PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=898-92-173)

Interfaces in PDB 4l9y crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.10 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF RHODOBACTER SPHAEROIDES MALYL-COA LYASE IN COMPLEX WITH MAGNESIUM, GLYOXYLATE, AND PROPIONYL-COA

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`226`	`59`	`12286`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`241`	`62`	`15404`	`2160.8`	`-23.6`	`0.221`	`28`	`6`	`0`	`0.611`
	`2`		F	`225`	`56`	`15105`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`212`	`57`	`12391`	`2022.4`	`-24.8`	`0.174`	`23`	`4`	`0`	`0.611`
	`3`		C	`175`	`45`	`15624`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`151`	`42`	`15404`	`1475.2`	`-16.4`	`0.259`	`17`	`4`	`0`	`0.611`
	`4`		F	`131`	`36`	`15105`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`145`	`36`	`12338`	`1292.0`	`-16.5`	`0.193`	`17`	`4`	`0`	`0.611`
	`5`		E	`126`	`33`	`12338`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`146`	`37`	`12391`	`1233.2`	`-14.5`	`0.223`	`17`	`4`	`0`	`0.611`
	`6`		C	`123`	`34`	`15624`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`147`	`36`	`12286`	`1230.7`	`-14.1`	`0.247`	`17`	`4`	`0`	`0.611`
	*Average:*													`1569.1`	`-18.3`	`0.219`	`20`	`4`	`0`	`0.611`
2	`7`		E	`80`	`22`	`12338`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`82`	`22`	`12286`	`778.8`	`-11.4`	`0.152`	`10`	`4`	`0`	`0.353`
	`8`		D	`78`	`22`	`12391`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`84`	`22`	`15624`	`778.6`	`-11.7`	`0.136`	`9`	`2`	`0`	`0.353`
	`9`		F	`81`	`22`	`15105`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`77`	`22`	`15404`	`772.5`	`-12.0`	`0.126`	`9`	`2`	`0`	`0.353`
	*Average:*													`776.6`	`-11.7`	`0.138`	`9`	`3`	`0`	`0.353`
3	`10`		[1VU]B:401	`46`	`1`	`976`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`61`	`21`	`12286`	`525.5`	`1.4`	`0.631`	`9`	`0`	`0`	`0.055`
4	`11`		C	`41`	`8`	`15624`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`48`	`14`	`12286`	`368.8`	`-3.5`	`0.477`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
5	`12`		D	`43`	`9`	`12391`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`34`	`8`	`12286`	`338.7`	`-2.5`	`0.508`	`3`	`0`	`0`	`0.033`
	`13`		E	`40`	`9`	`12338`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`39`	`9`	`15404`	`331.3`	`-2.3`	`0.535`	`3`	`0`	`0`	`0.033`
	`14`		F	`40`	`9`	`15105`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`37`	`9`	`15624`	`328.5`	`-2.6`	`0.498`	`2`	`0`	`0`	`0.033`
	*Average:*													`332.9`	`-2.5`	`0.514`	`3`	`0`	`0`	`0.033`
6	`15`		F	`27`	`11`	`15105`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`24`	`10`	`12338`	`229.0`	`-1.8`	`0.520`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
7	`16`		F	`19`	`9`	`15105`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`20`	`10`	`15624`	`220.0`	`4.3`	`0.971`	`7`	`6`	`0`	`0.000`
8	`17`		[1VU]B:401	`16`	`1`	`976`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`15404`	`166.0`	`-2.0`	`0.248`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
9	`18`		D	`17`	`10`	`12391`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`19`	`6`	`15624`	`127.2`	`-1.8`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`19`		[GLV]D:401	`5`	`1`	`189`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`9`	`12391`	`94.8`	`2.6`	`0.669`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
11	`20`		A	`8`	`3`	`15404`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`4`	`15624`	`83.6`	`1.2`	`0.808`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
	`21`		F	`8`	`3`	`15105`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`8`	`3`	`12391`	`83.4`	`1.2`	`0.820`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`83.5`	`1.2`	`0.814`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
12	`22`		F	`11`	`3`	`15105`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`10`	`5`	`15624`	`83.3`	`0.2`	`0.722`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		E	`8`	`4`	`12338`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`10`	`2`	`15404`	`68.2`	`0.9`	`0.736`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`75.8`	`0.6`	`0.729`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`24`		[GLV]B:402	`5`	`1`	`188`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`8`	`12286`	`76.1`	`2.1`	`0.602`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
14	`25`		[CL]E:402	`1`	`1`	`125`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`12338`	`70.6`	`-11.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.376`
	`26`		[CL]F:402	`1`	`1`	`125`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`15105`	`70.4`	`-11.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.376`
	`27`		[CL]A:402	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`15404`	`69.9`	`-11.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.376`
	`28`		[CL]C:402	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`15624`	`69.7`	`-11.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.376`
	*Average:*													`70.2`	`-11.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.376`
15	`29`		F	`10`	`4`	`15105`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`8`	`5`	`12286`	`64.3`	`-0.8`	`0.514`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`30`		C	`8`	`4`	`15624`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`8`	`4`	`15404`	`64.1`	`-0.4`	`0.583`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`31`		D	`8`	`3`	`12391`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`6`	`4`	`12286`	`55.0`	`0.9`	`0.830`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`32`		[MG]A:401	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`15404`	`50.8`	`-8.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.305`
	`33`		[MG]F:401	`1`	`1`	`98`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`15105`	`50.7`	`-8.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.305`
	`34`		[MG]E:401	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`12338`	`50.4`	`-8.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.305`
	`35`		[MG]C:401	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`15624`	`49.9`	`-8.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.305`
	`36`		[MG]D:402	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`8`	`12391`	`38.0`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.305`
	`37`		[MG]B:403	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`6`	`12286`	`32.1`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.305`
	*Average:*													`45.3`	`-7.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.305`
19	`38`		[GLV]B:402	`5`	`1`	`188`	`f`	[1VU]B:401	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`976`	`39.3`	`1.3`	`0.789`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`39`		D	`4`	`2`	`12391`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`3`	`15404`	`37.4`	`-0.9`	`0.273`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`40`		F	`4`	`2`	`15105`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`6`	`2`	`12286`	`36.5`	`0.5`	`0.700`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`41`		E	`4`	`1`	`12338`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`4`	`1`	`15624`	`34.2`	`-0.8`	`0.332`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`42`		[GLV]D:401	`3`	`1`	`189`	`f`	[MG]D:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`27.3`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.061`
24	`43`		[GLV]B:402	`4`	`1`	`188`	`f`	[MG]B:403	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`23.8`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
25	`44`		[GLV]D:401	`3`	`1`	`189`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15105`	`16.6`	`0.0`	`0.329`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`45`		[1VU]B:401	`3`	`1`	`976`	`f`	[MG]B:403	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`15.6`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
27	`46`		[CL]A:402	`1`	`1`	`125`	`f`	[MG]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`13.2`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
28	`47`		[CL]C:402	`1`	`1`	`125`	`f`	[MG]C:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`13.2`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
29	`48`		[GLV]B:402	`3`	`1`	`188`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15404`	`12.6`	`0.0`	`0.342`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`49`		[CL]E:402	`1`	`1`	`125`	`f`	[MG]E:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.9`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
31	`50`		[CL]F:402	`1`	`1`	`125`	`f`	[MG]F:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.6`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
32	`51`		[MG]D:402	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15105`	`10.1`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	`52`		[MG]B:403	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15404`	`9.8`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
	*Average:*													`9.9`	`-1.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
33	`53`		F	`3`	`3`	`15105`	`◊`	[1VU]B:401	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`2`	`1`	`976`	`9.2`	`0.1`	`0.536`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`54`		A	`1`	`1`	`15404`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`1`	`1`	`12286`	`8.0`	`0.3`	`0.855`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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