PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=253-HE-CLH)

Interfaces in PDB 4cqf crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 2.30 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF SCHISTOSOMA MANSONI HDAC8 COMPLEXED WITH A MERCAPTOACETAMIDE INHIBITOR

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`116`	`39`	`16994`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`96`	`30`	`18304`	`1009.9`	`-12.6`	`0.089`	`6`	`3`	`0`	`0.000`
	`2`		B	`95`	`31`	`17688`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`107`	`36`	`17000`	`941.3`	`-9.6`	`0.170`	`8`	`4`	`0`	`0.000`
	`3`		A	`94`	`29`	`17000`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`104`	`37`	`17688`	`893.1`	`-8.8`	`0.211`	`7`	`2`	`0`	`0.000`
	`4`		C	`106`	`36`	`18304`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`92`	`29`	`16994`	`880.1`	`-7.7`	`0.270`	`8`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`931.1`	`-9.7`	`0.185`	`7`	`3`	`0`	`0.000`
2	`5`		D	`62`	`18`	`16994`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`60`	`20`	`17688`	`558.0`	`-3.9`	`0.427`	`7`	`1`	`0`	`0.000`
3	`6`		C	`44`	`12`	`18304`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`60`	`17`	`17688`	`533.9`	`-2.8`	`0.474`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		C	`45`	`13`	`18304`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`35`	`11`	`17688`	`397.1`	`-1.7`	`0.446`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`465.5`	`-2.2`	`0.460`	`10`	`0`	`0`	`0.000`
4	`8`		D	`46`	`14`	`16994`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`43`	`14`	`17688`	`427.9`	`-5.1`	`0.179`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
	`9`		C	`47`	`15`	`18304`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`47`	`13`	`17000`	`417.1`	`-5.0`	`0.201`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`422.5`	`-5.0`	`0.190`	`5`	`1`	`0`	`0.000`
5	`10`		C	`29`	`10`	`18304`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`39`	`14`	`17000`	`321.9`	`0.8`	`0.683`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
6	`11`		[9Z8]D:700	`19`	`1`	`532`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`46`	`17`	`16994`	`284.8`	`-8.6`	`0.181`	`5`	`0`	`0`	`0.007`
	`12`		[9Z8]A:700	`19`	`1`	`535`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`45`	`17`	`17000`	`284.1`	`-8.8`	`0.116`	`5`	`0`	`0`	`0.007`
	`13`		[9Z8]C:700	`19`	`1`	`536`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`45`	`16`	`18304`	`283.5`	`-9.2`	`0.142`	`6`	`0`	`0`	`0.007`
	`14`		[9Z8]B:700	`19`	`1`	`531`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`45`	`16`	`17688`	`278.1`	`-9.2`	`0.137`	`5`	`0`	`0`	`0.007`
	*Average:*													`282.6`	`-8.9`	`0.144`	`5`	`0`	`0`	`0.007`
7	`15`		C	`24`	`8`	`18304`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`24`	`9`	`17000`	`201.1`	`0.0`	`0.649`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
	`16`		D	`27`	`10`	`16994`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`18`	`7`	`17688`	`175.2`	`0.6`	`0.715`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`188.1`	`0.3`	`0.682`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
8	`17`		D	`27`	`9`	`16994`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`23`	`6`	`17000`	`198.5`	`-1.1`	`0.463`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
9	`18`		[GOL]C:902	`6`	`1`	`222`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`34`	`9`	`18304`	`152.7`	`-0.8`	`0.543`	`3`	`0`	`0`	`0.001`
10	`19`		[DMF]C:803	`5`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`28`	`8`	`18304`	`147.3`	`3.2`	`0.450`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`20`		[DMF]D:801	`5`	`1`	`217`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`29`	`9`	`16994`	`144.6`	`3.0`	`0.459`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`21`		[GOL]B:902	`6`	`1`	`221`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`10`	`17688`	`140.4`	`-0.3`	`0.588`	`5`	`0`	`0`	`0.002`
	`22`		[GOL]D:900	`6`	`1`	`218`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`16994`	`134.8`	`-0.0`	`0.603`	`8`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`137.6`	`-0.2`	`0.595`	`7`	`0`	`0`	`0.002`
13	`23`		[GOL]C:901	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`18304`	`140.4`	`-0.2`	`0.592`	`8`	`0`	`0`	`0.002`
14	`24`		[DMF]A:801	`5`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`8`	`17000`	`139.6`	`3.6`	`0.486`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`25`		[GOL]C:900	`6`	`1`	`222`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`10`	`18304`	`135.9`	`1.3`	`0.713`	`8`	`0`	`0`	`0.001`
16	`26`		[DMF]B:801	`5`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`7`	`17688`	`132.5`	`2.9`	`0.442`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`27`		[DMF]A:800	`5`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`17000`	`132.1`	`3.8`	`0.523`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		[DMF]C:800	`5`	`1`	`215`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`10`	`18304`	`131.6`	`3.8`	`0.536`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		[DMF]D:800	`5`	`1`	`217`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`16994`	`131.2`	`3.8`	`0.519`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		[DMF]B:800	`5`	`1`	`215`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`17688`	`130.9`	`3.8`	`0.522`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`131.4`	`3.8`	`0.525`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`31`		[DMF]C:801	`5`	`1`	`215`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`18304`	`125.3`	`2.8`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`32`		[GOL]B:901	`6`	`1`	`220`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`17688`	`124.8`	`-0.8`	`0.488`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
20	`33`		[K]D:600	`1`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`16994`	`113.5`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	`34`		[K]B:600	`1`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`17688`	`113.5`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	`35`		[K]A:600	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`17000`	`113.4`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	`36`		[K]C:601	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`18304`	`112.7`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
	*Average:*													`113.3`	`-108.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.071`
21	`37`		[GOL]D:901	`6`	`1`	`221`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`16994`	`97.8`	`-0.2`	`0.517`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
22	`38`		A	`15`	`6`	`17000`	`◊`	[DMF]B:802	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`215`	`84.0`	`2.1`	`0.388`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		[DMF]C:802	`5`	`1`	`217`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`14`	`6`	`16994`	`83.3`	`2.3`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`83.7`	`2.2`	`0.397`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`40`		[DMF]B:802	`5`	`1`	`215`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`17688`	`66.2`	`1.3`	`0.248`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		[DMF]C:802	`5`	`1`	`217`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`18304`	`56.0`	`1.0`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`61.1`	`1.1`	`0.246`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`42`		[GOL]D:901	`6`	`1`	`221`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`18304`	`59.9`	`0.5`	`0.651`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
25	`43`		[9Z8]B:700	`5`	`1`	`531`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`17000`	`42.2`	`0.7`	`0.780`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		C	`8`	`4`	`18304`	`◊`	[9Z8]D:700	x,y-1,z	`1_545`	`8`	`1`	`532`	`42.1`	`0.5`	`0.649`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		[9Z8]C:700	`4`	`1`	`536`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`16994`	`37.5`	`0.6`	`0.755`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		[9Z8]A:700	`5`	`1`	`535`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`3`	`17688`	`35.8`	`0.6`	`0.755`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`39.4`	`0.6`	`0.735`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`47`		[ZN]C:500	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`18304`	`36.7`	`-26.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
	`48`		[ZN]D:500	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`16994`	`36.4`	`-26.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
	`49`		[ZN]B:500	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`7`	`17688`	`36.1`	`-26.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
	`50`		[ZN]A:500	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`7`	`17000`	`36.1`	`-26.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
	*Average:*													`36.4`	`-26.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
27	`51`		C	`6`	`3`	`18304`	`◊`	B	x-1,y-1,z	`1_445`	`4`	`2`	`17688`	`35.1`	`0.5`	`0.767`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`52`		[9Z8]A:700	`3`	`1`	`535`	`f`	[ZN]A:500	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`31.2`	`-14.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`53`		[9Z8]C:700	`3`	`1`	`536`	`f`	[ZN]C:500	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`31.1`	`-14.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`54`		[9Z8]B:700	`3`	`1`	`531`	`f`	[ZN]B:500	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.8`	`-13.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`55`		[9Z8]D:700	`3`	`1`	`532`	`f`	[ZN]D:500	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.4`	`-13.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	*Average:*													`30.9`	`-14.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
29	`56`		C	`1`	`1`	`18304`	`f`	[DMF]B:801	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`216`	`12.0`	`0.2`	`0.235`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`57`		[GOL]B:902	`1`	`1`	`221`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`17000`	`3.4`	`0.1`	`0.628`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		C	`1`	`1`	`18304`	`◊`	[GOL]D:900	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`218`	`1.9`	`0.1`	`0.616`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`2.6`	`0.1`	`0.622`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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in Europe

Bringing Structure to Biology

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