PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=717-48-MG5)

Interfaces in PDB 1yq9 crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 2.35 Å

STRUCTURE OF THE UNREADY OXIDIZED FORM OF [NIFE] HYDROGENASE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		H	`368`	`91`	`19944`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`345`	`90`	`12551`	`3495.7`	`-40.3`	`0.030`	`56`	`10`	`0`	`0.391`
	`2`		I	`364`	`90`	`19970`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`339`	`89`	`12582`	`3408.1`	`-37.2`	`0.038`	`53`	`12`	`0`	`0.391`
	*Average:*													`3451.9`	`-38.7`	`0.034`	`55`	`11`	`0`	`0.391`
2	`3`		I	`50`	`19`	`19970`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`45`	`16`	`12551`	`364.4`	`1.7`	`0.859`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
3	`4`		B	`37`	`12`	`12582`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`42`	`12`	`12551`	`340.0`	`-0.9`	`0.737`	`6`	`7`	`0`	`0.000`
4	`5`		[SF4]B:265	`8`	`1`	`309`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`14`	`12582`	`187.6`	`-20.6`	`0.596`	`0`	`0`	`0`	`0.124`
	`6`		[SF4]A:265	`8`	`1`	`309`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`13`	`12551`	`187.3`	`-20.4`	`0.464`	`0`	`0`	`0`	`0.124`
	*Average:*													`187.5`	`-20.5`	`0.530`	`0`	`0`	`0`	`0.124`
5	`7`		H	`20`	`6`	`19944`	`x`	H	x,y,z-1	`1_554`	`26`	`9`	`19944`	`178.2`	`1.3`	`0.780`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		[SF4]B:267	`8`	`1`	`309`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`31`	`15`	`12582`	`174.5`	`-18.9`	`0.184`	`1`	`0`	`0`	`0.117`
	`9`		[SF4]A:267	`8`	`1`	`308`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`15`	`12551`	`171.5`	`-18.7`	`0.214`	`1`	`0`	`0`	`0.117`
	*Average:*													`173.0`	`-18.8`	`0.199`	`1`	`0`	`0`	`0.117`
7	`10`		B	`19`	`8`	`12582`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`12551`	`174.4`	`0.3`	`0.774`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`11`		[F3S]B:266	`7`	`1`	`301`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`13`	`12582`	`170.3`	`-16.7`	`0.341`	`1`	`0`	`0`	`0.104`
	`12`		[F3S]A:266	`7`	`1`	`299`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`14`	`12551`	`169.2`	`-16.6`	`0.347`	`1`	`0`	`0`	`0.104`
	*Average:*													`169.8`	`-16.6`	`0.344`	`1`	`0`	`0`	`0.104`
9	`13`		[FCO]I:537	`7`	`1`	`261`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`16`	`9`	`19970`	`115.2`	`-1.9`	`0.270`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
	`14`		[FCO]H:537	`7`	`1`	`264`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`15`	`10`	`19944`	`114.7`	`-1.7`	`0.276`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
	*Average:*													`114.9`	`-1.8`	`0.273`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
10	`15`		B	`19`	`8`	`12582`	`f`	[GOL]A:1273	x-1,y,z-1	`1_454`	`6`	`1`	`221`	`114.4`	`-0.1`	`0.627`	`2`	`0`	`0`	`0.006`
11	`16`		[GOL]A:1272	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`12551`	`109.9`	`-0.3`	`0.644`	`3`	`0`	`0`	`0.009`
12	`17`		[GOL]H:1544	`6`	`1`	`217`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`19944`	`108.2`	`-0.1`	`0.555`	`2`	`0`	`0`	`0.006`
13	`18`		[GOL]A:1271	`6`	`1`	`221`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`12551`	`100.1`	`-0.1`	`0.626`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
14	`19`		I	`12`	`8`	`19970`	`◊`	H	x,y-1,z	`1_545`	`20`	`10`	`19944`	`99.7`	`2.4`	`0.883`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
15	`20`		B	`14`	`6`	`12582`	`◊`	I	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`4`	`19970`	`89.7`	`0.3`	`0.732`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`21`		B	`10`	`4`	`12582`	`◊`	H	x-1,y,z-1	`1_454`	`10`	`5`	`19944`	`88.2`	`0.9`	`0.808`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`22`		[H2S]B:2268	`1`	`1`	`133`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`12582`	`78.4`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
	`23`		[H2S]A:1268	`1`	`1`	`133`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`12551`	`77.6`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
	*Average:*													`78.0`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
18	`24`		[GOL]A:1542	`5`	`1`	`219`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`19944`	`77.1`	`-0.7`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
19	`25`		[GOL]H:1543	`6`	`1`	`217`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`19944`	`76.6`	`-0.6`	`0.501`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
20	`26`		B	`11`	`4`	`12582`	`f`	[GOL]A:1271	x-1,y,z-1	`1_454`	`5`	`1`	`221`	`75.1`	`-1.4`	`0.324`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
21	`27`		[GOL]B:2542	`5`	`1`	`220`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`19970`	`74.4`	`-0.9`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
22	`28`		I	`6`	`1`	`19970`	`◊`	H	x-1,y-1,z	`1_445`	`7`	`3`	`19944`	`72.8`	`-0.1`	`0.540`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`29`		[GOL]A:1273	`6`	`1`	`221`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`12551`	`70.5`	`-0.6`	`0.530`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`30`		[GOL]B:2542	`5`	`1`	`220`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`12582`	`67.5`	`-0.2`	`0.547`	`2`	`0`	`0`	`0.007`
25	`31`		[H2S]I:2541	`1`	`1`	`133`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`19970`	`67.0`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
	`32`		[H2S]H:1541	`1`	`1`	`133`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`19944`	`65.5`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
	*Average:*													`66.2`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
26	`33`		[GOL]A:1542	`5`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`12551`	`64.8`	`-0.6`	`0.475`	`2`	`0`	`0`	`0.009`
27	`34`		A	`8`	`3`	`12551`	`◊`	H	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`2`	`19944`	`63.2`	`0.9`	`0.715`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`35`		B	`12`	`6`	`12582`	`◊`	[GOL]H:1543	x-1,y,z-1	`1_454`	`4`	`1`	`217`	`59.5`	`0.1`	`0.665`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`36`		[SF4]B:267	`4`	`1`	`309`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`19970`	`59.4`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
	`37`		[SF4]A:267	`4`	`1`	`308`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`19944`	`57.9`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
	*Average:*													`58.6`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
30	`38`		[MG]I:540	`1`	`1`	`98`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`19970`	`53.6`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
	`39`		[MG]H:540	`1`	`1`	`98`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`19944`	`52.2`	`-9.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
	*Average:*													`52.9`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
31	`40`		[F3S]B:266	`4`	`1`	`301`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`19970`	`53.1`	`-2.3`	`0.000`	`1`	`0`	`0`	`0.017`
	`41`		[F3S]A:266	`4`	`1`	`299`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`19944`	`52.2`	`-2.3`	`0.000`	`1`	`0`	`0`	`0.017`
	*Average:*													`52.7`	`-2.3`	`0.000`	`1`	`0`	`0`	`0.017`
32	`42`		B	`8`	`3`	`12582`	`◊`	[GOL]A:1272	x-1,y,z-1	`1_454`	`5`	`1`	`217`	`52.6`	`-0.7`	`0.453`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`43`		[GOL]H:1543	`3`	`1`	`217`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`12551`	`44.3`	`-0.4`	`0.469`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
34	`44`		[GOL]H:1544	`5`	`1`	`217`	`◊`	H	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`2`	`19944`	`38.8`	`0.2`	`0.632`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`45`		I	`7`	`4`	`19970`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`6`	`3`	`12551`	`38.1`	`0.5`	`0.727`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`46`		[PER]I:539	`2`	`1`	`124`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`19970`	`36.7`	`0.7`	`0.743`	`3`	`0`	`0`	`0.004`
37	`47`		I	`5`	`3`	`19970`	`◊`	H	x,y-1,z-1	`1_544`	`7`	`3`	`19944`	`36.6`	`0.8`	`0.799`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`48`		[PER]H:539	`2`	`1`	`125`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`19944`	`36.5`	`0.7`	`0.737`	`3`	`0`	`0`	`0.004`
39	`49`		I	`3`	`1`	`19970`	`◊`	H	x-1,y-1,z-1	`1_444`	`2`	`1`	`19944`	`35.8`	`0.1`	`0.461`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
40	`50`		[H2S]H:1541	`1`	`1`	`133`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`12551`	`34.6`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
	`51`		[H2S]I:2541	`1`	`1`	`133`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`12582`	`34.5`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
	*Average:*													`34.6`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
41	`52`		I	`2`	`1`	`19970`	`x`	I	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`1`	`19970`	`33.7`	`-0.1`	`0.259`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`53`		[PER]H:539	`2`	`1`	`125`	`cf`	[NI]H:538	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`115`	`33.0`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
43	`54`		[PER]I:539	`2`	`1`	`124`	`cf`	[NI]I:538	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`115`	`32.3`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
44	`55`		[FCO]H:537	`3`	`1`	`264`	`f`	[NI]H:538	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`115`	`32.0`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
	`56`		[FCO]I:537	`3`	`1`	`261`	`f`	[NI]I:538	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`115`	`31.9`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
	*Average:*													`32.0`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
45	`57`		B	`9`	`4`	`12582`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`2`	`12551`	`29.4`	`-0.7`	`0.349`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`58`		[PER]H:539	`2`	`1`	`125`	`cf`	[FCO]H:537	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`264`	`28.6`	`-0.6`	`0.677`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
47	`59`		[PER]I:539	`2`	`1`	`124`	`cf`	[FCO]I:537	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`261`	`28.2`	`-0.6`	`0.677`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
48	`60`		[GOL]A:1272	`2`	`1`	`217`	`◊`	[GOL]A:1271	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`221`	`22.3`	`-0.4`	`0.422`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`61`		I	`3`	`1`	`19970`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`2`	`12582`	`17.7`	`0.2`	`0.744`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
50	`62`		[GOL]A:1271	`2`	`1`	`221`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`19944`	`11.3`	`0.1`	`0.652`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`63`		[GOL]B:2542	`1`	`1`	`220`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12551`	`0.3`	`0.0`	`0.592`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe