PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=814-5E-1HO)

Interfaces in PDB 3sl8 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.60 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF PDE4D2 WITH COMPOUND 10O

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`90`	`23`	`14939`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`94`	`24`	`15267`	`832.2`	`-1.2`	`0.640`	`13`	`17`	`0`	`0.000`
	`2`		D	`97`	`23`	`14584`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`94`	`24`	`14823`	`787.4`	`-1.0`	`0.667`	`11`	`15`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`809.8`	`-1.1`	`0.654`	`12`	`16`	`0`	`0.000`
2	`3`		B	`78`	`23`	`14823`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`77`	`22`	`15267`	`762.0`	`-1.9`	`0.580`	`15`	`9`	`0`	`0.000`
	`4`		D	`63`	`21`	`14584`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`63`	`20`	`14939`	`624.1`	`1.2`	`0.747`	`11`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`693.0`	`-0.3`	`0.664`	`13`	`8`	`0`	`0.000`
3	`5`		D	`51`	`17`	`14584`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`47`	`13`	`15267`	`459.1`	`-4.3`	`0.267`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
4	`6`		[JN7]D:1	`30`	`1`	`676`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`61`	`20`	`14584`	`451.5`	`-6.4`	`0.127`	`1`	`0`	`0`	`0.012`
	`7`		[JN7]C:1	`30`	`1`	`668`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`55`	`18`	`14939`	`431.2`	`-7.0`	`0.142`	`1`	`0`	`0`	`0.012`
	*Average:*													`441.3`	`-6.7`	`0.135`	`1`	`0`	`0`	`0.012`
5	`8`		[JN7]A:18	`30`	`1`	`674`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`56`	`21`	`15267`	`419.0`	`-5.3`	`0.218`	`2`	`0`	`0`	`0.009`
	`9`		[JN7]B:1	`29`	`1`	`676`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`58`	`20`	`14823`	`417.3`	`-6.2`	`0.171`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
	*Average:*													`418.1`	`-5.8`	`0.195`	`2`	`0`	`0`	`0.009`
6	`10`		C	`31`	`10`	`14939`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`42`	`15`	`14823`	`353.5`	`-0.6`	`0.598`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
7	`11`		C	`43`	`14`	`14939`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`29`	`9`	`15267`	`303.3`	`-1.6`	`0.478`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
8	`12`		D	`24`	`8`	`14584`	`◊`	C	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`29`	`8`	`14939`	`240.9`	`-0.8`	`0.556`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
9	`13`		B	`28`	`8`	`14823`	`◊`	A	-x+3/2,-y,z-1/2	`2_654`	`25`	`7`	`15267`	`238.4`	`-0.7`	`0.474`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
10	`14`		D	`19`	`5`	`14584`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`5`	`15267`	`179.3`	`2.5`	`0.893`	`6`	`10`	`0`	`0.000`
11	`15`		C	`19`	`7`	`14939`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`14823`	`154.4`	`1.8`	`0.842`	`0`	`2`	`0`	`0.000`
12	`16`		[PEG]D:5	`7`	`1`	`260`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`14584`	`129.5`	`3.0`	`0.328`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
13	`17`		[PEG]A:12	`7`	`1`	`253`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`23`	`7`	`15267`	`127.2`	`1.9`	`0.246`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`18`		[DMS]C:7	`4`	`1`	`215`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`14939`	`124.6`	`2.9`	`0.540`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`19`		[DMS]D:14	`4`	`1`	`214`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`14584`	`122.8`	`2.9`	`0.558`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`20`		[EDO]A:7	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`15267`	`119.1`	`4.2`	`0.713`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
17	`21`		[EDO]A:5	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`15267`	`113.6`	`2.9`	`0.410`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
18	`22`		[EDO]B:8	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`14823`	`113.4`	`3.8`	`0.666`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
19	`23`		[EDO]D:8	`4`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`14584`	`113.3`	`3.6`	`0.488`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
20	`24`		[EDO]A:11	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`15267`	`109.6`	`3.2`	`0.366`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`25`		[EDO]D:12	`4`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`14584`	`107.7`	`2.8`	`0.443`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
22	`26`		[EDO]D:4	`4`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`14584`	`107.5`	`3.2`	`0.431`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
23	`27`		[EDO]A:14	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`15267`	`102.2`	`2.7`	`0.420`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`28`		[PO4]C:6	`5`	`1`	`188`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`14939`	`100.8`	`-7.6`	`0.615`	`4`	`0`	`0`	`0.010`
25	`29`		[PO4]B:4	`5`	`1`	`189`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`11`	`14823`	`99.6`	`-7.0`	`0.478`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
26	`30`		[EDO]C:440	`4`	`1`	`183`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`14939`	`97.7`	`3.1`	`0.497`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
27	`31`		[EDO]D:2	`4`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`14584`	`97.4`	`1.7`	`0.315`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`32`		[EDO]D:15	`4`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`14584`	`96.7`	`2.0`	`0.222`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
29	`33`		[EDO]D:3	`4`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`14584`	`95.8`	`2.5`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`34`		[EDO]D:13	`4`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`14584`	`94.2`	`2.9`	`0.486`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
31	`35`		[EDO]A:15	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`15267`	`93.1`	`2.1`	`0.261`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
32	`36`		[EDO]A:16	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`15267`	`93.0`	`2.0`	`0.368`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`37`		[EDO]C:2	`4`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`14939`	`92.7`	`2.3`	`0.261`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
34	`38`		[EDO]A:1	`4`	`1`	`187`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`15267`	`91.2`	`2.3`	`0.428`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
35	`39`		[EDO]D:9	`4`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`14584`	`89.8`	`2.3`	`0.277`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
36	`40`		[EDO]C:3	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`14939`	`88.1`	`3.0`	`0.521`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`41`		[EDO]A:6	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`15267`	`87.4`	`2.5`	`0.486`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`42`		[EDO]A:8	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`15267`	`84.0`	`2.5`	`0.300`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
39	`43`		[EDO]D:10	`4`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`14584`	`82.7`	`2.4`	`0.274`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`44`		[EDO]D:441	`4`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`14584`	`78.8`	`1.5`	`0.217`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`45`		[EDO]A:440	`4`	`1`	`186`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`10`	`14939`	`78.0`	`2.0`	`0.247`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
42	`46`		[EDO]A:9	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`15267`	`75.4`	`2.1`	`0.334`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`47`		[PEG]D:5	`5`	`1`	`260`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`14939`	`72.6`	`2.5`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`48`		[EDO]A:17	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`15267`	`70.7`	`1.1`	`0.626`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
45	`49`		[EDO]A:13	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`15267`	`70.6`	`1.7`	`0.433`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
46	`50`		[EDO]B:6	`4`	`1`	`187`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`14823`	`70.3`	`1.6`	`0.238`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`51`		[EDO]D:11	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`10`	`5`	`15267`	`69.1`	`2.0`	`0.257`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`52`		[EDO]D:7	`4`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`14584`	`68.7`	`1.8`	`0.451`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
49	`53`		D	`10`	`3`	`14584`	`f`	[EDO]A:6	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`4`	`1`	`184`	`66.6`	`1.3`	`0.194`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`54`		[EDO]A:13	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`14939`	`62.9`	`1.8`	`0.442`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`55`		[ZN]C:4	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`14939`	`60.8`	`-32.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
	`56`		[ZN]A:4	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`15267`	`60.5`	`-32.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
	`57`		[ZN]D:6	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`14584`	`60.4`	`-33.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
	`58`		[ZN]B:2	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`14823`	`47.2`	`-24.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
	*Average:*													`57.2`	`-30.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
52	`59`		[EDO]A:440	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`15267`	`60.5`	`2.0`	`0.899`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
53	`60`		B	`7`	`2`	`14823`	`x`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`10`	`4`	`14823`	`56.5`	`0.0`	`0.628`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`61`		[EDO]D:7	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`14823`	`56.2`	`1.3`	`0.253`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
55	`62`		D	`10`	`4`	`14584`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`3`	`2`	`14823`	`55.2`	`-0.6`	`0.404`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
56	`63`		[EDO]C:3	`4`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`14584`	`54.3`	`1.0`	`0.750`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
57	`64`		D	`4`	`1`	`14584`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`9`	`3`	`14823`	`53.6`	`-0.7`	`0.354`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`65`		[EDO]C:440	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`5`	`2`	`14823`	`50.4`	`0.8`	`0.432`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`66`		[ZN]C:5	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`14939`	`46.9`	`-33.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
	`67`		[ZN]A:3	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`15267`	`46.6`	`-33.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
	`68`		[ZN]D:440	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`14584`	`46.0`	`-34.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
	`69`		[ZN]B:3	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`14823`	`36.7`	`-27.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
	*Average:*													`44.1`	`-32.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
60	`70`		D	`3`	`1`	`14584`	`f`	[EDO]A:9	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`4`	`1`	`185`	`45.9`	`1.4`	`0.949`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
61	`71`		[EDO]D:11	`3`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`14584`	`44.9`	`1.3`	`0.924`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
62	`72`		[EDO]B:6	`4`	`1`	`187`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`14584`	`43.8`	`0.4`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`73`		[EDO]A:8	`3`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`14823`	`42.6`	`1.4`	`0.818`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`74`		[EDO]D:9	`3`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`14823`	`40.1`	`1.5`	`0.939`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
65	`75`		[EDO]A:9	`4`	`1`	`185`	`f`	[EDO]A:1	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`187`	`31.4`	`1.3`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`76`		[EDO]D:11	`2`	`1`	`184`	`◊`	[EDO]A:15	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`2`	`1`	`186`	`31.1`	`2.0`	`0.707`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`77`		[PO4]B:4	`3`	`1`	`189`	`f`	[JN7]B:1	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`676`	`29.7`	`-2.5`	`0.527`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
68	`78`		[EDO]D:441	`2`	`1`	`184`	`f`	[EDO]D:4	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`184`	`29.5`	`1.1`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`79`		[EDO]D:7	`2`	`1`	`185`	`◊`	[EDO]B:6	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`187`	`28.2`	`1.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`80`		[DMS]C:7	`1`	`1`	`215`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`15267`	`26.1`	`1.4`	`0.649`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`81`		[EDO]A:16	`2`	`1`	`183`	`f`	[EDO]A:1	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`187`	`24.8`	`0.8`	`1.000`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
72	`82`		C	`3`	`1`	`14939`	`◊`	[EDO]A:17	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`2`	`1`	`184`	`24.5`	`0.0`	`0.477`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`83`		[PO4]B:4	`4`	`1`	`189`	`f`	[ZN]B:2	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`23.1`	`-11.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
74	`84`		[EDO]C:2	`2`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`15267`	`22.3`	`0.7`	`0.905`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
75	`85`		[PO4]B:4	`3`	`1`	`189`	`f`	[ZN]B:3	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`22.2`	`-9.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
76	`86`		D	`4`	`2`	`14584`	`f`	[PEG]A:12	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`3`	`1`	`253`	`19.6`	`0.8`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
77	`87`		[EDO]B:6	`2`	`1`	`187`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`15267`	`17.9`	`0.1`	`0.651`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
78	`88`		D	`3`	`1`	`14584`	`◊`	[EDO]B:6	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`3`	`1`	`187`	`15.6`	`0.4`	`0.881`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`89`		[EDO]A:440	`2`	`1`	`186`	`f`	[EDO]A:13	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`184`	`15.4`	`0.6`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`90`		[ZN]A:4	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]A:3	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`15.1`	`-12.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
81	`91`		[ZN]D:6	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]D:440	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`15.0`	`-12.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
82	`92`		[ZN]C:5	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]C:4	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`15.0`	`-12.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
83	`93`		[ZN]B:3	`1`	`1`	`98`	`f`	[ZN]B:2	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.8`	`-8.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
84	`94`		[EDO]A:9	`2`	`1`	`185`	`f`	[EDO]A:16	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`183`	`10.2`	`0.3`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
85	`95`		[PEG]D:5	`1`	`1`	`260`	`f`	[EDO]D:10	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`185`	`9.8`	`-0.0`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
86	`96`		D	`2`	`1`	`14584`	`◊`	[EDO]A:15	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`2`	`1`	`186`	`8.4`	`0.1`	`0.789`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
87	`97`		D	`1`	`1`	`14584`	`x`	D	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`1`	`1`	`14584`	`4.1`	`-0.0`	`0.534`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
88	`98`		[DMS]D:14	`1`	`1`	`214`	`f`	[EDO]D:9	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`185`	`3.7`	`0.2`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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