PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=264-HP-62N)

Interfaces in PDB 3v9u crystal.
Space symmetry group: P 32. Resolution: 2.30 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF RNASE T IN COMPLEX WITH A PREFERRED SSDNA (AAT) WITH TWO MG IN THE ACTIVE SITE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`139`	`38`	`10460`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`141`	`42`	`10405`	`1425.8`	`-19.7`	`0.072`	`7`	`0`	`0`	`0.348`
	`2`		B	`138`	`39`	`10071`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`134`	`38`	`10039`	`1346.0`	`-20.1`	`0.045`	`6`	`0`	`0`	`0.348`
	*Average:*													`1385.9`	`-19.9`	`0.058`	`7`	`0`	`0`	`0.348`
2	`3`		A	`77`	`24`	`10039`	`◊`	D	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`68`	`21`	`10460`	`646.4`	`-0.2`	`0.810`	`13`	`8`	`0`	`0.000`
	`4`		C	`66`	`24`	`10405`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`68`	`24`	`10071`	`572.4`	`-0.4`	`0.781`	`9`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`609.4`	`-0.3`	`0.795`	`11`	`7`	`0`	`0.000`
3	`5`		C	`52`	`15`	`10405`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`52`	`16`	`10460`	`493.4`	`0.2`	`0.797`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
	`6`		C	`47`	`16`	`10405`	`◊`	D	x-1,y-1,z	`1_445`	`41`	`11`	`10460`	`409.1`	`-0.1`	`0.745`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`451.3`	`0.1`	`0.771`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
4	`7`		F	`46`	`3`	`944`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`66`	`20`	`10071`	`483.3`	`-5.7`	`0.263`	`4`	`0`	`0`	`0.183`
5	`8`		G	`45`	`3`	`950`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`62`	`20`	`10405`	`453.1`	`-6.8`	`0.181`	`4`	`0`	`0`	`0.266`
	`9`		H	`45`	`3`	`945`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`62`	`19`	`10460`	`449.2`	`-7.2`	`0.159`	`4`	`0`	`0`	`0.266`
	*Average:*													`451.2`	`-7.0`	`0.170`	`4`	`0`	`0`	`0.266`
6	`10`		E	`38`	`2`	`714`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`64`	`21`	`10039`	`442.2`	`-6.2`	`0.347`	`6`	`0`	`0`	`0.216`
7	`11`		C	`37`	`11`	`10405`	`x`	C	x,y-1,z	`1_545`	`36`	`11`	`10405`	`308.8`	`-2.2`	`0.509`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		B	`31`	`11`	`10071`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`40`	`13`	`10071`	`291.0`	`-2.9`	`0.411`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		A	`30`	`10`	`10039`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`39`	`10`	`10039`	`286.3`	`-2.7`	`0.404`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		D	`40`	`9`	`10460`	`x`	D	x,y-1,z	`1_545`	`32`	`9`	`10460`	`281.1`	`-2.6`	`0.458`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`291.8`	`-2.6`	`0.445`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`15`		B	`31`	`10`	`10071`	`x`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`26`	`10`	`10071`	`232.8`	`-2.6`	`0.342`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		A	`27`	`11`	`10039`	`x`	A	x,y-1,z	`1_545`	`30`	`9`	`10039`	`219.8`	`-1.9`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`226.3`	`-2.3`	`0.392`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`17`		F	`19`	`2`	`944`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`10039`	`153.3`	`-1.3`	`0.391`	`2`	`0`	`0`	`0.024`
10	`18`		H	`22`	`2`	`945`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`10405`	`143.9`	`0.2`	`0.570`	`1`	`0`	`0`	`0.027`
	`19`		G	`20`	`2`	`950`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`10460`	`137.4`	`-2.1`	`0.397`	`1`	`0`	`0`	`0.027`
	*Average:*													`140.7`	`-0.9`	`0.483`	`1`	`0`	`0`	`0.027`
11	`20`		H	`19`	`3`	`945`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`17`	`4`	`10460`	`121.6`	`0.4`	`0.473`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`21`		C	`11`	`4`	`10405`	`◊`	G	x-1,y-1,z	`1_445`	`15`	`2`	`950`	`114.5`	`-0.5`	`0.248`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`22`		C	`7`	`4`	`10405`	`x`	C	x-1,y,z	`1_455`	`11`	`6`	`10405`	`87.4`	`2.6`	`0.894`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		D	`2`	`2`	`10460`	`x`	D	x-1,y-1,z	`1_445`	`4`	`1`	`10460`	`17.2`	`0.4`	`0.808`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`52.3`	`1.5`	`0.851`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`24`		[CO]B:302	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`10071`	`81.1`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.324`
	`25`		[CO]A:302	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`10039`	`80.0`	`-11.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.324`
	`26`		[CO]D:302	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`10460`	`78.5`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.324`
	*Average:*													`79.9`	`-12.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.324`
15	`27`		A	`8`	`2`	`10039`	`x`	A	x-1,y-1,z	`1_445`	`11`	`5`	`10039`	`76.5`	`1.5`	`0.846`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
	`28`		B	`4`	`3`	`10071`	`x`	B	x,y-1,z	`1_545`	`4`	`1`	`10071`	`31.6`	`0.4`	`0.726`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`54.1`	`0.9`	`0.786`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
16	`29`		E	`14`	`1`	`714`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`10071`	`76.5`	`-0.1`	`0.288`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`30`		D	`7`	`4`	`10460`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`10`	`5`	`10405`	`72.6`	`0.7`	`0.617`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		C	`4`	`3`	`10405`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`3`	`10460`	`44.7`	`0.3`	`0.658`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		A	`3`	`2`	`10039`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`2`	`10071`	`7.5`	`-0.0`	`0.618`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		B	`1`	`1`	`10071`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`10039`	`2.1`	`0.0`	`0.730`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`31.7`	`0.2`	`0.656`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`34`		B	`9`	`3`	`10071`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`7`	`2`	`10405`	`70.6`	`0.2`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		A	`11`	`3`	`10039`	`◊`	D	-y+1,x-y+2,z-1/3	`2_674`	`8`	`2`	`10460`	`59.2`	`-0.1`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`64.9`	`0.0`	`0.582`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`36`		[CO]D:301	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`10460`	`47.1`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.252`
	`37`		[CO]C:301	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`10405`	`47.1`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.252`
	*Average:*													`47.1`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.252`
20	`38`		[MG]E:101	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`10039`	`43.3`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.141`
	`39`		[MG]G:101	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`9`	`10405`	`43.1`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.141`
	`40`		[MG]H:101	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`10460`	`42.2`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.141`
	`41`		[MG]F:101	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`10071`	`41.6`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.141`
	*Average:*													`42.5`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.141`
21	`42`		[MG]A:301	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`10039`	`39.0`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.172`
	`43`		[MG]B:301	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`10071`	`38.0`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.172`
	*Average:*													`38.5`	`-6.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.172`
22	`44`		[CO]D:301	`1`	`1`	`125`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`945`	`33.2`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.134`
	`45`		[CO]C:301	`1`	`1`	`125`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`950`	`32.1`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.134`
	*Average:*													`32.7`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.134`
23	`46`		[MG]F:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`944`	`31.5`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.125`
	`47`		[MG]G:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`950`	`30.9`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.125`
	*Average:*													`31.2`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.125`
24	`48`		[MG]E:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`714`	`31.4`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.097`
25	`49`		[MG]H:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`945`	`31.0`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
	`50`		[MG]B:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`944`	`24.1`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
	*Average:*													`27.5`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
26	`51`		D	`4`	`2`	`10460`	`x`	D	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`3`	`10460`	`30.9`	`-0.7`	`0.377`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		C	`2`	`2`	`10405`	`x`	C	x-1,y-1,z	`1_445`	`6`	`4`	`10405`	`27.1`	`1.1`	`0.821`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`29.0`	`0.2`	`0.599`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
27	`53`		[MG]A:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`714`	`24.9`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
28	`54`		[CO]C:301	`1`	`1`	`125`	`f`	[MG]G:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`13.2`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.082`
29	`55`		[CO]D:301	`1`	`1`	`125`	`f`	[MG]H:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.6`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.056`
30	`56`		[MG]F:101	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]B:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.2`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.060`
31	`57`		[MG]E:101	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.1`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.059`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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in Europe

Bringing Structure to Biology

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