PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=136-DO-O54)

Interfaces in PDB 2okx crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.90 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF GH78 FAMILY RHAMNOSIDASE OF BACILLUS SP. GL1 AT 1.9 A

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`236`	`65`	`33152`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`233`	`65`	`33346`	`2235.8`	`-13.9`	`0.184`	`35`	`22`	`0`	`0.218`
2	`2`		A	`75`	`19`	`33346`	`◊`	B	-x+2,y-1/2,-z+1/2	`3_745`	`73`	`20`	`33152`	`640.2`	`-0.4`	`0.624`	`15`	`0`	`0`	`0.000`
3	`3`		A	`29`	`7`	`33346`	`◊`	B	-x+3/2,-y+1,z-1/2	`2_664`	`41`	`14`	`33152`	`294.9`	`-2.0`	`0.383`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
4	`4`		A	`29`	`9`	`33346`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`30`	`10`	`33346`	`268.5`	`-2.5`	`0.279`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
5	`5`		[GOL]A:3002	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`11`	`33346`	`143.0`	`-1.1`	`0.430`	`2`	`0`	`0`	`0.013`
6	`6`		[GOL]B:3012	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`13`	`33152`	`142.2`	`-0.9`	`0.494`	`5`	`0`	`0`	`0.021`
7	`7`		[GOL]A:3003	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`13`	`33346`	`142.1`	`-0.9`	`0.498`	`4`	`0`	`0`	`0.018`
8	`8`		[GOL]B:3010	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`11`	`33152`	`141.9`	`-1.0`	`0.427`	`2`	`0`	`0`	`0.013`
9	`9`		[GOL]A:3017	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`33346`	`133.8`	`0.7`	`0.701`	`6`	`0`	`0`	`0.013`
10	`10`		[GOL]A:3026	`6`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`11`	`33346`	`133.6`	`-0.3`	`0.541`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
11	`11`		[GOL]B:3025	`6`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`12`	`33152`	`132.1`	`0.2`	`0.640`	`2`	`0`	`0`	`0.004`
12	`12`		[GOL]B:3018	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`33152`	`130.4`	`0.8`	`0.747`	`7`	`0`	`0`	`0.015`
13	`13`		[GOL]A:3008	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`33346`	`130.1`	`-0.5`	`0.507`	`5`	`0`	`0`	`0.036`
	`14`		[GOL]B:3020	`6`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`33152`	`128.5`	`-0.5`	`0.505`	`5`	`0`	`0`	`0.036`
	*Average:*													`129.3`	`-0.5`	`0.506`	`5`	`0`	`0`	`0.036`
14	`15`		[GOL]B:3037	`6`	`1`	`217`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`33152`	`130.1`	`-0.8`	`0.509`	`3`	`0`	`0`	`0.014`
15	`16`		[GOL]B:3014	`6`	`1`	`217`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`14`	`33152`	`128.0`	`-1.3`	`0.395`	`7`	`0`	`0`	`0.029`
16	`17`		[GOL]A:3027	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`33346`	`125.3`	`-0.8`	`0.435`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
17	`18`		[GOL]A:3007	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`26`	`12`	`33346`	`124.4`	`-0.9`	`0.450`	`7`	`0`	`0`	`0.027`
18	`19`		[GOL]A:3030	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`33346`	`122.2`	`-0.9`	`0.429`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
19	`20`		[GOL]B:3029	`6`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`33152`	`120.0`	`-0.9`	`0.426`	`3`	`0`	`0`	`0.015`
20	`21`		[GOL]A:3001	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`33346`	`119.4`	`0.7`	`0.706`	`6`	`0`	`0`	`0.028`
	`22`		[GOL]B:3005	`6`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`33152`	`117.8`	`0.5`	`0.663`	`6`	`0`	`0`	`0.028`
	*Average:*													`118.6`	`0.6`	`0.685`	`6`	`0`	`0`	`0.028`
21	`23`		[GOL]A:3035	`5`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`33346`	`118.4`	`-0.4`	`0.500`	`3`	`0`	`0`	`0.011`
22	`24`		[GOL]A:3019	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`33346`	`118.1`	`-0.2`	`0.601`	`3`	`0`	`0`	`0.010`
23	`25`		[GOL]B:3011	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`33152`	`116.7`	`-0.3`	`0.581`	`3`	`0`	`0`	`0.011`
24	`26`		[GOL]B:3028	`5`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`33152`	`116.2`	`-0.1`	`0.562`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
25	`27`		[GOL]A:3022	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`33346`	`111.8`	`-0.8`	`0.469`	`2`	`0`	`0`	`0.022`
	`28`		[GOL]B:3021	`5`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`33152`	`110.5`	`-0.7`	`0.437`	`2`	`0`	`0`	`0.022`
	*Average:*													`111.2`	`-0.8`	`0.453`	`2`	`0`	`0`	`0.022`
26	`29`		[GOL]B:3042	`6`	`1`	`220`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`33152`	`111.5`	`-0.1`	`0.569`	`3`	`0`	`0`	`0.009`
27	`30`		[GOL]B:3034	`6`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`33152`	`108.6`	`-0.2`	`0.551`	`4`	`0`	`0`	`0.013`
28	`31`		[GOL]A:3040	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`33346`	`107.2`	`0.6`	`0.665`	`3`	`0`	`0`	`0.005`
29	`32`		[GOL]B:3036	`6`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`33152`	`101.7`	`1.4`	`0.788`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`33`		[GOL]B:3024	`6`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`33152`	`100.9`	`0.3`	`0.637`	`3`	`0`	`0`	`0.007`
31	`34`		[GOL]A:3033	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`33346`	`99.8`	`-0.1`	`0.611`	`3`	`0`	`0`	`0.010`
32	`35`		[GOL]B:3032	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`33152`	`96.9`	`-0.2`	`0.570`	`3`	`0`	`0`	`0.010`
33	`36`		[GOL]B:3016	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`3`	`33152`	`94.1`	`0.1`	`0.641`	`3`	`0`	`0`	`0.008`
34	`37`		[GOL]B:3038	`5`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`33152`	`93.6`	`0.3`	`0.584`	`2`	`0`	`0`	`0.004`
35	`38`		[GOL]A:3015	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`3`	`33346`	`89.8`	`0.6`	`0.686`	`5`	`0`	`0`	`0.011`
36	`39`		[GOL]B:3041	`5`	`1`	`213`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`33152`	`88.9`	`-0.3`	`0.529`	`3`	`0`	`0`	`0.011`
37	`40`		[GOL]B:3013	`5`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`33152`	`86.6`	`-1.4`	`0.339`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
	`41`		[GOL]A:3004	`5`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`33346`	`86.2`	`-1.5`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
	*Average:*													`86.4`	`-1.4`	`0.335`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
38	`42`		[GOL]A:3006	`5`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`33152`	`85.9`	`-1.5`	`0.308`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
39	`43`		[GOL]B:3009	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`33346`	`84.0`	`-1.7`	`0.247`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
40	`44`		B	`14`	`4`	`33152`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`9`	`3`	`33346`	`82.0`	`-0.1`	`0.572`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
41	`45`		[GOL]B:3009	`6`	`1`	`219`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`33152`	`80.2`	`0.4`	`0.664`	`3`	`0`	`0`	`0.006`
42	`46`		[GOL]A:3006	`5`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`33346`	`80.2`	`0.0`	`0.603`	`1`	`0`	`0`	`0.003`
43	`47`		[GOL]A:3023	`5`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`33346`	`79.9`	`0.4`	`0.677`	`4`	`0`	`0`	`0.009`
44	`48`		[GOL]A:3039	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`33346`	`76.9`	`-0.2`	`0.579`	`2`	`0`	`0`	`0.007`
45	`49`		[GOL]A:3043	`5`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`33346`	`72.3`	`-0.3`	`0.468`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
46	`50`		[GOL]A:3023	`4`	`1`	`218`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`33152`	`69.8`	`0.6`	`0.690`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
47	`51`		[GOL]A:3031	`5`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`33346`	`64.9`	`0.1`	`0.592`	`2`	`0`	`0`	`0.005`
48	`52`		[GOL]A:3039	`6`	`1`	`217`	`◊`	B	-x+2,y-1/2,-z+1/2	`3_745`	`10`	`4`	`33152`	`58.1`	`0.8`	`0.733`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
49	`53`		[GOL]B:3024	`3`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`33346`	`54.9`	`0.4`	`0.595`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
50	`54`		[GOL]B:3032	`6`	`1`	`219`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`7`	`2`	`33346`	`45.3`	`-0.0`	`0.572`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
51	`55`		A	`8`	`3`	`33346`	`◊`	[GOL]B:3041	-x+2,y-1/2,-z+1/2	`3_745`	`5`	`1`	`213`	`40.3`	`0.5`	`0.718`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
52	`56`		A	`3`	`2`	`33346`	`◊`	[GOL]B:3038	-x+3/2,-y+1,z-1/2	`2_664`	`3`	`1`	`219`	`40.2`	`-0.4`	`0.236`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`57`		[CA]A:4001	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`33346`	`39.6`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
	`58`		[CA]B:4003	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`33152`	`38.2`	`-7.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
	*Average:*													`38.9`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
54	`59`		[GOL]B:3020	`4`	`1`	`218`	`f`	[GOL]B:3011	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`219`	`36.9`	`0.0`	`0.614`	`1`	`0`	`0`	`0.003`
55	`60`		[GOL]B:3021	`2`	`1`	`219`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`33346`	`35.0`	`0.0`	`0.663`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
	`61`		[GOL]A:3022	`2`	`1`	`219`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`33152`	`34.2`	`0.0`	`0.670`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`34.6`	`0.0`	`0.666`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
56	`62`		[GOL]A:3019	`2`	`1`	`219`	`f`	[GOL]A:3008	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`218`	`32.6`	`0.3`	`0.696`	`2`	`0`	`0`	`0.004`
57	`63`		[GOL]A:3043	`3`	`1`	`216`	`f`	[GOL]A:3039	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`217`	`30.5`	`0.6`	`0.750`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
58	`64`		[GOL]A:3043	`3`	`1`	`216`	`◊`	B	-x+2,y-1/2,-z+1/2	`3_745`	`3`	`1`	`33152`	`29.8`	`0.6`	`0.801`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
59	`65`		[GOL]A:3026	`3`	`1`	`220`	`f`	[GOL]A:3007	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`217`	`29.0`	`-0.0`	`0.594`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`66`		[GOL]B:3025	`3`	`1`	`218`	`f`	[GOL]B:3014	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`217`	`28.9`	`-0.1`	`0.586`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`67`		[GOL]B:3041	`3`	`1`	`213`	`f`	[CA]B:4002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`28.7`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
	`68`		[GOL]A:3043	`4`	`1`	`216`	`f`	[CA]A:4004	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`23.8`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
	*Average:*													`26.2`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
62	`69`		[GOL]B:3042	`3`	`1`	`220`	`f`	[CA]B:4003	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`27.7`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
	`70`		[GOL]A:3040	`4`	`1`	`217`	`f`	[CA]A:4001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`27.1`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
	`71`		[GOL]A:3039	`3`	`1`	`217`	`f`	[CA]A:4004	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`23.9`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
	*Average:*													`26.2`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
63	`72`		A	`3`	`1`	`33346`	`◊`	[CA]B:4002	-x+2,y-1/2,-z+1/2	`3_745`	`1`	`1`	`85`	`24.7`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`73`		[CA]A:4004	`1`	`1`	`85`	`◊`	B	-x+2,y-1/2,-z+1/2	`3_745`	`3`	`1`	`33152`	`18.7`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`21.7`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`74`		[GOL]A:3043	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`33152`	`23.3`	`0.3`	`0.533`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`75`		[CA]B:4002	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`33152`	`22.0`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
	`76`		[CA]A:4004	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`33346`	`18.0`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
	*Average:*													`20.0`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
66	`77`		[GOL]A:3040	`2`	`1`	`217`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`33152`	`20.8`	`0.2`	`0.706`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`78`		[GOL]B:3042	`2`	`1`	`220`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`33346`	`16.7`	`0.3`	`0.703`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`79`		[GOL]A:3035	`2`	`1`	`220`	`f`	[GOL]A:3023	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`218`	`13.7`	`-0.2`	`0.540`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
69	`80`		[GOL]B:3036	`2`	`1`	`218`	`f`	[GOL]B:3024	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`218`	`8.3`	`-0.0`	`0.540`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`81`		[GOL]A:3033	`1`	`1`	`219`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`33152`	`5.8`	`-0.2`	`0.349`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
71	`82`		[GOL]B:3005	`1`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`33346`	`5.3`	`0.1`	`0.553`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`83`		[GOL]A:3001	`1`	`1`	`218`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`33152`	`4.3`	`0.1`	`0.551`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`4.8`	`0.1`	`0.552`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`84`		[GOL]B:3005	`1`	`1`	`218`	`◊`	[GOL]A:3040	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`217`	`3.1`	`-0.1`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`85`		[GOL]B:3034	`1`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`33346`	`2.1`	`-0.1`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
74	`86`		A	`1`	`1`	`33346`	`◊`	[GOL]A:3033	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`1`	`1`	`219`	`0.9`	`0.0`	`0.584`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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