PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=398-46-2ME)

Interfaces in PDB 2b1d crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 2.50 Å

5'-D(*GP*CP*AP*GP*AP*CP*GP*TP*CP*TP*GP*C)-3' METHIONINE REPRESSOR BINDING SITE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`54`	`12`	`2772`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`54`	`12`	`2786`	`551.3`	`-6.7`	`0.586`	`34`	`0`	`0`	`1.000`
	`2`		D	`54`	`12`	`2760`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`53`	`12`	`2785`	`550.6`	`-6.6`	`0.577`	`34`	`0`	`0`	`1.000`
	`3`		F	`58`	`12`	`2759`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`59`	`12`	`2772`	`545.2`	`-8.7`	`0.531`	`38`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`549.0`	`-7.3`	`0.565`	`35`	`0`	`0`	`1.000`
2	`4`		D	`14`	`2`	`2760`	`x`	D	x-1,y,z	`1_455`	`20`	`2`	`2760`	`137.0`	`2.9`	`0.825`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		B	`20`	`2`	`2772`	`x`	B	x,y,z-1	`1_554`	`15`	`2`	`2772`	`137.0`	`2.9`	`0.833`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		A	`16`	`2`	`2786`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`20`	`2`	`2786`	`135.9`	`3.6`	`0.847`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		F	`19`	`2`	`2759`	`x`	F	x,y-1,z	`1_545`	`15`	`2`	`2759`	`132.0`	`3.4`	`0.841`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		C	`19`	`2`	`2785`	`x`	C	x-1,y,z	`1_455`	`15`	`2`	`2785`	`129.2`	`3.4`	`0.842`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		E	`15`	`2`	`2772`	`x`	E	x,y-1,z	`1_545`	`21`	`2`	`2772`	`126.6`	`3.5`	`0.852`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`132.9`	`3.3`	`0.840`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
3	`10`		C	`11`	`4`	`2785`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`2786`	`89.3`	`-2.9`	`0.406`	`3`	`0`	`0`	`0.211`
4	`11`		D	`13`	`4`	`2760`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`2772`	`82.6`	`-1.9`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
5	`12`		[NCO]C:2507	`4`	`1`	`268`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`2785`	`80.3`	`0.5`	`0.498`	`5`	`0`	`0`	`0.086`
6	`13`		[NCO]F:2506	`5`	`1`	`267`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`2759`	`79.1`	`0.5`	`0.408`	`5`	`0`	`0`	`0.027`
7	`14`		[NCO]A:2505	`4`	`1`	`265`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`2786`	`79.1`	`0.0`	`0.442`	`5`	`0`	`0`	`0.109`
8	`15`		E	`7`	`3`	`2772`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`2785`	`63.6`	`-2.2`	`0.393`	`1`	`0`	`0`	`0.041`
9	`16`		[NCO]A:2505	`4`	`1`	`265`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`2759`	`57.2`	`-1.8`	`0.126`	`3`	`0`	`0`	`0.049`
10	`17`		[NCO]F:2506	`4`	`1`	`267`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`2772`	`50.9`	`-0.4`	`0.282`	`1`	`0`	`0`	`0.013`
11	`18`		B	`5`	`1`	`2772`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`1`	`2786`	`46.5`	`-0.3`	`0.520`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		C	`6`	`1`	`2785`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`1`	`2760`	`44.9`	`-0.3`	`0.544`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		F	`6`	`1`	`2759`	`◊`	E	x,y-1,z	`1_545`	`6`	`1`	`2772`	`37.8`	`-0.2`	`0.550`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`43.1`	`-0.3`	`0.538`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`21`		[NCO]C:2507	`3`	`1`	`268`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`2786`	`44.5`	`-1.8`	`0.122`	`4`	`0`	`0`	`0.178`
13	`22`		[NCO]A:2505	`3`	`1`	`265`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`2785`	`43.9`	`-1.7`	`0.133`	`4`	`0`	`0`	`0.170`
14	`23`		F	`9`	`5`	`2759`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`2785`	`43.4`	`-1.8`	`0.248`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
15	`24`		[NCO]F:2506	`4`	`1`	`267`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`2785`	`43.0`	`-1.9`	`0.379`	`2`	`0`	`0`	`0.137`
16	`25`		[NCO]A:2505	`4`	`1`	`265`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`2772`	`42.4`	`-0.5`	`0.168`	`1`	`0`	`0`	`0.013`
17	`26`		[NCO]C:2507	`3`	`1`	`268`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`2772`	`41.0`	`-1.5`	`0.563`	`1`	`0`	`0`	`0.017`
18	`27`		F	`8`	`3`	`2759`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`2786`	`40.4`	`-1.0`	`0.432`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
19	`28`		[NCO]F:2506	`3`	`1`	`267`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`2786`	`40.2`	`-1.5`	`0.151`	`2`	`0`	`0`	`0.116`
20	`29`		[NCO]C:2507	`4`	`1`	`268`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`2760`	`33.4`	`-0.6`	`0.643`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
21	`30`		E	`5`	`1`	`2772`	`◊`	F	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`1`	`2759`	`28.1`	`-0.3`	`0.523`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		A	`5`	`1`	`2786`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`1`	`2772`	`26.4`	`-0.2`	`0.533`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		D	`5`	`1`	`2760`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`2785`	`22.8`	`0.1`	`0.555`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`25.8`	`-0.1`	`0.537`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`33`		C	`2`	`1`	`2785`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`2772`	`25.4`	`-1.2`	`0.313`	`1`	`0`	`0`	`0.035`
	`34`		D	`3`	`2`	`2760`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`2786`	`20.9`	`-1.0`	`0.338`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
	*Average:*													`23.2`	`-1.1`	`0.326`	`1`	`0`	`0`	`0.035`
23	`35`		F	`4`	`2`	`2759`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`2785`	`23.4`	`-0.9`	`0.395`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`36`		[MG]B:2383	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`2772`	`17.8`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
25	`37`		E	`2`	`1`	`2772`	`◊`	B	x-1,y,z+1	`1_456`	`4`	`1`	`2772`	`14.9`	`-0.5`	`0.394`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`38`		E	`4`	`4`	`2772`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`2786`	`14.5`	`-0.8`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
27	`39`		[NCO]F:2506	`2`	`1`	`267`	`f`	[NCO]A:2505	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`265`	`11.7`	`0.1`	`0.707`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`40`		E	`2`	`2`	`2772`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`2760`	`11.2`	`-0.6`	`0.359`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
29	`41`		[MG]B:2383	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`2786`	`10.0`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
30	`42`		F	`1`	`1`	`2759`	`◊`	D	x-1,y,z+1	`1_456`	`1`	`1`	`2760`	`9.8`	`-0.2`	`0.362`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`43`		F	`3`	`1`	`2759`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`2772`	`9.2`	`-0.4`	`0.412`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
32	`44`		A	`1`	`1`	`2786`	`◊`	E	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`2772`	`4.7`	`-0.4`	`0.207`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`45`		B	`1`	`1`	`2772`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`2760`	`3.3`	`-0.4`	`0.188`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`46`		A	`1`	`1`	`2786`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`2760`	`0.1`	`-0.0`	`0.314`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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