PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=759-C1-BE2)

Interfaces in PDB 3qtk crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 1.85 Å

THE CRYSTAL STRUCTURE OF CHEMICALLY SYNTHESIZED VEGF-A

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`139`	`36`	`7088`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`149`	`38`	`6998`	`1393.4`	`-25.5`	`0.023`	`24`	`8`	`2`	`0.942`
	`2`		F	`135`	`35`	`7263`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`133`	`35`	`6891`	`1353.2`	`-26.3`	`0.018`	`26`	`7`	`2`	`0.942`
	`3`		C	`129`	`36`	`7053`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`143`	`37`	`7317`	`1351.3`	`-24.0`	`0.030`	`20`	`6`	`2`	`0.942`
	*Average:*													`1366.0`	`-25.3`	`0.024`	`23`	`7`	`2`	`0.942`
2	`4`		A	`46`	`14`	`6998`	`◊`	F	x,y-1,z	`1_545`	`35`	`8`	`7263`	`393.0`	`3.7`	`0.912`	`11`	`3`	`0`	`0.000`
	`5`		C	`34`	`8`	`7053`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`37`	`11`	`7317`	`344.1`	`3.7`	`0.880`	`8`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`368.5`	`3.7`	`0.896`	`10`	`5`	`0`	`0.000`
3	`6`		F	`37`	`11`	`7263`	`◊`	F	-x,y,-z-1	`2_554`	`38`	`11`	`7263`	`375.3`	`-5.0`	`0.288`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`7`		D	`38`	`9`	`7088`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`37`	`9`	`7317`	`340.4`	`-7.1`	`0.137`	`2`	`0`	`0`	`0.088`
	`8`		E	`37`	`9`	`6891`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`31`	`8`	`7053`	`329.9`	`-6.2`	`0.183`	`2`	`0`	`0`	`0.088`
	*Average:*													`335.1`	`-6.6`	`0.160`	`2`	`0`	`0`	`0.088`
5	`9`		F	`37`	`11`	`7263`	`◊`	D	-x,y,-z	`2_555`	`35`	`10`	`7088`	`332.6`	`2.9`	`0.846`	`7`	`6`	`0`	`0.000`
6	`10`		E	`33`	`11`	`6891`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`32`	`8`	`7317`	`326.9`	`-0.9`	`0.633`	`7`	`3`	`0`	`0.042`
	`11`		A	`31`	`8`	`6998`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`31`	`11`	`7317`	`306.9`	`-1.5`	`0.514`	`2`	`2`	`0`	`0.042`
	*Average:*													`316.9`	`-1.2`	`0.573`	`5`	`3`	`0`	`0.042`
7	`12`		F	`22`	`5`	`7263`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`33`	`9`	`6998`	`263.2`	`-0.9`	`0.556`	`7`	`1`	`0`	`0.000`
8	`13`		A	`27`	`8`	`6998`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`29`	`9`	`7317`	`257.5`	`1.5`	`0.804`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
9	`14`		F	`19`	`7`	`7263`	`◊`	E	-x,y,-z-1	`2_554`	`22`	`6`	`6891`	`184.5`	`0.5`	`0.749`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
10	`15`		C	`20`	`6`	`7053`	`◊`	E	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`18`	`6`	`6891`	`164.8`	`2.0`	`0.857`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`16`		F	`19`	`7`	`7263`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`7088`	`149.3`	`0.3`	`0.707`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
12	`17`		A	`10`	`5`	`6998`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`15`	`5`	`7053`	`138.3`	`-1.3`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
	`18`		F	`15`	`5`	`7263`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`7317`	`131.5`	`-0.9`	`0.447`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
	*Average:*													`134.9`	`-1.1`	`0.444`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
13	`19`		E	`9`	`3`	`6891`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`16`	`5`	`7088`	`114.7`	`-0.5`	`0.480`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`20`		[GOL]C:104	`6`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`7317`	`110.2`	`-1.0`	`0.435`	`1`	`0`	`0`	`0.052`
15	`21`		[GOL]D:105	`6`	`1`	`217`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`7088`	`107.9`	`-0.5`	`0.538`	`2`	`0`	`0`	`0.072`
16	`22`		[GOL]C:105	`6`	`1`	`218`	`◊`	B	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`24`	`7`	`7317`	`106.1`	`0.0`	`0.574`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`23`		[ACT]E:103	`4`	`1`	`184`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`6891`	`95.5`	`-1.4`	`0.549`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
18	`24`		B	`8`	`4`	`7317`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`6998`	`90.8`	`-2.5`	`0.157`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`25`		D	`12`	`4`	`7088`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`4_546`	`7`	`3`	`7053`	`86.7`	`1.7`	`0.864`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
20	`26`		[ACT]C:103	`4`	`1`	`182`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`3`	`7053`	`85.1`	`-2.0`	`0.515`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
21	`27`		[GOL]A:105	`6`	`1`	`214`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`6998`	`83.9`	`-0.6`	`0.476`	`0`	`0`	`0`	`0.075`
22	`28`		[GOL]A:105	`4`	`1`	`214`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`11`	`4`	`7317`	`75.4`	`0.2`	`0.657`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`29`		[ACT]A:103	`4`	`1`	`184`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`15`	`5`	`7317`	`75.0`	`-0.1`	`0.715`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`30`		[ACT]F:103	`4`	`1`	`183`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`7263`	`73.6`	`-0.9`	`0.560`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
25	`31`		[ACT]B:104	`3`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`7317`	`69.7`	`-1.3`	`0.420`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
26	`32`		[ACT]D:103	`3`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`7088`	`69.6`	`-0.5`	`0.610`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
27	`33`		[ACT]A:103	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`6998`	`66.7`	`0.2`	`0.711`	`1`	`0`	`0`	`0.025`
28	`34`		[ACT]C:106	`3`	`1`	`182`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`7053`	`64.1`	`-0.5`	`0.607`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
29	`35`		[ACT]E:104	`4`	`1`	`183`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`6891`	`63.5`	`-0.6`	`0.624`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
30	`36`		[GOL]C:105	`6`	`1`	`218`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`7053`	`60.3`	`0.7`	`0.751`	`2`	`0`	`0`	`0.007`
31	`37`		[GOL]C:104	`5`	`1`	`218`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`7053`	`54.2`	`0.4`	`0.633`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`38`		[GOL]D:105	`5`	`1`	`217`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`6998`	`52.0`	`-0.7`	`0.420`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
33	`39`		A	`7`	`3`	`6998`	`◊`	E	x,y-1,z+1	`1_546`	`6`	`4`	`6891`	`48.9`	`0.6`	`0.724`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`40`		F	`6`	`1`	`7263`	`x`	F	x,y-1,z	`1_545`	`6`	`2`	`7263`	`46.7`	`0.5`	`0.726`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`41`		[ACT]F:103	`3`	`1`	`183`	`◊`	D	-x,y,-z	`2_555`	`10`	`4`	`7088`	`40.9`	`0.4`	`0.759`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`42`		[ACT]B:104	`2`	`1`	`183`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`7053`	`40.0`	`-0.7`	`0.534`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
37	`43`		[ACT]E:103	`3`	`1`	`184`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`7263`	`36.1`	`0.2`	`0.719`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
38	`44`		[ACT]D:103	`3`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`6998`	`32.7`	`0.3`	`0.725`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`45`		[ACT]C:106	`3`	`1`	`182`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`7317`	`32.3`	`0.3`	`0.725`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`46`		C	`4`	`2`	`7053`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`2`	`7088`	`32.1`	`0.3`	`0.740`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`47`		[ACT]E:104	`3`	`1`	`183`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`7263`	`27.3`	`0.2`	`0.737`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`48`		C	`3`	`2`	`7053`	`x`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`3`	`2`	`7053`	`26.4`	`-0.6`	`0.380`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`49`		[ACT]F:103	`3`	`1`	`183`	`◊`	E	-x,y,-z-1	`2_554`	`3`	`1`	`6891`	`22.5`	`-0.6`	`0.484`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`50`		D	`2`	`1`	`7088`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`7053`	`20.9`	`-0.7`	`0.260`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`51`		E	`2`	`1`	`6891`	`◊`	D	-x,y,-z	`2_555`	`3`	`2`	`7088`	`19.7`	`0.3`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`52`		[GOL]C:105	`3`	`1`	`218`	`◊`	[GOL]C:104	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`218`	`16.0`	`-0.1`	`0.465`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
47	`53`		F	`4`	`3`	`7263`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`7053`	`15.7`	`-0.3`	`0.510`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
48	`54`		A	`1`	`1`	`6998`	`◊`	[ACT]E:103	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`184`	`10.1`	`0.2`	`0.629`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`55`		B	`1`	`1`	`7317`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`1`	`1`	`7053`	`8.7`	`0.2`	`0.791`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`56`		A	`1`	`1`	`6998`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`7053`	`2.7`	`0.1`	`0.631`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`57`		A	`1`	`1`	`6998`	`◊`	E	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`6891`	`0.8`	`-0.0`	`0.589`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`58`		[GOL]C:105	`1`	`1`	`218`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`7317`	`0.7`	`0.0`	`0.589`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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in Europe

Bringing Structure to Biology

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