PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=475-92-55A)

Interfaces in PDB 3rdk crystal.
Space symmetry group: P 43 21 2. Resolution: 1.49 Å

PROTEIN CRYSTAL STRUCTURE OF XYLANASE A1 OF PAENIBACILLUS SP. JDR-2

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`67`	`21`	`13807`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`66`	`21`	`13765`	`612.8`	`-3.7`	`0.311`	`15`	`0`	`0`	`0.184`
2	`2`		A	`55`	`15`	`13765`	`◊`	B	-y+1/2,x+1/2,z-1/4	`3_554`	`50`	`14`	`13807`	`521.2`	`-5.3`	`0.147`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
3	`3`		A	`40`	`13`	`13765`	`◊`	A	y,x,-z	`7_555`	`40`	`13`	`13765`	`368.0`	`-2.7`	`0.321`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
4	`4`		B	`37`	`10`	`13807`	`◊`	B	y,x,-z	`7_555`	`37`	`10`	`13807`	`362.9`	`0.1`	`0.610`	`4`	`4`	`0`	`0.015`
5	`5`		A	`35`	`11`	`13765`	`◊`	A	y,x,-z+1	`7_556`	`34`	`11`	`13765`	`252.7`	`-3.0`	`0.243`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
6	`6`		A	`22`	`8`	`13765`	`◊`	B	-y+1/2,x+1/2,z+3/4	`3_555`	`18`	`8`	`13807`	`166.5`	`-0.5`	`0.457`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`7`		[XYS]B:345	`9`	`1`	`257`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`12`	`13807`	`149.3`	`2.5`	`0.267`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		[XYS]A:345	`9`	`1`	`256`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`12`	`13765`	`148.3`	`2.4`	`0.265`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`148.8`	`2.4`	`0.266`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
8	`9`		[GOL]A:346	`6`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`13765`	`126.6`	`-0.6`	`0.476`	`3`	`0`	`0`	`0.067`
	`10`		[GOL]B:346	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`11`	`13807`	`124.7`	`-0.5`	`0.489`	`3`	`0`	`0`	`0.067`
	*Average:*													`125.6`	`-0.6`	`0.483`	`3`	`0`	`0`	`0.067`
9	`11`		[XYP]B:344	`9`	`1`	`260`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`13807`	`120.1`	`-2.0`	`0.591`	`5`	`0`	`0`	`0.151`
	`12`		[XYP]A:344	`9`	`1`	`259`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`13765`	`116.9`	`-2.0`	`0.607`	`5`	`0`	`0`	`0.151`
	*Average:*													`118.5`	`-2.0`	`0.599`	`5`	`0`	`0`	`0.151`
10	`13`		[GOL]B:347	`6`	`1`	`220`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`13807`	`116.8`	`-1.2`	`0.322`	`2`	`0`	`0`	`0.037`
11	`14`		[GOL]A:347	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`13765`	`114.2`	`-0.8`	`0.404`	`2`	`0`	`0`	`0.036`
12	`15`		[GOL]A:353	`6`	`1`	`223`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`13765`	`88.7`	`-0.1`	`0.531`	`4`	`0`	`0`	`0.038`
13	`16`		[GOL]B:349	`5`	`1`	`221`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`13807`	`81.0`	`-0.6`	`0.458`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
14	`17`		[GOL]A:352	`6`	`1`	`221`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`13765`	`75.0`	`0.1`	`0.544`	`1`	`0`	`0`	`0.007`
15	`18`		[GOL]A:349	`5`	`1`	`222`	`◊`	A	y,x,-z+1	`7_556`	`13`	`5`	`13765`	`72.5`	`-0.4`	`0.415`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
16	`19`		[GOL]B:348	`6`	`1`	`217`	`f`	B	y,x,-z	`7_555`	`10`	`5`	`13807`	`71.3`	`0.5`	`0.688`	`2`	`0`	`0`	`0.007`
17	`20`		[GOL]A:349	`5`	`1`	`222`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`13765`	`71.2`	`-0.5`	`0.432`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
18	`21`		[GCV]B:342	`4`	`1`	`334`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`13765`	`64.3`	`-0.0`	`0.281`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
	`22`		[GCV]A:342	`4`	`1`	`333`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`13807`	`63.6`	`0.1`	`0.263`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
	*Average:*													`64.0`	`0.0`	`0.272`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
19	`23`		B	`10`	`3`	`13807`	`◊`	A	-y+1/2,x+1/2,z-1/4	`3_554`	`11`	`3`	`13765`	`64.3`	`-0.1`	`0.505`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`24`		[XYP]A:343	`5`	`1`	`263`	`cf`	[GCV]A:342	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`333`	`58.5`	`-0.4`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
	`25`		[XYP]B:343	`5`	`1`	`258`	`cf`	[GCV]B:342	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`334`	`57.6`	`-0.2`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
	*Average:*													`58.0`	`-0.3`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
21	`26`		[XYP]B:343	`5`	`1`	`258`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`13807`	`55.1`	`0.1`	`0.747`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		[XYP]A:343	`5`	`1`	`263`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`13765`	`55.1`	`0.1`	`0.758`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`55.1`	`0.1`	`0.752`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`28`		[XYP]B:343	`7`	`1`	`258`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`13765`	`50.8`	`-1.1`	`0.623`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
	`29`		[XYP]A:343	`6`	`1`	`263`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`13807`	`46.8`	`-1.0`	`0.614`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
	*Average:*													`48.8`	`-1.0`	`0.618`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
23	`30`		[CL]A:348	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`13765`	`49.7`	`-6.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.142`
24	`31`		[XYP]B:344	`4`	`1`	`260`	`cf`	[XYP]B:343	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`258`	`45.9`	`-0.5`	`0.755`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
	`32`		[XYP]A:344	`4`	`1`	`259`	`cf`	[XYP]A:343	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`263`	`45.8`	`-0.5`	`0.778`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
	*Average:*													`45.9`	`-0.5`	`0.766`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
25	`33`		[CL]A:351	`1`	`1`	`125`	`f`	[CL]A:351	y,x,-z	`7_555`	`1`	`1`	`125`	`45.9`	`-9.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
26	`34`		[CL]A:351	`1`	`1`	`125`	`x`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`13765`	`45.6`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.237`
27	`35`		[MG]A:354	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`13765`	`43.8`	`-7.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.151`
28	`36`		[GOL]B:348	`4`	`1`	`217`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`13807`	`42.9`	`0.5`	`0.649`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`37`		[XYS]B:345	`4`	`1`	`257`	`cf`	[XYP]B:344	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`260`	`42.6`	`0.5`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		[XYS]A:345	`4`	`1`	`256`	`cf`	[XYP]A:344	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`259`	`42.0`	`0.5`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`42.3`	`0.5`	`0.426`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`39`		[CL]A:348	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	y,x,-z+1	`7_556`	`6`	`3`	`13765`	`35.3`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
31	`40`		[GOL]A:346	`4`	`1`	`220`	`f`	[XYP]A:344	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`259`	`32.6`	`-1.3`	`0.510`	`2`	`0`	`0`	`0.079`
	`41`		[GOL]B:346	`4`	`1`	`219`	`f`	[XYP]B:344	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`260`	`32.1`	`-1.3`	`0.510`	`2`	`0`	`0`	`0.079`
	*Average:*													`32.4`	`-1.3`	`0.510`	`2`	`0`	`0`	`0.079`
32	`42`		[XYP]B:344	`3`	`1`	`260`	`f`	[GCV]B:342	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`334`	`31.9`	`1.5`	`0.534`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		[XYP]A:344	`3`	`1`	`259`	`f`	[GCV]A:342	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`333`	`31.5`	`1.5`	`0.595`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`31.7`	`1.5`	`0.565`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`44`		[CL]A:350	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`13765`	`28.2`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
34	`45`		[GCV]B:342	`4`	`1`	`334`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`13807`	`26.5`	`0.3`	`0.347`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		[GCV]A:342	`5`	`1`	`333`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`13765`	`25.6`	`0.3`	`0.314`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`26.0`	`0.3`	`0.330`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`47`		[MG]A:354	`1`	`1`	`98`	`f`	[GOL]A:347	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`218`	`26.0`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.054`
36	`48`		[GOL]B:349	`1`	`1`	`221`	`f`	[GCV]A:342	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`333`	`24.7`	`0.1`	`0.233`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
37	`49`		[CL]A:350	`1`	`1`	`125`	`f`	B	y,x,-z	`7_555`	`4`	`1`	`13807`	`24.1`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
38	`50`		[CL]A:348	`1`	`1`	`125`	`f`	[GOL]A:349	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`222`	`21.9`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
39	`51`		[GOL]B:349	`2`	`1`	`221`	`f`	[XYP]A:343	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`263`	`16.3`	`-1.0`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
40	`52`		[GOL]B:347	`1`	`1`	`220`	`f`	[GOL]B:346	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`219`	`12.3`	`0.2`	`0.540`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`53`		[GOL]A:349	`2`	`1`	`222`	`◊`	[GOL]A:349	y,x,-z+1	`7_556`	`2`	`1`	`222`	`11.8`	`-0.2`	`0.472`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`54`		[GOL]A:352	`1`	`1`	`221`	`◊`	[XYP]B:343	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`258`	`10.4`	`-0.3`	`0.595`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
43	`55`		[GOL]A:347	`2`	`1`	`218`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13807`	`9.8`	`-0.1`	`0.341`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
44	`56`		[GOL]A:347	`2`	`1`	`218`	`f`	[XYP]A:343	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`263`	`7.9`	`0.1`	`0.684`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`57`		[GOL]A:347	`1`	`1`	`218`	`f`	[XYP]A:344	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`259`	`7.0`	`-0.2`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
46	`58`		[GOL]A:352	`1`	`1`	`221`	`f`	[XYP]A:343	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`263`	`5.9`	`-0.2`	`0.624`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
47	`59`		[GOL]A:347	`1`	`1`	`218`	`f`	[GOL]A:346	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`220`	`5.6`	`0.1`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`60`		[GOL]B:347	`1`	`1`	`220`	`f`	[XYP]B:344	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`260`	`4.6`	`-0.2`	`0.624`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
49	`61`		[GOL]B:347	`1`	`1`	`220`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13765`	`3.8`	`-0.0`	`0.412`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`62`		[GOL]A:352	`2`	`1`	`221`	`f`	[GCV]A:342	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`333`	`3.0`	`0.1`	`0.390`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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