PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=629-E1-C55)

Interfaces in PDB 1yp4 crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.30 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF POTATO TUBER ADP-GLUCOSE PYROPHOSPHORYLASE IN COMPLEX WITH ADP-GLUCOSE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`153`	`46`	`19371`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`150`	`45`	`18567`	`1376.3`	`-17.8`	`0.041`	`16`	`0`	`0`	`0.126`
	`2`		D	`142`	`45`	`18992`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`152`	`47`	`18886`	`1363.9`	`-16.1`	`0.063`	`16`	`0`	`0`	`0.126`
	*Average:*													`1370.1`	`-16.9`	`0.052`	`16`	`0`	`0`	`0.126`
2	`3`		C	`138`	`37`	`18886`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`146`	`37`	`18567`	`1181.2`	`-5.4`	`0.490`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
3	`4`		C	`97`	`28`	`18886`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`104`	`33`	`19371`	`865.3`	`-6.2`	`0.307`	`4`	`4`	`0`	`0.043`
	`5`		D	`77`	`24`	`18992`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`79`	`25`	`18567`	`727.9`	`-6.9`	`0.224`	`4`	`0`	`0`	`0.043`
	*Average:*													`796.6`	`-6.5`	`0.266`	`4`	`2`	`0`	`0.043`
4	`6`		[ADQ]B:506	`36`	`1`	`731`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`76`	`34`	`19371`	`535.5`	`-5.4`	`0.610`	`11`	`0`	`0`	`0.052`
5	`7`		[ADP]A:557	`25`	`1`	`577`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`55`	`22`	`18567`	`340.3`	`-5.9`	`0.520`	`8`	`0`	`0`	`0.045`
	`8`		[ADP]C:558	`25`	`1`	`548`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`55`	`23`	`18886`	`318.2`	`-3.9`	`0.572`	`8`	`0`	`0`	`0.045`
	*Average:*													`329.3`	`-4.9`	`0.546`	`8`	`0`	`0`	`0.045`
6	`9`		B	`30`	`9`	`19371`	`◊`	D	x-1,y,z-1	`1_454`	`33`	`10`	`18992`	`255.6`	`-1.4`	`0.379`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
7	`10`		D	`34`	`12`	`18992`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`12`	`19371`	`252.4`	`0.6`	`0.687`	`3`	`0`	`1`	`0.011`
8	`11`		C	`26`	`10`	`18886`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`26`	`10`	`19371`	`238.2`	`1.2`	`0.740`	`0`	`3`	`0`	`0.000`
9	`12`		D	`26`	`8`	`18992`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`18`	`6`	`19371`	`221.6`	`0.1`	`0.557`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`13`		C	`24`	`7`	`18886`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`24`	`10`	`19371`	`210.5`	`0.6`	`0.658`	`1`	`3`	`0`	`0.000`
11	`14`		A	`25`	`8`	`18567`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`22`	`6`	`19371`	`199.2`	`0.8`	`0.718`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
12	`15`		D	`17`	`6`	`18992`	`◊`	A	-x+2,y-1/2,-z+2	`2_747`	`18`	`5`	`18567`	`152.0`	`-1.4`	`0.387`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`16`		B	`19`	`6`	`19371`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`17`	`7`	`18886`	`133.6`	`0.4`	`0.671`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
14	`17`		[SO4]C:1010	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`18886`	`126.5`	`-18.2`	`0.787`	`5`	`0`	`0`	`0.111`
15	`18`		[SO4]D:1011	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`24`	`10`	`18992`	`119.5`	`-18.2`	`0.801`	`6`	`0`	`0`	`0.113`
16	`19`		[SO4]A:1008	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`18567`	`118.5`	`-19.2`	`0.773`	`10`	`0`	`0`	`0.111`
17	`20`		[SO4]D:1003	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`18992`	`117.2`	`-18.4`	`0.828`	`6`	`0`	`0`	`0.115`
18	`21`		[SO4]B:1001	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`19371`	`114.6`	`-18.6`	`0.830`	`7`	`0`	`0`	`0.109`
19	`22`		[SO4]B:1021	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`19371`	`113.7`	`-16.3`	`0.695`	`9`	`0`	`0`	`0.102`
20	`23`		[SO4]B:1009	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`19371`	`111.0`	`-15.3`	`0.834`	`6`	`0`	`0`	`0.091`
21	`24`		[SO4]A:1000	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`18567`	`108.8`	`-20.5`	`0.677`	`8`	`0`	`0`	`0.113`
22	`25`		[SO4]C:1002	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`18886`	`107.2`	`-19.5`	`0.745`	`6`	`0`	`0`	`0.120`
23	`26`		A	`15`	`7`	`18567`	`◊`	D	-x+2,y-1/2,-z+2	`2_747`	`9`	`4`	`18992`	`101.9`	`-0.1`	`0.591`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`27`		[SO4]D:1023	`5`	`1`	`187`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`18992`	`100.6`	`-15.4`	`0.679`	`4`	`0`	`0`	`0.093`
25	`28`		[SO4]B:1006	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`19371`	`100.1`	`-14.0`	`0.905`	`3`	`0`	`0`	`0.077`
26	`29`		[SO4]A:1020	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`18567`	`97.3`	`-15.3`	`0.815`	`7`	`0`	`0`	`0.087`
27	`30`		[SO4]C:1022	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`18886`	`96.8`	`-14.8`	`0.827`	`6`	`0`	`0`	`0.095`
28	`31`		C	`9`	`3`	`18886`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`18567`	`91.9`	`-2.7`	`0.071`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
29	`32`		[SO4]D:1004	`5`	`1`	`188`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`18992`	`90.7`	`-11.5`	`0.936`	`5`	`0`	`0`	`0.075`
30	`33`		[SO4]A:1007	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`18567`	`89.0`	`-11.5`	`0.947`	`6`	`0`	`0`	`0.067`
31	`34`		[SO4]C:1005	`5`	`1`	`187`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`18886`	`83.3`	`-11.6`	`0.926`	`4`	`0`	`0`	`0.073`
32	`35`		B	`9`	`3`	`19371`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`3`	`18567`	`79.2`	`0.9`	`0.776`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		C	`5`	`3`	`18886`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`3`	`18992`	`23.6`	`0.5`	`0.762`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`51.4`	`0.7`	`0.769`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`37`		A	`10`	`6`	`18567`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`4`	`18992`	`69.8`	`3.1`	`0.945`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`38`		C	`6`	`2`	`18886`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`8`	`3`	`18567`	`61.3`	`-0.7`	`0.394`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`39`		[SO4]C:1005	`4`	`1`	`187`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`19371`	`46.6`	`-5.8`	`0.770`	`1`	`0`	`0`	`0.031`
36	`40`		[ADP]A:557	`6`	`1`	`577`	`f`	[SO4]A:1020	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`186`	`41.2`	`-4.8`	`0.839`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
37	`41`		[SO4]B:1006	`3`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`18886`	`40.1`	`-3.7`	`0.970`	`2`	`0`	`0`	`0.023`
38	`42`		[ADP]C:558	`8`	`1`	`548`	`f`	[SO4]C:1022	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`186`	`39.4`	`-4.9`	`0.860`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
39	`43`		[ADQ]B:506	`6`	`1`	`731`	`f`	[SO4]B:1021	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`186`	`36.1`	`-4.7`	`0.806`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
40	`44`		[SO4]A:1007	`3`	`1`	`186`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`18992`	`24.4`	`-3.2`	`0.470`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
41	`45`		C	`2`	`1`	`18886`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`1`	`1`	`18992`	`14.4`	`0.3`	`0.769`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`46`		[SO4]D:1004	`3`	`1`	`188`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`18567`	`7.7`	`-0.7`	`0.850`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
43	`47`		[SO4]C:1010	`1`	`1`	`185`	`f`	[SO4]C:1002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`7.4`	`-1.8`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
44	`48`		[SO4]A:1008	`1`	`1`	`186`	`f`	[SO4]A:1000	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`186`	`6.3`	`-1.5`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
45	`49`		[SO4]B:1009	`1`	`1`	`185`	`f`	[SO4]B:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`186`	`5.5`	`-1.3`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
46	`50`		[SO4]D:1011	`3`	`1`	`186`	`f`	[SO4]D:1003	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`2.9`	`-0.6`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

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