PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=377-44-E9E)

Interfaces in PDB 3ril crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.40 Å

THE ACID BETA-GLUCOSIDASE ACTIVE SITE EXHIBITS PLASTICITY IN BINDING 3,4,5,6-TETRAHYDROXYAZEPANE-BASED INHIBITORS: IMPLICATIONS FOR PHARMACOLOGICAL CHAPERONE DESIGN FOR GAUCHER DISEASE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`112`	`35`	`18611`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`105`	`32`	`18809`	`986.5`	`-11.1`	`0.147`	`3`	`1`	`0`	`0.046`
	`2`		D	`101`	`31`	`18648`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`110`	`35`	`18544`	`966.7`	`-10.0`	`0.175`	`2`	`1`	`0`	`0.046`
	*Average:*													`976.6`	`-10.5`	`0.161`	`3`	`1`	`0`	`0.046`
2	`3`		B	`73`	`24`	`18809`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`72`	`22`	`18544`	`638.5`	`-13.0`	`0.022`	`3`	`0`	`0`	`0.059`
	`4`		D	`72`	`21`	`18648`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`69`	`22`	`18611`	`629.6`	`-12.4`	`0.022`	`2`	`0`	`0`	`0.059`
	*Average:*													`634.0`	`-12.7`	`0.022`	`3`	`0`	`0`	`0.059`
3	`5`		C	`57`	`18`	`18611`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`54`	`19`	`18544`	`516.7`	`1.9`	`0.863`	`8`	`0`	`0`	`0.003`
4	`6`		D	`47`	`18`	`18648`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`49`	`19`	`18809`	`434.3`	`-4.3`	`0.298`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
5	`7`		D	`36`	`12`	`18648`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`36`	`14`	`18544`	`340.5`	`-6.2`	`0.077`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		C	`36`	`13`	`18611`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`38`	`12`	`18809`	`332.1`	`-6.2`	`0.080`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`336.3`	`-6.2`	`0.079`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`9`		[3RK]B:509	`11`	`1`	`292`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`32`	`14`	`18809`	`198.2`	`-0.7`	`0.521`	`8`	`0`	`0`	`0.018`
	`10`		[3RK]D:509	`11`	`1`	`292`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`32`	`14`	`18648`	`185.4`	`-0.8`	`0.525`	`8`	`0`	`0`	`0.018`
	*Average:*													`191.8`	`-0.8`	`0.523`	`8`	`0`	`0`	`0.018`
7	`11`		[3RK]A:513	`11`	`1`	`290`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`33`	`15`	`18544`	`189.5`	`-0.2`	`0.588`	`6`	`0`	`0`	`0.012`
8	`12`		[3RK]C:513	`11`	`1`	`288`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`32`	`14`	`18611`	`186.0`	`-0.1`	`0.610`	`6`	`0`	`0`	`0.011`
9	`13`		D	`20`	`6`	`18648`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`14`	`6`	`18544`	`182.5`	`0.5`	`0.725`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		C	`17`	`7`	`18611`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`20`	`7`	`18809`	`180.8`	`0.9`	`0.767`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`181.7`	`0.7`	`0.746`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
10	`15`		D	`20`	`8`	`18648`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`18809`	`157.7`	`-0.0`	`0.645`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
11	`16`		[SO4]C:511	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`26`	`13`	`18611`	`120.6`	`-20.2`	`0.650`	`1`	`0`	`0`	`0.085`
12	`17`		[NAG]B:508	`11`	`1`	`366`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`18809`	`120.2`	`2.7`	`0.327`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		[NAG]A:512	`11`	`1`	`368`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`18544`	`117.9`	`3.0`	`0.357`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		[NAG]C:512	`10`	`1`	`369`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`18611`	`117.1`	`2.9`	`0.377`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`118.4`	`2.8`	`0.353`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`20`		[NAG]D:508	`11`	`1`	`364`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`18648`	`114.6`	`2.4`	`0.282`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`21`		[SO4]B:501	`5`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`18809`	`109.2`	`-17.2`	`0.689`	`5`	`0`	`0`	`0.080`
15	`22`		[SO4]D:501	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`18648`	`108.1`	`-17.1`	`0.676`	`4`	`0`	`0`	`0.077`
16	`23`		[SO4]A:501	`5`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`18544`	`106.0`	`-16.0`	`0.866`	`5`	`0`	`0`	`0.075`
17	`24`		[SO4]C:501	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`18611`	`103.9`	`-16.9`	`0.683`	`5`	`0`	`0`	`0.078`
18	`25`		[SO4]C:508	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`18611`	`95.3`	`-14.6`	`0.825`	`5`	`0`	`0`	`0.069`
19	`26`		[SO4]C:502	`5`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`18611`	`94.1`	`-13.2`	`0.873`	`5`	`0`	`0`	`0.063`
20	`27`		[SO4]B:502	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`18809`	`93.4`	`-12.9`	`0.882`	`5`	`0`	`0`	`0.062`
21	`28`		[SO4]A:503	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`18544`	`93.4`	`-13.1`	`0.881`	`5`	`0`	`0`	`0.063`
22	`29`		[SO4]D:502	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`18648`	`91.8`	`-12.6`	`0.884`	`6`	`0`	`0`	`0.062`
23	`30`		[SO4]D:506	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`18648`	`90.8`	`-12.2`	`0.819`	`1`	`0`	`0`	`0.052`
24	`31`		[SO4]C:503	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`18611`	`90.6`	`-12.8`	`0.833`	`4`	`0`	`0`	`0.060`
25	`32`		[SO4]B:507	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`18809`	`90.5`	`-12.3`	`0.834`	`3`	`0`	`0`	`0.056`
26	`33`		[SO4]A:502	`5`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`18544`	`88.5`	`-11.9`	`0.869`	`3`	`0`	`0`	`0.054`
27	`34`		[SO4]A:506	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`18544`	`88.5`	`-12.3`	`0.758`	`2`	`0`	`0`	`0.054`
28	`35`		[SO4]C:506	`5`	`1`	`187`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`18611`	`87.9`	`-12.4`	`0.710`	`1`	`0`	`0`	`0.052`
29	`36`		[SO4]B:504	`5`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`18809`	`86.6`	`-11.8`	`0.748`	`1`	`0`	`0`	`0.050`
30	`37`		[SO4]D:504	`5`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`18648`	`85.8`	`-11.1`	`0.809`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`38`		[SO4]A:507	`5`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`18544`	`81.7`	`-10.2`	`0.928`	`3`	`0`	`0`	`0.047`
32	`39`		[SO4]B:505	`5`	`1`	`187`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`18809`	`79.9`	`-10.3`	`0.884`	`1`	`0`	`0`	`0.044`
33	`40`		[SO4]D:505	`5`	`1`	`187`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`18648`	`78.7`	`-9.8`	`0.899`	`2`	`0`	`0`	`0.044`
34	`41`		[SO4]C:507	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`18611`	`78.6`	`-9.7`	`0.946`	`3`	`0`	`0`	`0.045`
35	`42`		[SO4]D:503	`5`	`1`	`187`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`18648`	`77.5`	`-11.7`	`0.652`	`2`	`0`	`0`	`0.052`
36	`43`		[SO4]B:503	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`18809`	`77.5`	`-11.4`	`0.658`	`2`	`0`	`0`	`0.050`
37	`44`		[SO4]B:506	`4`	`1`	`188`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`18809`	`67.2`	`-8.6`	`0.925`	`3`	`0`	`0`	`0.041`
38	`45`		[SO4]A:510	`5`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`18544`	`66.8`	`-9.7`	`0.546`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
39	`46`		D	`5`	`3`	`18648`	`f`	[SO4]A:505	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`1`	`186`	`66.7`	`-6.9`	`0.948`	`3`	`0`	`0`	`0.034`
40	`47`		[SO4]A:508	`5`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`18544`	`65.9`	`-8.3`	`0.923`	`2`	`0`	`0`	`0.038`
41	`48`		[SO4]D:507	`4`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`18648`	`65.7`	`-8.5`	`0.900`	`3`	`0`	`0`	`0.040`
42	`49`		[SO4]C:504	`4`	`1`	`187`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`18611`	`65.3`	`-8.4`	`0.821`	`2`	`0`	`0`	`0.038`
43	`50`		[SO4]C:509	`5`	`1`	`186`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`18611`	`65.0`	`-8.3`	`0.872`	`2`	`0`	`0`	`0.038`
44	`51`		C	`8`	`2`	`18611`	`x`	C	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`6`	`3`	`18611`	`64.5`	`-1.4`	`0.196`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		A	`6`	`3`	`18544`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`8`	`2`	`18544`	`63.1`	`-1.4`	`0.199`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`63.8`	`-1.4`	`0.198`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`53`		[SO4]C:505	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y-1,z	`1_545`	`4`	`2`	`18809`	`64.4`	`-6.2`	`0.970`	`3`	`0`	`0`	`0.031`
46	`54`		[SO4]A:504	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`18544`	`64.3`	`-8.0`	`0.832`	`2`	`0`	`0`	`0.037`
47	`55`		[SO4]A:511	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`18544`	`62.7`	`-8.2`	`0.771`	`1`	`0`	`0`	`0.035`
48	`56`		[SO4]C:510	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`18611`	`55.8`	`-6.2`	`0.900`	`2`	`0`	`0`	`0.029`
49	`57`		[SO4]C:505	`4`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`18611`	`55.1`	`-6.2`	`0.936`	`2`	`0`	`0`	`0.014`
50	`58`		[SO4]A:509	`5`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`18544`	`53.6`	`-6.1`	`0.911`	`2`	`0`	`0`	`0.029`
51	`59`		[SO4]A:505	`5`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`3`	`18544`	`51.2`	`-5.9`	`0.936`	`2`	`0`	`0`	`0.013`
52	`60`		[SO4]C:504	`4`	`1`	`187`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`6`	`2`	`18544`	`46.3`	`-5.2`	`0.932`	`2`	`0`	`0`	`0.012`
53	`61`		C	`6`	`2`	`18611`	`◊`	[SO4]A:504	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`1`	`186`	`44.7`	`-5.1`	`0.905`	`2`	`0`	`0`	`0.012`
54	`62`		D	`2`	`1`	`18648`	`◊`	[SO4]A:511	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`4`	`1`	`186`	`29.4`	`-2.3`	`0.971`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
55	`63`		[SO4]B:506	`3`	`1`	`188`	`◊`	[SO4]A:510	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`187`	`20.5`	`-4.6`	`0.995`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
56	`64`		[SO4]B:501	`1`	`1`	`187`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`18544`	`12.8`	`-1.5`	`0.778`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
57	`65`		[SO4]D:501	`1`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`18611`	`11.9`	`-1.6`	`0.608`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
58	`66`		[SO4]A:501	`1`	`1`	`187`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`18809`	`11.1`	`-1.3`	`0.761`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
59	`67`		[SO4]C:501	`1`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`18648`	`10.1`	`-1.2`	`0.647`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
60	`68`		[SO4]A:508	`1`	`1`	`187`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`18809`	`9.1`	`-1.2`	`0.656`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
61	`69`		[SO4]B:506	`4`	`1`	`188`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`18544`	`8.0`	`-0.8`	`0.486`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
62	`70`		[SO4]B:506	`1`	`1`	`188`	`f`	[SO4]B:504	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`187`	`7.9`	`-1.9`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
63	`71`		[SO4]D:507	`1`	`1`	`185`	`f`	[SO4]D:504	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`186`	`7.0`	`-1.7`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`72`		[SO4]C:509	`1`	`1`	`186`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`18648`	`6.9`	`-0.9`	`0.591`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
65	`73`		[SO4]B:501	`1`	`1`	`187`	`◊`	[SO4]A:510	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`187`	`3.7`	`-0.9`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
66	`74`		[SO4]C:509	`1`	`1`	`186`	`f`	[SO4]C:506	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`187`	`3.7`	`-0.9`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
67	`75`		C	`1`	`1`	`18611`	`◊`	[NAG]C:512	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`369`	`3.3`	`0.1`	`0.525`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`76`		[NAG]A:512	`1`	`1`	`368`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`1`	`1`	`18544`	`2.8`	`0.1`	`0.522`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`3.1`	`0.1`	`0.524`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`77`		[SO4]A:508	`3`	`1`	`187`	`f`	[SO4]A:506	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`186`	`3.3`	`-0.6`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
69	`78`		D	`1`	`1`	`18648`	`◊`	[SO4]B:505	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`187`	`3.1`	`-0.3`	`0.890`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`79`		[SO4]D:507	`1`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`18611`	`0.6`	`-0.0`	`0.870`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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