PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=878-56-FFB)

Interfaces in PDB 3o9z crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.45 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF THE WLBA (WBPB) DEHYDROGENASE FROM THERMUS THERMOPHILUS IN COMPLEX WITH NAD AND ALPHA-KETOGLUTARATE AT 1.45 ANGSTROM RESOLUTION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`112`	`29`	`14014`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`112`	`29`	`14142`	`1067.7`	`-5.7`	`0.357`	`11`	`5`	`0`	`0.183`
	`2`		D	`103`	`30`	`14069`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`106`	`29`	`13875`	`996.9`	`-6.4`	`0.293`	`9`	`6`	`0`	`0.183`
	*Average:*													`1032.3`	`-6.1`	`0.325`	`10`	`6`	`0`	`0.183`
2	`3`		D	`86`	`25`	`14069`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`86`	`24`	`14142`	`829.5`	`0.6`	`0.686`	`19`	`33`	`0`	`0.159`
	`4`		C	`75`	`24`	`13875`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`74`	`21`	`14014`	`771.9`	`0.0`	`0.651`	`16`	`21`	`0`	`0.159`
	*Average:*													`800.7`	`0.3`	`0.669`	`18`	`27`	`0`	`0.159`
3	`5`		[NAD]C:311	`43`	`1`	`838`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`71`	`30`	`13875`	`550.5`	`-7.7`	`0.258`	`9`	`0`	`0`	`0.358`
	`6`		[NAD]B:311	`43`	`1`	`844`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`69`	`30`	`14014`	`546.3`	`-6.4`	`0.362`	`9`	`0`	`0`	`0.358`
	`7`		[NAD]D:311	`43`	`1`	`846`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`67`	`28`	`14069`	`545.4`	`-7.7`	`0.188`	`8`	`0`	`0`	`0.358`
	`8`		[NAD]A:311	`43`	`1`	`843`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`70`	`31`	`14142`	`543.2`	`-7.4`	`0.266`	`8`	`0`	`0`	`0.358`
	*Average:*													`546.3`	`-7.3`	`0.268`	`9`	`0`	`0`	`0.358`
4	`9`		A	`40`	`11`	`14142`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`39`	`10`	`13875`	`385.2`	`0.1`	`0.623`	`7`	`1`	`0`	`0.000`
	`10`		B	`41`	`12`	`14014`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`37`	`13`	`14069`	`340.5`	`0.9`	`0.710`	`6`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`362.9`	`0.5`	`0.667`	`7`	`2`	`0`	`0.000`
5	`11`		A	`33`	`10`	`14142`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`42`	`14`	`13875`	`349.4`	`-0.1`	`0.636`	`4`	`6`	`0`	`0.000`
	`12`		D	`43`	`13`	`14069`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`27`	`8`	`14014`	`325.8`	`0.3`	`0.662`	`4`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`337.6`	`0.1`	`0.649`	`4`	`6`	`0`	`0.000`
6	`13`		A	`30`	`9`	`14142`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`35`	`10`	`14014`	`277.8`	`0.8`	`0.698`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
7	`14`		D	`25`	`8`	`14069`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`25`	`9`	`13875`	`209.9`	`0.3`	`0.666`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
8	`15`		[AKG]D:312	`10`	`1`	`284`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`25`	`11`	`14069`	`162.7`	`1.0`	`0.522`	`8`	`0`	`0`	`0.067`
	`16`		[AKG]A:312	`10`	`1`	`284`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`11`	`14142`	`160.6`	`2.1`	`0.586`	`9`	`0`	`0`	`0.067`
	`17`		[AKG]B:312	`10`	`1`	`285`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`11`	`14014`	`154.2`	`2.1`	`0.586`	`10`	`0`	`0`	`0.067`
	*Average:*													`159.2`	`1.7`	`0.564`	`9`	`0`	`0`	`0.067`
9	`18`		[AKG]C:312	`10`	`1`	`279`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`23`	`12`	`13875`	`156.6`	`2.5`	`0.620`	`8`	`0`	`0`	`0.016`
10	`19`		[EDO]B:313	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`14014`	`94.4`	`3.5`	`0.511`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`20`		[EDO]C:313	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`14014`	`64.2`	`1.8`	`0.246`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`21`		[AKG]A:312	`6`	`1`	`284`	`f`	[NAD]A:311	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`843`	`63.5`	`-0.4`	`0.454`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	`22`		[AKG]D:312	`6`	`1`	`284`	`f`	[NAD]D:311	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`846`	`62.5`	`-0.4`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	`23`		[AKG]B:312	`7`	`1`	`285`	`f`	[NAD]B:311	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`844`	`62.2`	`-0.4`	`0.446`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	*Average:*													`62.7`	`-0.4`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
13	`24`		[EDO]B:314	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`13875`	`63.2`	`1.8`	`0.246`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`25`		[AKG]C:312	`7`	`1`	`279`	`f`	[NAD]C:311	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`838`	`63.0`	`0.5`	`0.529`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`26`		[NAD]A:311	`7`	`1`	`843`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`14014`	`59.1`	`-3.0`	`0.261`	`1`	`0`	`0`	`0.102`
	`27`		[NAD]B:311	`7`	`1`	`844`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`14142`	`57.5`	`-2.9`	`0.266`	`0`	`0`	`0`	`0.102`
	`28`		[NAD]D:311	`7`	`1`	`846`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`13875`	`54.7`	`-1.9`	`0.392`	`0`	`0`	`0`	`0.102`
	`29`		[NAD]C:311	`6`	`1`	`838`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`14069`	`41.2`	`-2.3`	`0.322`	`0`	`0`	`0`	`0.102`
	*Average:*													`53.1`	`-2.5`	`0.310`	`0`	`0`	`0`	`0.102`
16	`30`		[CL]A:313	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`14142`	`59.0`	`-9.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.261`
	`31`		[CL]D:313	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`14069`	`58.1`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.261`
	`32`		[CL]B:315	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`14014`	`50.3`	`-7.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.261`
	`33`		[CL]C:314	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`13875`	`50.0`	`-7.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.261`
	*Average:*													`54.4`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.261`
17	`34`		D	`5`	`1`	`14069`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`2`	`14014`	`52.4`	`0.8`	`0.782`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`35`		A	`8`	`3`	`14142`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`4`	`1`	`13875`	`48.2`	`0.6`	`0.739`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`50.3`	`0.7`	`0.761`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
18	`36`		[NAD]D:311	`4`	`1`	`846`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`14142`	`50.4`	`1.3`	`0.837`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		[NAD]C:311	`3`	`1`	`838`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`14014`	`42.4`	`1.2`	`0.838`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		[NAD]A:311	`4`	`1`	`843`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`14069`	`41.5`	`1.1`	`0.816`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		[NAD]B:311	`3`	`1`	`844`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`13875`	`40.6`	`1.1`	`0.824`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`43.7`	`1.2`	`0.829`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`40`		[EDO]B:314	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`14142`	`45.4`	`0.1`	`0.565`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`41`		[EDO]C:313	`4`	`1`	`184`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`14069`	`42.2`	`0.1`	`0.571`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`42`		[EDO]C:313	`2`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`13875`	`42.0`	`1.2`	`0.585`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`43`		[EDO]B:314	`2`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`14014`	`39.5`	`1.0`	`0.568`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`44`		D	`3`	`2`	`14069`	`x`	D	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`6`	`4`	`14069`	`34.3`	`0.6`	`0.540`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`45`		[CL]D:313	`1`	`1`	`125`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`13875`	`32.4`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.086`
	`46`		[CL]A:313	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`14014`	`31.9`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.086`
	`47`		[CL]B:315	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`14142`	`29.1`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.086`
	`48`		[CL]C:314	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`14069`	`28.8`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.086`
	*Average:*													`30.5`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.086`
25	`49`		[EDO]B:314	`2`	`1`	`184`	`f`	[CL]B:315	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`22.0`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
26	`50`		[EDO]C:313	`2`	`1`	`184`	`f`	[CL]C:314	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`21.8`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
27	`51`		[EDO]B:313	`1`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`14142`	`20.0`	`0.0`	`0.613`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`52`		[EDO]B:313	`1`	`1`	`184`	`◊`	[AKG]B:312	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`285`	`18.4`	`0.8`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`53`		[CL]B:315	`1`	`1`	`125`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`13875`	`6.8`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
	`54`		[CL]C:314	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`14014`	`6.6`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
	`55`		[CL]D:313	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`14142`	`5.5`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
	`56`		[CL]A:313	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`14069`	`4.0`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
	*Average:*													`5.7`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
30	`57`		D	`2`	`2`	`14069`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`14014`	`5.1`	`-0.0`	`0.598`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		C	`1`	`1`	`13875`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`14142`	`4.5`	`-0.0`	`0.504`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`4.8`	`-0.0`	`0.551`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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