PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=761-83-L1A)

Interfaces in PDB 4lvc crystal.
Space symmetry group: P 21 21 2. Resolution: 1.74 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE HYDROLASE FROM BRADYRHIZOBIUM ELKANII IN COMPLEX WITH ADENOSINE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`294`	`76`	`20545`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`294`	`76`	`20656`	`2861.0`	`-31.9`	`0.035`	`38`	`5`	`0`	`0.504`
2	`2`		D	`275`	`74`	`21565`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`281`	`76`	`20532`	`2716.8`	`-27.8`	`0.064`	`35`	`9`	`0`	`0.487`
3	`3`		C	`179`	`48`	`20532`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`180`	`48`	`20656`	`1665.6`	`-5.3`	`0.624`	`26`	`12`	`0`	`0.295`
4	`4`		D	`166`	`47`	`21565`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`168`	`44`	`20545`	`1562.5`	`-5.4`	`0.616`	`27`	`11`	`0`	`0.369`
5	`5`		[NAD]B:503	`42`	`1`	`860`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`71`	`31`	`20545`	`519.3`	`-5.3`	`0.499`	`16`	`0`	`0`	`0.399`
	`6`		[NAD]C:503	`43`	`1`	`853`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`71`	`31`	`20532`	`512.9`	`-5.5`	`0.471`	`16`	`0`	`0`	`0.399`
	`7`		[NAD]A:503	`43`	`1`	`859`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`70`	`31`	`20656`	`509.1`	`-5.8`	`0.424`	`15`	`0`	`0`	`0.399`
	*Average:*													`513.8`	`-5.5`	`0.465`	`16`	`0`	`0`	`0.399`
6	`8`		[NAD]D:501	`37`	`1`	`855`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`70`	`28`	`21565`	`506.3`	`-4.0`	`0.466`	`9`	`0`	`0`	`0.156`
7	`9`		B	`50`	`19`	`20545`	`◊`	A	-x+3/2,y-1/2,-z+2	`4_647`	`46`	`11`	`20656`	`466.1`	`-0.6`	`0.660`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
8	`10`		D	`47`	`12`	`21565`	`◊`	C	-x+3/2,y-1/2,-z+1	`4_646`	`43`	`15`	`20532`	`398.6`	`-1.2`	`0.600`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
9	`11`		C	`44`	`12`	`20532`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`43`	`12`	`20545`	`346.0`	`-5.1`	`0.169`	`1`	`2`	`0`	`0.025`
10	`12`		D	`41`	`12`	`21565`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`41`	`13`	`20656`	`339.6`	`-4.6`	`0.214`	`1`	`1`	`0`	`0.022`
11	`13`		D	`33`	`9`	`21565`	`◊`	C	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`3_456`	`38`	`11`	`20532`	`319.3`	`-1.7`	`0.501`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`14`		[ADN]B:501	`19`	`1`	`432`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`40`	`20`	`20545`	`241.5`	`0.7`	`0.396`	`9`	`0`	`0`	`0.081`
	`15`		[ADN]A:501	`19`	`1`	`433`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`45`	`20`	`20656`	`241.3`	`1.8`	`0.504`	`9`	`0`	`0`	`0.081`
	`16`		[ADN]C:501	`19`	`1`	`432`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`43`	`20`	`20532`	`239.1`	`1.5`	`0.473`	`10`	`0`	`0`	`0.081`
	*Average:*													`240.6`	`1.3`	`0.458`	`9`	`0`	`0`	`0.081`
13	`17`		B	`23`	`8`	`20545`	`x`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+2	`3_457`	`28`	`8`	`20545`	`192.2`	`-1.2`	`0.506`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`18`		[NAD]D:501	`15`	`1`	`855`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`20532`	`175.3`	`-2.1`	`0.519`	`3`	`0`	`0`	`0.065`
	`19`		[NAD]B:503	`15`	`1`	`860`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`20656`	`163.1`	`-1.9`	`0.497`	`3`	`0`	`0`	`0.065`
	`20`		[NAD]A:503	`15`	`1`	`859`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`20545`	`161.9`	`-1.9`	`0.518`	`3`	`0`	`0`	`0.065`
	*Average:*													`166.8`	`-1.9`	`0.511`	`3`	`0`	`0`	`0.065`
15	`21`		[NAD]C:503	`15`	`1`	`853`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`21565`	`164.1`	`-2.1`	`0.482`	`3`	`0`	`0`	`0.037`
16	`22`		[GOL]D:502	`6`	`1`	`218`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`21565`	`141.0`	`-0.3`	`0.563`	`3`	`0`	`0`	`0.032`
17	`23`		C	`14`	`7`	`20532`	`◊`	D	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`3_456`	`15`	`8`	`21565`	`140.0`	`1.6`	`0.778`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
18	`24`		[GOL]A:505	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`10`	`20656`	`139.0`	`-0.5`	`0.577`	`3`	`0`	`0`	`0.030`
19	`25`		[GOL]C:504	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`23`	`10`	`20532`	`137.3`	`-0.7`	`0.520`	`4`	`0`	`0`	`0.040`
20	`26`		[GOL]B:504	`6`	`1`	`217`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`20545`	`136.2`	`-0.5`	`0.576`	`4`	`0`	`0`	`0.044`
21	`27`		[ACT]C:508	`4`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`20532`	`127.3`	`-0.2`	`0.670`	`1`	`0`	`0`	`0.010`
22	`28`		[GOL]D:503	`6`	`1`	`218`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`21565`	`123.0`	`-0.4`	`0.544`	`3`	`0`	`0`	`0.034`
23	`29`		A	`14`	`5`	`20656`	`◊`	A	-x+2,-y+1,z	`2_765`	`14`	`5`	`20656`	`121.0`	`-0.0`	`0.639`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
24	`30`		[GOL]A:504	`6`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`20656`	`116.8`	`-0.7`	`0.522`	`2`	`0`	`0`	`0.025`
25	`31`		[GOL]C:507	`6`	`1`	`217`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`20532`	`114.6`	`-1.0`	`0.446`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
26	`32`		[GOL]C:505	`6`	`1`	`221`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`20532`	`108.8`	`-0.5`	`0.495`	`6`	`0`	`0`	`0.051`
27	`33`		[GOL]A:506	`6`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`20656`	`108.0`	`-0.4`	`0.500`	`5`	`0`	`0`	`0.045`
	`34`		[GOL]B:506	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`20545`	`106.9`	`-0.4`	`0.530`	`3`	`0`	`0`	`0.045`
	*Average:*													`107.4`	`-0.4`	`0.515`	`4`	`0`	`0`	`0.045`
28	`35`		[GOL]D:504	`5`	`1`	`217`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`21565`	`106.2`	`-1.0`	`0.451`	`1`	`0`	`0`	`0.027`
29	`36`		D	`12`	`5`	`21565`	`◊`	D	-x+2,-y,z	`2_755`	`12`	`5`	`21565`	`104.4`	`-0.3`	`0.599`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`37`		[GOL]D:505	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`3_456`	`17`	`4`	`20532`	`100.5`	`-0.9`	`0.465`	`1`	`0`	`0`	`0.021`
31	`38`		B	`10`	`3`	`20545`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+2	`3_457`	`13`	`4`	`20656`	`99.4`	`-0.7`	`0.507`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`39`		[GOL]C:506	`6`	`1`	`220`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`20532`	`98.3`	`-0.3`	`0.566`	`2`	`0`	`0`	`0.018`
33	`40`		[GOL]B:505	`5`	`1`	`220`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`20545`	`96.4`	`-0.3`	`0.511`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`41`		C	`9`	`5`	`20532`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`10`	`5`	`20545`	`93.2`	`0.7`	`0.750`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
35	`42`		[ACT]B:509	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`20545`	`92.4`	`-0.7`	`0.631`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
36	`43`		[ACT]B:508	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`20545`	`92.2`	`-1.1`	`0.571`	`1`	`0`	`0`	`0.029`
37	`44`		A	`11`	`6`	`20656`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+2	`3_457`	`9`	`3`	`20545`	`84.3`	`0.1`	`0.649`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
38	`45`		[GOL]B:507	`6`	`1`	`220`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`20532`	`75.4`	`-1.0`	`0.456`	`2`	`0`	`0`	`0.030`
39	`46`		C	`8`	`4`	`20532`	`x`	C	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`3_456`	`10`	`3`	`20532`	`73.6`	`1.5`	`0.806`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`47`		A	`10`	`3`	`20656`	`f`	[GOL]B:505	x-1/2,-y+1/2,-z+2	`3_457`	`5`	`1`	`220`	`70.1`	`-0.0`	`0.546`	`2`	`0`	`0`	`0.015`
41	`48`		A	`6`	`2`	`20656`	`◊`	D	x-1/2,-y+1/2,-z+2	`3_457`	`9`	`4`	`21565`	`68.1`	`-0.5`	`0.519`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`49`		[NAD]C:503	`10`	`1`	`853`	`f`	[ADN]C:501	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`432`	`66.3`	`1.1`	`0.606`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		[NAD]B:503	`11`	`1`	`860`	`f`	[ADN]B:501	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`432`	`63.9`	`0.9`	`0.597`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		[NAD]A:503	`11`	`1`	`859`	`f`	[ADN]A:501	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`433`	`62.8`	`1.0`	`0.609`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`64.3`	`1.0`	`0.604`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`52`		[GOL]A:504	`4`	`1`	`220`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`20545`	`60.2`	`-1.1`	`0.338`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
44	`53`		[GOL]B:507	`5`	`1`	`220`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`20545`	`59.9`	`0.7`	`0.725`	`3`	`0`	`0`	`0.003`
45	`54`		[GOL]C:506	`5`	`1`	`220`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`20545`	`58.9`	`-0.4`	`0.539`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
46	`55`		[GOL]D:505	`6`	`1`	`219`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`21565`	`58.8`	`-0.0`	`0.632`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
47	`56`		[GOL]B:507	`4`	`1`	`220`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`21565`	`57.3`	`-0.3`	`0.515`	`2`	`0`	`0`	`0.013`
48	`57`		[NH4]B:502	`1`	`1`	`117`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`20545`	`56.3`	`0.7`	`0.774`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`58`		[NH4]A:502	`1`	`1`	`117`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`20656`	`55.8`	`0.7`	`0.768`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`59`		[NH4]C:502	`1`	`1`	`117`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`20532`	`55.4`	`0.8`	`0.772`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`55.8`	`0.8`	`0.771`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`60`		[GOL]C:504	`5`	`1`	`219`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`21565`	`40.2`	`0.5`	`0.756`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
50	`61`		[GOL]A:505	`4`	`1`	`219`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`20545`	`37.9`	`0.2`	`0.671`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		[GOL]B:504	`5`	`1`	`217`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`20656`	`37.5`	`0.3`	`0.659`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`37.7`	`0.2`	`0.665`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`63`		[GOL]D:502	`4`	`1`	`218`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`20532`	`32.8`	`0.2`	`0.711`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`64`		[GOL]D:504	`2`	`1`	`217`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`20532`	`27.0`	`0.5`	`0.751`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
53	`65`		[NH4]A:502	`1`	`1`	`117`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`20532`	`25.0`	`0.1`	`0.660`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`66`		[NH4]C:502	`1`	`1`	`117`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`20656`	`24.5`	`0.1`	`0.701`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`24.8`	`0.1`	`0.680`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`67`		[NH4]B:502	`1`	`1`	`117`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`21565`	`24.9`	`0.1`	`0.707`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`68`		[GOL]A:504	`2`	`1`	`220`	`f`	[NAD]A:503	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`859`	`21.3`	`-0.1`	`0.579`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`69`		[NH4]A:502	`1`	`1`	`117`	`◊`	[ADN]A:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`433`	`14.9`	`0.5`	`0.827`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`70`		[NH4]C:502	`1`	`1`	`117`	`◊`	[ADN]C:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`432`	`14.8`	`0.5`	`0.827`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`71`		[NH4]B:502	`1`	`1`	`117`	`◊`	[ADN]B:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`432`	`14.2`	`0.4`	`0.827`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`14.6`	`0.5`	`0.827`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`72`		[GOL]C:506	`1`	`1`	`220`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`20656`	`10.2`	`0.2`	`0.644`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`73`		[GOL]C:505	`1`	`1`	`221`	`◊`	[GOL]A:506	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`220`	`8.6`	`0.2`	`0.500`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`74`		[GOL]A:506	`1`	`1`	`220`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`20532`	`8.1`	`-0.0`	`0.514`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
60	`75`		[GOL]C:505	`1`	`1`	`221`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`20656`	`5.8`	`-0.0`	`0.510`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`76`		[GOL]B:506	`1`	`1`	`219`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`21565`	`4.8`	`-0.0`	`0.522`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`77`		[ACT]B:508	`1`	`1`	`183`	`◊`	A	-x+3/2,y-1/2,-z+2	`4_647`	`1`	`1`	`20656`	`0.2`	`0.0`	`0.568`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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