PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=625-C5-P76)

Interfaces in PDB 3v9x crystal.
Space symmetry group: P 32. Resolution: 1.90 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF RNASE T IN COMPLEX WITH A PREFERRED SSDNA (AAA) WITH TWO MG IN THE ACTIVE SITE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`156`	`41`	`10565`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`151`	`42`	`10634`	`1490.9`	`-20.9`	`0.096`	`10`	`6`	`0`	`0.506`
	`2`		D	`133`	`35`	`10044`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`126`	`36`	`9979`	`1346.1`	`-21.4`	`0.027`	`11`	`0`	`0`	`0.506`
	*Average:*													`1418.5`	`-21.2`	`0.062`	`11`	`3`	`0`	`0.506`
2	`3`		D	`65`	`22`	`10044`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`67`	`24`	`10565`	`625.3`	`-0.5`	`0.770`	`12`	`5`	`0`	`0.000`
	`4`		C	`69`	`23`	`9979`	`◊`	A	-y,x-y+1,z-1/3	`2_564`	`63`	`21`	`10634`	`623.3`	`1.4`	`0.841`	`12`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`624.3`	`0.5`	`0.805`	`12`	`6`	`0`	`0.000`
3	`5`		H	`50`	`3`	`1086`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`67`	`21`	`10044`	`520.8`	`-3.2`	`0.159`	`3`	`0`	`0`	`0.200`
	`6`		G	`48`	`3`	`1062`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`65`	`21`	`9979`	`514.9`	`-3.9`	`0.136`	`3`	`0`	`0`	`0.200`
	*Average:*													`517.8`	`-3.5`	`0.148`	`3`	`0`	`0`	`0.200`
4	`7`		A	`58`	`14`	`10634`	`◊`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`52`	`16`	`10565`	`513.9`	`-0.4`	`0.746`	`7`	`6`	`0`	`0.000`
	`8`		A	`54`	`16`	`10634`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`52`	`13`	`10565`	`503.6`	`-3.8`	`0.499`	`4`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`508.7`	`-2.1`	`0.622`	`6`	`5`	`0`	`0.000`
5	`9`		E	`45`	`3`	`1293`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`65`	`20`	`10634`	`485.1`	`-4.0`	`0.257`	`4`	`0`	`0`	`0.218`
6	`10`		F	`45`	`3`	`1002`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`66`	`20`	`10565`	`477.1`	`-3.7`	`0.205`	`3`	`0`	`0`	`0.194`
7	`11`		C	`46`	`12`	`9979`	`x`	C	x-1,y,z	`1_455`	`41`	`14`	`9979`	`354.2`	`-3.5`	`0.405`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		D	`45`	`13`	`10044`	`x`	D	x-1,y,z	`1_455`	`38`	`12`	`10044`	`347.4`	`-3.5`	`0.403`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		A	`42`	`13`	`10634`	`x`	A	x,y-1,z	`1_545`	`44`	`13`	`10634`	`347.0`	`-2.7`	`0.498`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		B	`40`	`12`	`10565`	`x`	B	x,y-1,z	`1_545`	`43`	`10`	`10565`	`340.5`	`-3.3`	`0.459`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`347.3`	`-3.3`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`15`		E	`33`	`3`	`1293`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`26`	`8`	`10565`	`271.1`	`-0.9`	`0.561`	`5`	`0`	`0`	`0.046`
9	`16`		A	`19`	`8`	`10634`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`26`	`3`	`1293`	`187.0`	`-2.2`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`17`		G	`18`	`2`	`1062`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`10044`	`152.2`	`-1.4`	`0.320`	`2`	`0`	`0`	`0.035`
	`18`		H	`21`	`2`	`1086`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`9979`	`147.0`	`-0.1`	`0.405`	`1`	`0`	`0`	`0.035`
	*Average:*													`149.6`	`-0.7`	`0.362`	`2`	`0`	`0`	`0.035`
11	`19`		F	`17`	`2`	`1002`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`10634`	`151.6`	`-1.5`	`0.342`	`3`	`0`	`0`	`0.042`
12	`20`		C	`17`	`5`	`9979`	`x`	C	x,y-1,z	`1_545`	`18`	`8`	`9979`	`144.2`	`-1.7`	`0.379`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		D	`16`	`8`	`10044`	`x`	D	x-1,y-1,z	`1_445`	`18`	`6`	`10044`	`133.8`	`-2.0`	`0.362`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`139.0`	`-1.8`	`0.371`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`22`		F	`20`	`3`	`1002`	`◊`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`15`	`4`	`10565`	`143.1`	`1.4`	`0.460`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`23`		D	`7`	`2`	`10044`	`x`	D	x,y-1,z	`1_545`	`9`	`5`	`10044`	`84.4`	`1.1`	`0.849`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	`24`		C	`14`	`5`	`9979`	`x`	C	x-1,y-1,z	`1_445`	`6`	`2`	`9979`	`78.2`	`2.0`	`0.901`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`81.3`	`1.6`	`0.875`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
15	`25`		B	`9`	`5`	`10565`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`10`	`5`	`10634`	`72.2`	`0.2`	`0.614`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		A	`9`	`5`	`10634`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`9`	`5`	`10565`	`64.2`	`-0.2`	`0.505`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		D	`3`	`1`	`10044`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`3`	`9979`	`55.2`	`-0.9`	`0.170`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		C	`3`	`2`	`9979`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`10044`	`15.8`	`0.1`	`0.675`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`51.8`	`-0.2`	`0.491`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`29`		C	`9`	`3`	`9979`	`◊`	A	-y-1,x-y,z-1/3	`2_454`	`7`	`2`	`10634`	`60.6`	`-0.4`	`0.510`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		B	`8`	`2`	`10565`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`8`	`3`	`10044`	`55.9`	`-0.1`	`0.547`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`58.3`	`-0.3`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`31`		A	`3`	`2`	`10634`	`x`	A	x-1,y-1,z	`1_445`	`5`	`4`	`10634`	`52.2`	`2.1`	`0.949`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		B	`5`	`3`	`10565`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`2`	`10565`	`44.5`	`1.0`	`0.875`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`48.4`	`1.5`	`0.912`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`33`		[MG]E:101	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`8`	`10634`	`43.4`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.175`
	`34`		[MG]F:101	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`10565`	`43.2`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.175`
	`35`		[MG]G:101	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`9979`	`41.5`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.175`
	`36`		[MG]H:101	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`10044`	`41.2`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.175`
	*Average:*													`42.3`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.175`
19	`37`		A	`3`	`2`	`10634`	`◊`	E	x-1,y-1,z	`1_445`	`5`	`1`	`1293`	`40.5`	`-0.1`	`0.499`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`38`		[MG]D:301	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`10044`	`38.9`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.244`
	`39`		[MG]B:301	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`6`	`10565`	`38.2`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.244`
	`40`		[MG]C:301	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`9979`	`37.0`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.244`
	`41`		[MG]A:301	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`10634`	`36.7`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.244`
	*Average:*													`37.7`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.244`
21	`42`		[MG]E:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`1293`	`33.1`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.160`
22	`43`		[MG]H:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`1086`	`32.6`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.166`
	`44`		[MG]G:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`1062`	`31.9`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.166`
	`45`		[MG]B:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`1002`	`26.8`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.166`
	*Average:*													`30.5`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.166`
23	`46`		[MG]F:101	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`1002`	`32.2`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.164`
	`47`		[MG]D:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`1086`	`25.5`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.164`
	`48`		[MG]C:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`1062`	`24.8`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.164`
	*Average:*													`27.5`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.164`
24	`49`		B	`4`	`1`	`10565`	`x`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`5`	`2`	`10565`	`29.6`	`-0.4`	`0.443`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`50`		[MG]A:301	`1`	`1`	`98`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`1293`	`27.3`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.139`
26	`51`		D	`2`	`1`	`10044`	`◊`	H	x-1,y-1,z	`1_445`	`1`	`1`	`1086`	`20.8`	`0.2`	`0.494`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		G	`1`	`1`	`1062`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`1`	`9979`	`20.6`	`0.6`	`0.743`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`20.7`	`0.4`	`0.619`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`53`		[MG]G:101	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]C:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`13.9`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
28	`54`		[MG]H:101	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]D:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.1`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
29	`55`		[MG]F:101	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]B:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.4`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.089`
30	`56`		[MG]E:101	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:301	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`10.8`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
31	`57`		C	`1`	`1`	`9979`	`◊`	A	-y,x-y,z-1/3	`2_554`	`1`	`1`	`10634`	`4.8`	`-0.2`	`0.367`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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in Europe

Bringing Structure to Biology

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