700`	`27.2`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`30.5`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`42`		C	`10`	`4`	`4558`	`f`	[CD]A:171	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`1`	`1`	`112`	`37.0`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.318`
38	`43`		[DIO]C:186	`4`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`5067`	`33.2`	`0.6`	`0.075`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`44`		B	`7`	`3`	`4700`	`f`	[CD]C:172	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`1`	`1`	`112`	`31.7`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.157`
40	`45`		[DIO]C:183	`5`	`1`	`219`	`f`	[DIO]C:182	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`220`	`30.7`	`1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`46`		[DIO]B:185	`5`	`1`	`217`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`4696`	`30.3`	`0.2`	`0.043`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`47`		[DIO]C:186	`6`	`1`	`216`	`◊`	[DIO]B:185	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`217`	`29.3`	`1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`48`		[DIO]C:183	`4`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`5067`	`27.5`	`0.7`	`0.073`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`49`		[DIO]C:182	`5`	`1`	`220`	`◊`	[DIO]C:181	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`218`	`26.5`	`1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`50`		[DIO]D:189	`3`	`1`	`217`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`4558`	`26.5`	`0.6`	`0.082`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`51`		[DIO]C:181	`5`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`4700`	`25.8`	`0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`52`		[DIO]B:185	`3`	`1`	`217`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`4558`	`20.2`	`0.1`	`0.128`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`53`		[DIO]C:186	`4`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`4700`	`20.2`	`0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`54`		[DIO]C:182	`2`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`5067`	`16.7`	`0.2`	`0.167`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`55`		[DIO]C:182	`3`	`1`	`220`	`◊`	A	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`4`	`2`	`5067`	`13.1`	`0.5`	`0.860`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`56`		D	`1`	`1`	`4696`	`◊`	A	-x+3/2,-y+2,z-1/2	`2_674`	`2`	`2`	`5067`	`7.8`	`-0.1`	`0.521`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`57`		[DIO]D:189	`3`	`1`	`217`	`f`	[DIO]C:181	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`218`	`7.7`	`0.4`	`0.577`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`58`		[DIO]B:184	`2`	`1`	`218`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`4696`	`5.9`	`0.3`	`0.913`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`59`		C	`1`	`1`	`4558`	`◊`	D	-x+1/2,-y+2,z-1/2	`2_574`	`2`	`1`	`4696`	`4.8`	`-0.0`	`0.698`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`60`		B	`1`	`1`	`4700`	`f`	[DIO]C:187	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`2`	`1`	`217`	`2.5`	`0.0`	`0.710`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`61`		A	`1`	`1`	`5067`	`x`	A	-x+3/2,-y+2,z-1/2	`2_674`	`1`	`1`	`5067`	`0.9`	`0.0`	`0.753`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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