PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=645-4D-AGJ)

Interfaces in PDB 3exe crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.98 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF THE PYRUVATE DEHYDROGENASE (E1P) COMPONENT OF HUMAN PYRUVATE DEHYDROGENASE COMPLEX

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`259`	`59`	`14148`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`260`	`59`	`14077`	`2320.2`	`-33.0`	`0.088`	`27`	`22`	`0`	`0.181`
	`2`		H	`258`	`59`	`14128`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`263`	`60`	`14098`	`2316.3`	`-32.5`	`0.092`	`28`	`22`	`0`	`0.181`
	*Average:*													`2318.3`	`-32.7`	`0.090`	`28`	`22`	`0`	`0.181`
2	`3`		F	`191`	`52`	`14098`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`187`	`54`	`16844`	`1760.7`	`-17.5`	`0.201`	`26`	`5`	`0`	`0.192`
	`4`		B	`190`	`51`	`14077`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`183`	`53`	`16762`	`1757.9`	`-17.3`	`0.193`	`25`	`4`	`0`	`0.192`
	`5`		H	`191`	`51`	`14128`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`188`	`54`	`16760`	`1754.6`	`-17.4`	`0.190`	`25`	`5`	`0`	`0.192`
	`6`		D	`191`	`51`	`14148`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`184`	`53`	`16942`	`1754.5`	`-17.2`	`0.227`	`25`	`4`	`0`	`0.192`
	*Average:*													`1756.9`	`-17.3`	`0.203`	`25`	`5`	`0`	`0.192`
3	`7`		F	`170`	`52`	`14098`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`169`	`45`	`16760`	`1628.3`	`-22.7`	`0.043`	`14`	`6`	`0`	`0.205`
	`8`		B	`168`	`52`	`14077`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`170`	`46`	`16942`	`1626.8`	`-24.1`	`0.033`	`17`	`6`	`0`	`0.205`
	`9`		H	`173`	`53`	`14128`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`176`	`46`	`16844`	`1625.9`	`-24.0`	`0.038`	`17`	`6`	`0`	`0.205`
	`10`		D	`171`	`52`	`14148`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`173`	`45`	`16762`	`1621.3`	`-24.1`	`0.035`	`14`	`6`	`0`	`0.205`
	*Average:*													`1625.6`	`-23.7`	`0.037`	`16`	`6`	`0`	`0.205`
4	`11`		C	`82`	`19`	`16762`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`83`	`19`	`16942`	`664.5`	`-6.5`	`0.338`	`6`	`0`	`0`	`0.021`
	`12`		G	`82`	`19`	`16844`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`81`	`19`	`16760`	`659.6`	`-6.4`	`0.327`	`6`	`0`	`0`	`0.021`
	*Average:*													`662.1`	`-6.4`	`0.333`	`6`	`0`	`0`	`0.021`
5	`13`		C	`45`	`16`	`16762`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`49`	`16`	`16942`	`445.7`	`-3.1`	`0.414`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
	`14`		G	`47`	`15`	`16844`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`48`	`17`	`16760`	`433.2`	`-2.8`	`0.395`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`439.5`	`-3.0`	`0.404`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
6	`15`		D	`45`	`12`	`14148`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`40`	`12`	`16942`	`412.5`	`-0.5`	`0.683`	`8`	`3`	`0`	`0.000`
	`16`		G	`41`	`12`	`16844`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`41`	`12`	`14098`	`409.3`	`-0.8`	`0.618`	`5`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`410.9`	`-0.7`	`0.651`	`7`	`3`	`0`	`0.000`
7	`17`		[TPP]A:1005	`25`	`1`	`602`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`48`	`20`	`16942`	`304.4`	`-2.9`	`0.581`	`10`	`0`	`0`	`0.055`
	`18`		[TPP]C:1002	`25`	`1`	`599`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`47`	`20`	`16762`	`304.3`	`-3.4`	`0.582`	`10`	`0`	`0`	`0.055`
	`19`		[TPP]E:1011	`25`	`1`	`602`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`48`	`19`	`16760`	`303.8`	`-3.6`	`0.575`	`11`	`0`	`0`	`0.055`
	`20`		[TPP]G:1008	`26`	`1`	`599`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`47`	`19`	`16844`	`302.0`	`-3.0`	`0.603`	`12`	`0`	`0`	`0.055`
	*Average:*													`303.6`	`-3.2`	`0.585`	`11`	`0`	`0`	`0.055`
8	`21`		B	`22`	`8`	`14077`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`19`	`6`	`16942`	`201.8`	`1.3`	`0.821`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		G	`20`	`7`	`16844`	`◊`	H	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`20`	`8`	`14128`	`153.5`	`-0.2`	`0.596`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`177.7`	`0.6`	`0.709`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
9	`23`		[TPP]E:1011	`19`	`1`	`602`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`26`	`8`	`14128`	`177.8`	`0.3`	`0.493`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		[TPP]G:1008	`18`	`1`	`599`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`26`	`8`	`14098`	`176.8`	`0.2`	`0.469`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		[TPP]A:1005	`18`	`1`	`602`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`26`	`8`	`14148`	`176.2`	`0.3`	`0.504`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		[TPP]C:1002	`18`	`1`	`599`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`26`	`8`	`14077`	`175.6`	`0.3`	`0.495`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`176.6`	`0.3`	`0.490`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`27`		H	`13`	`4`	`14128`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`3`	`14148`	`128.0`	`1.3`	`0.714`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
11	`28`		F	`16`	`6`	`14098`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`19`	`8`	`16762`	`125.3`	`1.5`	`0.761`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
12	`29`		[K]F:1009	`1`	`1`	`216`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`14098`	`118.6`	`-108.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.810`
	`30`		[K]B:1003	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`14077`	`118.1`	`-108.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.810`
	`31`		[K]H:1012	`1`	`1`	`216`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`16`	`9`	`14128`	`117.8`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.810`
	`32`		[K]D:1006	`1`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`14148`	`117.8`	`-107.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.810`
	*Average:*													`118.1`	`-108.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.810`
13	`33`		[GOL]E:1103	`6`	`1`	`218`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`16760`	`94.1`	`-0.5`	`0.506`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
	`34`		[GOL]A:1101	`6`	`1`	`220`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`4`	`16942`	`92.9`	`-0.6`	`0.523`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
	*Average:*													`93.5`	`-0.6`	`0.515`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
14	`35`		[GOL]G:1104	`6`	`1`	`216`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`22`	`5`	`16844`	`93.0`	`-0.6`	`0.557`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
15	`36`		[GOL]C:1102	`6`	`1`	`215`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`4`	`16762`	`91.3`	`-0.4`	`0.561`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
16	`37`		G	`10`	`3`	`16844`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`9`	`4`	`16762`	`82.4`	`0.5`	`0.648`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`38`		[GOL]A:1101	`4`	`1`	`220`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`14077`	`69.8`	`-0.7`	`0.447`	`2`	`0`	`0`	`0.011`
	`39`		[GOL]E:1103	`4`	`1`	`218`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`14098`	`69.2`	`-0.8`	`0.396`	`1`	`0`	`0`	`0.011`
	*Average:*													`69.5`	`-0.8`	`0.422`	`2`	`0`	`0`	`0.011`
18	`40`		[GOL]C:1102	`5`	`1`	`215`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`14148`	`68.9`	`-1.1`	`0.446`	`1`	`0`	`0`	`0.010`
19	`41`		[GOL]G:1104	`4`	`1`	`216`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`14128`	`68.7`	`-0.9`	`0.491`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
20	`42`		H	`7`	`4`	`14128`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`16762`	`67.0`	`-0.0`	`0.606`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`43`		F	`10`	`4`	`14098`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`3`	`14077`	`66.1`	`-0.9`	`0.320`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`44`		[MN]G:1007	`1`	`1`	`123`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`11`	`9`	`16844`	`50.6`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
	`45`		[MN]A:1004	`1`	`1`	`123`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`9`	`16942`	`50.3`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
	`46`		[MN]C:1001	`1`	`1`	`123`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`10`	`16762`	`50.3`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
	`47`		[MN]E:1010	`1`	`1`	`123`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`11`	`8`	`16760`	`50.1`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
	*Average:*													`50.3`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
23	`48`		E	`5`	`3`	`16760`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`6`	`2`	`14148`	`46.5`	`-0.5`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`49`		[TPP]C:1002	`5`	`1`	`599`	`f`	[MN]C:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`38.2`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
	`50`		[TPP]E:1011	`5`	`1`	`602`	`f`	[MN]E:1010	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`38.0`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
	`51`		[TPP]G:1008	`5`	`1`	`599`	`f`	[MN]G:1007	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`38.0`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
	`52`		[TPP]A:1005	`5`	`1`	`602`	`f`	[MN]A:1004	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`37.9`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
	*Average:*													`38.0`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
25	`53`		E	`5`	`3`	`16760`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`3`	`14077`	`33.6`	`0.5`	`0.767`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`54`		G	`2`	`2`	`16844`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`16762`	`9.8`	`0.2`	`0.710`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`55`		E	`3`	`3`	`16760`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`3`	`16942`	`6.4`	`-0.1`	`0.572`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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