PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=267-K7-LE0)

Interfaces in PDB 2m39

THE SOLUTION STRUCTURE OF 3',5'-LINKED 2'-O-(2-METHOXYETHYL)-RNA DUPLEX

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		[C5L]A:11	`20`	`1`	`534`	`c`	[G48]A:10	`23`	`1`	`564`	`165.2`	`2.2`	`0.668`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`2`		[C5L]A:3	`19`	`1`	`543`	`c`	[G48]A:2	`18`	`1`	`580`	`145.1`	`2.9`	`0.722`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`155.1`	`2.5`	`0.695`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
2	`3`		[C5L]B:21	`19`	`1`	`555`	`c`	[T39]B:20	`19`	`1`	`544`	`157.2`	`2.5`	`0.698`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
3	`4`		[A44]A:6	`21`	`1`	`563`	`c`	[T39]A:7	`20`	`1`	`566`	`154.5`	`2.1`	`0.651`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		[A44]B:17	`19`	`1`	`560`	`c`	[A44]B:18	`20`	`1`	`570`	`151.4`	`2.4`	`0.657`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		[A44]A:5	`17`	`1`	`577`	`c`	[A44]A:6	`19`	`1`	`563`	`135.2`	`3.2`	`0.698`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`143.3`	`2.8`	`0.677`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
5	`7`		[T39]B:19	`19`	`1`	`546`	`c`	[T39]B:20	`18`	`1`	`544`	`151.3`	`2.0`	`0.699`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		[C5L]B:15	`19`	`1`	`545`	`c`	[G48]B:14	`21`	`1`	`561`	`145.4`	`2.7`	`0.697`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`9`		[C5L]B:23	`18`	`1`	`549`	`c`	[G48]B:22	`21`	`1`	`563`	`144.0`	`2.8`	`0.712`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`10`		[C5L]A:1	`15`	`1`	`561`	`c`	[G48]A:2	`18`	`1`	`580`	`142.1`	`1.2`	`0.445`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`11`		[C5L]B:15	`18`	`1`	`545`	`c`	[G48]B:16	`18`	`1`	`580`	`142.0`	`1.0`	`0.619`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`12`		[T39]A:7	`16`	`1`	`566`	`c`	[T39]A:8	`17`	`1`	`557`	`141.9`	`1.7`	`0.697`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`13`		[G48]B:16	`18`	`1`	`580`	`c`	[A44]B:17	`19`	`1`	`560`	`141.2`	`2.8`	`0.732`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[G48]A:4	`18`	`1`	`589`	`c`	[A44]A:5	`20`	`1`	`577`	`137.9`	`2.5`	`0.716`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`139.5`	`2.7`	`0.724`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`15`		[C5L]B:13	`16`	`1`	`555`	`c`	[G48]B:14	`17`	`1`	`561`	`139.8`	`1.1`	`0.405`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		[C5L]B:21	`15`	`1`	`555`	`c`	[G48]B:22	`16`	`1`	`563`	`119.5`	`1.3`	`0.642`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`129.7`	`1.2`	`0.524`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`17`		[A44]B:18	`20`	`1`	`570`	`c`	[T39]B:19	`17`	`1`	`546`	`135.4`	`2.6`	`0.694`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`18`		[C5L]A:3	`16`	`1`	`543`	`c`	[G48]A:4	`19`	`1`	`589`	`125.8`	`1.3`	`0.635`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`19`		[C5L]A:9	`15`	`1`	`569`	`c`	[T39]A:8	`15`	`1`	`557`	`123.7`	`3.0`	`0.750`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`20`		B	`15`	`1`	`480`	`c`	[C5L]B:23	`17`	`1`	`549`	`122.7`	`1.3`	`0.578`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`21`		[C5L]A:9	`15`	`1`	`569`	`c`	[G48]A:10	`14`	`1`	`564`	`119.2`	`2.3`	`0.718`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`22`		A	`15`	`1`	`484`	`c`	[C5L]A:11	`15`	`1`	`534`	`119.0`	`0.8`	`0.562`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`23`		[G48]A:10	`16`	`1`	`564`	`◊`	[G48]B:16	`17`	`1`	`580`	`118.3`	`2.0`	`0.718`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`24`		[G48]A:4	`16`	`1`	`589`	`◊`	[G48]B:22	`17`	`1`	`563`	`117.4`	`2.1`	`0.726`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`25`		[A44]A:6	`12`	`1`	`563`	`◊`	[T39]B:20	`11`	`1`	`544`	`95.2`	`0.6`	`0.575`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`26`		[C5L]B:21	`14`	`1`	`555`	`◊`	[A44]A:5	`10`	`1`	`577`	`92.1`	`1.1`	`0.620`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		[C5L]A:9	`12`	`1`	`569`	`◊`	[A44]B:17	`9`	`1`	`560`	`79.2`	`1.1`	`0.628`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`85.6`	`1.1`	`0.624`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`28`		B	`15`	`1`	`480`	`◊`	[G48]A:2	`15`	`1`	`580`	`89.8`	`1.9`	`0.658`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`29`		A	`14`	`1`	`484`	`◊`	[G48]B:14	`14`	`1`	`561`	`84.2`	`2.6`	`0.706`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`30`		[C5L]B:23	`5`	`1`	`549`	`◊`	[G48]A:2	`5`	`1`	`580`	`83.2`	`0.1`	`0.512`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
26	`31`		[A44]B:18	`11`	`1`	`570`	`◊`	[T39]A:8	`13`	`1`	`557`	`79.0`	`1.2`	`0.638`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`32`		[C5L]A:3	`9`	`1`	`543`	`◊`	[C5L]B:23	`10`	`1`	`549`	`72.5`	`0.2`	`0.527`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`33`		[C5L]B:15	`6`	`1`	`545`	`◊`	[G48]A:10	`5`	`1`	`564`	`72.1`	`0.4`	`0.558`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		[C5L]A:11	`5`	`1`	`534`	`◊`	[G48]B:14	`4`	`1`	`561`	`55.7`	`0.9`	`0.603`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`63.9`	`0.7`	`0.581`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
29	`35`		[C5L]A:11	`10`	`1`	`534`	`◊`	[C5L]B:15	`9`	`1`	`545`	`66.6`	`0.0`	`0.497`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`36`		A	`5`	`1`	`484`	`◊`	[C5L]B:13	`6`	`1`	`555`	`62.4`	`-0.1`	`0.428`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
31	`37`		B	`4`	`1`	`480`	`◊`	[C5L]A:1	`6`	`1`	`561`	`60.6`	`-0.2`	`0.423`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
32	`38`		[C5L]A:3	`5`	`1`	`543`	`◊`	[G48]B:22	`4`	`1`	`563`	`55.9`	`0.9`	`0.607`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
33	`39`		[C5L]B:21	`5`	`1`	`555`	`◊`	[G48]A:4	`4`	`1`	`589`	`55.6`	`0.9`	`0.627`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
34	`40`		[C5L]A:9	`6`	`1`	`569`	`◊`	[G48]B:16	`4`	`1`	`580`	`55.5`	`0.9`	`0.630`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
35	`41`		[A44]B:18	`3`	`1`	`570`	`◊`	[T39]A:7	`5`	`1`	`566`	`51.4`	`1.0`	`0.656`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`42`		[A44]A:6	`3`	`1`	`563`	`◊`	[T39]B:19	`5`	`1`	`546`	`51.1`	`1.0`	`0.656`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		[A44]A:5	`3`	`1`	`577`	`◊`	[T39]B:20	`5`	`1`	`544`	`49.2`	`0.8`	`0.618`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`50.1`	`0.9`	`0.637`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`44`		[A44]B:17	`4`	`1`	`560`	`◊`	[T39]A:8	`5`	`1`	`557`	`51.0`	`0.9`	`0.623`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`45`		[A44]A:6	`4`	`1`	`563`	`◊`	[A44]B:18	`4`	`1`	`570`	`39.3`	`1.4`	`0.661`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`46`		[G48]A:10	`5`	`1`	`564`	`◊`	[G48]B:14	`5`	`1`	`561`	`37.7`	`0.9`	`0.614`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		[G48]A:2	`5`	`1`	`580`	`◊`	[G48]B:22	`5`	`1`	`563`	`36.8`	`0.9`	`0.620`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`37.3`	`0.9`	`0.617`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`48`		[C5L]B:21	`6`	`1`	`555`	`◊`	[A44]A:6	`10`	`1`	`563`	`37.4`	`-0.1`	`0.496`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		[C5L]A:9	`3`	`1`	`569`	`◊`	[A44]B:18	`3`	`1`	`570`	`5.7`	`-0.1`	`0.472`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`21.6`	`-0.1`	`0.484`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`50`		[G48]B:22	`4`	`1`	`563`	`◊`	[A44]A:5	`5`	`1`	`577`	`34.0`	`-0.2`	`0.465`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`51`		[T39]A:7	`6`	`1`	`566`	`◊`	[T39]B:19	`6`	`1`	`546`	`18.5`	`0.5`	`0.602`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`52`		[T39]A:8	`1`	`1`	`557`	`◊`	[T39]B:19	`2`	`1`	`546`	`17.6`	`-0.6`	`0.341`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`53`		[A44]A:5	`2`	`1`	`577`	`◊`	[T39]B:19	`3`	`1`	`546`	`16.7`	`0.2`	`0.538`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`54`		[A44]B:17	`2`	`1`	`560`	`◊`	[T39]A:7	`3`	`1`	`566`	`15.8`	`0.1`	`0.552`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`55`		[G48]B:16	`3`	`1`	`580`	`◊`	[T39]A:8	`3`	`1`	`557`	`13.5`	`0.0`	`0.499`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`56`		[C5L]A:11	`1`	`1`	`534`	`◊`	[C5L]B:13	`1`	`1`	`555`	`8.9`	`0.0`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`57`		[G48]A:10	`4`	`1`	`564`	`◊`	[A44]B:17	`4`	`1`	`560`	`8.8`	`0.2`	`0.526`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`58`		[C5L]A:1	`1`	`1`	`561`	`◊`	[C5L]B:23	`1`	`1`	`549`	`6.3`	`0.0`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`59`		[G48]A:4	`1`	`1`	`589`	`◊`	[T39]B:20	`2`	`1`	`544`	`6.1`	`-0.1`	`0.451`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`60`		[C5L]A:9	`1`	`1`	`569`	`◊`	[C5L]B:15	`1`	`1`	`545`	`3.4`	`0.0`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`61`		[C5L]A:3	`1`	`1`	`543`	`◊`	[A44]A:5	`1`	`1`	`577`	`3.2`	`0.0`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`62`		[C5L]B:21	`1`	`1`	`555`	`◊`	[T39]B:19	`2`	`1`	`546`	`2.9`	`0.2`	`0.493`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`63`		[C5L]A:9	`1`	`1`	`569`	`◊`	[T39]A:7	`2`	`1`	`566`	`2.6`	`0.1`	`0.490`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`64`		[C5L]B:23	`3`	`1`	`549`	`◊`	[G48]A:4	`2`	`1`	`589`	`2.3`	`-0.0`	`0.454`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`65`		[A44]A:5	`1`	`1`	`577`	`◊`	[T39]A:7	`1`	`1`	`566`	`1.2`	`0.1`	`0.451`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`66`		A	`1`	`1`	`484`	`◊`	[G48]A:10	`1`	`1`	`564`	`1.0`	`0.0`	`0.449`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`67`		[A44]A:6	`1`	`1`	`563`	`◊`	[T39]A:8	`1`	`1`	`557`	`0.4`	`0.0`	`0.451`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`68`		[C5L]A:3	`1`	`1`	`543`	`◊`	[C5L]B:21	`1`	`1`	`555`	`0.3`	`0.0`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`69`		[A44]A:6	`1`	`1`	`563`	`◊`	[A44]B:17	`1`	`1`	`560`	`0.3`	`0.0`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`70`		[C5L]A:11	`1`	`1`	`534`	`◊`	[G48]B:16	`1`	`1`	`580`	`0.2`	`0.0`	`0.442`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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