PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=746-L8-55P)

Interfaces in PDB 4ogl crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.25 Å

X-RAY STRUCTURE URIDINE PHOSPHORYLASE FROM VIBRIO CHOLERAE IN COMPLEX WITH THYMINE AT 1.25 A RESOLUTION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`210`	`53`	`11212`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`214`	`55`	`11196`	`1883.4`	`-22.3`	`0.136`	`17`	`0`	`0`	`1.000`
	`2`		F	`218`	`56`	`10935`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`208`	`53`	`11386`	`1870.1`	`-22.1`	`0.123`	`18`	`0`	`0`	`1.000`
	`3`		B	`207`	`53`	`11340`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`214`	`57`	`10932`	`1868.6`	`-23.3`	`0.094`	`14`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1874.1`	`-22.6`	`0.118`	`16`	`0`	`0`	`1.000`
2	`4`		C	`107`	`33`	`11196`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`105`	`33`	`11340`	`1048.9`	`-20.4`	`0.013`	`6`	`6`	`0`	`1.000`
	`5`		E	`104`	`33`	`11386`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`102`	`33`	`11212`	`1040.1`	`-20.2`	`0.010`	`6`	`6`	`0`	`1.000`
	`6`		F	`103`	`33`	`10935`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`102`	`33`	`10932`	`1028.1`	`-20.4`	`0.006`	`6`	`4`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1039.0`	`-20.3`	`0.009`	`6`	`5`	`0`	`1.000`
3	`7`		D	`36`	`11`	`11212`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`49`	`14`	`10932`	`383.6`	`-2.4`	`0.549`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		F	`48`	`15`	`10935`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`36`	`11`	`11196`	`380.6`	`-2.0`	`0.588`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`382.1`	`-2.2`	`0.568`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
4	`9`		F	`21`	`8`	`10935`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`4`	`11340`	`194.5`	`2.6`	`0.822`	`5`	`4`	`0`	`0.036`
	`10`		C	`18`	`6`	`11196`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`4`	`10932`	`189.9`	`2.1`	`0.838`	`6`	`4`	`0`	`0.036`
	`11`		D	`17`	`4`	`11212`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`11340`	`187.3`	`1.9`	`0.837`	`5`	`4`	`0`	`0.036`
	`12`		F	`16`	`4`	`10935`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`6`	`11212`	`182.6`	`1.8`	`0.850`	`7`	`4`	`0`	`0.036`
	`13`		E	`16`	`4`	`11386`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`10932`	`179.7`	`1.9`	`0.751`	`4`	`4`	`0`	`0.036`
	`14`		E	`20`	`7`	`11386`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`11196`	`176.3`	`1.7`	`0.762`	`5`	`4`	`0`	`0.036`
	*Average:*													`185.0`	`2.0`	`0.810`	`5`	`4`	`0`	`0.036`
5	`15`		D	`21`	`7`	`11212`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`22`	`6`	`10932`	`181.5`	`0.0`	`0.648`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		F	`22`	`8`	`10935`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`21`	`5`	`11196`	`172.7`	`-0.1`	`0.646`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		E	`21`	`5`	`11386`	`◊`	B	x-1,y,z-1	`1_454`	`20`	`8`	`11340`	`171.4`	`-0.2`	`0.633`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`175.2`	`-0.1`	`0.643`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
6	`18`		[TDR]E:301	`9`	`1`	`261`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`27`	`12`	`11386`	`162.8`	`0.5`	`0.548`	`3`	`0`	`0`	`0.139`
	`19`		[TDR]C:301	`9`	`1`	`264`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`27`	`12`	`11196`	`161.3`	`0.5`	`0.547`	`3`	`0`	`0`	`0.139`
	`20`		[TDR]B:301	`9`	`1`	`263`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`12`	`11340`	`156.5`	`-0.7`	`0.359`	`3`	`0`	`0`	`0.139`
	`21`		[TDR]A:301	`9`	`1`	`264`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`13`	`10932`	`150.3`	`2.0`	`0.645`	`3`	`0`	`0`	`0.139`
	`22`		[TDR]F:301	`9`	`1`	`263`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`29`	`13`	`10935`	`149.3`	`2.1`	`0.666`	`3`	`0`	`0`	`0.139`
	`23`		[TDR]D:301	`9`	`1`	`265`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`27`	`12`	`11212`	`147.1`	`0.5`	`0.540`	`3`	`0`	`0`	`0.139`
	*Average:*													`154.5`	`0.8`	`0.551`	`3`	`0`	`0`	`0.139`
7	`24`		[TRS]B:303	`7`	`1`	`252`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`11`	`11340`	`119.7`	`2.3`	`0.219`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
8	`25`		[GOL]F:304	`6`	`1`	`220`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`22`	`9`	`10935`	`111.1`	`-0.8`	`0.477`	`3`	`0`	`0`	`0.117`
	`26`		[GOL]C:305	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`11196`	`106.9`	`-1.0`	`0.458`	`1`	`0`	`0`	`0.117`
	`27`		[GOL]E:304	`6`	`1`	`218`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`11386`	`94.5`	`-1.3`	`0.386`	`1`	`0`	`0`	`0.117`
	*Average:*													`104.1`	`-1.0`	`0.440`	`2`	`0`	`0`	`0.117`
9	`28`		[GOL]A:303	`6`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`8`	`10932`	`106.5`	`-0.8`	`0.463`	`2`	`0`	`0`	`0.216`
	`29`		[GOL]D:302	`6`	`1`	`219`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`11212`	`105.2`	`-1.0`	`0.452`	`2`	`0`	`0`	`0.216`
	*Average:*													`105.9`	`-0.9`	`0.458`	`2`	`0`	`0`	`0.216`
10	`30`		[EDO]F:302	`4`	`1`	`186`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`10935`	`104.5`	`3.4`	`0.539`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`31`		[EDO]C:303	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`20`	`10`	`11196`	`93.8`	`3.0`	`0.501`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`32`		[EDO]B:302	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`11340`	`89.0`	`2.1`	`0.280`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`33`		[GOL]D:303	`6`	`1`	`219`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`11212`	`83.2`	`-0.9`	`0.410`	`1`	`0`	`0`	`0.070`
14	`34`		C	`11`	`3`	`11196`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`2`	`10932`	`74.0`	`-0.3`	`0.501`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		E	`10`	`2`	`11386`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`9`	`2`	`11196`	`73.3`	`-0.4`	`0.470`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`36`		E	`9`	`2`	`11386`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`10`	`2`	`10932`	`72.0`	`-0.4`	`0.460`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`73.1`	`-0.4`	`0.477`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`37`		[GOL]D:303	`6`	`1`	`219`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`11196`	`71.6`	`0.3`	`0.670`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
16	`38`		[GOL]E:304	`6`	`1`	`218`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10935`	`70.2`	`-0.1`	`0.599`	`1`	`0`	`0`	`0.041`
	`39`		[GOL]C:305	`6`	`1`	`219`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`11212`	`66.0`	`1.1`	`0.669`	`1`	`0`	`0`	`0.041`
	`40`		[GOL]F:304	`4`	`1`	`220`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`11386`	`48.9`	`-0.4`	`0.483`	`1`	`0`	`0`	`0.041`
	*Average:*													`61.7`	`0.2`	`0.584`	`1`	`0`	`0`	`0.041`
17	`41`		[EDO]C:304	`4`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`11212`	`68.1`	`1.5`	`0.797`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`42`		[TRS]B:303	`4`	`1`	`252`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`10932`	`67.5`	`2.6`	`0.312`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`43`		[EDO]C:304	`4`	`1`	`185`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`11196`	`67.1`	`2.0`	`0.842`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`44`		[GOL]A:303	`6`	`1`	`220`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11340`	`66.6`	`0.0`	`0.565`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
	`45`		[GOL]D:302	`4`	`1`	`219`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`11196`	`42.3`	`0.3`	`0.653`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
	*Average:*													`54.5`	`0.2`	`0.609`	`1`	`0`	`0`	`0.015`
21	`46`		[EDO]C:302	`3`	`1`	`184`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`11212`	`61.3`	`1.0`	`0.189`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`47`		[EDO]E:303	`4`	`1`	`185`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`10935`	`60.5`	`1.0`	`0.557`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`48`		[EDO]A:302	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`11340`	`60.4`	`1.0`	`0.564`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`49`		[EDO]F:303	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`10932`	`59.1`	`0.7`	`0.564`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		[EDO]E:302	`4`	`1`	`186`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`11386`	`58.1`	`0.5`	`0.492`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`58.6`	`0.6`	`0.528`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`51`		[EDO]F:303	`4`	`1`	`185`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`10935`	`58.8`	`0.8`	`0.550`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		[EDO]E:302	`4`	`1`	`186`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`11212`	`56.8`	`0.6`	`0.515`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`57.8`	`0.7`	`0.533`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`53`		B	`8`	`3`	`11340`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`8`	`3`	`11386`	`54.2`	`-1.4`	`0.302`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`54`		[EDO]E:303	`4`	`1`	`185`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`11386`	`54.0`	`1.5`	`0.856`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`55`		[EDO]C:302	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`11196`	`52.1`	`1.5`	`0.859`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`56`		[EDO]A:302	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`10932`	`51.9`	`1.5`	`0.850`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`57`		[NA]E:305	`1`	`1`	`125`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`10935`	`45.8`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	`58`		[NA]C:306	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11212`	`45.4`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	`59`		[NA]A:304	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11340`	`45.3`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	`60`		[NA]C:306	`1`	`1`	`125`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11196`	`44.8`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	`61`		[NA]E:305	`1`	`1`	`125`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11386`	`44.7`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	`62`		[NA]A:304	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`10932`	`44.7`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
	*Average:*													`45.1`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.307`
31	`63`		[TRS]B:303	`4`	`1`	`252`	`f`	[TDR]B:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`263`	`44.5`	`1.6`	`0.758`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`64`		[GOL]C:305	`4`	`1`	`219`	`f`	[TDR]C:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`264`	`38.6`	`0.7`	`0.564`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		[GOL]F:304	`4`	`1`	`220`	`f`	[TDR]F:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`263`	`37.1`	`0.7`	`0.595`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`37.8`	`0.7`	`0.579`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`66`		[GOL]E:304	`4`	`1`	`218`	`f`	[TDR]E:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`261`	`37.0`	`0.5`	`0.536`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`67`		[GOL]A:303	`4`	`1`	`220`	`f`	[TDR]A:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`264`	`36.5`	`0.6`	`0.535`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`68`		[GOL]D:302	`4`	`1`	`219`	`f`	[TDR]D:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`265`	`35.3`	`0.6`	`0.589`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`35.9`	`0.6`	`0.562`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`69`		[EDO]C:303	`3`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`11340`	`29.8`	`0.2`	`0.700`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`70`		[GOL]D:303	`3`	`1`	`219`	`f`	[TDR]D:301	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`265`	`29.0`	`0.1`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`71`		D	`4`	`2`	`11212`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`4`	`2`	`11196`	`21.6`	`0.4`	`0.784`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`72`		C	`4`	`3`	`11196`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`7`	`5`	`11386`	`17.6`	`-0.1`	`0.591`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`73`		B	`5`	`3`	`11340`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`4`	`2`	`11212`	`15.5`	`0.1`	`0.663`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`16.6`	`-0.0`	`0.627`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`74`		[GOL]D:303	`2`	`1`	`219`	`f`	[GOL]D:302	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`219`	`17.5`	`0.4`	`0.589`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
40	`75`		[TDR]B:301	`3`	`1`	`263`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`10932`	`17.4`	`-0.3`	`0.356`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`76`		[TDR]E:301	`3`	`1`	`261`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10935`	`15.4`	`-0.3`	`0.322`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`77`		[TDR]A:301	`3`	`1`	`264`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`11340`	`14.4`	`-0.3`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`78`		[TDR]F:301	`3`	`1`	`263`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`11386`	`13.3`	`-0.3`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	*Average:*													`15.1`	`-0.3`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
41	`79`		C	`1`	`1`	`11196`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`2`	`1`	`10932`	`13.3`	`-0.2`	`0.323`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`80`		F	`2`	`1`	`10935`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`1`	`1`	`11212`	`6.7`	`0.0`	`0.631`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`10.0`	`-0.1`	`0.477`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`81`		[EDO]A:302	`1`	`1`	`183`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`10935`	`10.4`	`0.3`	`0.932`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`82`		[EDO]E:303	`1`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11212`	`9.4`	`0.3`	`0.928`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`83`		[EDO]C:302	`2`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11340`	`9.1`	`0.4`	`0.925`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe