PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=515-5E-OBC)

Interfaces in PDB 2hba crystal.
Space symmetry group: C 2 2 21. Resolution: 1.25 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF N-TERMINAL DOMAIN OF RIBOSOMAL PROTEIN L9 (NTL9) K12M

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`67`	`19`	`3735`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`63`	`17`	`3724`	`581.0`	`-7.1`	`0.318`	`4`	`0`	`0`	`0.003`
2	`2`		A	`56`	`15`	`3724`	`◊`	B	-x-1/2,y-1/2,-z-1/2	`7_444`	`58`	`14`	`3735`	`420.8`	`-6.5`	`0.253`	`3`	`0`	`0`	`0.024`
3	`3`		B	`36`	`11`	`3735`	`◊`	B	-x-1,y,-z-1/2	`3_454`	`36`	`11`	`3735`	`302.9`	`1.1`	`0.750`	`4`	`0`	`0`	`0.004`
	`4`		A	`33`	`10`	`3724`	`◊`	A	-x,y,-z-1/2	`3_554`	`34`	`10`	`3724`	`273.8`	`0.3`	`0.722`	`6`	`0`	`0`	`0.004`
	*Average:*													`288.4`	`0.7`	`0.736`	`5`	`0`	`0`	`0.004`
4	`5`		B	`14`	`6`	`3735`	`◊`	A	-x-1/2,-y-1/2,z-1/2	`6_444`	`8`	`3`	`3724`	`66.5`	`2.0`	`0.824`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`6`		A	`5`	`3`	`3724`	`◊`	B	-x-1/2,-y-1/2,z-1/2	`6_444`	`4`	`2`	`3735`	`35.3`	`0.7`	`0.791`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`50.9`	`1.3`	`0.807`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
5	`7`		B	`8`	`2`	`3735`	`◊`	B	x,-y,-z	`4_555`	`8`	`2`	`3735`	`63.7`	`0.8`	`0.777`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
6	`8`		[CL]B:202	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`3735`	`56.6`	`-7.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
7	`9`		A	`11`	`4`	`3724`	`◊`	[IMD]B:301	-x-1/2,y-1/2,-z-1/2	`7_444`	`5`	`1`	`196`	`56.0`	`1.6`	`0.203`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`10`		B	`8`	`4`	`3735`	`◊`	A	x-1/2,y+1/2,z	`5_455`	`7`	`3`	`3724`	`51.4`	`0.4`	`0.596`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`11`		[ZN]B:108	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]B:108	x,-y,-z	`4_555`	`1`	`1`	`98`	`43.8`	`-35.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
10	`12`		[CL]A:208	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`3724`	`43.2`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
	`13`		[CL]B:207	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`3735`	`33.3`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
	*Average:*													`38.3`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.049`
11	`14`		[CL]A:208	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	-x-1/2,y-1/2,-z-1/2	`7_444`	`6`	`4`	`3735`	`40.9`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	`15`		A	`8`	`3`	`3724`	`◊`	[CL]B:209	-x-1/2,y-1/2,-z-1/2	`7_444`	`1`	`1`	`125`	`36.4`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	`16`		A	`8`	`4`	`3724`	`◊`	[CL]B:207	-x-1/2,y-1/2,-z-1/2	`7_444`	`1`	`1`	`125`	`30.9`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	*Average:*													`36.1`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
12	`17`		[CL]A:203	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`3724`	`40.5`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
	`18`		[CL]B:210	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`3735`	`31.4`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
	*Average:*													`36.0`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
13	`19`		A	`5`	`2`	`3724`	`◊`	A	x,-y-1,-z	`4_545`	`5`	`2`	`3724`	`38.1`	`0.1`	`0.705`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
14	`20`		[CL]B:210	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	-x-1/2,-y-1/2,z-1/2	`6_444`	`12`	`3`	`3724`	`34.9`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		[CL]A:203	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	-x-1/2,-y-1/2,z-1/2	`6_444`	`10`	`2`	`3735`	`29.4`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`32.1`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`22`		[ZN]A:101	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`3724`	`34.8`	`-17.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.153`
	`23`		[ZN]B:103	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`3735`	`32.2`	`-16.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.153`
	*Average:*													`33.5`	`-17.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.153`
16	`24`		[CL]A:205	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`3724`	`34.5`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	`25`		[CL]B:206	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3735`	`19.1`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	`26`		[CL]A:204	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`3724`	`16.0`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	*Average:*													`23.2`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
17	`27`		[ZN]B:104	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`3735`	`32.7`	`-15.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
	`28`		[ZN]A:102	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`3724`	`22.6`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
	*Average:*													`27.6`	`-12.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
18	`29`		[CL]A:208	`1`	`1`	`125`	`f`	[ZN]A:106	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`32.6`	`-18.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.155`
19	`30`		[ZN]A:106	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	-x-1/2,y-1/2,-z-1/2	`7_444`	`9`	`4`	`3735`	`30.1`	`-13.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
	`31`		A	`5`	`3`	`3724`	`◊`	[ZN]B:107	-x-1/2,y-1/2,-z-1/2	`7_444`	`1`	`1`	`98`	`14.1`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
	*Average:*													`22.1`	`-10.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
20	`32`		[CL]B:201	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	-x-1,y,-z-1/2	`3_454`	`10`	`3`	`3735`	`29.4`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
21	`33`		[CL]B:201	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`3735`	`29.2`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
22	`34`		[ZN]B:105	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`3735`	`28.5`	`-13.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
23	`35`		[ZN]B:108	`1`	`1`	`98`	`x`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`3735`	`28.3`	`-12.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.122`
24	`36`		A	`4`	`1`	`3724`	`◊`	[CL]B:206	-x-1/2,-y-1/2,z-1/2	`6_444`	`1`	`1`	`125`	`28.0`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		B	`2`	`1`	`3735`	`◊`	[CL]A:204	-x-1/2,-y-1/2,z-1/2	`6_444`	`1`	`1`	`125`	`22.2`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		B	`2`	`1`	`3735`	`◊`	[CL]A:205	-x-1/2,-y-1/2,z-1/2	`6_444`	`1`	`1`	`125`	`12.1`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`20.8`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`39`		[CL]B:206	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`8_445`	`4`	`2`	`3724`	`27.6`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
	`40`		B	`3`	`1`	`3735`	`◊`	[CL]A:204	x-1/2,-y-1/2,-z	`8_445`	`1`	`1`	`125`	`25.4`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
	`41`		B	`2`	`1`	`3735`	`◊`	[CL]A:205	x-1/2,-y-1/2,-z	`8_445`	`1`	`1`	`125`	`11.2`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
	*Average:*													`21.4`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
26	`42`		[IMD]B:301	`3`	`1`	`196`	`◊`	B	x,-y,-z-1	`4_554`	`3`	`1`	`3735`	`27.1`	`0.5`	`0.201`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`43`		[CL]B:206	`1`	`1`	`125`	`f`	[ZN]B:104	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`26.6`	`-14.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.085`
28	`44`		[CL]A:203	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	-x-1/2,y-1/2,-z-1/2	`7_444`	`3`	`1`	`3735`	`25.7`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
	`45`		A	`2`	`1`	`3724`	`◊`	[CL]B:210	-x-1/2,y-1/2,-z-1/2	`7_444`	`1`	`1`	`125`	`16.1`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
	*Average:*													`20.9`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
29	`46`		[CL]A:205	`1`	`1`	`125`	`f`	[CL]A:204	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`25.2`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
30	`47`		[CL]A:203	`1`	`1`	`125`	`f`	[ZN]A:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`25.0`	`-13.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.115`
31	`48`		[ZN]B:103	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	-x-1/2,-y-1/2,z-1/2	`6_444`	`10`	`3`	`3724`	`23.9`	`-7.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		[ZN]A:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	-x-1/2,-y-1/2,z-1/2	`6_444`	`5`	`2`	`3735`	`15.3`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`19.6`	`-6.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`50`		[CL]A:204	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,-y-1,-z	`4_545`	`3`	`1`	`3724`	`22.8`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
	`51`		[CL]B:206	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	x,-y,-z	`4_555`	`2`	`1`	`3735`	`21.0`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
	`52`		[CL]A:205	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,-y-1,-z	`4_545`	`3`	`1`	`3724`	`14.1`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
	*Average:*													`19.3`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
33	`53`		[IMD]B:301	`3`	`1`	`196`	`f`	[ZN]B:107	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`22.5`	`-9.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
34	`54`		[CL]B:209	`1`	`1`	`125`	`f`	[ZN]B:107	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`22.2`	`-11.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
35	`55`		[CL]B:202	`1`	`1`	`125`	`f`	[ZN]B:105	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`22.0`	`-10.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
36	`56`		[CL]A:205	`1`	`1`	`125`	`f`	[ZN]A:102	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`21.8`	`-11.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.097`
37	`57`		[CL]B:201	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x-1/2,y+1/2,z	`5_455`	`3`	`1`	`3724`	`21.2`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
38	`58`		[ZN]A:106	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`3724`	`21.2`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
	`59`		[ZN]B:107	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`3735`	`17.9`	`-6.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
	*Average:*													`19.6`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
39	`60`		[IMD]B:301	`2`	`1`	`196`	`f`	[CL]B:209	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`21.1`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
40	`61`		[CL]B:210	`1`	`1`	`125`	`f`	[ZN]B:103	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`20.7`	`-11.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.065`
41	`62`		[IMD]B:301	`2`	`1`	`196`	`f`	[CL]B:207	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`20.5`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
42	`63`		[CL]B:207	`1`	`1`	`125`	`f`	[ZN]B:107	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`20.0`	`-10.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.062`
43	`64`		[CL]B:201	`1`	`1`	`125`	`f`	[ZN]B:105	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`19.4`	`-9.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
44	`65`		[CL]A:204	`1`	`1`	`125`	`f`	[ZN]A:102	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`18.7`	`-9.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
45	`66`		[CL]B:202	`1`	`1`	`125`	`f`	[CL]B:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`18.3`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
46	`67`		[CL]B:209	`1`	`1`	`125`	`f`	[CL]B:207	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`18.2`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
47	`68`		[CL]B:209	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`3735`	`17.7`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
48	`69`		[IMD]B:301	`2`	`1`	`196`	`◊`	[CL]B:210	x,-y,-z-1	`4_554`	`1`	`1`	`125`	`16.9`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`70`		[ZN]B:105	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	-x-1,y,-z-1/2	`3_454`	`7`	`2`	`3735`	`16.8`	`-7.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
50	`71`		B	`4`	`2`	`3735`	`◊`	[ZN]A:102	-x-1/2,-y-1/2,z-1/2	`6_444`	`1`	`1`	`98`	`15.5`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`72`		A	`3`	`1`	`3724`	`◊`	[ZN]B:104	-x-1/2,-y-1/2,z-1/2	`6_444`	`1`	`1`	`98`	`8.1`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`11.8`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`73`		[ZN]B:104	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,-y,-z	`4_555`	`2`	`1`	`3735`	`14.6`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
	`74`		[ZN]A:102	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,-y-1,-z	`4_545`	`3`	`1`	`3724`	`14.2`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
	*Average:*													`14.4`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
52	`75`		[ZN]A:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	-x-1/2,y-1/2,-z-1/2	`7_444`	`3`	`1`	`3735`	`11.7`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
	`76`		A	`2`	`1`	`3724`	`◊`	[ZN]B:103	-x-1/2,y-1/2,-z-1/2	`7_444`	`1`	`1`	`98`	`7.7`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
	*Average:*													`9.7`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
53	`77`		[IMD]B:301	`2`	`1`	`196`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3735`	`11.2`	`0.1`	`0.164`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`78`		[ZN]B:105	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x-1/2,y+1/2,z	`5_455`	`2`	`1`	`3724`	`9.1`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
55	`79`		[IMD]B:301	`2`	`1`	`196`	`◊`	[ZN]B:103	x,-y,-z-1	`4_554`	`1`	`1`	`98`	`5.7`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`80`		[ZN]B:104	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`8_445`	`2`	`1`	`3724`	`4.9`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	`81`		B	`1`	`1`	`3735`	`◊`	[ZN]A:102	x-1/2,-y-1/2,-z	`8_445`	`1`	`1`	`98`	`3.7`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
	*Average:*													`4.3`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
57	`82`		[CL]B:206	`1`	`1`	`125`	`◊`	[CL]A:205	x-1/2,-y-1/2,-z	`8_445`	`1`	`1`	`125`	`4.7`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
58	`83`		[CL]B:210	`1`	`1`	`125`	`◊`	[ZN]A:102	-x-1/2,-y-1/2,z-1/2	`6_444`	`1`	`1`	`98`	`4.6`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`84`		[CL]B:202	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x-1/2,y+1/2,z	`5_455`	`1`	`1`	`3724`	`3.6`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
60	`85`		B	`1`	`1`	`3735`	`◊`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`8_445`	`1`	`1`	`3724`	`2.3`	`0.1`	`0.795`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`86`		[CL]B:210	`1`	`1`	`125`	`◊`	[CL]A:205	-x-1/2,-y-1/2,z-1/2	`6_444`	`1`	`1`	`125`	`1.7`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`87`		[ZN]B:104	`1`	`1`	`98`	`◊`	[CL]A:205	x-1/2,-y-1/2,-z	`8_445`	`1`	`1`	`125`	`0.9`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
63	`88`		[CL]B:202	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	-x-1,y,-z-1/2	`3_454`	`2`	`1`	`3735`	`0.3`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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