PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=125-70-O80)

Interfaces in PDB 3dva crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.35 Å

SNAPSHOTS OF CATALYSIS IN THE E1 SUBUNIT OF THE PYRUVATE DEHYDROGENASE MULTI-ENZYME COMPLEX

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		H	`207`	`51`	`13644`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`216`	`54`	`13359`	`1972.1`	`-13.3`	`0.213`	`28`	`18`	`0`	`1.000`
	`2`		D	`207`	`53`	`13618`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`211`	`54`	`13315`	`1959.5`	`-14.0`	`0.177`	`28`	`18`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1965.8`	`-13.6`	`0.195`	`28`	`18`	`0`	`1.000`
2	`3`		C	`198`	`53`	`17940`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`208`	`55`	`18203`	`1872.7`	`-22.2`	`0.067`	`30`	`0`	`0`	`0.536`
	`4`		G	`188`	`51`	`17846`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`197`	`52`	`17644`	`1831.3`	`-21.7`	`0.074`	`27`	`0`	`0`	`0.536`
	*Average:*													`1852.0`	`-22.0`	`0.070`	`29`	`0`	`0`	`0.536`
3	`5`		H	`173`	`49`	`13644`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`182`	`47`	`17846`	`1685.3`	`-20.8`	`0.024`	`20`	`4`	`0`	`0.694`
	`6`		D	`176`	`49`	`13618`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`171`	`47`	`17940`	`1666.9`	`-21.6`	`0.016`	`22`	`4`	`0`	`0.694`
	`7`		B	`173`	`52`	`13315`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`174`	`45`	`18203`	`1657.2`	`-21.1`	`0.028`	`23`	`4`	`0`	`0.694`
	`8`		F	`177`	`52`	`13359`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`182`	`47`	`17644`	`1642.5`	`-21.0`	`0.039`	`21`	`4`	`0`	`0.694`
	*Average:*													`1663.0`	`-21.1`	`0.027`	`22`	`4`	`0`	`0.694`
4	`9`		D	`146`	`43`	`13618`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`148`	`47`	`18203`	`1350.0`	`-8.4`	`0.232`	`17`	`3`	`0`	`0.638`
	`10`		B	`146`	`45`	`13315`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`151`	`45`	`17940`	`1296.9`	`-10.6`	`0.170`	`21`	`3`	`0`	`0.638`
	`11`		F	`142`	`40`	`13359`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`143`	`44`	`17846`	`1276.8`	`-12.4`	`0.113`	`16`	`0`	`0`	`0.638`
	`12`		H	`136`	`39`	`13644`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`135`	`43`	`17644`	`1177.4`	`-11.7`	`0.110`	`15`	`2`	`0`	`0.638`
	*Average:*													`1275.3`	`-10.8`	`0.156`	`17`	`2`	`0`	`0.638`
5	`13`		A	`114`	`37`	`18203`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`107`	`37`	`17940`	`907.1`	`2.9`	`0.868`	`6`	`2`	`0`	`0.000`
6	`14`		H	`81`	`22`	`13644`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`87`	`23`	`13618`	`743.9`	`-1.3`	`0.612`	`8`	`3`	`0`	`0.000`
7	`15`		G	`58`	`20`	`17846`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`52`	`19`	`13315`	`465.1`	`2.4`	`0.849`	`6`	`5`	`0`	`0.000`
8	`16`		H	`44`	`14`	`13644`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`45`	`14`	`13618`	`411.4`	`5.7`	`0.949`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
9	`17`		I	`43`	`11`	`3204`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`46`	`11`	`13618`	`383.4`	`-1.7`	`0.500`	`5`	`3`	`0`	`0.140`
	`18`		J	`41`	`9`	`3038`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`41`	`9`	`13644`	`346.1`	`-2.7`	`0.376`	`5`	`3`	`0`	`0.140`
	*Average:*													`364.8`	`-2.2`	`0.438`	`5`	`3`	`0`	`0.140`
10	`19`		[TPW]G:1370	`24`	`1`	`591`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`52`	`18`	`17846`	`306.0`	`1.5`	`0.566`	`10`	`0`	`0`	`0.175`
	`20`		[TPW]C:1370	`24`	`1`	`588`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`49`	`19`	`17940`	`305.0`	`-0.6`	`0.552`	`9`	`0`	`0`	`0.175`
	`21`		[TPW]E:1370	`24`	`1`	`585`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`50`	`19`	`17644`	`303.2`	`-0.8`	`0.535`	`11`	`0`	`0`	`0.175`
	`22`		[TPW]A:1370	`24`	`1`	`587`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`50`	`19`	`18203`	`298.7`	`-1.1`	`0.543`	`10`	`0`	`0`	`0.175`
	*Average:*													`303.2`	`-0.2`	`0.549`	`10`	`0`	`0`	`0.175`
11	`23`		I	`28`	`7`	`3204`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`38`	`10`	`13315`	`281.5`	`-2.7`	`0.369`	`3`	`0`	`0`	`0.115`
	`24`		J	`22`	`6`	`3038`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`32`	`10`	`13359`	`246.1`	`-3.5`	`0.207`	`2`	`0`	`0`	`0.115`
	*Average:*													`263.8`	`-3.1`	`0.288`	`3`	`0`	`0`	`0.115`
12	`25`		J	`30`	`8`	`3038`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`38`	`9`	`13618`	`276.0`	`0.2`	`0.654`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		H	`33`	`9`	`13644`	`◊`	I	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`30`	`9`	`3204`	`262.2`	`-0.0`	`0.645`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`269.1`	`0.1`	`0.649`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
13	`27`		G	`28`	`9`	`17846`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`34`	`10`	`17940`	`241.1`	`1.3`	`0.778`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
14	`28`		H	`27`	`8`	`13644`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`29`	`9`	`18203`	`210.5`	`1.8`	`0.795`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		E	`3`	`2`	`17644`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`2`	`2`	`13618`	`17.4`	`0.6`	`0.771`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`114.0`	`1.2`	`0.783`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`30`		[TPW]G:1370	`17`	`1`	`591`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`25`	`9`	`13359`	`177.2`	`2.3`	`0.532`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		[TPW]A:1370	`18`	`1`	`587`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`26`	`9`	`13618`	`176.8`	`2.1`	`0.505`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		[TPW]E:1370	`18`	`1`	`585`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`27`	`9`	`13644`	`176.5`	`2.0`	`0.508`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		[TPW]C:1370	`17`	`1`	`588`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`9`	`13315`	`173.0`	`2.2`	`0.509`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`175.9`	`2.1`	`0.514`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`34`		F	`25`	`9`	`13359`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`24`	`9`	`17940`	`165.6`	`0.9`	`0.719`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`35`		E	`18`	`3`	`17644`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`22`	`5`	`18203`	`145.8`	`-0.3`	`0.625`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`36`		G	`16`	`5`	`17846`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`18`	`6`	`17940`	`117.3`	`0.9`	`0.732`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`37`		[K]B:1325	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`13315`	`110.0`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.881`
	`38`		[K]D:1325	`1`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`13618`	`108.9`	`-108.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.881`
	*Average:*													`109.5`	`-108.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.881`
20	`39`		G	`12`	`5`	`17846`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`15`	`6`	`17644`	`102.2`	`0.9`	`0.735`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
21	`40`		F	`8`	`3`	`13359`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`2`	`17940`	`82.8`	`1.1`	`0.827`	`1`	`3`	`0`	`0.000`
22	`41`		G	`10`	`7`	`17846`	`◊`	B	x-1,y,z-1	`1_454`	`11`	`6`	`13315`	`72.7`	`0.4`	`0.688`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`42`		A	`8`	`5`	`18203`	`◊`	I	x,y,z-1	`1_554`	`8`	`4`	`3204`	`72.5`	`1.0`	`0.791`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`43`		E	`4`	`2`	`17644`	`◊`	J	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`2`	`3038`	`24.4`	`-0.0`	`0.417`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`48.4`	`0.5`	`0.604`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
24	`44`		[MG]E:369	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`8`	`17644`	`40.7`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.203`
	`45`		[MG]G:369	`1`	`1`	`98`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`12`	`8`	`17846`	`39.2`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.203`
	`46`		[MG]A:1368	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`8`	`18203`	`38.7`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.203`
	`47`		[MG]C:1368	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`6`	`17940`	`38.0`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.203`
	*Average:*													`39.1`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.203`
25	`48`		[TPW]E:1370	`6`	`1`	`585`	`f`	[MG]E:369	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`31.1`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.138`
	`49`		[TPW]G:1370	`4`	`1`	`591`	`f`	[MG]G:369	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.6`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.138`
	`50`		[TPW]C:1370	`3`	`1`	`588`	`f`	[MG]C:1368	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.5`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.138`
	`51`		[TPW]A:1370	`4`	`1`	`587`	`f`	[MG]A:1368	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.0`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.138`
	*Average:*													`30.6`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.138`
26	`52`		H	`2`	`1`	`13644`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`2`	`17644`	`29.0`	`1.0`	`0.898`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
27	`53`		[MG]E:370	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`17644`	`28.1`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
	`54`		[MG]A:1326	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`18203`	`28.0`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
	`55`		[MG]A:1326	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`17940`	`27.8`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
	`56`		[MG]E:370	`1`	`1`	`98`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`17846`	`25.5`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
	*Average:*													`27.3`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
28	`57`		[MG]E:370	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`13359`	`22.0`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`58`		[MG]A:1326	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`13618`	`18.2`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`59`		[MG]A:1326	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`13315`	`17.4`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`60`		[MG]E:370	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`13644`	`15.6`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	*Average:*													`18.3`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
29	`61`		B	`2`	`1`	`13315`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`2`	`17940`	`20.1`	`0.4`	`0.796`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		A	`2`	`2`	`18203`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`3`	`13618`	`5.6`	`0.1`	`0.659`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`12.9`	`0.2`	`0.727`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`63`		A	`1`	`1`	`18203`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`18203`	`10.1`	`-0.3`	`0.223`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe