PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=653-73-LBP)

Interfaces in PDB 4ki2 crystal.
Space symmetry group: P 62 2 2. Resolution: 3.30 Å

CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS OF AN RNA-POLYMERASE SIGMA-SUBUNIT FRAGMENT COMPLEXED WITH -10 PROMOTER ELEMENT SSDNA

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		E	`92`	`9`	`2836`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`107`	`26`	`13586`	`907.8`	`-1.7`	`0.703`	`18`	`0`	`0`	`0.100`
2	`2`		D	`92`	`10`	`2995`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`98`	`24`	`9790`	`898.5`	`-4.5`	`0.565`	`15`	`0`	`0`	`1.000`
3	`3`		B	`57`	`22`	`13586`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`63`	`19`	`9790`	`542.8`	`-3.7`	`0.445`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
4	`4`		B	`48`	`14`	`13586`	`◊`	B	-y-1,-x-1,-z+2/3	`10_445`	`50`	`14`	`13586`	`462.2`	`5.2`	`0.945`	`12`	`6`	`0`	`0.000`
5	`5`		A	`41`	`9`	`9790`	`◊`	A	-x-1,-y,z	`4_455`	`42`	`9`	`9790`	`388.5`	`3.5`	`0.908`	`4`	`6`	`0`	`0.000`
6	`6`		E	`24`	`5`	`2836`	`◊`	D	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`23`	`3`	`2995`	`213.9`	`-2.3`	`0.406`	`8`	`0`	`0`	`0.019`
7	`7`		E	`20`	`3`	`2836`	`◊`	D	x,x-y,-z+1/3	`12_555`	`25`	`5`	`2995`	`208.8`	`-2.2`	`0.408`	`9`	`0`	`0`	`0.021`
8	`8`		D	`16`	`2`	`2995`	`◊`	B	-x-1,-y,z	`4_455`	`23`	`7`	`13586`	`171.4`	`-4.0`	`0.294`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
9	`9`		G	`17`	`3`	`965`	`◊`	F	x,x-y,-z+1/3	`12_555`	`15`	`3`	`977`	`144.4`	`-2.5`	`0.485`	`8`	`0`	`0`	`1.000`
10	`10`		F	`15`	`3`	`977`	`◊`	G	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`14`	`3`	`965`	`141.2`	`-2.3`	`0.478`	`8`	`0`	`0`	`1.000`
11	`11`		B	`12`	`2`	`13586`	`◊`	B	-x-1,-y,z	`4_455`	`12`	`2`	`13586`	`118.0`	`-2.2`	`0.257`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`12`		B	`13`	`4`	`13586`	`◊`	A	x,x-y,-z+1/3	`12_555`	`11`	`5`	`9790`	`105.9`	`0.2`	`0.565`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`13`		B	`7`	`4`	`13586`	`◊`	A	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`15`	`6`	`9790`	`92.9`	`-0.2`	`0.418`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`14`		F	`13`	`1`	`977`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`19`	`1`	`2836`	`86.1`	`2.5`	`0.798`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`15`		G	`14`	`1`	`965`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`1`	`2995`	`84.6`	`2.4`	`0.803`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`16`		F	`11`	`3`	`977`	`x`	[K]G:102	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`1`	`1`	`216`	`70.7`	`-39.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.204`
17	`17`		[K]G:102	`1`	`1`	`216`	`x`	G	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`965`	`70.5`	`-39.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.203`
18	`18`		B	`6`	`2`	`13586`	`◊`	D	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`9`	`2`	`2995`	`69.8`	`-0.6`	`0.563`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`19`		E	`9`	`2`	`2836`	`◊`	A	x,x-y,-z+1/3	`12_555`	`7`	`3`	`9790`	`69.4`	`-0.9`	`0.522`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
20	`20`		E	`9`	`3`	`2836`	`x`	[K]D:101	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`1`	`1`	`216`	`67.4`	`-38.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.345`
	`21`		E	`11`	`3`	`2836`	`x`	[K]D:102	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`1`	`1`	`216`	`55.9`	`-29.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.345`
	*Average:*													`61.7`	`-34.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.345`
21	`22`		[K]D:101	`1`	`1`	`216`	`x`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`2995`	`64.9`	`-36.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.187`
22	`23`		F	`11`	`3`	`977`	`x`	[K]G:101	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`1`	`1`	`216`	`59.4`	`-28.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.145`
23	`24`		[K]G:101	`1`	`1`	`216`	`x`	G	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`965`	`59.0`	`-28.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.146`
24	`25`		[K]D:102	`1`	`1`	`216`	`x`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`2995`	`55.3`	`-29.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
25	`26`		[K]D:102	`1`	`1`	`216`	`f`	[K]D:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`50.1`	`-50.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.129`
26	`27`		F	`8`	`1`	`977`	`◊`	D	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`10`	`2`	`2995`	`48.2`	`0.5`	`0.636`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`28`		G	`8`	`1`	`965`	`◊`	E	x,x-y,-z+1/3	`12_555`	`8`	`2`	`2836`	`46.5`	`0.3`	`0.610`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`29`		[K]G:102	`1`	`1`	`216`	`f`	[K]G:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`46.2`	`-46.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.119`
29	`30`		D	`6`	`3`	`2995`	`◊`	A	-x-1,-y,z	`4_455`	`4`	`3`	`9790`	`42.8`	`0.6`	`0.613`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`31`		F	`7`	`2`	`977`	`x`	[K]D:103	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`1`	`1`	`216`	`40.7`	`-16.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.084`
31	`32`		[K]D:103	`1`	`1`	`216`	`x`	G	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`965`	`39.4`	`-15.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.082`
32	`33`		[K]G:101	`1`	`1`	`216`	`f`	[K]D:103	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`37.6`	`-37.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.097`
33	`34`		[K]D:103	`1`	`1`	`216`	`f`	[K]D:102	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`36.7`	`-36.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
34	`35`		F	`5`	`3`	`977`	`◊`	F	y,x,-z+2/3	`7_555`	`5`	`3`	`977`	`36.6`	`-4.0`	`0.186`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
35	`36`		[K]D:103	`1`	`1`	`216`	`x`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`2995`	`36.4`	`-17.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.088`
36	`37`		E	`9`	`2`	`2836`	`x`	[K]D:103	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`1`	`1`	`216`	`35.8`	`-17.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.087`
37	`38`		G	`6`	`3`	`965`	`◊`	G	x-y,-y,-z	`8_555`	`6`	`3`	`965`	`34.5`	`-3.8`	`0.224`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
38	`39`		E	`6`	`3`	`2836`	`◊`	E	y,x,-z+2/3	`7_555`	`6`	`3`	`2836`	`27.4`	`-2.8`	`0.222`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
39	`40`		D	`3`	`3`	`2995`	`◊`	D	x-y,-y,-z	`8_555`	`3`	`3`	`2995`	`20.4`	`-2.3`	`0.197`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
40	`41`		E	`1`	`1`	`2836`	`◊`	B	-y-1,-x-1,-z+2/3	`10_445`	`3`	`2`	`13586`	`17.4`	`-1.1`	`0.267`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`42`		[K]D:103	`1`	`1`	`216`	`f`	[K]D:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`14.6`	`-14.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
42	`43`		B	`4`	`2`	`13586`	`◊`	A	-x-1,-y,z	`4_455`	`2`	`2`	`9790`	`14.2`	`0.0`	`0.524`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`44`		[K]G:101	`1`	`1`	`216`	`x`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`2995`	`13.1`	`-6.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
44	`45`		E	`5`	`1`	`2836`	`x`	[K]G:101	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`1`	`1`	`216`	`13.0`	`-6.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
45	`46`		[K]G:102	`1`	`1`	`216`	`f`	[K]D:103	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`12.4`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
46	`47`		F	`3`	`1`	`977`	`x`	[K]D:102	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`1`	`1`	`216`	`11.4`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
47	`48`		[K]G:101	`1`	`1`	`216`	`f`	[K]D:102	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`10.7`	`-10.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
48	`49`		[K]D:102	`1`	`1`	`216`	`x`	G	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`965`	`10.6`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
49	`50`		E	`3`	`1`	`2836`	`◊`	G	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`4`	`1`	`965`	`10.1`	`-0.4`	`0.416`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
50	`51`		F	`3`	`1`	`977`	`◊`	D	x,x-y,-z+1/3	`12_555`	`2`	`1`	`2995`	`8.4`	`-0.7`	`0.332`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
51	`52`		G	`1`	`1`	`965`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`9790`	`2.5`	`-0.1`	`0.414`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`53`		F	`1`	`1`	`977`	`◊`	E	y,x,-z+2/3	`7_555`	`1`	`1`	`2836`	`1.2`	`-0.1`	`0.236`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`54`		F	`1`	`1`	`977`	`◊`	A	x-y,x,z+1/3	`6_555`	`2`	`1`	`9790`	`0.8`	`0.0`	`0.570`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`55`		G	`1`	`1`	`965`	`◊`	D	x-y,-y,-z	`8_555`	`1`	`1`	`2995`	`0.7`	`-0.1`	`0.256`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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