PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=369-D4-6PG)

Interfaces in PDB 3hww crystal.
Space symmetry group: P 41 21 2. Resolution: 1.95 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF MENAQUINONE SYNTHESIS PROTEIN MEND FROM E. COLI IN COMPLEX WITH OXOGLUTARATE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`274`	`75`	`21843`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`265`	`68`	`22494`	`2545.1`	`-21.3`	`0.104`	`38`	`8`	`0`	`0.091`
2	`2`		A	`169`	`38`	`22494`	`◊`	A	y,x,-z	`7_555`	`169`	`38`	`22494`	`1487.6`	`-0.4`	`0.759`	`26`	`16`	`0`	`0.032`
	`3`		D	`175`	`42`	`21843`	`◊`	D	y,x,-z	`7_555`	`175`	`43`	`21843`	`1455.1`	`-2.7`	`0.561`	`20`	`14`	`0`	`0.032`
	*Average:*													`1471.4`	`-1.5`	`0.660`	`23`	`15`	`0`	`0.032`
3	`4`		A	`69`	`17`	`22494`	`x`	A	-y-1/2,x+1/2,z+1/4	`3_455`	`90`	`28`	`22494`	`677.8`	`-6.5`	`0.244`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		D	`47`	`12`	`21843`	`◊`	A	y,x,-z	`7_555`	`46`	`12`	`22494`	`371.0`	`-5.3`	`0.190`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
5	`6`		A	`35`	`11`	`22494`	`◊`	D	-x-1/2,y-1/2,-z+1/4	`5_445`	`35`	`12`	`21843`	`308.2`	`-0.8`	`0.560`	`5`	`5`	`0`	`0.000`
6	`7`		D	`21`	`9`	`21843`	`◊`	A	-y-1/2,x+1/2,z+1/4	`3_455`	`18`	`8`	`22494`	`173.0`	`-0.4`	`0.403`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`8`		[AKG]A:557	`10`	`1`	`282`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`13`	`22494`	`172.1`	`1.0`	`0.457`	`6`	`0`	`0`	`0.007`
8	`9`		[AKG]D:557	`9`	`1`	`282`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`28`	`13`	`21843`	`168.6`	`2.2`	`0.598`	`8`	`0`	`0`	`0.006`
9	`10`		[GOL]A:579	`6`	`1`	`225`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`22494`	`127.4`	`-0.9`	`0.385`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
10	`11`		[GOL]D:571	`6`	`1`	`220`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`21843`	`102.8`	`-0.9`	`0.468`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
11	`12`		[GOL]A:577	`6`	`1`	`218`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`21843`	`93.2`	`0.4`	`0.631`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
12	`13`		[GOL]A:580	`5`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`22494`	`85.2`	`-0.6`	`0.479`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
13	`14`		[GOL]D:569	`6`	`1`	`224`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`21843`	`80.1`	`1.7`	`0.780`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
14	`15`		[GOL]A:577	`6`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`22494`	`79.6`	`-0.8`	`0.420`	`1`	`0`	`0`	`0.003`
15	`16`		[NA]D:578	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`21843`	`79.4`	`-12.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.059`
16	`17`		[GOL]D:581	`5`	`1`	`219`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`21843`	`73.8`	`0.8`	`0.646`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`18`		[CL]A:563	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`22494`	`71.1`	`-12.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
18	`19`		[NA]D:561	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`21843`	`70.6`	`-11.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
19	`20`		[NA]D:573	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`21843`	`70.6`	`-9.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
20	`21`		D	`8`	`1`	`21843`	`◊`	D	-y,-x,-z-1/2	`8_554`	`8`	`1`	`21843`	`69.0`	`-0.3`	`0.526`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		[NA]A:560	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`22494`	`68.8`	`-9.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
22	`23`		[NA]A:569	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`22494`	`68.6`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
23	`24`		[NA]A:574	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`22494`	`68.1`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
24	`25`		[NA]D:565	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`21843`	`67.6`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
25	`26`		[NA]A:559	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`7`	`22494`	`65.9`	`-12.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
26	`27`		[NA]A:565	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`6`	`22494`	`65.5`	`-11.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
27	`28`		[NA]A:564	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`22494`	`64.0`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
28	`29`		[NA]D:564	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`21843`	`63.5`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
29	`30`		[NA]A:575	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`22494`	`63.3`	`-9.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	`31`		[NA]D:572	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`21843`	`55.1`	`-7.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	`32`		[NA]D:575	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	y,x,-z	`7_555`	`14`	`6`	`21843`	`48.3`	`-7.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	*Average:*													`55.6`	`-8.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
30	`33`		[NA]D:574	`1`	`1`	`125`	`f`	A	y,x,-z	`7_555`	`7`	`5`	`22494`	`63.2`	`-8.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
31	`34`		[NA]D:560	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`21843`	`62.5`	`-12.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
32	`35`		[NA]D:559	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`21843`	`62.5`	`-12.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
33	`36`		[NA]A:568	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`22494`	`61.1`	`-10.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
34	`37`		[NA]D:579	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`21843`	`59.9`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
35	`38`		[NA]D:577	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`21843`	`59.4`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
	`39`		[NA]D:576	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`21843`	`52.6`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
	*Average:*													`56.0`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
36	`40`		[NA]A:572	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`10`	`22494`	`56.5`	`-9.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
37	`41`		[NA]D:562	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`21843`	`56.4`	`-11.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
38	`42`		[NA]D:580	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`21843`	`55.9`	`-10.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
	`43`		[NA]A:576	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`6`	`22494`	`53.9`	`-10.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
	*Average:*													`54.9`	`-10.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
39	`44`		[NA]A:578	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`22494`	`53.5`	`-7.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
40	`45`		[NA]A:573	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`22494`	`52.3`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
41	`46`		[NA]A:567	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`22494`	`52.1`	`-7.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
42	`47`		[NA]D:563	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`21843`	`51.2`	`-9.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
43	`48`		[NA]A:566	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`22494`	`51.0`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
44	`49`		[NA]D:570	`1`	`1`	`125`	`f`	D	y,x,-z	`7_555`	`13`	`5`	`21843`	`50.0`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
45	`50`		[NA]A:562	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`22494`	`48.1`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
46	`51`		[NA]A:561	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`22494`	`46.9`	`-7.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
47	`52`		[NA]A:570	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`22494`	`45.9`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
48	`53`		[NA]A:571	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	y,x,-z	`7_555`	`13`	`4`	`22494`	`42.8`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
49	`54`		[NA]D:567	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	y,x,-z	`7_555`	`8`	`4`	`22494`	`42.3`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
	`55`		[NA]D:567	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`21843`	`41.0`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
	*Average:*													`41.7`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
50	`56`		[NA]A:571	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`22494`	`41.8`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
51	`57`		[MG]A:558	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`22494`	`41.5`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
	`58`		[MG]D:558	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`21843`	`40.6`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
	*Average:*													`41.0`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
52	`59`		[CL]D:568	`1`	`1`	`125`	`f`	A	y,x,-z	`7_555`	`8`	`4`	`22494`	`41.3`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
53	`60`		[NA]A:570	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	y,x,-z	`7_555`	`8`	`3`	`22494`	`40.8`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
54	`61`		[NA]D:570	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`21843`	`40.7`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
	`62`		[NA]D:572	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	y,x,-z	`7_555`	`2`	`1`	`21843`	`17.1`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
	*Average:*													`28.9`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
55	`63`		[NA]D:566	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`21843`	`40.2`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
	`64`		[NA]D:566	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	y,x,-z	`7_555`	`7`	`3`	`22494`	`39.8`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
	*Average:*													`40.0`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
56	`65`		[NA]A:562	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`21843`	`39.4`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
	`66`		[NA]A:561	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`21843`	`24.4`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
	*Average:*													`31.9`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
57	`67`		[MG]D:558	`1`	`1`	`98`	`f`	[AKG]D:557	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`282`	`34.4`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`68`		[MG]A:558	`1`	`1`	`98`	`f`	[AKG]A:557	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`282`	`33.0`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	*Average:*													`33.7`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
58	`69`		[NA]D:574	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`21843`	`31.7`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
59	`70`		[CL]D:568	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`21843`	`29.9`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
60	`71`		[NA]D:577	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]D:576	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`29.0`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
61	`72`		[GOL]A:579	`5`	`1`	`225`	`f`	[NA]A:568	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`28.6`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
62	`73`		[NA]A:573	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]A:572	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`27.3`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
63	`74`		[NA]A:575	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	y,x,-z	`7_555`	`3`	`2`	`22494`	`26.8`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	`75`		[NA]D:575	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`21843`	`18.6`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	*Average:*													`22.7`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
64	`76`		[NA]A:564	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`21843`	`23.0`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
65	`77`		[NA]D:575	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]D:572	y,x,-z	`7_555`	`1`	`1`	`125`	`22.9`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
66	`78`		[CL]D:568	`1`	`1`	`125`	`◊`	[NA]D:567	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`22.2`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
67	`79`		[NA]A:562	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]A:561	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`21.7`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
68	`80`		[CL]D:568	`1`	`1`	`125`	`◊`	[NA]D:566	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`21.3`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
69	`81`		[NA]A:576	`1`	`1`	`125`	`f`	[AKG]A:557	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`282`	`21.2`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	`82`		[NA]D:580	`1`	`1`	`125`	`f`	[AKG]D:557	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`282`	`17.4`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
	*Average:*													`19.3`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
70	`83`		[NA]D:573	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]D:564	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`19.2`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
71	`84`		[NA]D:564	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]D:563	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`18.5`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
72	`85`		[NA]A:571	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]A:570	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`18.0`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
73	`86`		[GOL]A:577	`2`	`1`	`218`	`f`	[NA]D:562	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`15.3`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
74	`87`		[NA]D:573	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]D:563	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`12.4`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
75	`88`		[NA]D:567	`1`	`1`	`125`	`f`	[NA]D:566	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`10.8`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
76	`89`		[NA]D:575	`1`	`1`	`125`	`◊`	[NA]D:570	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`8.8`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
77	`90`		[NA]D:572	`1`	`1`	`125`	`◊`	[NA]D:570	y,x,-z	`7_555`	`1`	`1`	`125`	`5.8`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
78	`91`		[GOL]D:569	`1`	`1`	`224`	`◊`	A	y,x,-z	`7_555`	`3`	`2`	`22494`	`5.7`	`-0.1`	`0.555`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`92`		[NA]A:569	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	y,x,-z	`7_555`	`1`	`1`	`22494`	`5.6`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
80	`93`		D	`1`	`1`	`21843`	`x`	D	x-1/2,-y+1/2,-z-1/4	`6_454`	`1`	`1`	`21843`	`1.4`	`0.0`	`0.716`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
81	`94`		[NA]A:569	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	-x-1/2,y-1/2,-z+1/4	`5_445`	`1`	`1`	`21843`	`1.0`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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