PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=595-EP-D2D)

Interfaces in PDB 3x1s crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.81 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF THE NUCLEOSOME CORE PARTICLE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		J	`676`	`145`	`32811`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`673`	`146`	`32923`	`6371.8`	`-71.9`	`0.993`	`318`	`0`	`0`	`0.896`
2	`2`		F	`250`	`56`	`7173`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`259`	`61`	`8750`	`2566.4`	`-43.5`	`0.032`	`23`	`4`	`0`	`1.000`
	`3`		B	`229`	`51`	`6399`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`243`	`58`	`8396`	`2431.9`	`-40.9`	`0.049`	`20`	`6`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`2499.1`	`-42.2`	`0.040`	`22`	`5`	`0`	`1.000`
3	`4`		H	`253`	`62`	`7595`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`242`	`59`	`8416`	`2454.4`	`-44.9`	`0.032`	`20`	`6`	`0`	`0.906`
	`5`		D	`252`	`62`	`7929`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`243`	`61`	`8555`	`2447.6`	`-41.7`	`0.042`	`22`	`9`	`0`	`0.906`
	*Average:*													`2451.0`	`-43.3`	`0.037`	`21`	`8`	`0`	`0.906`
4	`6`		I	`105`	`21`	`32923`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`82`	`24`	`8750`	`777.2`	`-3.1`	`0.881`	`16`	`0`	`0`	`0.113`
5	`7`		J	`91`	`18`	`32811`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`79`	`24`	`8750`	`684.3`	`-11.4`	`0.640`	`14`	`0`	`0`	`0.807`
6	`8`		G	`61`	`19`	`8416`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`65`	`21`	`8396`	`681.5`	`-8.5`	`0.247`	`6`	`0`	`0`	`1.000`
	`9`		C	`60`	`17`	`8555`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`57`	`21`	`8750`	`651.5`	`-8.5`	`0.266`	`7`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`666.5`	`-8.5`	`0.256`	`7`	`0`	`0`	`1.000`
7	`10`		I	`87`	`18`	`32923`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`68`	`21`	`8396`	`673.8`	`-11.6`	`0.562`	`14`	`0`	`0`	`0.324`
8	`11`		J	`75`	`13`	`32811`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`63`	`18`	`8396`	`622.5`	`-10.1`	`0.604`	`12`	`0`	`0`	`0.372`
9	`12`		E	`52`	`14`	`8750`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`58`	`14`	`8396`	`579.9`	`-12.4`	`0.111`	`2`	`2`	`0`	`0.266`
10	`13`		D	`48`	`13`	`7929`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`52`	`11`	`6399`	`497.2`	`-2.5`	`0.632`	`8`	`2`	`0`	`0.160`
	`14`		H	`49`	`11`	`7595`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`47`	`11`	`7173`	`480.1`	`-2.5`	`0.632`	`6`	`2`	`0`	`0.160`
	*Average:*													`488.6`	`-2.5`	`0.632`	`7`	`2`	`0`	`0.160`
11	`15`		J	`58`	`13`	`32811`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`51`	`18`	`8555`	`482.7`	`-7.7`	`0.595`	`8`	`0`	`0`	`0.119`
12	`16`		I	`56`	`12`	`32923`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`46`	`15`	`7929`	`427.7`	`-7.1`	`0.572`	`19`	`0`	`0`	`0.417`
13	`17`		I	`50`	`12`	`32923`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`44`	`15`	`8416`	`420.7`	`-5.9`	`0.611`	`10`	`0`	`0`	`0.098`
14	`18`		G	`39`	`14`	`8416`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`51`	`12`	`6399`	`417.3`	`-2.4`	`0.523`	`6`	`0`	`0`	`0.072`
	`19`		C	`42`	`14`	`8555`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`46`	`12`	`7173`	`392.0`	`-3.7`	`0.404`	`5`	`0`	`0`	`0.072`
	*Average:*													`404.6`	`-3.0`	`0.464`	`6`	`0`	`0`	`0.072`
15	`20`		I	`51`	`12`	`32923`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`46`	`13`	`8555`	`404.9`	`-7.1`	`0.560`	`7`	`0`	`0`	`0.098`
16	`21`		J	`43`	`8`	`32811`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`39`	`12`	`7929`	`361.8`	`-5.6`	`0.585`	`5`	`0`	`0`	`0.062`
17	`22`		J	`47`	`11`	`32811`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`35`	`13`	`7595`	`345.9`	`-7.2`	`0.514`	`9`	`0`	`0`	`0.116`
18	`23`		J	`43`	`8`	`32811`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`42`	`15`	`6399`	`343.7`	`-6.6`	`0.530`	`6`	`0`	`0`	`0.116`
19	`24`		J	`47`	`10`	`32811`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`46`	`11`	`8416`	`341.3`	`-4.5`	`0.649`	`7`	`0`	`0`	`0.183`
20	`25`		I	`40`	`7`	`32923`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`37`	`14`	`7173`	`324.9`	`-6.9`	`0.474`	`6`	`0`	`0`	`0.130`
21	`26`		J	`38`	`10`	`32811`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`29`	`10`	`7173`	`291.9`	`-2.4`	`0.688`	`3`	`0`	`0`	`0.047`
22	`27`		I	`29`	`4`	`32923`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`30`	`10`	`7595`	`258.4`	`-4.8`	`0.538`	`3`	`0`	`0`	`0.083`
23	`28`		I	`37`	`11`	`32923`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`8`	`6399`	`250.5`	`-2.0`	`0.708`	`2`	`0`	`0`	`0.040`
24	`29`		H	`28`	`10`	`7595`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`28`	`6`	`6399`	`230.7`	`-1.6`	`0.600`	`4`	`1`	`0`	`0.082`
	`30`		D	`31`	`13`	`7929`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`24`	`7`	`7173`	`229.4`	`-1.1`	`0.606`	`3`	`1`	`0`	`0.082`
	*Average:*													`230.0`	`-1.3`	`0.603`	`4`	`1`	`0`	`0.082`
25	`31`		F	`26`	`6`	`7173`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`24`	`6`	`7929`	`230.6`	`0.4`	`0.709`	`3`	`2`	`0`	`0.010`
26	`32`		F	`16`	`5`	`7173`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`22`	`6`	`8555`	`183.4`	`-1.0`	`0.547`	`1`	`1`	`0`	`0.013`
27	`33`		J	`26`	`5`	`32811`	`◊`	I	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`25`	`4`	`32923`	`161.2`	`2.7`	`0.884`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`34`		G	`17`	`4`	`8416`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`4`	`8555`	`131.2`	`0.2`	`0.705`	`1`	`0`	`0`	`0.003`
29	`35`		J	`16`	`4`	`32811`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`13`	`6`	`7929`	`114.7`	`-1.9`	`0.556`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
30	`36`		E	`10`	`5`	`8750`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`11`	`3`	`8555`	`108.2`	`1.4`	`0.826`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
31	`37`		I	`10`	`3`	`32923`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`8`	`3`	`8396`	`94.2`	`-0.6`	`0.632`	`2`	`0`	`0`	`0.003`
32	`38`		H	`7`	`3`	`7595`	`◊`	I	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`8`	`2`	`32923`	`65.2`	`-1.8`	`0.481`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
33	`39`		I	`10`	`3`	`32923`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`11`	`4`	`7929`	`65.1`	`-1.4`	`0.529`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
34	`40`		D	`7`	`2`	`7929`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`8416`	`63.8`	`-0.1`	`0.650`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
	`41`		H	`6`	`2`	`7595`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`8555`	`56.6`	`-0.3`	`0.582`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
	*Average:*													`60.2`	`-0.2`	`0.616`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
35	`42`		C	`6`	`4`	`8555`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`8396`	`60.4`	`1.6`	`0.863`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		G	`1`	`1`	`8416`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`8750`	`2.2`	`-0.0`	`0.628`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`31.3`	`0.8`	`0.746`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`44`		I	`11`	`3`	`32923`	`◊`	J	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`10`	`3`	`32811`	`58.3`	`1.1`	`0.761`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`45`		J	`8`	`1`	`32811`	`x`	J	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`11`	`1`	`32811`	`57.9`	`0.7`	`0.717`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`46`		[MN]I:201	`1`	`1`	`123`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`32923`	`55.8`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.076`
39	`47`		[CL]I:204	`1`	`1`	`125`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`32923`	`55.7`	`-7.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
40	`48`		E	`9`	`3`	`8750`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`6`	`4`	`7929`	`49.9`	`0.2`	`0.703`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`49`		[MN]I:203	`1`	`1`	`123`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`12`	`3`	`32923`	`47.9`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.082`
42	`50`		E	`13`	`3`	`8750`	`◊`	[MN]D:202	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`123`	`45.0`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	`51`		E	`12`	`3`	`8750`	`◊`	[MN]D:201	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`123`	`44.6`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
	*Average:*													`44.8`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.031`
43	`52`		[MN]G:201	`1`	`1`	`123`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`8416`	`44.2`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
44	`53`		[MN]I:202	`1`	`1`	`123`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`32923`	`41.8`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
45	`54`		[MN]G:201	`1`	`1`	`123`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`7595`	`40.9`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
46	`55`		J	`5`	`2`	`32811`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`7`	`3`	`8396`	`37.6`	`0.6`	`0.711`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`56`		[CL]J:301	`1`	`1`	`125`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`32811`	`35.3`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.193`
48	`57`		H	`5`	`2`	`7595`	`◊`	J	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`32811`	`35.1`	`-0.8`	`0.480`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
49	`58`		I	`5`	`2`	`32923`	`◊`	J	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`5`	`2`	`32811`	`31.6`	`-2.8`	`0.295`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`59`		[MN]D:201	`1`	`1`	`123`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`7929`	`29.3`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.085`
	`60`		[MN]D:202	`1`	`1`	`123`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`7929`	`28.4`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.085`
	*Average:*													`28.9`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.085`
51	`61`		I	`6`	`2`	`32923`	`x`	I	-x-1/2,-y,z-1/2	`2_454`	`2`	`1`	`32923`	`27.8`	`-0.6`	`0.536`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`62`		[MN]D:202	`1`	`1`	`123`	`f`	[MN]D:201	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`123`	`27.4`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
53	`63`		[MN]I:201	`1`	`1`	`123`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`1`	`1`	`8396`	`26.7`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
54	`64`		[CL]J:301	`1`	`1`	`125`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`32923`	`24.9`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
55	`65`		J	`4`	`2`	`32811`	`◊`	I	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`7`	`3`	`32923`	`24.8`	`-1.0`	`0.471`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`66`		I	`4`	`2`	`32923`	`◊`	J	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`2`	`32811`	`20.9`	`-1.4`	`0.399`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`67`		[MN]G:201	`1`	`1`	`123`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`32923`	`19.8`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
58	`68`		J	`4`	`2`	`32811`	`x`	J	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`32811`	`18.7`	`-1.2`	`0.277`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`69`		[MN]D:202	`1`	`1`	`123`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`8555`	`18.3`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
	`70`		[MN]D:201	`1`	`1`	`123`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`8555`	`9.4`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
	*Average:*													`13.9`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
60	`71`		J	`4`	`2`	`32811`	`◊`	[CL]J:301	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`1`	`1`	`125`	`17.6`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`72`		I	`1`	`1`	`32923`	`◊`	J	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`3`	`1`	`32811`	`14.8`	`-1.5`	`0.246`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`73`		F	`3`	`2`	`7173`	`◊`	[MN]D:201	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`123`	`14.0`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
	`74`		F	`2`	`2`	`7173`	`◊`	[MN]D:202	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`123`	`5.9`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
	*Average:*													`10.0`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
63	`75`		I	`4`	`2`	`32923`	`x`	I	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`2`	`1`	`32923`	`11.8`	`-0.0`	`0.544`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`76`		[MN]I:202	`1`	`1`	`123`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`32811`	`10.7`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
65	`77`		I	`3`	`1`	`32923`	`x`	I	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`3`	`1`	`32923`	`10.4`	`-0.3`	`0.477`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`78`		[MN]I:201	`1`	`1`	`123`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`32811`	`9.2`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
67	`79`		[MN]I:203	`1`	`1`	`123`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`32811`	`6.7`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`80`		J	`1`	`1`	`32811`	`x`	J	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`2`	`1`	`32811`	`3.8`	`-0.2`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`81`		J	`1`	`1`	`32811`	`◊`	I	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`2`	`1`	`32923`	`3.5`	`-0.4`	`0.249`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`82`		I	`1`	`1`	`32923`	`◊`	B	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`1`	`1`	`6399`	`0.6`	`-0.0`	`0.443`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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