PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=392-EJ-2G9)

Interfaces in PDB 2jdi crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.90 Å

GROUND STATE STRUCTURE OF F1-ATPASE FROM BOVINE HEART MITOCHONDRIA (BOVINE F1-ATPASE CRYSTALLISED IN THE ABSENCE OF AZIDE)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`331`	`85`	`20770`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`316`	`86`	`21103`	`2995.5`	`-22.2`	`0.135`	`39`	`15`	`0`	`0.528`
2	`2`		D	`259`	`77`	`20770`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`262`	`70`	`21436`	`2465.0`	`-21.1`	`0.147`	`22`	`10`	`0`	`0.478`
	`3`		F	`234`	`68`	`20686`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`240`	`64`	`21103`	`2273.8`	`-15.3`	`0.231`	`21`	`12`	`0`	`0.478`
	*Average:*													`2369.4`	`-18.2`	`0.189`	`22`	`11`	`0`	`0.478`
3	`4`		F	`235`	`61`	`20686`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`230`	`61`	`21139`	`2206.7`	`-13.8`	`0.393`	`26`	`11`	`0`	`0.427`
4	`5`		E	`211`	`55`	`20044`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`212`	`58`	`21436`	`1911.2`	`-17.5`	`0.175`	`17`	`7`	`0`	`0.583`
5	`6`		E	`185`	`57`	`20044`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`192`	`55`	`21139`	`1845.1`	`-14.8`	`0.163`	`17`	`5`	`0`	`0.574`
6	`7`		I	`81`	`20`	`2455`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`90`	`28`	`6198`	`871.6`	`-13.2`	`0.325`	`12`	`5`	`0`	`1.000`
7	`8`		G	`64`	`22`	`11763`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`68`	`18`	`20770`	`662.9`	`-7.1`	`0.263`	`7`	`9`	`0`	`0.129`
8	`9`		G	`62`	`22`	`11763`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`72`	`20`	`21436`	`645.5`	`-7.6`	`0.250`	`4`	`6`	`0`	`0.115`
9	`10`		C	`55`	`14`	`21103`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`60`	`14`	`21436`	`528.7`	`-5.6`	`0.196`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
10	`11`		B	`61`	`17`	`21139`	`◊`	C	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`46`	`14`	`21103`	`498.1`	`0.5`	`0.676`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
11	`12`		G	`51`	`21`	`11763`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`53`	`15`	`20686`	`496.4`	`-5.8`	`0.345`	`5`	`1`	`0`	`0.026`
12	`13`		H	`57`	`15`	`6198`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`58`	`15`	`11763`	`474.5`	`-9.0`	`0.258`	`3`	`0`	`0`	`0.294`
13	`14`		G	`40`	`15`	`11763`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`46`	`14`	`20044`	`438.7`	`-4.6`	`0.316`	`7`	`5`	`0`	`0.053`
14	`15`		[ANP]F:1479	`30`	`1`	`628`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`62`	`20`	`20686`	`395.0`	`-2.6`	`0.553`	`12`	`0`	`0`	`0.129`
	`16`		[ANP]D:1480	`31`	`1`	`627`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`63`	`21`	`20770`	`373.4`	`-2.2`	`0.560`	`13`	`0`	`0`	`0.129`
	*Average:*													`384.2`	`-2.4`	`0.557`	`13`	`0`	`0`	`0.129`
15	`17`		[ANP]C:1511	`31`	`1`	`625`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`49`	`16`	`21103`	`375.4`	`-1.3`	`0.578`	`15`	`0`	`0`	`0.188`
	`18`		[ANP]A:1511	`31`	`1`	`623`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`48`	`17`	`21436`	`374.8`	`-1.8`	`0.568`	`15`	`0`	`0`	`0.188`
	`19`		[ANP]B:1511	`30`	`1`	`623`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`48`	`18`	`21139`	`369.3`	`-0.9`	`0.625`	`13`	`0`	`0`	`0.188`
	*Average:*													`373.1`	`-1.3`	`0.590`	`14`	`0`	`0`	`0.188`
16	`20`		A	`41`	`14`	`21436`	`◊`	D	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`34`	`10`	`20770`	`351.1`	`-0.0`	`0.684`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
17	`21`		B	`27`	`11`	`21139`	`◊`	F	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`34`	`17`	`20686`	`280.6`	`-0.9`	`0.577`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`22`		I	`28`	`8`	`2455`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`32`	`10`	`11763`	`275.5`	`-5.4`	`0.292`	`0`	`0`	`0`	`0.155`
19	`23`		F	`25`	`8`	`20686`	`◊`	H	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`29`	`8`	`6198`	`239.4`	`-1.5`	`0.597`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`24`		H	`27`	`8`	`6198`	`◊`	B	-x+1/2,-y+1,z-1/2	`2_564`	`19`	`6`	`21139`	`228.4`	`-1.9`	`0.274`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
21	`25`		G	`28`	`10`	`11763`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`33`	`12`	`21103`	`227.5`	`-1.8`	`0.490`	`1`	`0`	`0`	`0.007`
22	`26`		E	`32`	`13`	`20044`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`27`	`10`	`21103`	`213.2`	`1.6`	`0.810`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
23	`27`		G	`19`	`8`	`11763`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`10`	`21139`	`201.7`	`-3.7`	`0.222`	`0`	`2`	`0`	`0.024`
24	`28`		F	`23`	`8`	`20686`	`◊`	C	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`18`	`8`	`21103`	`169.3`	`-1.9`	`0.336`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`29`		I	`24`	`5`	`2455`	`◊`	B	-x+1/2,-y+1,z-1/2	`2_564`	`16`	`5`	`21139`	`160.6`	`-1.9`	`0.481`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`30`		E	`18`	`7`	`20044`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`12`	`3`	`20770`	`148.0`	`0.1`	`0.637`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`31`		[ANP]D:1480	`14`	`1`	`627`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`21103`	`145.4`	`0.2`	`0.653`	`3`	`0`	`0`	`0.014`
28	`32`		C	`14`	`7`	`21103`	`◊`	H	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`18`	`5`	`6198`	`144.0`	`-2.4`	`0.296`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`33`		[ANP]F:1479	`12`	`1`	`628`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`21139`	`127.0`	`-0.5`	`0.572`	`2`	`0`	`0`	`0.022`
30	`34`		E	`14`	`5`	`20044`	`◊`	A	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`18`	`7`	`21436`	`123.3`	`0.4`	`0.690`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
31	`35`		F	`14`	`4`	`20686`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`20770`	`108.7`	`-2.7`	`0.128`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
32	`36`		B	`10`	`6`	`21139`	`◊`	H	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`13`	`5`	`6198`	`97.5`	`-1.5`	`0.395`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`37`		[ANP]A:1511	`10`	`1`	`623`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`20770`	`87.7`	`0.8`	`0.706`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		[ANP]C:1511	`9`	`1`	`625`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`20686`	`71.5`	`0.3`	`0.660`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`79.6`	`0.5`	`0.683`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`39`		E	`16`	`6`	`20044`	`◊`	D	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`13`	`6`	`20770`	`82.1`	`0.3`	`0.627`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`40`		B	`8`	`2`	`21139`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`3`	`21103`	`63.9`	`0.4`	`0.647`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`41`		[ANP]B:1511	`10`	`1`	`623`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`20044`	`61.9`	`0.3`	`0.651`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
37	`42`		B	`4`	`2`	`21139`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`11`	`4`	`21436`	`49.8`	`0.5`	`0.745`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`43`		H	`6`	`3`	`6198`	`◊`	F	-x+1/2,-y+1,z-1/2	`2_564`	`10`	`4`	`20686`	`49.0`	`1.2`	`0.871`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
39	`44`		[MG]F:1480	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`20686`	`42.6`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
	`45`		[MG]D:1481	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`20770`	`39.9`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
	*Average:*													`41.2`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
40	`46`		[MG]C:1512	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`21103`	`39.8`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.116`
	`47`		[MG]A:1512	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`21436`	`39.5`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.116`
	`48`		[MG]B:1512	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`21139`	`38.8`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.116`
	*Average:*													`39.4`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.116`
41	`49`		[MG]A:1512	`1`	`1`	`98`	`f`	[ANP]A:1511	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`623`	`39.5`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.158`
	`50`		[MG]C:1512	`1`	`1`	`98`	`f`	[ANP]C:1511	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`625`	`39.4`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.158`
	`51`		[MG]B:1512	`1`	`1`	`98`	`f`	[ANP]B:1511	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`623`	`39.1`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.158`
	`52`		[MG]F:1480	`1`	`1`	`98`	`f`	[ANP]F:1479	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`628`	`30.9`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.158`
	`53`		[MG]D:1481	`1`	`1`	`98`	`f`	[ANP]D:1480	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`627`	`29.9`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.158`
	*Average:*													`35.8`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.158`
42	`54`		B	`1`	`1`	`21139`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`20044`	`9.2`	`0.2`	`0.448`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`55`		[MG]D:1481	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`21103`	`8.6`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
	`56`		[MG]F:1480	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`21139`	`7.0`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
	*Average:*													`7.8`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

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