PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=926-DD-26C)

Interfaces in PDB 4nnj crystal.
Space symmetry group: P 2 21 21. Resolution: 2.40 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF UBA1 IN COMPLEX WITH UBIQUITIN-AMP AND THIOESTERIFIED UBIQUITIN

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`192`	`56`	`45811`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`197`	`54`	`45616`	`1704.9`	`-5.8`	`0.471`	`7`	`4`	`0`	`0.000`
2	`2`		B	`138`	`30`	`5145`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`182`	`54`	`45616`	`1576.9`	`-6.5`	`0.323`	`14`	`9`	`0`	`0.290`
	`3`		D	`140`	`31`	`5107`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`178`	`56`	`45811`	`1573.2`	`-8.2`	`0.244`	`15`	`10`	`0`	`0.290`
	*Average:*													`1575.0`	`-7.3`	`0.284`	`15`	`10`	`0`	`0.290`
3	`4`		E	`88`	`21`	`5028`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`100`	`34`	`45811`	`888.6`	`-7.4`	`0.198`	`4`	`3`	`0`	`0.138`
4	`5`		C	`67`	`20`	`45811`	`◊`	A	-x,-y+1/2,z-1/2	`4_554`	`64`	`21`	`45616`	`629.1`	`-8.4`	`0.061`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
5	`6`		C	`37`	`11`	`45811`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`38`	`11`	`5028`	`341.1`	`1.0`	`0.668`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`7`		[AMP]B:101	`22`	`1`	`498`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`47`	`21`	`45616`	`334.2`	`-0.8`	`0.650`	`2`	`0`	`0`	`0.033`
	`8`		[AMP]D:101	`22`	`1`	`499`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`44`	`20`	`45811`	`312.1`	`-1.0`	`0.629`	`2`	`0`	`0`	`0.033`
	*Average:*													`323.1`	`-0.9`	`0.640`	`2`	`0`	`0`	`0.033`
7	`9`		A	`32`	`13`	`45616`	`◊`	C	-x-1,y-1/2,-z-1/2	`3_444`	`35`	`13`	`45811`	`287.8`	`5.1`	`0.917`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
8	`10`		A	`27`	`7`	`45616`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`32`	`10`	`45811`	`255.5`	`1.1`	`0.669`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
9	`11`		C	`25`	`8`	`45811`	`◊`	A	-x-1,-y+1/2,z-1/2	`4_454`	`29`	`10`	`45616`	`210.0`	`-2.1`	`0.345`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`12`		[GOL]A:1111	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`11`	`45616`	`148.2`	`0.3`	`0.643`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`13`		[GOL]A:1103	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`31`	`13`	`45616`	`146.7`	`-0.6`	`0.556`	`3`	`0`	`0`	`0.032`
12	`14`		[GOL]C:1102	`6`	`1`	`218`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`30`	`13`	`45811`	`146.7`	`-0.5`	`0.554`	`3`	`0`	`0`	`0.033`
13	`15`		[GOL]A:1102	`6`	`1`	`221`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`26`	`14`	`45616`	`146.5`	`-0.5`	`0.523`	`2`	`0`	`0`	`0.023`
14	`16`		[GOL]C:1103	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`27`	`14`	`45811`	`144.9`	`-0.8`	`0.512`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
15	`17`		[GOL]C:1109	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`24`	`9`	`45811`	`139.7`	`2.7`	`0.678`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`18`		[GOL]A:1108	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`28`	`10`	`45616`	`139.5`	`2.0`	`0.667`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
17	`19`		C	`14`	`6`	`45811`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`22`	`9`	`45616`	`134.8`	`0.6`	`0.693`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
18	`20`		[GOL]A:1117	`6`	`1`	`221`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`45616`	`132.7`	`-0.9`	`0.429`	`1`	`0`	`0`	`0.022`
19	`21`		[GOL]C:1113	`6`	`1`	`220`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`10`	`45811`	`129.8`	`0.5`	`0.583`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`22`		[GOL]C:1112	`6`	`1`	`217`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`45811`	`128.4`	`-1.0`	`0.464`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
21	`23`		[GOL]A:1104	`6`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`10`	`45616`	`126.9`	`0.7`	`0.658`	`3`	`0`	`0`	`0.011`
22	`24`		[GOL]C:1105	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`26`	`9`	`45811`	`124.5`	`-1.5`	`0.350`	`1`	`0`	`0`	`0.035`
23	`25`		[GOL]A:1109	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`8`	`45616`	`123.4`	`-1.3`	`0.385`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
24	`26`		[GOL]A:1107	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`9`	`45616`	`123.2`	`-2.8`	`0.219`	`0`	`0`	`0`	`0.047`
25	`27`		[GOL]A:1116	`6`	`1`	`221`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`45616`	`120.6`	`-0.3`	`0.507`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
26	`28`		[GOL]A:1114	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`45616`	`119.8`	`-0.9`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.016`
27	`29`		A	`14`	`3`	`45616`	`◊`	A	x,-y,-z	`2_555`	`14`	`3`	`45616`	`118.8`	`1.7`	`0.825`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
28	`30`		[GOL]A:1105	`6`	`1`	`221`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`45616`	`115.6`	`-1.3`	`0.385`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
29	`31`		[GOL]C:1106	`6`	`1`	`218`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`45811`	`114.5`	`0.0`	`0.615`	`2`	`0`	`0`	`0.015`
30	`32`		[GOL]A:1110	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`45616`	`111.8`	`0.1`	`0.616`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
31	`33`		[GOL]C:1110	`6`	`1`	`222`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`45811`	`111.3`	`0.0`	`0.573`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		[GOL]C:1107	`6`	`1`	`215`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`25`	`11`	`45811`	`110.3`	`0.4`	`0.631`	`2`	`0`	`0`	`0.008`
33	`35`		[SO4]A:1101	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`11`	`45616`	`108.3`	`-13.3`	`0.946`	`3`	`0`	`0`	`0.247`
34	`36`		[GOL]A:1106	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`45616`	`108.2`	`0.1`	`0.641`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		[SO4]C:1101	`5`	`1`	`183`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`10`	`45811`	`104.9`	`-12.3`	`0.942`	`2`	`0`	`0`	`0.235`
36	`38`		[GOL]A:1118	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`45811`	`99.9`	`-0.3`	`0.452`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
37	`39`		[GOL]A:1115	`6`	`1`	`217`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`5`	`45616`	`96.7`	`-0.2`	`0.559`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
38	`40`		[GOL]A:1113	`6`	`1`	`221`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`45616`	`96.6`	`-0.3`	`0.412`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`41`		[GOL]A:1112	`5`	`1`	`222`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`45616`	`96.1`	`-0.9`	`0.402`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
40	`42`		E	`14`	`5`	`5028`	`◊`	A	-x,-y+1/2,z-1/2	`4_554`	`10`	`3`	`45616`	`95.2`	`-0.7`	`0.402`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`43`		[GOL]A:1113	`5`	`1`	`221`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`45811`	`92.2`	`-1.5`	`0.298`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
42	`44`		[GOL]C:1104	`6`	`1`	`219`	`f`	A	-x,-y+1/2,z-1/2	`4_554`	`11`	`5`	`45616`	`86.0`	`1.1`	`0.758`	`4`	`0`	`0`	`0.012`
43	`45`		[GOL]C:1108	`6`	`1`	`220`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`45811`	`83.3`	`-0.1`	`0.511`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
44	`46`		[GOL]C:1104	`5`	`1`	`219`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`45811`	`82.6`	`-0.1`	`0.570`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`47`		[GOL]C:1111	`6`	`1`	`220`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`45811`	`77.8`	`1.0`	`0.769`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
46	`48`		[SO4]A:1119	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`45616`	`71.0`	`-9.8`	`0.700`	`1`	`0`	`0`	`0.173`
47	`49`		[GOL]A:1118	`5`	`1`	`219`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`45616`	`50.8`	`0.2`	`0.635`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`50`		[AMP]D:101	`7`	`1`	`499`	`◊`	[GOL]C:1111	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`220`	`50.0`	`0.8`	`0.717`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`51`		[SO4]C:1114	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`45811`	`47.4`	`-4.8`	`0.947`	`2`	`0`	`0`	`0.101`
50	`52`		[AMP]B:101	`5`	`1`	`498`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`5145`	`46.5`	`-2.2`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	`53`		[AMP]D:101	`5`	`1`	`499`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`5107`	`44.9`	`-2.0`	`0.261`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	*Average:*													`45.7`	`-2.1`	`0.277`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
51	`54`		[SO4]C:1114	`4`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`5107`	`44.3`	`-5.9`	`0.708`	`0`	`0`	`0`	`0.104`
52	`55`		[GOL]C:1112	`3`	`1`	`217`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`45616`	`41.5`	`0.0`	`0.579`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`56`		[GOL]C:1108	`4`	`1`	`220`	`f`	[GOL]C:1107	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`215`	`40.3`	`-0.0`	`0.529`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`57`		[SO4]C:1114	`4`	`1`	`184`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`5028`	`39.0`	`-3.9`	`0.929`	`0`	`0`	`0`	`0.056`
55	`58`		[GOL]A:1117	`3`	`1`	`221`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`45811`	`28.7`	`0.1`	`0.492`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`59`		[AMP]B:101	`3`	`1`	`498`	`◊`	[SO4]A:1101	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`185`	`24.0`	`-3.9`	`0.571`	`0`	`0`	`0`	`0.066`
57	`60`		[GOL]C:1111	`2`	`1`	`220`	`f`	[SO4]C:1101	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`183`	`20.3`	`-1.9`	`0.863`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
58	`61`		[GOL]C:1110	`1`	`1`	`222`	`f`	[GOL]A:1118	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`219`	`19.9`	`0.2`	`0.507`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`62`		[AMP]D:101	`3`	`1`	`499`	`◊`	[SO4]C:1101	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`183`	`18.3`	`-3.2`	`0.602`	`0`	`0`	`0`	`0.056`
60	`63`		E	`2`	`2`	`5028`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`5107`	`17.6`	`0.3`	`0.553`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`64`		A	`2`	`1`	`45616`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`1`	`1`	`5107`	`6.5`	`0.2`	`0.742`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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