PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=734-EH-805)

Interfaces in PDB 2quw crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 2.20 Å

HAMMERHEAD RIBOZYME G12A MUTANT AFTER CLEAVAGE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`68`	`14`	`10240`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`63`	`10`	`2474`	`562.4`	`-7.9`	`0.953`	`29`	`0`	`0`	`0.307`
	`2`		B	`67`	`15`	`10211`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`62`	`10`	`2455`	`551.6`	`-6.4`	`0.961`	`27`	`0`	`0`	`0.307`
	*Average:*													`557.0`	`-7.1`	`0.957`	`28`	`0`	`0`	`0.307`
2	`3`		D	`39`	`8`	`10240`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`36`	`10`	`10211`	`275.4`	`-6.0`	`0.867`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
3	`4`		[CCC]A:12	`22`	`1`	`481`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`37`	`11`	`10211`	`248.6`	`3.4`	`0.748`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		[CCC]C:12	`22`	`1`	`481`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`33`	`10`	`10240`	`237.7`	`3.6`	`0.777`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		B	`31`	`9`	`10211`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`33`	`10`	`10240`	`237.5`	`-7.3`	`0.769`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
6	`7`		B	`27`	`7`	`10211`	`◊`	C	x-1,y+1,z	`1_465`	`24`	`5`	`2474`	`202.9`	`-6.0`	`0.748`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
7	`8`		B	`28`	`5`	`10211`	`◊`	D	x-1,y+1,z-1	`1_464`	`27`	`5`	`10240`	`192.5`	`-5.8`	`0.754`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		A	`22`	`3`	`2455`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`23`	`6`	`10240`	`183.4`	`-4.7`	`0.753`	`1`	`0`	`0`	`0.028`
9	`10`		B	`17`	`5`	`10211`	`◊`	D	x-1,y,z+1	`1_456`	`17`	`5`	`10240`	`175.7`	`-3.6`	`0.715`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		B	`20`	`5`	`10211`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`4`	`2474`	`166.5`	`-4.8`	`0.715`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
11	`12`		B	`19`	`6`	`10211`	`◊`	D	x-1,y+1,z	`1_465`	`20`	`5`	`10240`	`146.8`	`-5.6`	`0.652`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
12	`13`		[GTP]A:1	`19`	`1`	`610`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`1`	`2455`	`129.7`	`0.8`	`0.837`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`14`		[GTP]C:1	`15`	`1`	`632`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`1`	`2474`	`122.5`	`1.6`	`0.844`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`15`		[CCC]A:12	`15`	`1`	`481`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`2`	`2455`	`120.6`	`0.5`	`0.618`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`16`		[CCC]C:12	`13`	`1`	`481`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`1`	`2474`	`117.7`	`0.4`	`0.619`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`17`		B	`17`	`9`	`10211`	`◊`	[GTP]C:1	x-1,y,z	`1_455`	`10`	`1`	`632`	`112.4`	`-2.5`	`0.572`	`4`	`0`	`0`	`0.024`
17	`18`		D	`21`	`3`	`10240`	`◊`	B	x,y-1,z+1	`1_546`	`14`	`3`	`10211`	`110.8`	`-3.2`	`0.742`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`19`		[GTP]A:1	`13`	`1`	`610`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`3`	`10211`	`107.1`	`2.4`	`0.907`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		[GTP]C:1	`12`	`1`	`632`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`10240`	`100.4`	`1.8`	`0.869`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
20	`21`		A	`10`	`3`	`2455`	`◊`	D	x-1,y+1,z	`1_465`	`10`	`2`	`10240`	`87.2`	`-3.0`	`0.585`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
21	`22`		D	`8`	`3`	`10240`	`x`	D	x-1,y,z+1	`1_456`	`6`	`1`	`10240`	`63.8`	`-4.4`	`0.324`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		[MG]B:2	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`10211`	`58.8`	`-10.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.115`
23	`24`		[MG]B:1	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`10211`	`54.3`	`-7.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.094`
	`25`		[MG]D:3	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`10240`	`47.2`	`-6.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.094`
	*Average:*													`50.8`	`-7.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.094`
24	`26`		[MG]D:71	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`10240`	`54.3`	`-7.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.248`
	`27`		[MG]D:12	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10240`	`44.4`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.248`
	*Average:*													`49.3`	`-8.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.248`
25	`28`		[MG]C:14	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`2474`	`51.8`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.131`
26	`29`		[MG]B:4	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10211`	`51.3`	`-9.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.108`
27	`30`		[MG]B:71	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10211`	`50.0`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
28	`31`		[MG]B:6	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`10211`	`49.3`	`-7.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.083`
29	`32`		[GTP]A:1	`6`	`1`	`610`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`2`	`10240`	`48.3`	`-2.6`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
30	`33`		[GTP]C:1	`3`	`1`	`632`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`10211`	`46.6`	`-0.5`	`0.589`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
31	`34`		[MG]D:11	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`10240`	`45.3`	`-7.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.103`
32	`35`		[MG]B:72	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`10211`	`43.1`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.067`
33	`36`		[MG]B:7	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`10211`	`42.9`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
	`37`		[MG]D:70	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`10240`	`41.7`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
	*Average:*													`42.3`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.080`
34	`38`		B	`6`	`3`	`10211`	`x`	B	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`1`	`10211`	`41.6`	`-2.9`	`0.337`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`39`		[MG]D:70	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`2474`	`36.6`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
	`40`		[MG]B:7	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`2455`	`33.7`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
	*Average:*													`35.1`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
36	`41`		[MG]B:72	`1`	`1`	`98`	`◊`	[GTP]C:1	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`632`	`34.0`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
37	`42`		[MG]A:13	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10211`	`33.1`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
38	`43`		[MG]A:13	`1`	`1`	`98`	`◊`	[CCC]A:12	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`481`	`32.3`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
39	`44`		[MG]B:10	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`10211`	`30.5`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
40	`45`		[GTP]A:1	`3`	`1`	`610`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`10240`	`29.1`	`-1.1`	`0.516`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
41	`46`		[MG]B:10	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`10240`	`24.4`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
42	`47`		[MG]B:10	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`10240`	`23.3`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
43	`48`		[MG]B:6	`1`	`1`	`98`	`◊`	[CCC]A:12	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`481`	`15.5`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
44	`49`		B	`1`	`1`	`10211`	`◊`	[MG]D:71	x-1,y+1,z-1	`1_464`	`1`	`1`	`98`	`10.2`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`50`		[MG]D:71	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]D:12	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`9.0`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
46	`51`		[MG]B:70	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]B:2	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`3.5`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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