PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=534-EL-7PG)

Interfaces in PDB 3pm5 crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 2.30 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF BOXB IN MIXED VALENT STATE WITH BOUND BENZOYL-COA

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`111`	`36`	`20258`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`116`	`38`	`20667`	`1088.4`	`3.7`	`0.785`	`25`	`21`	`0`	`0.064`
	`2`		B	`114`	`37`	`20218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`114`	`36`	`20833`	`1071.1`	`4.5`	`0.815`	`24`	`22`	`0`	`0.064`
	*Average:*													`1079.7`	`4.1`	`0.800`	`25`	`22`	`0`	`0.064`
2	`3`		C	`91`	`24`	`20667`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`85`	`22`	`20218`	`737.1`	`-6.5`	`0.180`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
3	`4`		[BYC]C:1003	`49`	`1`	`1118`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`87`	`32`	`20667`	`620.7`	`0.5`	`0.490`	`10`	`0`	`0`	`0.054`
	`5`		[BYC]A:1003	`48`	`1`	`1126`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`86`	`33`	`20833`	`617.9`	`0.8`	`0.531`	`10`	`0`	`0`	`0.054`
	`6`		[BYC]B:1003	`49`	`1`	`1127`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`89`	`34`	`20218`	`615.3`	`0.8`	`0.526`	`8`	`0`	`0`	`0.054`
	`7`		[BYC]D:1003	`51`	`1`	`1114`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`87`	`35`	`20258`	`612.3`	`-0.1`	`0.462`	`11`	`0`	`0`	`0.054`
	*Average:*													`616.6`	`0.5`	`0.502`	`10`	`0`	`0`	`0.054`
4	`8`		C	`53`	`17`	`20667`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`58`	`21`	`20258`	`520.0`	`3.0`	`0.762`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
5	`9`		C	`56`	`14`	`20667`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`67`	`20`	`20833`	`505.9`	`6.1`	`0.910`	`6`	`3`	`0`	`0.000`
6	`10`		D	`48`	`11`	`20258`	`◊`	D	-x,y,-z-1	`2_554`	`47`	`11`	`20258`	`483.2`	`7.7`	`0.969`	`8`	`8`	`0`	`0.000`
7	`11`		D	`58`	`20`	`20258`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`54`	`20`	`20833`	`476.7`	`3.6`	`0.799`	`5`	`4`	`0`	`0.000`
8	`12`		A	`35`	`9`	`20833`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`35`	`9`	`20833`	`326.3`	`-2.3`	`0.319`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
9	`13`		A	`33`	`10`	`20833`	`◊`	D	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`32`	`9`	`20258`	`291.5`	`0.3`	`0.611`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
	`14`		B	`32`	`9`	`20218`	`◊`	C	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`32`	`9`	`20667`	`287.0`	`-0.1`	`0.571`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`289.2`	`0.1`	`0.591`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
10	`15`		B	`27`	`8`	`20218`	`x`	B	-x-1/2,y-1/2,-z-1	`4_444`	`23`	`7`	`20218`	`201.6`	`0.2`	`0.578`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`16`		[PGE]D:486	`10`	`1`	`338`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`34`	`12`	`20258`	`198.9`	`3.2`	`0.208`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`17`		[BYC]A:1003	`20`	`1`	`1126`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`26`	`9`	`20218`	`197.8`	`-2.4`	`0.392`	`3`	`0`	`0`	`0.049`
	`18`		[BYC]D:1003	`20`	`1`	`1114`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`20667`	`180.5`	`-2.8`	`0.307`	`1`	`0`	`0`	`0.049`
	`19`		[BYC]C:1003	`20`	`1`	`1118`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`20258`	`179.9`	`-3.0`	`0.306`	`1`	`0`	`0`	`0.049`
	`20`		[BYC]B:1003	`20`	`1`	`1127`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`9`	`20833`	`178.7`	`-3.3`	`0.287`	`1`	`0`	`0`	`0.049`
	*Average:*													`184.2`	`-2.9`	`0.323`	`2`	`0`	`0`	`0.049`
13	`21`		A	`20`	`7`	`20833`	`◊`	C	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`18`	`5`	`20667`	`172.9`	`2.0`	`0.798`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
	`22`		B	`17`	`5`	`20218`	`◊`	D	x-1/2,y+1/2,z	`3_455`	`16`	`5`	`20258`	`153.8`	`1.7`	`0.781`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`163.4`	`1.9`	`0.789`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
14	`23`		C	`13`	`4`	`20667`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`23`	`8`	`20833`	`165.2`	`-2.4`	`0.099`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
15	`24`		[PGO]A:487	`5`	`1`	`213`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`20833`	`109.1`	`3.4`	`0.379`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`25`		[SO4]A:482	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`20833`	`108.6`	`-15.2`	`0.796`	`4`	`0`	`0`	`0.113`
17	`26`		[GOL]D:485	`6`	`1`	`221`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`20258`	`106.0`	`0.7`	`0.665`	`3`	`0`	`0`	`0.004`
18	`27`		[PGO]B:483	`5`	`1`	`210`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`20667`	`94.1`	`1.7`	`0.140`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`28`		[SO4]C:482	`5`	`1`	`187`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`20667`	`92.0`	`-11.3`	`0.818`	`5`	`0`	`0`	`0.082`
20	`29`		[PGO]D:484	`4`	`1`	`208`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`20258`	`91.8`	`3.1`	`0.380`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`30`		[SO4]A:483	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`20833`	`88.2`	`-12.1`	`0.693`	`1`	`0`	`0`	`0.083`
22	`31`		[SO4]C:483	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`20667`	`84.6`	`-11.7`	`0.685`	`1`	`0`	`0`	`0.074`
23	`32`		[SO4]C:482	`5`	`1`	`187`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`13`	`5`	`20833`	`81.0`	`-9.2`	`0.798`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
24	`33`		[GOL]C:486	`6`	`1`	`219`	`f`	D	x,y-1,z	`1_545`	`13`	`4`	`20258`	`80.8`	`-0.5`	`0.452`	`2`	`0`	`0`	`0.009`
25	`34`		[SO4]C:484	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`20667`	`78.2`	`-9.8`	`0.862`	`1`	`0`	`0`	`0.062`
26	`35`		[SO4]A:484	`5`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`20218`	`76.1`	`-9.5`	`0.883`	`1`	`0`	`0`	`0.066`
27	`36`		[PGO]B:482	`4`	`1`	`210`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`20218`	`72.3`	`1.0`	`0.548`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`37`		[SO4]D:482	`5`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`20258`	`72.1`	`-9.6`	`0.850`	`1`	`0`	`0`	`0.061`
29	`38`		[PGE]D:486	`7`	`1`	`338`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`20667`	`65.0`	`2.2`	`0.229`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`39`		[GOL]C:486	`6`	`1`	`219`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`20667`	`64.7`	`-0.7`	`0.438`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`40`		[SO4]A:484	`5`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`20833`	`61.9`	`-7.8`	`0.822`	`1`	`0`	`0`	`0.055`
32	`41`		[CL]A:486	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`20218`	`59.5`	`-7.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.103`
	`42`		[CL]D:483	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`20667`	`59.1`	`-7.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.103`
	`43`		[CL]C:485	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`20258`	`59.0`	`-7.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.103`
	`44`		[CL]A:485	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`20833`	`58.7`	`-7.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.103`
	*Average:*													`59.1`	`-7.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.103`
33	`45`		[SO4]D:482	`5`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`20667`	`58.2`	`-6.6`	`0.779`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
34	`46`		[SO4]C:483	`5`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`20258`	`55.7`	`-6.1`	`0.919`	`1`	`0`	`0`	`0.040`
35	`47`		[SO4]C:484	`5`	`1`	`186`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`20258`	`53.4`	`-6.8`	`0.785`	`1`	`0`	`0`	`0.044`
36	`48`		[FE]A:1002	`1`	`1`	`137`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`20833`	`53.4`	`-9.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.125`
	`49`		[FE]D:1002	`1`	`1`	`137`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`20258`	`51.7`	`-9.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.125`
	`50`		[FE]C:1002	`1`	`1`	`137`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`20667`	`51.2`	`-9.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.125`
	`51`		[FE]B:1002	`1`	`1`	`137`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`20218`	`47.9`	`-9.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.125`
	*Average:*													`51.0`	`-9.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.125`
37	`52`		[PGO]B:483	`3`	`1`	`210`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`20218`	`53.0`	`2.1`	`0.436`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`53`		A	`9`	`3`	`20833`	`x`	A	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`8`	`4`	`20833`	`52.8`	`0.8`	`0.742`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`54`		[FE]A:1001	`1`	`1`	`137`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`9`	`20833`	`52.8`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.117`
	`55`		[FE]D:1001	`1`	`1`	`137`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`20258`	`52.4`	`-8.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.117`
	`56`		[FE]B:1001	`1`	`1`	`137`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`20218`	`51.7`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.117`
	`57`		[FE]C:1001	`1`	`1`	`137`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`20667`	`51.0`	`-8.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.117`
	*Average:*													`52.0`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.117`
40	`58`		[SO4]A:483	`4`	`1`	`186`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`20218`	`51.3`	`-5.8`	`0.912`	`1`	`0`	`0`	`0.041`
41	`59`		[PGO]B:482	`3`	`1`	`210`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`20667`	`50.6`	`2.1`	`0.444`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
42	`60`		[BYC]B:1003	`5`	`1`	`1127`	`◊`	[BYC]A:1003	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`1126`	`47.3`	`1.5`	`0.652`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`61`		[BYC]D:1003	`5`	`1`	`1114`	`◊`	[BYC]C:1003	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`1118`	`45.5`	`1.5`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`46.4`	`1.5`	`0.644`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`62`		[CL]D:483	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`20258`	`39.0`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
	`63`		[CL]A:485	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`20218`	`39.0`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
	`64`		[CL]A:486	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`20833`	`38.4`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
	`65`		[CL]C:485	`1`	`1`	`125`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`20667`	`38.0`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
	*Average:*													`38.6`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
44	`66`		[PGO]D:484	`4`	`1`	`208`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`20667`	`38.4`	`0.4`	`0.693`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`67`		[SO4]A:482	`4`	`1`	`185`	`◊`	D	-x,y,-z	`2_555`	`2`	`1`	`20258`	`32.7`	`-3.0`	`0.944`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
46	`68`		[BYC]D:1003	`6`	`1`	`1114`	`f`	[FE]D:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`32.6`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	`69`		[BYC]B:1003	`7`	`1`	`1127`	`f`	[FE]B:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`32.2`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	`70`		[BYC]C:1003	`6`	`1`	`1118`	`f`	[FE]C:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`31.6`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	`71`		[BYC]A:1003	`5`	`1`	`1126`	`f`	[FE]A:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`29.2`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	*Average:*													`31.4`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
47	`72`		[PGE]D:486	`3`	`1`	`338`	`f`	[PGO]D:484	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`208`	`30.2`	`1.5`	`0.414`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`73`		[BYC]D:1003	`6`	`1`	`1114`	`f`	[FE]D:1002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`26.7`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
	`74`		[BYC]B:1003	`6`	`1`	`1127`	`f`	[FE]B:1002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`26.2`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
	`75`		[BYC]C:1003	`6`	`1`	`1118`	`f`	[FE]C:1002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`26.1`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
	`76`		[BYC]A:1003	`6`	`1`	`1126`	`f`	[FE]A:1002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`24.0`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
	*Average:*													`25.7`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
49	`77`		[FE]C:1002	`1`	`1`	`137`	`f`	[FE]C:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`23.4`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
50	`78`		[FE]D:1002	`1`	`1`	`137`	`f`	[FE]D:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`21.6`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
51	`79`		[FE]A:1002	`1`	`1`	`137`	`f`	[FE]A:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`21.0`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
52	`80`		[FE]B:1002	`1`	`1`	`137`	`f`	[FE]B:1001	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`137`	`20.5`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
53	`81`		[PGO]B:483	`1`	`1`	`210`	`f`	[PGO]B:482	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`210`	`0.7`	`0.0`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe