PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=925-D3-JI5)

Interfaces in PDB 3fhx crystal.
Space symmetry group: I 2 2 2. Resolution: 2.50 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF D235A MUTANT OF HUMAN PYRIDOXAL KINASE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`216`	`55`	`14662`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`209`	`56`	`14720`	`2085.6`	`-7.5`	`0.340`	`36`	`10`	`0`	`0.087`
2	`2`		B	`80`	`22`	`14662`	`◊`	B	-x,y,-z	`3_555`	`78`	`22`	`14662`	`732.1`	`3.6`	`0.797`	`10`	`10`	`0`	`0.000`
3	`3`		A	`48`	`14`	`14720`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1/2	`7_545`	`45`	`17`	`14662`	`420.1`	`1.5`	`0.701`	`8`	`5`	`0`	`0.000`
4	`4`		[ATP]A:407	`31`	`1`	`598`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`57`	`24`	`14720`	`376.0`	`-2.2`	`0.404`	`9`	`0`	`0`	`0.045`
	`5`		[ATP]B:409	`31`	`1`	`603`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`56`	`24`	`14662`	`370.1`	`-2.4`	`0.386`	`10`	`0`	`0`	`0.045`
	*Average:*													`373.1`	`-2.3`	`0.395`	`10`	`0`	`0`	`0.045`
5	`6`		[PLP]B:314	`16`	`1`	`399`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`40`	`16`	`14662`	`242.5`	`-3.2`	`0.367`	`2`	`0`	`0`	`0.014`
6	`7`		B	`21`	`6`	`14662`	`◊`	A	-x,-y,z	`2_555`	`26`	`7`	`14720`	`223.5`	`4.8`	`0.941`	`8`	`8`	`0`	`0.000`
7	`8`		[PXL]A:313	`12`	`1`	`325`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`37`	`15`	`14720`	`213.7`	`3.0`	`0.233`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		[PXL]B:313	`12`	`1`	`320`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`33`	`13`	`14662`	`194.8`	`3.3`	`0.253`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
9	`10`		B	`21`	`8`	`14662`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1/2	`8_455`	`16`	`8`	`14720`	`166.0`	`2.5`	`0.846`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
10	`11`		[MPD]B:320	`7`	`1`	`281`	`f`	B	-x,y,-z	`3_555`	`20`	`6`	`14662`	`129.1`	`-7.4`	`0.697`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
11	`12`		[MPD]B:321	`7`	`1`	`278`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`14662`	`127.0`	`-6.2`	`0.912`	`1`	`0`	`0`	`0.023`
12	`13`		[MPD]A:321	`7`	`1`	`280`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`14720`	`116.6`	`-5.9`	`0.802`	`1`	`0`	`0`	`0.022`
13	`14`		[MPD]B:319	`6`	`1`	`278`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`14662`	`108.9`	`-6.5`	`0.580`	`1`	`0`	`0`	`0.024`
14	`15`		[SO4]A:316	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`14720`	`107.2`	`-15.1`	`0.718`	`1`	`0`	`0`	`0.054`
15	`16`		[SO4]B:316	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`14662`	`106.7`	`-14.9`	`0.713`	`2`	`0`	`0`	`0.055`
16	`17`		[SO4]A:317	`5`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`14720`	`101.3`	`-13.7`	`0.738`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
17	`18`		[SO4]A:318	`5`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`14720`	`96.5`	`-11.7`	`0.867`	`1`	`0`	`0`	`0.042`
18	`19`		[SO4]A:314	`5`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`12`	`14720`	`87.0`	`-13.5`	`0.667`	`4`	`0`	`0`	`0.053`
19	`20`		[MPD]B:320	`5`	`1`	`281`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`14662`	`79.4`	`-4.0`	`0.809`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`21`		[SO4]B:317	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`14662`	`74.7`	`-9.7`	`0.850`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
21	`22`		[SO4]A:319	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`14720`	`74.3`	`-8.9`	`0.844`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
22	`23`		[SO4]A:315	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`14720`	`71.2`	`-9.1`	`0.644`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
23	`24`		[SO4]A:320	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`14720`	`70.7`	`-9.2`	`0.782`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
24	`25`		[SO4]B:318	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`14662`	`70.1`	`-10.4`	`0.543`	`1`	`0`	`0`	`0.038`
25	`26`		[SO4]B:315	`4`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`14662`	`66.1`	`-9.5`	`0.663`	`1`	`0`	`0`	`0.034`
26	`27`		[PLP]B:314	`12`	`1`	`399`	`f`	[PXL]B:313	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`320`	`62.7`	`3.2`	`0.386`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`28`		[SO4]A:320	`5`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`14662`	`60.1`	`-6.8`	`0.751`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
28	`29`		[SO4]B:315	`4`	`1`	`186`	`f`	[ATP]B:409	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`603`	`53.5`	`-7.6`	`0.616`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
29	`30`		[NA]A:402	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`14720`	`52.2`	`-8.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
	`31`		[NA]B:406	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`14662`	`51.8`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
	*Average:*													`52.0`	`-8.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
30	`32`		[SO4]A:315	`4`	`1`	`186`	`f`	[ATP]A:407	x,y,z	`1_555`	`10`	`1`	`598`	`48.4`	`-6.8`	`0.630`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
31	`33`		[PLP]B:314	`4`	`1`	`399`	`f`	[ATP]B:409	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`603`	`48.0`	`-2.8`	`0.304`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
32	`34`		A	`6`	`2`	`14720`	`◊`	[MPD]B:319	-x+1/2,y-1/2,-z+1/2	`7_545`	`5`	`1`	`278`	`45.0`	`-1.7`	`0.908`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[SO4]A:314	`4`	`1`	`187`	`f`	[ATP]A:407	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`598`	`40.0`	`-4.7`	`0.711`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
34	`36`		[SO4]A:314	`4`	`1`	`187`	`f`	[PXL]A:313	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`325`	`36.6`	`-2.7`	`0.697`	`1`	`0`	`0`	`0.011`
35	`37`		[ATP]B:409	`6`	`1`	`603`	`f`	[NA]B:406	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`36.5`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
	`38`		[ATP]A:407	`7`	`1`	`598`	`f`	[NA]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`35.9`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
	*Average:*													`36.2`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
36	`39`		[MG]A:400	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`14720`	`34.5`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
	`40`		[MG]B:404	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`14662`	`27.5`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
	*Average:*													`31.0`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
37	`41`		[MPD]A:321	`2`	`1`	`280`	`f`	[SO4]A:319	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`186`	`34.0`	`-5.3`	`0.965`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
38	`42`		[ATP]B:409	`5`	`1`	`603`	`f`	[MG]B:404	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`33.7`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
	`43`		[ATP]A:407	`4`	`1`	`598`	`f`	[MG]A:400	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`32.3`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
	*Average:*													`33.0`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
39	`44`		B	`5`	`1`	`14662`	`◊`	[SO4]A:320	x-1/2,-y+1/2,-z+1/2	`8_455`	`3`	`1`	`185`	`33.3`	`-4.3`	`0.728`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`45`		[MPD]B:321	`3`	`1`	`278`	`f`	[SO4]B:317	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`185`	`23.9`	`-3.8`	`0.000`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
41	`46`		A	`5`	`3`	`14720`	`x`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1/2	`7_545`	`2`	`2`	`14720`	`22.8`	`0.2`	`0.663`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`47`		[SO4]B:315	`2`	`1`	`186`	`f`	[MG]B:404	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`22.7`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
43	`48`		[SO4]A:315	`3`	`1`	`186`	`f`	[MG]A:400	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`22.2`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
44	`49`		A	`5`	`2`	`14720`	`◊`	A	-x,-y,z	`2_555`	`5`	`2`	`14720`	`20.4`	`0.2`	`0.650`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`50`		[PLP]B:314	`1`	`1`	`399`	`f`	[MG]B:404	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`4.5`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
46	`51`		B	`2`	`1`	`14662`	`x`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+1/2	`8_455`	`2`	`2`	`14662`	`2.1`	`0.0`	`0.644`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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