PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=942-7B-55E)

Interfaces in PDB 3o41 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.95 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF 101F FAB BOUND TO 15-MER PEPTIDE EPITOPE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		L	`198`	`59`	`11535`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`188`	`52`	`11538`	`1833.0`	`-25.1`	`0.047`	`16`	`1`	`0`	`0.287`
	`2`		B	`200`	`57`	`11387`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`188`	`53`	`11512`	`1812.6`	`-26.4`	`0.024`	`16`	`1`	`0`	`0.287`
	*Average:*													`1822.8`	`-25.7`	`0.036`	`16`	`1`	`0`	`0.287`
2	`3`		A	`87`	`27`	`11512`	`◊`	H	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`82`	`26`	`11538`	`717.0`	`2.6`	`0.929`	`14`	`0`	`0`	`0.000`
3	`4`		H	`62`	`23`	`11538`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`69`	`23`	`11512`	`584.5`	`-1.5`	`0.749`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
4	`5`		L	`45`	`11`	`11535`	`◊`	B	-x-3/2,-y,z-1/2	`2_354`	`54`	`14`	`11387`	`430.8`	`1.3`	`0.771`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		P	`40`	`9`	`1584`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`55`	`14`	`11538`	`417.8`	`-2.4`	`0.597`	`5`	`3`	`0`	`0.040`
	`7`		C	`36`	`9`	`1430`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`55`	`13`	`11512`	`416.4`	`-2.8`	`0.546`	`5`	`3`	`0`	`0.040`
	*Average:*													`417.1`	`-2.6`	`0.572`	`5`	`3`	`0`	`0.040`
6	`8`		L	`32`	`13`	`11535`	`◊`	A	-x-3/2,-y,z-1/2	`2_354`	`24`	`9`	`11512`	`283.1`	`0.3`	`0.712`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
7	`9`		C	`35`	`7`	`1430`	`◊`	P	x-1,y,z	`1_455`	`31`	`6`	`1584`	`265.4`	`-5.0`	`0.355`	`6`	`0`	`0`	`1.000`
8	`10`		B	`27`	`7`	`11387`	`◊`	L	x-1,y,z	`1_455`	`28`	`7`	`11535`	`248.5`	`-0.6`	`0.559`	`4`	`0`	`0`	`0.009`
9	`11`		B	`30`	`11`	`11387`	`◊`	L	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`25`	`10`	`11535`	`217.0`	`0.4`	`0.705`	`2`	`7`	`0`	`0.006`
10	`12`		P	`23`	`5`	`1584`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`33`	`8`	`11535`	`189.2`	`-2.0`	`0.484`	`4`	`0`	`0`	`0.028`
	`13`		C	`22`	`5`	`1430`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`29`	`9`	`11387`	`184.1`	`-1.7`	`0.522`	`4`	`0`	`0`	`0.028`
	*Average:*													`186.7`	`-1.8`	`0.503`	`4`	`0`	`0`	`0.028`
11	`14`		P	`14`	`3`	`1584`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`11512`	`127.2`	`0.2`	`0.707`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`15`		H	`14`	`5`	`11538`	`◊`	B	-x-3/2,-y,z-1/2	`2_354`	`14`	`3`	`11387`	`108.7`	`1.1`	`0.815`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
13	`16`		[SO4]B:215	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`11387`	`95.3`	`-11.7`	`0.922`	`4`	`0`	`0`	`0.111`
14	`17`		[SO4]L:216	`5`	`1`	`184`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`11535`	`91.9`	`-10.4`	`0.930`	`4`	`0`	`0`	`0.109`
15	`18`		C	`9`	`2`	`1430`	`◊`	L	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`5`	`11535`	`90.7`	`-1.7`	`0.282`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
	`19`		B	`17`	`4`	`11387`	`◊`	P	x-1,y,z	`1_455`	`8`	`2`	`1584`	`86.2`	`-2.3`	`0.226`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
	*Average:*													`88.4`	`-2.0`	`0.254`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
16	`20`		[SO4]L:219	`5`	`1`	`185`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`11535`	`90.7`	`-12.8`	`0.870`	`4`	`0`	`0`	`0.129`
17	`21`		[SO4]B:216	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`11387`	`81.6`	`-12.2`	`0.824`	`3`	`0`	`0`	`0.111`
18	`22`		[SO4]A:215	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`11512`	`80.0`	`-10.3`	`0.919`	`3`	`0`	`0`	`0.096`
19	`23`		[SO4]H:216	`4`	`1`	`185`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`11538`	`78.3`	`-11.1`	`0.826`	`4`	`0`	`0`	`0.114`
20	`24`		[SO4]B:217	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11387`	`75.9`	`-11.0`	`0.820`	`3`	`0`	`0`	`0.102`
21	`25`		[SO4]A:216	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`11512`	`73.9`	`-10.4`	`0.889`	`4`	`0`	`0`	`0.101`
22	`26`		L	`6`	`3`	`11535`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`11512`	`68.1`	`-1.1`	`0.323`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`27`		A	`11`	`4`	`11512`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`8`	`4`	`11538`	`65.9`	`1.8`	`0.913`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
24	`28`		[SO4]H:215	`4`	`1`	`185`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11538`	`62.1`	`-8.4`	`0.767`	`2`	`0`	`0`	`0.083`
25	`29`		A	`7`	`3`	`11512`	`f`	[SO4]H:214	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`185`	`62.0`	`-8.4`	`0.747`	`2`	`0`	`0`	`0.077`
26	`30`		[SO4]L:215	`5`	`1`	`186`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`11535`	`60.4`	`-8.0`	`0.777`	`1`	`0`	`0`	`0.075`
27	`31`		[SO4]L:217	`4`	`1`	`185`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`11535`	`59.4`	`-7.9`	`0.753`	`1`	`0`	`0`	`0.074`
28	`32`		[SO4]L:218	`4`	`1`	`185`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`11535`	`58.1`	`-7.1`	`0.814`	`1`	`0`	`0`	`0.067`
29	`33`		[SO4]A:214	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`11512`	`52.5`	`-7.0`	`0.683`	`1`	`0`	`0`	`0.061`
30	`34`		[SO4]L:218	`4`	`1`	`185`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`11538`	`50.5`	`-6.6`	`0.737`	`1`	`0`	`0`	`0.062`
31	`35`		[SO4]A:214	`5`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`11387`	`49.7`	`-6.5`	`0.737`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
32	`36`		A	`8`	`3`	`11512`	`◊`	P	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`2`	`1584`	`48.0`	`1.0`	`0.835`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
	`37`		C	`3`	`1`	`1430`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`2`	`11538`	`37.4`	`1.4`	`0.908`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`42.7`	`1.2`	`0.871`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
33	`38`		B	`8`	`3`	`11387`	`◊`	[SO4]L:215	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`4`	`1`	`186`	`46.3`	`-5.2`	`0.783`	`1`	`0`	`0`	`0.021`
34	`39`		[NH2]P:437	`1`	`1`	`117`	`cf`	P	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`1584`	`40.8`	`0.1`	`0.642`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		[NH2]C:437	`1`	`1`	`117`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`1430`	`40.6`	`0.1`	`0.646`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`40.7`	`0.1`	`0.644`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`41`		[SO4]H:214	`3`	`1`	`185`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`11538`	`38.8`	`-4.2`	`0.929`	`1`	`0`	`0`	`0.017`
36	`42`		[NH2]C:437	`1`	`1`	`117`	`◊`	P	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`4`	`1584`	`37.3`	`0.1`	`0.758`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		C	`10`	`4`	`1430`	`◊`	[NH2]P:437	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`117`	`36.4`	`0.1`	`0.768`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`36.8`	`0.1`	`0.763`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`44`		A	`2`	`1`	`11512`	`◊`	[SO4]H:215	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`185`	`36.2`	`-3.7`	`0.914`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
38	`45`		[SO4]L:217	`3`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`11387`	`36.0`	`-3.8`	`0.925`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
39	`46`		[SO4]B:216	`4`	`1`	`185`	`◊`	L	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`2`	`1`	`11535`	`35.2`	`-3.6`	`0.967`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
40	`47`		[SO4]L:219	`3`	`1`	`185`	`◊`	A	-x-3/2,-y,z-1/2	`2_354`	`3`	`1`	`11512`	`31.8`	`-4.2`	`0.453`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`48`		[NH2]C:437	`1`	`1`	`117`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`11387`	`26.9`	`0.4`	`0.834`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`49`		[NH2]P:437	`1`	`1`	`117`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`11535`	`26.1`	`0.2`	`0.764`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`26.5`	`0.3`	`0.799`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`50`		B	`2`	`2`	`11387`	`x`	B	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`4`	`3`	`11387`	`23.1`	`-0.1`	`0.372`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`51`		[SO4]A:215	`2`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11387`	`12.4`	`-1.2`	`0.918`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
44	`52`		C	`1`	`1`	`1430`	`◊`	[SO4]H:214	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`185`	`8.5`	`-1.2`	`0.576`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
45	`53`		[SO4]H:215	`1`	`1`	`185`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`1584`	`3.0`	`-0.4`	`0.760`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
46	`54`		[SO4]L:217	`1`	`1`	`185`	`◊`	[SO4]A:214	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`184`	`1.1`	`-0.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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