PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=355-4C-N0K)

Interfaces in PDB 4avt crystal.
Space symmetry group: P 43 21 2. Resolution: 3.20 Å

STRUCTURE OF CPHPC BOUND TO SERUM AMYLOID P COMPONENT

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		E	`77`	`22`	`9054`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`75`	`22`	`9049`	`750.6`	`-5.9`	`0.238`	`12`	`6`	`0`	`0.452`
	`2`		J	`74`	`21`	`9067`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`73`	`22`	`9067`	`747.9`	`-5.8`	`0.241`	`11`	`6`	`0`	`0.452`
	`3`		D	`74`	`22`	`9051`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`74`	`21`	`9067`	`746.9`	`-5.9`	`0.241`	`11`	`6`	`0`	`0.452`
	`4`		H	`75`	`22`	`9074`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`73`	`21`	`9057`	`746.7`	`-5.8`	`0.241`	`11`	`6`	`0`	`0.452`
	`5`		C	`71`	`21`	`9049`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`74`	`21`	`9075`	`745.9`	`-5.7`	`0.239`	`11`	`6`	`0`	`0.452`
	`6`		G	`73`	`21`	`9056`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`74`	`22`	`9054`	`744.2`	`-5.7`	`0.242`	`13`	`6`	`0`	`0.452`
	`7`		I	`75`	`22`	`9064`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`74`	`21`	`9075`	`741.1`	`-6.0`	`0.228`	`12`	`5`	`0`	`0.452`
	`8`		F	`74`	`21`	`9057`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`73`	`21`	`9051`	`741.1`	`-5.8`	`0.242`	`12`	`6`	`0`	`0.452`
	`9`		I	`74`	`21`	`9064`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`75`	`23`	`9056`	`740.4`	`-5.8`	`0.242`	`11`	`6`	`0`	`0.452`
	`10`		J	`76`	`22`	`9067`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`72`	`21`	`9074`	`739.2`	`-5.7`	`0.248`	`12`	`6`	`0`	`0.452`
	*Average:*													`744.4`	`-5.8`	`0.240`	`12`	`6`	`0`	`0.452`
2	`11`		F	`27`	`8`	`9057`	`◊`	J	-y+3/2,x+1/2,z-1/4	`3_654`	`38`	`14`	`9067`	`287.4`	`2.9`	`0.837`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
	`12`		E	`37`	`14`	`9054`	`◊`	I	-y+3/2,x+1/2,z-1/4	`3_654`	`28`	`8`	`9064`	`286.1`	`2.9`	`0.839`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`286.8`	`2.9`	`0.838`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
3	`13`		D	`18`	`7`	`9051`	`◊`	D	-y+1,-x+1,-z+1/2	`8_665`	`18`	`7`	`9051`	`168.2`	`2.1`	`0.829`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
	`14`		C	`15`	`7`	`9049`	`◊`	C	-y+1,-x+1,-z+1/2	`8_665`	`15`	`7`	`9049`	`150.8`	`1.8`	`0.811`	`4`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`159.5`	`2.0`	`0.820`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
4	`15`		[GHE]J:1207	`13`	`1`	`520`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`23`	`9`	`9064`	`155.4`	`6.0`	`0.844`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		[GHE]B:1207	`12`	`1`	`515`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`9`	`9075`	`154.8`	`5.8`	`0.827`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		[GHE]C:1207	`12`	`1`	`524`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`24`	`10`	`9049`	`153.3`	`5.6`	`0.817`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		[GHE]G:1207	`13`	`1`	`517`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`24`	`10`	`9056`	`151.5`	`5.6`	`0.807`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`153.7`	`5.8`	`0.824`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
5	`19`		[GHE]B:1207	`13`	`1`	`515`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`10`	`9067`	`155.2`	`-3.9`	`0.112`	`2`	`0`	`0`	`0.099`
	`20`		[GHE]J:1207	`14`	`1`	`520`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`23`	`9`	`9067`	`154.5`	`-4.3`	`0.111`	`2`	`0`	`0`	`0.099`
	`21`		[GHE]G:1207	`15`	`1`	`517`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`25`	`10`	`9074`	`152.2`	`-4.6`	`0.134`	`2`	`0`	`0`	`0.099`
	`22`		[GHE]C:1207	`14`	`1`	`524`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`9051`	`149.0`	`-4.0`	`0.140`	`2`	`0`	`0`	`0.099`
	*Average:*													`152.7`	`-4.2`	`0.124`	`2`	`0`	`0`	`0.099`
6	`23`		[GHE]E:1207	`15`	`1`	`520`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`9057`	`154.7`	`-4.2`	`0.149`	`2`	`0`	`0`	`0.025`
7	`24`		[GHE]E:1207	`14`	`1`	`520`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`25`	`10`	`9054`	`154.7`	`5.7`	`0.801`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`25`		[NAG]D:1207	`11`	`1`	`361`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`9051`	`141.5`	`4.6`	`0.482`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		[NAG]E:1208	`11`	`1`	`361`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`9054`	`139.6`	`4.2`	`0.498`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		[NAG]J:1208	`11`	`1`	`367`	`cf`	J	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`9067`	`134.2`	`4.4`	`0.445`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		[NAG]F:1207	`11`	`1`	`361`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`9057`	`133.6`	`4.5`	`0.482`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		[NAG]I:1207	`10`	`1`	`363`	`cf`	I	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`9064`	`131.5`	`4.6`	`0.560`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		[NAG]C:1208	`10`	`1`	`357`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`9049`	`130.9`	`4.5`	`0.562`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		[NAG]A:1207	`10`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`9075`	`126.2`	`4.2`	`0.510`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`133.9`	`4.4`	`0.506`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`32`		[NAG]H:1207	`12`	`1`	`347`	`cf`	H	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`9074`	`132.9`	`3.3`	`0.310`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`33`		[NAG]B:1208	`10`	`1`	`360`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`9067`	`128.0`	`4.3`	`0.535`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`34`		[NAG]G:1208	`11`	`1`	`359`	`cf`	G	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`9056`	`127.2`	`4.6`	`0.516`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`35`		H	`12`	`5`	`9074`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`9056`	`120.3`	`0.9`	`0.747`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		J	`12`	`5`	`9067`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`9064`	`113.5`	`0.7`	`0.713`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		F	`13`	`6`	`9057`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`9054`	`102.2`	`0.8`	`0.724`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		B	`12`	`6`	`9067`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`9075`	`96.9`	`0.8`	`0.735`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		D	`7`	`5`	`9051`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`9049`	`41.5`	`0.6`	`0.749`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`94.9`	`0.8`	`0.734`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`40`		D	`15`	`5`	`9051`	`◊`	C	-y+1,-x+1,-z+1/2	`8_665`	`14`	`5`	`9049`	`117.5`	`3.1`	`0.906`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
14	`41`		E	`13`	`4`	`9054`	`◊`	J	-y+3/2,x+1/2,z-1/4	`3_654`	`11`	`3`	`9067`	`96.0`	`-1.0`	`0.409`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`42`		[CA]B:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`9067`	`34.5`	`-8.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	`43`		[CA]A:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`9075`	`34.4`	`-8.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	`44`		[CA]C:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`9049`	`34.4`	`-8.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	`45`		[CA]F:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`9057`	`34.3`	`-8.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	`46`		[CA]H:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`9074`	`34.3`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	`47`		[CA]G:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`9056`	`34.0`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	`48`		[CA]D:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`9051`	`34.0`	`-8.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	`49`		[CA]I:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`9064`	`33.8`	`-7.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	`50`		[CA]J:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`9067`	`33.7`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	`51`		[CA]E:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`9054`	`33.1`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	*Average:*													`34.0`	`-8.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
16	`52`		[CA]B:1205	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`9067`	`30.6`	`-9.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.335`
	`53`		[CA]C:1205	`1`	`1`	`85`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`9049`	`30.4`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.335`
	`54`		[CA]D:1205	`1`	`1`	`85`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`9051`	`30.2`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.335`
	`55`		[CA]E:1205	`1`	`1`	`85`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`9054`	`30.1`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.335`
	`56`		[CA]A:1205	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`9075`	`30.1`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.335`
	`57`		[CA]J:1205	`1`	`1`	`85`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`9067`	`30.0`	`-9.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.335`
	`58`		[CA]G:1205	`1`	`1`	`85`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`9056`	`29.9`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.335`
	`59`		[CA]F:1205	`1`	`1`	`85`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`9057`	`29.4`	`-8.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.335`
	`60`		[CA]H:1205	`1`	`1`	`85`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`9074`	`29.4`	`-8.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.335`
	`61`		[CA]I:1205	`1`	`1`	`85`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`9064`	`29.3`	`-8.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.335`
	*Average:*													`29.9`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.335`
17	`62`		[GHE]J:1207	`4`	`1`	`520`	`f`	[CA]J:1206	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`26.0`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.116`
	`63`		[GHE]G:1207	`5`	`1`	`517`	`f`	[CA]H:1206	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`25.6`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.116`
	`64`		[GHE]E:1207	`6`	`1`	`520`	`f`	[CA]F:1206	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`24.9`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.116`
	`65`		[GHE]B:1207	`4`	`1`	`515`	`f`	[CA]B:1206	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`24.0`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.116`
	`66`		[GHE]C:1207	`3`	`1`	`524`	`f`	[CA]D:1206	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`22.0`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.116`
	*Average:*													`24.5`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.116`
18	`67`		[GHE]J:1207	`5`	`1`	`520`	`◊`	[CA]I:1206	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`25.1`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	`68`		[GHE]E:1207	`5`	`1`	`520`	`◊`	[CA]E:1206	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`24.7`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	`69`		[GHE]G:1207	`5`	`1`	`517`	`◊`	[CA]G:1206	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`24.3`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	`70`		[GHE]B:1207	`5`	`1`	`515`	`◊`	[CA]A:1206	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`24.0`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	`71`		[GHE]C:1207	`5`	`1`	`524`	`◊`	[CA]C:1206	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`23.8`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	*Average:*													`24.4`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
19	`72`		[GHE]J:1207	`2`	`1`	`520`	`f`	[CA]J:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`23.2`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
	`73`		[GHE]G:1207	`3`	`1`	`517`	`f`	[CA]H:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`23.2`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
	`74`		[GHE]B:1207	`2`	`1`	`515`	`f`	[CA]B:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`22.9`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
	`75`		[GHE]C:1207	`4`	`1`	`524`	`f`	[CA]D:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`22.1`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
	`76`		[GHE]E:1207	`4`	`1`	`520`	`f`	[CA]F:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`22.0`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
	*Average:*													`22.7`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
20	`77`		[GHE]E:1207	`2`	`1`	`520`	`◊`	[CA]E:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`23.0`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
	`78`		[GHE]G:1207	`3`	`1`	`517`	`◊`	[CA]G:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`22.9`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
	`79`		[GHE]B:1207	`3`	`1`	`515`	`◊`	[CA]A:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`22.7`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
	`80`		[GHE]C:1207	`4`	`1`	`524`	`◊`	[CA]C:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`22.3`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
	`81`		[GHE]J:1207	`4`	`1`	`520`	`◊`	[CA]I:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`22.3`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
	*Average:*													`22.6`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
21	`82`		F	`2`	`2`	`9057`	`◊`	I	-y+3/2,x+1/2,z-1/4	`3_654`	`2`	`2`	`9064`	`6.3`	`0.5`	`0.842`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`83`		[CA]F:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]F:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`6.2`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
23	`84`		[CA]D:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]D:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`6.1`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
24	`85`		[CA]G:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]G:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`6.0`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
25	`86`		[CA]I:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]I:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`6.0`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
26	`87`		[CA]E:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]E:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`5.4`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
27	`88`		[CA]A:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]A:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`5.3`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
28	`89`		[CA]H:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]H:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`5.2`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
29	`90`		[CA]C:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]C:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`5.2`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
30	`91`		[CA]B:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]B:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`4.7`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
31	`92`		[CA]J:1206	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]J:1205	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`4.6`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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