PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=921-HN-H9I)

Interfaces in PDB 3c63 crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.75 Å

TETRAMERIC CYTOCHROME CB562 (K34/H59/D62/H63/H73/A74/H77) ASSEMBLY STABILIZED BY INTERPROTEIN ZINC COORDINATION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`65`	`20`	`6375`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`62`	`20`	`6406`	`597.7`	`-6.1`	`0.245`	`3`	`1`	`0`	`0.079`
	`2`		D	`50`	`19`	`6388`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`56`	`19`	`6297`	`520.1`	`-8.8`	`0.088`	`0`	`0`	`0`	`0.079`
	*Average:*													`558.9`	`-7.4`	`0.167`	`2`	`1`	`0`	`0.079`
2	`3`		[HEM]B:150	`43`	`1`	`825`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`76`	`20`	`6375`	`555.4`	`-20.1`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.349`
	`4`		[HEM]A:150	`43`	`1`	`818`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`74`	`20`	`6406`	`553.5`	`-18.8`	`0.390`	`0`	`0`	`0`	`0.349`
	`5`		[HEM]C:150	`43`	`1`	`823`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`73`	`20`	`6297`	`539.0`	`-18.5`	`0.393`	`0`	`0`	`0`	`0.349`
	*Average:*													`549.3`	`-19.2`	`0.375`	`0`	`0`	`0`	`0.349`
3	`6`		[HEM]D:150	`43`	`1`	`831`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`68`	`20`	`6388`	`549.7`	`-18.4`	`0.381`	`1`	`0`	`0`	`0.169`
4	`7`		D	`51`	`16`	`6388`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`53`	`15`	`6406`	`496.9`	`-2.6`	`0.436`	`3`	`2`	`0`	`0.042`
	`8`		C	`52`	`15`	`6297`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`50`	`16`	`6375`	`467.9`	`-2.9`	`0.470`	`3`	`3`	`0`	`0.042`
	*Average:*													`482.4`	`-2.7`	`0.453`	`3`	`3`	`0`	`0.042`
5	`9`		C	`26`	`10`	`6297`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`26`	`9`	`6406`	`230.5`	`2.8`	`0.857`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
6	`10`		B	`24`	`9`	`6375`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`20`	`6`	`6388`	`196.2`	`1.0`	`0.736`	`1`	`3`	`0`	`0.000`
7	`11`		B	`13`	`4`	`6375`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`19`	`7`	`6375`	`146.0`	`0.1`	`0.636`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		A	`13`	`5`	`6406`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`14`	`5`	`6388`	`144.2`	`2.7`	`0.869`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
9	`13`		C	`15`	`6`	`6297`	`x`	C	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`5`	`6297`	`132.1`	`1.9`	`0.781`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
10	`14`		B	`15`	`5`	`6375`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`4`	`6388`	`130.7`	`1.5`	`0.793`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
11	`15`		B	`14`	`6`	`6375`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`11`	`4`	`6297`	`96.4`	`1.5`	`0.788`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`16`		B	`8`	`6`	`6375`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`11`	`4`	`6297`	`82.9`	`1.2`	`0.804`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`17`		C	`11`	`4`	`6297`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`6406`	`79.3`	`-0.6`	`0.497`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
	`18`		D	`8`	`3`	`6388`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`6375`	`77.1`	`-0.6`	`0.485`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
	*Average:*													`78.2`	`-0.6`	`0.491`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
14	`19`		B	`11`	`5`	`6375`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`13`	`5`	`6406`	`77.2`	`0.9`	`0.728`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
15	`20`		B	`12`	`5`	`6375`	`◊`	D	x-1,y,z-1	`1_454`	`7`	`3`	`6388`	`69.2`	`1.0`	`0.763`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`21`		A	`9`	`4`	`6406`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`7`	`2`	`6406`	`61.5`	`0.0`	`0.595`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`22`		C	`4`	`2`	`6297`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`8`	`2`	`6406`	`61.0`	`1.0`	`0.802`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
18	`23`		A	`6`	`4`	`6406`	`◊`	D	x-1,y,z-1	`1_454`	`9`	`4`	`6388`	`48.2`	`0.4`	`0.686`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`24`		C	`6`	`2`	`6297`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`5`	`2`	`6388`	`46.2`	`-0.2`	`0.506`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
20	`25`		C	`6`	`2`	`6297`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`3`	`1`	`6406`	`39.3`	`0.5`	`0.745`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
21	`26`		[CA]D:108	`1`	`1`	`85`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`6388`	`34.4`	`-6.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.059`
22	`27`		[ZN]D:107	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`6388`	`33.7`	`-17.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.326`
	`28`		[ZN]A:107	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`6406`	`33.2`	`-17.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.326`
	`29`		[ZN]B:107	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`6375`	`33.1`	`-18.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.326`
	`30`		[ZN]C:107	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`6297`	`32.9`	`-18.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.326`
	*Average:*													`33.2`	`-17.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.326`
23	`31`		[HEM]C:150	`3`	`1`	`823`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`5`	`2`	`6388`	`33.6`	`-0.9`	`0.557`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`32`		[CA]B:109	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`6375`	`29.6`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
25	`33`		[CA]B:109	`1`	`1`	`85`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`6`	`3`	`6388`	`29.5`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
26	`34`		[ZN]A:107	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`6375`	`28.4`	`-11.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.210`
	`35`		[ZN]D:107	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`6297`	`28.1`	`-11.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.210`
	`36`		[ZN]B:107	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`6406`	`28.0`	`-11.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.210`
	`37`		[ZN]C:107	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`6388`	`27.6`	`-11.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.210`
	*Average:*													`28.0`	`-11.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.210`
27	`38`		[ZN]C:107	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`6375`	`28.0`	`-10.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.185`
	`39`		[ZN]A:107	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`6388`	`28.0`	`-10.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.185`
	`40`		[ZN]B:107	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`6297`	`27.7`	`-10.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.185`
	`41`		[ZN]D:107	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`6406`	`27.5`	`-10.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.185`
	*Average:*													`27.8`	`-10.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.185`
28	`42`		[CA]B:108	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`6375`	`27.9`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	`43`		[CA]B:110	`1`	`1`	`85`	`f`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`5`	`2`	`6406`	`25.4`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	*Average:*													`26.7`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
29	`44`		B	`3`	`1`	`6375`	`◊`	[CA]D:108	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`1`	`1`	`85`	`26.8`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
	`45`		[CA]B:108	`1`	`1`	`85`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`3`	`1`	`6406`	`23.3`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
	*Average:*													`25.1`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
30	`46`		[HEM]A:150	`5`	`1`	`818`	`f`	[CA]A:108	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`26.4`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.046`
31	`47`		B	`4`	`3`	`6375`	`◊`	[HEM]D:150	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`3`	`1`	`831`	`25.7`	`-1.3`	`0.533`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
32	`48`		B	`4`	`2`	`6375`	`◊`	[CA]A:108	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`85`	`24.3`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
33	`49`		[CA]A:108	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`6406`	`22.3`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
34	`50`		A	`3`	`2`	`6406`	`◊`	[HEM]D:150	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`831`	`19.7`	`-0.3`	`0.749`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
35	`51`		[CA]B:110	`1`	`1`	`85`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`6375`	`18.4`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
36	`52`		[CA]B:108	`1`	`1`	`85`	`◊`	[HEM]A:150	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`4`	`1`	`818`	`12.9`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
37	`53`		[HEM]B:150	`1`	`1`	`825`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`4`	`2`	`6388`	`11.2`	`-0.5`	`0.422`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
38	`54`		[CA]B:108	`1`	`1`	`85`	`◊`	[CA]A:108	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`85`	`10.7`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
39	`55`		B	`3`	`1`	`6375`	`◊`	[HEM]A:150	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`3`	`1`	`818`	`10.5`	`-0.5`	`0.715`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
40	`56`		D	`1`	`1`	`6388`	`x`	D	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`2`	`6388`	`7.6`	`-0.2`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`57`		[CA]B:109	`1`	`1`	`85`	`◊`	[CA]D:108	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`1`	`1`	`85`	`6.8`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
42	`58`		[HEM]B:150	`1`	`1`	`825`	`f`	[CA]B:109	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`6.2`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
43	`59`		C	`2`	`1`	`6297`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`6388`	`5.3`	`0.1`	`0.661`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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in Europe

Bringing Structure to Biology

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