PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=355-DJ-BKH)

Interfaces in PDB 2x4u crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.10 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF MHC CLASS I HLA-A2.1 BOUND TO HIV-1 PEPTIDE RT468-476

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`130`	`35`	`6860`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`150`	`43`	`15194`	`1330.9`	`-9.9`	`0.122`	`20`	`6`	`0`	`1.000`
	`2`		E	`136`	`35`	`6830`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`147`	`41`	`15073`	`1311.9`	`-9.2`	`0.126`	`19`	`6`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1321.4`	`-9.5`	`0.124`	`20`	`6`	`0`	`1.000`
2	`3`		C	`58`	`9`	`1389`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`118`	`36`	`15194`	`867.5`	`-10.1`	`0.397`	`14`	`1`	`0`	`1.000`
	`4`		F	`64`	`9`	`1384`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`120`	`38`	`15073`	`867.4`	`-10.5`	`0.339`	`15`	`1`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`867.5`	`-10.3`	`0.368`	`15`	`1`	`0`	`1.000`
3	`5`		D	`70`	`27`	`15073`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`66`	`16`	`15194`	`603.8`	`4.5`	`0.746`	`8`	`6`	`0`	`0.000`
4	`6`		B	`33`	`11`	`6860`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`32`	`10`	`15073`	`342.7`	`1.1`	`0.660`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
5	`7`		B	`30`	`11`	`6860`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`32`	`10`	`15194`	`298.0`	`-1.0`	`0.449`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		B	`33`	`9`	`6860`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`31`	`9`	`15073`	`272.4`	`5.0`	`0.910`	`7`	`2`	`0`	`0.000`
	`9`		A	`30`	`11`	`15194`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`27`	`7`	`6830`	`245.9`	`4.6`	`0.906`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`259.2`	`4.8`	`0.908`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
7	`10`		A	`24`	`8`	`15194`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`29`	`9`	`6830`	`259.6`	`-0.6`	`0.432`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`11`		A	`32`	`8`	`15194`	`◊`	E	x,y-1,z	`1_545`	`28`	`10`	`6830`	`250.4`	`-0.4`	`0.460`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`12`		A	`22`	`6`	`15194`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`34`	`9`	`15194`	`223.7`	`-2.2`	`0.224`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		D	`30`	`7`	`15073`	`x`	D	x-1,y,z	`1_455`	`20`	`5`	`15073`	`216.2`	`-1.7`	`0.307`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`219.9`	`-1.9`	`0.265`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
10	`14`		[MES]A:1277	`11`	`1`	`325`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`32`	`10`	`15194`	`172.5`	`3.0`	`0.228`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`15`		B	`12`	`4`	`6860`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`18`	`7`	`15073`	`152.2`	`0.7`	`0.593`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
12	`16`		D	`18`	`6`	`15073`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`16`	`7`	`6830`	`128.3`	`1.1`	`0.692`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
13	`17`		D	`14`	`5`	`15073`	`x`	D	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`18`	`10`	`15073`	`127.0`	`1.5`	`0.663`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`18`		[GOL]D:1279	`6`	`1`	`221`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`15073`	`114.9`	`-0.3`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
15	`19`		[GOL]B:1101	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`6860`	`108.2`	`0.1`	`0.577`	`4`	`0`	`0`	`0.105`
16	`20`		[GOL]A:1278	`6`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`15194`	`106.6`	`-0.7`	`0.470`	`1`	`0`	`0`	`0.079`
17	`21`		[MES]B:1100	`8`	`1`	`330`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`6860`	`104.9`	`1.8`	`0.200`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`22`		[GOL]E:1102	`6`	`1`	`220`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`6830`	`101.4`	`-0.3`	`0.477`	`1`	`0`	`0`	`0.048`
19	`23`		[MES]E:1100	`7`	`1`	`331`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`6830`	`100.1`	`1.8`	`0.252`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`24`		[GOL]D:1278	`6`	`1`	`219`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`6830`	`98.6`	`0.2`	`0.591`	`3`	`0`	`0`	`0.075`
21	`25`		[MES]D:1276	`8`	`1`	`330`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`15073`	`97.1`	`1.2`	`0.117`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`26`		[GOL]A:1279	`5`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`15194`	`96.9`	`-0.5`	`0.475`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
23	`27`		[MES]D:1276	`9`	`1`	`330`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`6830`	`95.5`	`2.8`	`0.219`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`28`		[GOL]E:1101	`6`	`1`	`220`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`20`	`4`	`6830`	`90.7`	`-0.7`	`0.478`	`1`	`0`	`0`	`0.073`
25	`29`		[GOL]A:1276	`6`	`1`	`221`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`4`	`6860`	`89.1`	`-1.2`	`0.375`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
26	`30`		[GOL]D:1278	`6`	`1`	`219`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`15073`	`86.3`	`-0.7`	`0.430`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
27	`31`		[GOL]D:1280	`6`	`1`	`218`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15073`	`82.7`	`0.4`	`0.636`	`2`	`0`	`0`	`0.033`
28	`32`		[MES]D:1277	`8`	`1`	`329`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`15073`	`82.5`	`0.9`	`0.101`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`33`		[MES]E:1100	`6`	`1`	`331`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`15073`	`80.8`	`2.2`	`0.336`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`34`		[GOL]E:1101	`6`	`1`	`220`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`15073`	`80.1`	`-0.8`	`0.392`	`1`	`0`	`0`	`0.080`
31	`35`		[MES]B:1100	`6`	`1`	`330`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`15194`	`77.6`	`2.4`	`0.355`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`36`		[GOL]B:1101	`4`	`1`	`219`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`15194`	`74.3`	`-0.4`	`0.474`	`2`	`0`	`0`	`0.078`
33	`37`		[MES]D:1277	`5`	`1`	`329`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`6830`	`67.4`	`1.9`	`0.348`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`38`		[GOL]A:1276	`6`	`1`	`221`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`15194`	`66.8`	`-0.1`	`0.455`	`1`	`0`	`0`	`0.034`
35	`39`		B	`9`	`3`	`6860`	`◊`	E	x,y-1,z	`1_545`	`6`	`3`	`6830`	`60.4`	`-0.8`	`0.330`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`40`		[MES]E:1100	`5`	`1`	`331`	`◊`	[MES]D:1277	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`329`	`58.6`	`2.6`	`0.065`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`41`		A	`6`	`3`	`15194`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`3`	`6860`	`48.6`	`1.4`	`0.827`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
	`42`		E	`6`	`2`	`6830`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`2`	`15073`	`40.7`	`1.6`	`0.846`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`44.7`	`1.5`	`0.836`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
38	`43`		A	`6`	`4`	`15194`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`12`	`5`	`15073`	`43.4`	`0.3`	`0.606`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		A	`7`	`4`	`15194`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`5`	`4`	`15073`	`31.5`	`-0.0`	`0.559`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`37.5`	`0.1`	`0.583`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`45`		[MES]E:1100	`7`	`1`	`331`	`f`	[GOL]D:1279	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`221`	`42.3`	`1.1`	`0.158`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`46`		[MES]B:1100	`6`	`1`	`330`	`◊`	[GOL]A:1278	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`216`	`42.1`	`1.6`	`0.234`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`47`		A	`7`	`2`	`15194`	`◊`	[GOL]D:1280	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`4`	`1`	`218`	`35.0`	`-0.4`	`0.534`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`48`		[GOL]A:1279	`5`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`6860`	`34.8`	`-0.8`	`0.344`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
43	`49`		[GOL]A:1279	`3`	`1`	`218`	`f`	[GOL]A:1276	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`221`	`32.3`	`-0.2`	`0.493`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
44	`50`		[GOL]D:1279	`2`	`1`	`221`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`6830`	`24.4`	`0.6`	`0.766`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`51`		A	`2`	`2`	`15194`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`3`	`2`	`15073`	`22.4`	`0.5`	`0.785`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		A	`2`	`1`	`15194`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`15073`	`5.7`	`0.1`	`0.715`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`14.0`	`0.3`	`0.750`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`53`		[GOL]A:1278	`3`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`6860`	`19.0`	`0.3`	`0.651`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`54`		[MES]E:1100	`3`	`1`	`331`	`f`	[GOL]E:1101	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`220`	`16.8`	`-0.1`	`0.213`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
48	`55`		[MES]B:1100	`1`	`1`	`330`	`f`	[GOL]A:1279	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`218`	`16.2`	`0.4`	`0.302`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`56`		[GOL]A:1279	`2`	`1`	`218`	`◊`	[GOL]A:1278	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`216`	`13.4`	`0.2`	`0.661`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`57`		[MES]B:1100	`3`	`1`	`330`	`f`	[GOL]A:1276	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`221`	`13.1`	`0.1`	`0.227`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`58`		[MES]D:1277	`2`	`1`	`329`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15194`	`6.7`	`0.3`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`59`		[GOL]E:1101	`2`	`1`	`220`	`f`	[GOL]D:1279	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`221`	`6.6`	`-0.1`	`0.583`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
53	`60`		D	`1`	`1`	`15073`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`15194`	`5.0`	`0.3`	`0.822`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`61`		[GOL]A:1278	`2`	`1`	`216`	`◊`	[GOL]A:1276	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`221`	`4.3`	`0.1`	`0.612`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`62`		B	`1`	`1`	`6860`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`1384`	`2.1`	`-0.0`	`0.617`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`63`		A	`1`	`1`	`15194`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`1384`	`1.4`	`-0.0`	`0.661`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`64`		[GOL]D:1280	`1`	`1`	`218`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`6830`	`0.9`	`-0.0`	`0.511`	`0`	`0`	`0`	`0.002`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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