PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=675-DC-ECK)

Interfaces in PDB 2hrd crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.70 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF THE URIDINE PHOSPHORYLASE FROM SALMONELLA TYPHIMURIUM IN COMPLEX WITH THYMINE AND PHOSPHATE ION AT 1.70A RESOLUTION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`233`	`59`	`10593`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`231`	`58`	`11154`	`2117.0`	`-17.9`	`0.229`	`24`	`0`	`0`	`0.520`
	`2`		E	`237`	`60`	`10963`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`227`	`57`	`10719`	`2107.3`	`-18.6`	`0.216`	`25`	`0`	`0`	`0.520`
	`3`		F	`229`	`57`	`10782`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`231`	`59`	`10880`	`2070.1`	`-15.6`	`0.305`	`21`	`1`	`0`	`0.520`
	*Average:*													`2098.1`	`-17.3`	`0.250`	`23`	`0`	`0`	`0.520`
2	`4`		E	`104`	`34`	`10963`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`99`	`32`	`10880`	`973.5`	`-22.4`	`0.001`	`2`	`1`	`0`	`0.466`
	`5`		F	`100`	`32`	`10782`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`104`	`34`	`11154`	`966.1`	`-22.5`	`0.001`	`2`	`0`	`0`	`0.466`
	`6`		D	`107`	`34`	`10593`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`101`	`33`	`10719`	`964.4`	`-21.2`	`0.002`	`3`	`1`	`0`	`0.466`
	*Average:*													`968.0`	`-22.0`	`0.001`	`2`	`1`	`0`	`0.466`
3	`7`		B	`43`	`13`	`11154`	`◊`	E	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`45`	`13`	`10963`	`416.0`	`1.7`	`0.817`	`9`	`2`	`0`	`0.000`
4	`8`		F	`43`	`13`	`10782`	`x`	F	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`39`	`10`	`10782`	`343.2`	`-1.0`	`0.583`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
5	`9`		F	`29`	`8`	`10782`	`◊`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`28`	`8`	`10880`	`309.5`	`-1.0`	`0.567`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
6	`10`		A	`30`	`12`	`10880`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`36`	`14`	`10963`	`303.5`	`-0.3`	`0.669`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
7	`11`		B	`32`	`8`	`11154`	`◊`	E	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`24`	`7`	`10963`	`259.5`	`0.5`	`0.717`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		F	`16`	`4`	`10782`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`24`	`9`	`10963`	`209.5`	`2.6`	`0.789`	`6`	`2`	`0`	`0.018`
	`13`		C	`18`	`4`	`10719`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`10880`	`199.3`	`0.2`	`0.603`	`3`	`1`	`0`	`0.018`
	`14`		B	`22`	`9`	`11154`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`10880`	`195.4`	`1.3`	`0.725`	`5`	`2`	`0`	`0.018`
	`15`		F	`21`	`6`	`10782`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`10593`	`193.5`	`1.3`	`0.638`	`4`	`1`	`0`	`0.018`
	`16`		E	`15`	`3`	`10963`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`10593`	`187.0`	`0.7`	`0.705`	`4`	`0`	`0`	`0.018`
	`17`		C	`24`	`9`	`10719`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`11154`	`171.4`	`1.0`	`0.672`	`3`	`0`	`0`	`0.018`
	*Average:*													`192.7`	`1.2`	`0.688`	`4`	`1`	`0`	`0.018`
9	`18`		[1PE]B:1001	`11`	`1`	`479`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`10`	`11154`	`166.9`	`-1.1`	`0.526`	`2`	`0`	`0`	`0.039`
10	`19`		[TDR]F:906	`9`	`1`	`261`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`29`	`15`	`10782`	`161.9`	`2.0`	`0.649`	`3`	`0`	`0`	`0.053`
	`20`		[TDR]A:901	`9`	`1`	`261`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`28`	`15`	`10880`	`161.2`	`-0.5`	`0.415`	`5`	`0`	`0`	`0.053`
	`21`		[TDR]C:903	`9`	`1`	`262`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`27`	`15`	`10719`	`159.9`	`2.0`	`0.647`	`4`	`0`	`0`	`0.053`
	`22`		[TDR]B:902	`9`	`1`	`262`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`29`	`15`	`11154`	`157.7`	`2.1`	`0.647`	`4`	`0`	`0`	`0.053`
	`23`		[TDR]E:905	`9`	`1`	`260`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`30`	`15`	`10963`	`157.5`	`2.2`	`0.662`	`5`	`0`	`0`	`0.053`
	*Average:*													`159.6`	`1.6`	`0.604`	`4`	`0`	`0`	`0.053`
11	`24`		[TDR]D:904	`9`	`1`	`263`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`28`	`15`	`10593`	`159.6`	`2.1`	`0.651`	`5`	`0`	`0`	`0.003`
12	`25`		C	`16`	`4`	`10719`	`◊`	D	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`19`	`7`	`10593`	`156.5`	`1.7`	`0.832`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
13	`26`		F	`19`	`6`	`10782`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`16`	`6`	`10593`	`154.5`	`-0.4`	`0.532`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
14	`27`		A	`16`	`7`	`10880`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`14`	`3`	`10719`	`130.9`	`0.5`	`0.720`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
15	`28`		A	`18`	`7`	`10880`	`◊`	F	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`15`	`6`	`10782`	`127.9`	`3.6`	`0.919`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
16	`29`		[PO4]C:803	`5`	`1`	`187`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`10719`	`104.8`	`-6.9`	`0.670`	`5`	`0`	`0`	`0.183`
	`30`		[PO4]B:802	`5`	`1`	`188`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`11154`	`96.3`	`-6.1`	`0.768`	`7`	`0`	`0`	`0.183`
	*Average:*													`100.6`	`-6.5`	`0.719`	`6`	`0`	`0`	`0.183`
17	`31`		A	`11`	`3`	`10880`	`x`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`13`	`4`	`10880`	`103.8`	`-0.5`	`0.567`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`32`		[PO4]F:806	`5`	`1`	`188`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`10782`	`97.5`	`-5.1`	`0.828`	`9`	`0`	`0`	`0.181`
19	`33`		[PO4]D:804	`5`	`1`	`188`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`10593`	`96.7`	`-7.6`	`0.556`	`7`	`0`	`0`	`0.213`
20	`34`		[PO4]A:801	`5`	`1`	`189`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`10880`	`96.3`	`-5.0`	`0.834`	`8`	`0`	`0`	`0.167`
21	`35`		[PO4]E:805	`5`	`1`	`187`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`10963`	`95.6`	`-6.5`	`0.741`	`7`	`0`	`0`	`0.188`
22	`36`		[GOL]E:1015	`6`	`1`	`218`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`10963`	`91.7`	`-0.8`	`0.459`	`2`	`0`	`0`	`0.033`
23	`37`		[GOL]C:1013	`6`	`1`	`218`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`10593`	`90.0`	`-1.5`	`0.335`	`1`	`0`	`0`	`0.039`
24	`38`		[GOL]A:1254	`6`	`1`	`218`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`10963`	`89.9`	`-1.2`	`0.354`	`2`	`0`	`0`	`0.040`
25	`39`		[GOL]F:1011	`6`	`1`	`217`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`10782`	`89.7`	`-1.0`	`0.406`	`2`	`0`	`0`	`0.037`
26	`40`		[GOL]A:1254	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`10880`	`88.9`	`-1.0`	`0.400`	`3`	`0`	`0`	`0.045`
27	`41`		[GOL]C:1013	`6`	`1`	`218`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`10719`	`88.7`	`-0.7`	`0.454`	`3`	`0`	`0`	`0.040`
28	`42`		[GOL]F:1011	`6`	`1`	`217`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`11154`	`85.9`	`-1.2`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
29	`43`		[GOL]B:1014	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`11154`	`71.8`	`0.0`	`0.575`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
30	`44`		[PO4]F:807	`4`	`1`	`189`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`10782`	`53.2`	`-2.5`	`0.869`	`2`	`0`	`0`	`0.067`
31	`45`		B	`6`	`3`	`11154`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`6`	`3`	`10593`	`51.8`	`1.3`	`0.869`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`46`		[PO4]F:807	`4`	`1`	`189`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`10593`	`51.2`	`-2.4`	`0.892`	`2`	`0`	`0`	`0.012`
33	`47`		[PO4]F:807	`4`	`1`	`189`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`10963`	`51.0`	`-2.4`	`0.893`	`2`	`0`	`0`	`0.013`
34	`48`		[PO4]A:808	`3`	`1`	`188`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`10880`	`46.8`	`-1.9`	`0.889`	`2`	`0`	`0`	`0.011`
35	`49`		[PO4]A:808	`3`	`1`	`188`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`10719`	`46.5`	`-2.3`	`0.852`	`2`	`0`	`0`	`0.063`
36	`50`		[PO4]A:808	`3`	`1`	`188`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`11154`	`46.4`	`-1.9`	`0.896`	`2`	`0`	`0`	`0.011`
37	`51`		A	`4`	`2`	`10880`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`5`	`1`	`11154`	`42.6`	`-0.1`	`0.345`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`52`		[PO4]C:803	`3`	`1`	`187`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`10963`	`40.3`	`-0.8`	`0.927`	`2`	`0`	`0`	`0.030`
	`53`		[PO4]B:802	`3`	`1`	`188`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10593`	`39.4`	`-0.7`	`0.932`	`2`	`0`	`0`	`0.030`
	*Average:*													`39.9`	`-0.8`	`0.930`	`2`	`0`	`0`	`0.030`
39	`54`		[PO4]D:804	`3`	`1`	`188`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`11154`	`39.5`	`-0.7`	`0.930`	`2`	`0`	`0`	`0.028`
40	`55`		[PO4]A:801	`3`	`1`	`189`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10782`	`39.5`	`-0.8`	`0.931`	`2`	`0`	`0`	`0.029`
41	`56`		[PO4]E:805	`3`	`1`	`187`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10719`	`39.4`	`-0.7`	`0.930`	`2`	`0`	`0`	`0.027`
42	`57`		[PO4]F:806	`3`	`1`	`188`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10880`	`38.6`	`-0.7`	`0.933`	`2`	`0`	`0`	`0.028`
43	`58`		[GOL]B:1014	`3`	`1`	`219`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10593`	`28.7`	`0.2`	`0.676`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
44	`59`		[TDR]D:904	`4`	`1`	`263`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`11154`	`18.8`	`0.0`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	`60`		[TDR]B:902	`5`	`1`	`262`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`10593`	`18.0`	`-0.0`	`0.419`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	`61`		[TDR]F:906	`4`	`1`	`261`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`10880`	`17.4`	`-0.1`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	`62`		[TDR]E:905	`5`	`1`	`260`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`10719`	`17.2`	`-0.1`	`0.402`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	`63`		[TDR]A:901	`3`	`1`	`261`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10782`	`15.6`	`-0.1`	`0.337`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	`64`		[TDR]C:903	`3`	`1`	`262`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10963`	`15.0`	`-0.2`	`0.337`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
	*Average:*													`17.0`	`-0.1`	`0.395`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
45	`65`		D	`2`	`1`	`10593`	`◊`	C	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`2`	`2`	`10719`	`15.1`	`0.1`	`0.679`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`66`		[TDR]A:901	`2`	`1`	`261`	`f`	[PO4]A:801	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`189`	`9.9`	`-0.4`	`0.596`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
47	`67`		[TDR]F:906	`2`	`1`	`261`	`f`	[PO4]F:806	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`188`	`9.6`	`-0.4`	`0.596`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
48	`68`		[TDR]B:902	`2`	`1`	`262`	`f`	[PO4]B:802	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`188`	`9.2`	`-0.4`	`0.586`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
	`69`		[TDR]C:903	`2`	`1`	`262`	`f`	[PO4]C:803	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`187`	`8.7`	`-0.4`	`0.586`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
	*Average:*													`8.9`	`-0.4`	`0.586`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
49	`70`		[TDR]E:905	`2`	`1`	`260`	`f`	[PO4]E:805	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`187`	`9.2`	`-0.4`	`0.596`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
50	`71`		[TDR]D:904	`2`	`1`	`263`	`f`	[PO4]D:804	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`188`	`8.8`	`-0.4`	`0.586`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
51	`72`		[GOL]B:1014	`2`	`1`	`219`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10719`	`5.2`	`0.1`	`0.678`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`73`		[1PE]B:1001	`1`	`1`	`479`	`◊`	E	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`10963`	`5.1`	`0.2`	`0.772`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`74`		B	`1`	`1`	`11154`	`◊`	C	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`1`	`1`	`10719`	`0.5`	`-0.0`	`0.588`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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