PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=537-HM-BL2)

Interfaces in PDB 3hwx crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 2.60 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF MENAQUINONE SYNTHESIS PROTEIN MEND FROM E. COLI IN COMPLEX WITH THDP

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		S	`351`	`92`	`23102`	`◊`	R	x,y,z	`1_555`	`347`	`93`	`23047`	`3413.2`	`-41.9`	`0.002`	`50`	`7`	`0`	`0.469`
	`2`		J	`360`	`92`	`23054`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`359`	`95`	`23188`	`3379.2`	`-39.0`	`0.004`	`43`	`6`	`0`	`0.469`
	`3`		B	`355`	`93`	`22940`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`347`	`92`	`23019`	`3375.0`	`-40.7`	`0.002`	`48`	`6`	`0`	`0.469`
	`4`		Z	`348`	`93`	`23184`	`◊`	1	x,y,z	`1_555`	`354`	`91`	`23232`	`3374.7`	`-42.1`	`0.001`	`44`	`6`	`0`	`0.469`
	*Average:*													`3385.5`	`-40.9`	`0.003`	`46`	`6`	`0`	`0.469`
2	`5`		J	`177`	`42`	`23054`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`171`	`42`	`22940`	`1531.0`	`-0.3`	`0.730`	`24`	`18`	`0`	`0.161`
	`6`		S	`173`	`41`	`23102`	`◊`	1	x,y,z	`1_555`	`173`	`42`	`23232`	`1528.8`	`-1.5`	`0.677`	`25`	`23`	`0`	`0.161`
	`7`		Z	`174`	`41`	`23184`	`◊`	R	x,y,z	`1_555`	`177`	`45`	`23047`	`1486.3`	`-2.8`	`0.624`	`28`	`10`	`0`	`0.161`
	`8`		I	`178`	`44`	`23188`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`170`	`42`	`23019`	`1446.0`	`-2.3`	`0.629`	`22`	`9`	`0`	`0.161`
	*Average:*													`1498.0`	`-1.7`	`0.665`	`25`	`15`	`0`	`0.161`
3	`9`		J	`61`	`20`	`23054`	`◊`	Z	x,y-1,z+1	`1_546`	`62`	`17`	`23184`	`529.2`	`-1.0`	`0.569`	`7`	`3`	`0`	`0.000`
4	`10`		R	`53`	`15`	`23047`	`◊`	1	x-1,y,z	`1_455`	`57`	`23`	`23232`	`518.4`	`5.2`	`0.927`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
	`11`		B	`51`	`18`	`22940`	`◊`	I	x,y-1,z	`1_545`	`57`	`23`	`23188`	`509.3`	`6.1`	`0.932`	`7`	`8`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`513.8`	`5.7`	`0.930`	`6`	`5`	`0`	`0.000`
5	`12`		B	`51`	`16`	`22940`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`46`	`12`	`23019`	`449.4`	`0.2`	`0.623`	`1`	`3`	`0`	`0.000`
	`13`		R	`49`	`16`	`23047`	`◊`	S	x-1,y,z	`1_455`	`44`	`14`	`23102`	`442.6`	`0.3`	`0.680`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`446.0`	`0.2`	`0.652`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
6	`14`		Z	`48`	`15`	`23184`	`◊`	S	x,y,z	`1_555`	`45`	`15`	`23102`	`400.7`	`-4.9`	`0.195`	`1`	`0`	`0`	`0.037`
	`15`		R	`46`	`14`	`23047`	`◊`	1	x,y,z	`1_555`	`46`	`13`	`23232`	`393.5`	`-5.6`	`0.150`	`2`	`0`	`0`	`0.037`
	`16`		I	`47`	`14`	`23188`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`45`	`13`	`22940`	`380.9`	`-4.9`	`0.190`	`1`	`0`	`0`	`0.037`
	`17`		J	`45`	`14`	`23054`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`44`	`14`	`23019`	`373.6`	`-5.5`	`0.144`	`1`	`0`	`0`	`0.037`
	*Average:*													`387.2`	`-5.2`	`0.170`	`1`	`0`	`0`	`0.037`
7	`18`		[TPP]I:601	`26`	`1`	`598`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`48`	`22`	`23188`	`324.1`	`-9.9`	`0.253`	`12`	`0`	`0`	`0.303`
	`19`		[TPP]J:601	`25`	`1`	`594`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`45`	`22`	`23054`	`318.3`	`-9.3`	`0.267`	`11`	`0`	`0`	`0.303`
	`20`		[TPP]Z:601	`26`	`1`	`591`	`f`	Z	x,y,z	`1_555`	`47`	`22`	`23184`	`317.4`	`-9.4`	`0.273`	`11`	`0`	`0`	`0.303`
	`21`		[TPP]R:601	`26`	`1`	`589`	`f`	R	x,y,z	`1_555`	`43`	`21`	`23047`	`315.0`	`-9.9`	`0.264`	`11`	`0`	`0`	`0.303`
	`22`		[TPP]B:601	`26`	`1`	`586`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`47`	`23`	`22940`	`313.4`	`-9.6`	`0.264`	`14`	`0`	`0`	`0.303`
	`23`		[TPP]S:601	`26`	`1`	`591`	`f`	S	x,y,z	`1_555`	`48`	`21`	`23102`	`313.0`	`-9.5`	`0.276`	`13`	`0`	`0`	`0.303`
	`24`		[TPP]A:601	`26`	`1`	`588`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`45`	`21`	`23019`	`312.5`	`-8.9`	`0.291`	`14`	`0`	`0`	`0.303`
	`25`		[TPP]1:601	`26`	`1`	`587`	`f`	1	x,y,z	`1_555`	`43`	`23`	`23232`	`312.2`	`-9.4`	`0.263`	`12`	`0`	`0`	`0.303`
	*Average:*													`315.7`	`-9.5`	`0.269`	`12`	`0`	`0`	`0.303`
8	`26`		A	`37`	`8`	`23019`	`◊`	1	x,y,z	`1_555`	`33`	`10`	`23232`	`320.4`	`-1.7`	`0.399`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`27`		S	`37`	`8`	`23102`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`34`	`8`	`23188`	`307.8`	`-2.4`	`0.369`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`314.1`	`-2.0`	`0.384`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
9	`28`		I	`22`	`6`	`23188`	`◊`	B	x-1,y+1,z	`1_465`	`31`	`12`	`22940`	`211.5`	`1.2`	`0.754`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		R	`31`	`10`	`23047`	`◊`	1	x-1,y+1,z	`1_465`	`20`	`7`	`23232`	`193.5`	`1.1`	`0.746`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`202.5`	`1.2`	`0.750`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`30`		Z	`21`	`7`	`23184`	`◊`	J	x-1,y+1,z-1	`1_464`	`18`	`4`	`23054`	`165.6`	`0.8`	`0.726`	`0`	`3`	`0`	`0.000`
11	`31`		[GOL]J:557	`6`	`1`	`216`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`23054`	`150.3`	`-0.0`	`0.601`	`2`	`0`	`0`	`0.007`
12	`32`		[TPP]S:601	`14`	`1`	`591`	`◊`	R	x,y,z	`1_555`	`23`	`11`	`23047`	`147.1`	`1.7`	`0.770`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		[TPP]1:601	`13`	`1`	`587`	`◊`	Z	x,y,z	`1_555`	`21`	`11`	`23184`	`144.8`	`1.5`	`0.751`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		[TPP]B:601	`14`	`1`	`586`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`11`	`23019`	`144.3`	`1.6`	`0.775`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		[TPP]J:601	`13`	`1`	`594`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`23`	`11`	`23188`	`144.3`	`1.6`	`0.748`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		[TPP]A:601	`13`	`1`	`588`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`10`	`22940`	`144.3`	`1.4`	`0.742`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		[TPP]I:601	`13`	`1`	`598`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`26`	`11`	`23054`	`142.3`	`1.5`	`0.764`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		[TPP]Z:601	`13`	`1`	`591`	`◊`	1	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`23232`	`140.9`	`1.3`	`0.750`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		[TPP]R:601	`13`	`1`	`589`	`◊`	S	x,y,z	`1_555`	`21`	`11`	`23102`	`140.9`	`1.6`	`0.788`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`143.6`	`1.5`	`0.761`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`40`		[GOL]1:558	`6`	`1`	`215`	`f`	1	x,y,z	`1_555`	`25`	`12`	`23232`	`140.1`	`0.8`	`0.693`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`41`		S	`22`	`9`	`23102`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`23019`	`138.4`	`0.7`	`0.702`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`42`		[NA]S:559	`1`	`1`	`125`	`f`	S	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`23102`	`71.6`	`-9.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.097`
16	`43`		[NA]Z:557	`1`	`1`	`125`	`f`	Z	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`23184`	`70.9`	`-9.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
17	`44`		[NA]R:557	`1`	`1`	`125`	`f`	R	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`23047`	`70.4`	`-10.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.089`
18	`45`		[NA]S:557	`1`	`1`	`125`	`f`	S	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`23102`	`70.2`	`-10.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.103`
19	`46`		[NA]I:559	`1`	`1`	`125`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`23188`	`69.0`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.090`
20	`47`		[NA]R:558	`1`	`1`	`125`	`f`	R	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`23047`	`62.8`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
21	`48`		[NA]Z:558	`1`	`1`	`125`	`f`	Z	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`23184`	`58.9`	`-7.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.067`
22	`49`		[NA]R:559	`1`	`1`	`125`	`f`	R	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`23047`	`56.7`	`-7.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.069`
23	`50`		[NA]A:557	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`23019`	`55.7`	`-7.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
24	`51`		Z	`6`	`2`	`23184`	`◊`	I	x,y,z-1	`1_554`	`6`	`3`	`23188`	`54.1`	`1.4`	`0.868`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
25	`52`		[NA]S:558	`1`	`1`	`125`	`f`	S	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`23102`	`53.0`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.056`
26	`53`		[NA]A:558	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`23019`	`52.4`	`-6.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.065`
27	`54`		[NA]B:557	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`22940`	`51.1`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
28	`55`		[NA]I:557	`1`	`1`	`125`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`23188`	`49.1`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.059`
	`56`		[NA]1:557	`1`	`1`	`125`	`f`	1	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`23232`	`48.5`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.059`
	*Average:*													`48.8`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.059`
29	`57`		[NA]A:558	`1`	`1`	`125`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`23188`	`48.7`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
30	`58`		[MG]Z:602	`1`	`1`	`98`	`f`	Z	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`23184`	`37.9`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.122`
	`59`		[MG]1:602	`1`	`1`	`98`	`f`	1	x,y,z	`1_555`	`10`	`8`	`23232`	`37.7`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.122`
	`60`		[MG]A:602	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`23019`	`37.4`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.122`
	`61`		[MG]J:602	`1`	`1`	`98`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`23054`	`37.4`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.122`
	`62`		[MG]I:602	`1`	`1`	`98`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`23188`	`37.3`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.122`
	`63`		[MG]B:602	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`22940`	`36.4`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.122`
	`64`		[MG]S:602	`1`	`1`	`98`	`f`	S	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`23102`	`36.3`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.122`
	`65`		[MG]R:602	`1`	`1`	`98`	`f`	R	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`23047`	`35.9`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.122`
	*Average:*													`37.0`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.122`
31	`66`		Z	`4`	`1`	`23184`	`◊`	1	x-1,y+1,z	`1_465`	`4`	`1`	`23232`	`34.9`	`-0.4`	`0.360`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`67`		I	`4`	`1`	`23188`	`◊`	J	x-1,y+1,z	`1_465`	`5`	`1`	`23054`	`33.6`	`-0.5`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`34.3`	`-0.4`	`0.366`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`68`		1	`5`	`3`	`23232`	`◊`	J	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`3`	`23054`	`33.2`	`1.0`	`0.852`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`69`		[MG]I:602	`1`	`1`	`98`	`f`	[TPP]I:601	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`598`	`32.0`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
	`70`		[MG]R:602	`1`	`1`	`98`	`f`	[TPP]R:601	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`589`	`31.9`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
	`71`		[MG]B:602	`1`	`1`	`98`	`f`	[TPP]B:601	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`586`	`31.8`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
	`72`		[MG]S:602	`1`	`1`	`98`	`f`	[TPP]S:601	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`591`	`31.7`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
	`73`		[MG]Z:602	`1`	`1`	`98`	`f`	[TPP]Z:601	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`591`	`31.4`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
	`74`		[MG]A:602	`1`	`1`	`98`	`f`	[TPP]A:601	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`588`	`31.2`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
	`75`		[MG]J:602	`1`	`1`	`98`	`f`	[TPP]J:601	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`594`	`31.1`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
	`76`		[MG]1:602	`1`	`1`	`98`	`f`	[TPP]1:601	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`587`	`31.0`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
	*Average:*													`31.5`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
34	`77`		R	`4`	`1`	`23047`	`◊`	[NA]S:559	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`125`	`31.1`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`78`		[NA]1:557	`1`	`1`	`125`	`◊`	Z	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`23184`	`27.9`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	`79`		[NA]I:557	`1`	`1`	`125`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`23054`	`27.5`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
	*Average:*													`27.7`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
36	`80`		[NA]I:558	`1`	`1`	`125`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`23188`	`26.2`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
37	`81`		[NA]S:557	`1`	`1`	`125`	`◊`	R	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`23047`	`24.6`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
38	`82`		B	`4`	`3`	`22940`	`◊`	S	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`1`	`23102`	`24.0`	`0.5`	`0.796`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`83`		R	`2`	`2`	`23047`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`23019`	`12.2`	`0.4`	`0.815`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`18.1`	`0.5`	`0.805`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`84`		[NA]Z:558	`1`	`1`	`125`	`◊`	1	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`23232`	`21.0`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
40	`85`		B	`3`	`1`	`22940`	`◊`	Z	x,y-1,z+1	`1_546`	`5`	`2`	`23184`	`13.7`	`-0.2`	`0.448`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`86`		I	`3`	`1`	`23188`	`◊`	A	x-1,y+1,z	`1_465`	`2`	`1`	`23019`	`12.7`	`0.3`	`0.767`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`87`		S	`1`	`1`	`23102`	`◊`	1	x-1,y+1,z	`1_465`	`1`	`1`	`23232`	`4.6`	`0.0`	`0.509`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`8.6`	`0.2`	`0.638`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`88`		B	`1`	`1`	`22940`	`◊`	[NA]I:557	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`125`	`11.1`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`89`		[NA]R:559	`1`	`1`	`125`	`◊`	Z	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`23184`	`8.0`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe