PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=122-EJ-E49)

Interfaces in PDB 4r6a crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.10 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TLR8 IN COMPLEX WITH HYBRID-2

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`216`	`65`	`31564`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`219`	`68`	`31611`	`2002.0`	`-8.2`	`0.260`	`20`	`5`	`0`	`0.000`
2	`2`		B	`120`	`48`	`31564`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`128`	`49`	`31611`	`1025.8`	`14.2`	`0.986`	`14`	`6`	`0`	`0.000`
3	`3`		[HB2]A:915	`20`	`1`	`505`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`44`	`14`	`31564`	`260.2`	`-6.1`	`0.302`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`4`		[HB2]B:901	`20`	`1`	`510`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`44`	`14`	`31611`	`241.5`	`-5.6`	`0.312`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`250.8`	`-5.9`	`0.307`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		B	`30`	`9`	`31564`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`32`	`10`	`31611`	`256.0`	`-0.4`	`0.511`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		[NAG]B:903	`14`	`1`	`355`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`31`	`16`	`31564`	`221.8`	`5.1`	`0.396`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		[NAG]A:901	`14`	`1`	`358`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`32`	`16`	`31611`	`220.8`	`4.7`	`0.379`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`221.3`	`4.9`	`0.387`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		[NAG]A:906	`14`	`1`	`355`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`17`	`31611`	`217.0`	`6.4`	`0.551`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		[NAG]B:908	`13`	`1`	`357`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`30`	`17`	`31564`	`211.3`	`5.5`	`0.488`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`214.2`	`6.0`	`0.520`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
7	`10`		A	`26`	`10`	`31611`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`21`	`8`	`31611`	`205.2`	`1.7`	`0.722`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`11`		[NAG]B:913	`13`	`1`	`360`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`15`	`31564`	`188.8`	`5.6`	`0.471`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`12`		[NAG]A:910	`13`	`1`	`359`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`26`	`15`	`31611`	`184.3`	`5.4`	`0.457`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`186.5`	`5.5`	`0.464`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
9	`13`		[NAG]A:902	`13`	`1`	`360`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`8`	`31611`	`165.0`	`4.0`	`0.367`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[NAG]B:904	`13`	`1`	`352`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`31564`	`164.4`	`4.3`	`0.378`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`164.7`	`4.2`	`0.372`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`15`		[HB2]A:915	`19`	`1`	`505`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`31611`	`157.1`	`-0.3`	`0.701`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		[HB2]B:901	`17`	`1`	`510`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`31564`	`140.6`	`0.1`	`0.773`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`148.8`	`-0.1`	`0.737`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
11	`17`		B	`18`	`5`	`31564`	`x`	B	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`22`	`9`	`31564`	`153.9`	`2.1`	`0.730`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
12	`18`		B	`21`	`7`	`31564`	`◊`	[NAG]B:911	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`13`	`1`	`363`	`140.2`	`2.5`	`0.213`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
13	`19`		B	`16`	`7`	`31564`	`x`	B	-x-1,y-1/2,-z+1	`2_446`	`17`	`7`	`31564`	`138.3`	`-0.6`	`0.401`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
14	`20`		[NAG]B:917	`13`	`1`	`363`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`31564`	`135.9`	`2.9`	`0.253`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`21`		B	`17`	`7`	`31564`	`◊`	[NAG]A:905	x-1,y,z	`1_455`	`12`	`1`	`362`	`135.3`	`2.3`	`0.242`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		[NAG]B:907	`13`	`1`	`363`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`21`	`8`	`31611`	`131.7`	`2.3`	`0.168`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`133.5`	`2.3`	`0.205`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`23`		[NAG]B:914	`11`	`1`	`359`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`31564`	`130.6`	`3.9`	`0.422`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		[NAG]A:911	`10`	`1`	`361`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`31611`	`128.6`	`3.7`	`0.494`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`129.6`	`3.8`	`0.458`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
17	`25`		[NAG]B:907	`11`	`1`	`363`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`31564`	`129.0`	`3.9`	`0.391`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		[NAG]A:905	`11`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`31611`	`128.0`	`4.1`	`0.463`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`128.5`	`4.0`	`0.427`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
18	`27`		[NAG]B:916	`10`	`1`	`359`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`31564`	`128.3`	`2.2`	`0.278`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		[NAG]A:913	`11`	`1`	`360`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`31611`	`128.1`	`2.4`	`0.260`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`128.2`	`2.3`	`0.269`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`29`		[NAG]B:902	`10`	`1`	`360`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`31564`	`127.7`	`3.2`	`0.387`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`30`		[NAG]A:909	`11`	`1`	`355`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`31611`	`118.8`	`3.1`	`0.353`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
21	`31`		[NAG]B:916	`10`	`1`	`359`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`14`	`6`	`31611`	`114.4`	`3.5`	`0.378`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		B	`17`	`6`	`31564`	`◊`	[NAG]A:913	x-1,y,z	`1_455`	`10`	`1`	`360`	`102.3`	`2.4`	`0.276`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`108.3`	`2.9`	`0.327`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`33`		[NAG]A:914	`12`	`1`	`362`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`31611`	`113.5`	`2.6`	`0.273`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`34`		[NAG]B:911	`11`	`1`	`363`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`31564`	`108.0`	`2.8`	`0.341`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`35`		[NAG]A:907	`11`	`1`	`363`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`31611`	`96.9`	`2.6`	`0.284`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`36`		[NAG]B:912	`7`	`1`	`356`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`6`	`31564`	`94.5`	`3.1`	`0.510`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
26	`37`		[NAG]B:909	`10`	`1`	`363`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`31564`	`92.7`	`1.5`	`0.204`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`38`		[NAG]A:909	`11`	`1`	`355`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`11`	`3`	`31611`	`85.1`	`0.4`	`0.130`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
28	`39`		[NAG]B:902	`7`	`1`	`360`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`12`	`5`	`31611`	`84.2`	`1.3`	`0.269`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`40`		[NAG]A:907	`10`	`1`	`363`	`cf`	[NAG]A:906	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`355`	`75.9`	`1.9`	`0.081`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		[NAG]B:909	`10`	`1`	`363`	`cf`	[NAG]B:908	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`357`	`72.4`	`2.0`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`74.1`	`1.9`	`0.083`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`42`		[NAG]A:902	`9`	`1`	`360`	`cf`	[NAG]A:901	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`358`	`70.8`	`1.6`	`0.093`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`43`		[NAG]B:904	`9`	`1`	`352`	`cf`	[NAG]B:903	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`355`	`69.2`	`1.9`	`0.095`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`70.0`	`1.7`	`0.094`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
31	`44`		B	`6`	`2`	`31564`	`◊`	[HB2]B:901	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`13`	`1`	`510`	`69.6`	`-0.3`	`0.810`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`45`		[NAG]A:911	`10`	`1`	`361`	`cf`	[NAG]A:910	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`359`	`66.8`	`1.4`	`0.082`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		[NAG]B:914	`9`	`1`	`359`	`cf`	[NAG]B:913	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`360`	`65.6`	`1.1`	`0.051`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`66.2`	`1.2`	`0.066`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`47`		[MAN]A:904	`5`	`1`	`291`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`31611`	`63.4`	`1.3`	`0.442`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
34	`48`		B	`6`	`2`	`31564`	`◊`	[NAG]B:912	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`5`	`1`	`356`	`62.6`	`0.7`	`0.259`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`49`		[BMA]A:912	`5`	`1`	`292`	`cf`	[NAG]A:911	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`361`	`61.6`	`1.9`	`0.206`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`50`		[BMA]B:905	`6`	`1`	`282`	`cf`	[NAG]B:904	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`352`	`61.2`	`1.5`	`0.109`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
37	`51`		[BMA]A:908	`7`	`1`	`290`	`cf`	[NAG]A:907	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`363`	`60.5`	`1.2`	`0.130`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		[BMA]B:915	`7`	`1`	`291`	`cf`	[NAG]B:914	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`359`	`58.6`	`1.2`	`0.130`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`59.6`	`1.2`	`0.130`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`53`		[BMA]A:903	`7`	`1`	`292`	`cf`	[NAG]A:902	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`360`	`60.3`	`0.9`	`0.100`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`54`		[MAN]B:906	`5`	`1`	`289`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`31564`	`60.0`	`1.1`	`0.374`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
40	`55`		[BMA]B:910	`5`	`1`	`294`	`cf`	[NAG]B:909	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`363`	`60.0`	`1.4`	`0.150`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`56`		[MAN]B:906	`6`	`1`	`289`	`cf`	[BMA]B:905	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`282`	`58.0`	`2.9`	`0.367`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`57`		[MAN]A:904	`6`	`1`	`291`	`cf`	[BMA]A:903	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`292`	`57.9`	`2.6`	`0.229`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`58`		B	`6`	`3`	`31564`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`3`	`1`	`31611`	`42.7`	`0.2`	`0.673`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
44	`59`		[BMA]A:903	`5`	`1`	`292`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`31611`	`40.0`	`1.4`	`0.484`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`60`		[BMA]B:905	`5`	`1`	`282`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`31564`	`38.5`	`0.8`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`61`		[BMA]A:912	`5`	`1`	`292`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`31611`	`36.7`	`1.1`	`0.368`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`62`		[BMA]B:915	`5`	`1`	`291`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`31564`	`34.6`	`0.3`	`0.289`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
48	`63`		[NAG]A:907	`2`	`1`	`363`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`31564`	`31.6`	`1.5`	`0.727`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		[NAG]B:909	`1`	`1`	`363`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`31611`	`15.9`	`0.5`	`0.672`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`23.8`	`1.0`	`0.699`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`65`		[BMA]B:910	`4`	`1`	`294`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`31564`	`27.8`	`0.1`	`0.183`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`66`		[BMA]A:908	`3`	`1`	`290`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`31611`	`16.2`	`0.5`	`0.430`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`67`		A	`4`	`2`	`31611`	`x`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`2`	`1`	`31611`	`8.3`	`-0.1`	`0.459`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`68`		[MAN]A:904	`2`	`1`	`291`	`f`	[NAG]A:902	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`360`	`2.5`	`0.0`	`0.194`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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