PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=161-4B-250)

Interfaces in PDB 4dob crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.05 Å

TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-MONOCHLOROROMETHYLENE TRIPHOSPHATE: STEREOSELECTIVE BINDING OF R-ISOMER

Interfaces

##		Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
`1`		T	`78`	`8`	`3763`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`80`	`28`	`17094`	`683.5`	`-4.4`	`0.421`	`12`	`0`	`0`	`0.092`
`2`		P	`41`	`9`	`2182`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`43`	`10`	`3763`	`425.8`	`-5.6`	`0.526`	`24`	`0`	`0`	`1.000`
`3`		D	`35`	`3`	`1359`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`46`	`16`	`17094`	`355.7`	`-7.4`	`0.366`	`7`	`0`	`0`	`0.095`
`4`		[GRC]A:410	`30`	`1`	`611`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`47`	`18`	`17094`	`312.9`	`-0.5`	`0.618`	`6`	`0`	`0`	`0.030`
`5`		A	`32`	`8`	`17094`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`26`	`7`	`17094`	`247.6`	`2.2`	`0.786`	`7`	`1`	`0`	`0.000`
`6`		A	`27`	`10`	`17094`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`27`	`11`	`17094`	`239.0`	`3.7`	`0.871`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
`7`		P	`26`	`3`	`2182`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`29`	`15`	`17094`	`229.4`	`-6.4`	`0.219`	`5`	`0`	`0`	`0.082`
`8`		D	`22`	`5`	`1359`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`22`	`5`	`3763`	`226.0`	`-3.1`	`0.552`	`18`	`0`	`0`	`1.000`
`9`		A	`23`	`7`	`17094`	`x`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`23`	`9`	`17094`	`211.5`	`-2.8`	`0.168`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`10`		A	`25`	`9`	`17094`	`◊`	P	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`22`	`2`	`2182`	`194.6`	`1.6`	`0.513`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`11`		A	`14`	`8`	`17094`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`15`	`2`	`3763`	`153.4`	`-0.3`	`0.531`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`12`		A	`20`	`9`	`17094`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`15`	`5`	`17094`	`150.8`	`3.8`	`0.866`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
`13`		[DOC]P:10	`11`	`1`	`419`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`17094`	`120.3`	`0.4`	`0.364`	`2`	`0`	`0`	`0.004`
`14`		A	`14`	`4`	`17094`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`9`	`2`	`17094`	`115.1`	`-1.8`	`0.197`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`15`		[DOC]P:10	`14`	`1`	`419`	`cf`	P	x,y,z	`1_555`	`14`	`1`	`2182`	`108.9`	`2.4`	`0.531`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`16`		D	`14`	`1`	`1359`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`10`	`3`	`17094`	`95.6`	`2.1`	`0.841`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`17`		[DOC]P:10	`12`	`1`	`419`	`◊`	[GRC]A:410	x,y,z	`1_555`	`17`	`1`	`611`	`92.4`	`2.7`	`0.582`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`18`		T	`14`	`2`	`3763`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`3`	`17094`	`79.1`	`-0.3`	`0.546`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`19`		[GRC]A:410	`8`	`1`	`611`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`3763`	`75.6`	`0.9`	`0.632`	`3`	`0`	`0`	`0.004`
`20`		[CL]A:407	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`17094`	`75.1`	`-11.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
`21`		[CL]A:405	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`17094`	`73.9`	`-12.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.115`
`22`		[CL]A:409	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`17094`	`64.0`	`-10.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
`23`		[CL]A:406	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`17094`	`63.2`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
`24`		[CL]A:408	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`17094`	`62.4`	`-9.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
`25`		[DOC]P:10	`5`	`1`	`419`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`3763`	`58.4`	`0.1`	`0.445`	`3`	`0`	`0`	`0.079`
`26`		[NA]A:404	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`17094`	`57.7`	`-9.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
`27`		[NA]A:403	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`17094`	`56.9`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
`28`		A	`7`	`2`	`17094`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`7`	`3`	`3763`	`48.3`	`-2.1`	`0.319`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`29`		[NA]A:402	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`17094`	`39.2`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
`30`		[NA]A:403	`1`	`1`	`125`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2182`	`33.9`	`-5.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
`31`		[MG]A:401	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`17094`	`33.4`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
`32`		[NA]A:404	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1359`	`30.9`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.040`
`33`		D	`5`	`1`	`1359`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`2`	`1`	`3763`	`30.8`	`0.0`	`0.454`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`34`		[GRC]A:410	`5`	`1`	`611`	`f`	[MG]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`30.8`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
`35`		[GRC]A:410	`6`	`1`	`611`	`f`	[NA]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`27.7`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
`36`		[DOC]P:10	`6`	`1`	`419`	`◊`	[NA]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`27.6`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
`37`		[CL]A:406	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`1359`	`15.1`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
`38`		A	`4`	`3`	`17094`	`◊`	T	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`2`	`3763`	`15.0`	`-0.7`	`0.452`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`39`		[NA]A:402	`1`	`1`	`125`	`f`	[MG]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.6`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
`40`		[CL]A:408	`1`	`1`	`125`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3763`	`7.1`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
`41`		[CL]A:406	`1`	`1`	`125`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3763`	`6.0`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
`42`		A	`1`	`1`	`17094`	`◊`	P	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`2182`	`2.5`	`-0.1`	`0.408`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`43`		A	`2`	`2`	`17094`	`x`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`2`	`1`	`17094`	`0.9`	`0.0`	`0.622`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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