PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=165-47-K6D)

Interfaces in PDB 4w4z crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.41 Å

STRUCTURE OF THE EPHA4 LBD IN COMPLEX WITH PEPTIDE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		H	`63`	`11`	`1349`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`75`	`28`	`9604`	`621.1`	`-10.6`	`0.196`	`7`	`1`	`0`	`1.000`
	`2`		F	`61`	`11`	`1349`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`75`	`28`	`9793`	`612.1`	`-8.3`	`0.290`	`7`	`0`	`0`	`1.000`
	`3`		G	`61`	`11`	`1342`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`74`	`28`	`9650`	`604.3`	`-8.8`	`0.266`	`7`	`0`	`0`	`1.000`
	`4`		E	`58`	`11`	`1377`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`72`	`26`	`9734`	`586.7`	`-9.2`	`0.202`	`6`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`606.0`	`-9.2`	`0.239`	`7`	`0`	`0`	`1.000`
2	`5`		D	`60`	`17`	`9604`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`54`	`16`	`9734`	`476.4`	`3.1`	`0.756`	`10`	`3`	`0`	`0.000`
	`6`		C	`52`	`15`	`9650`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`57`	`15`	`9793`	`449.1`	`3.9`	`0.809`	`12`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`462.7`	`3.5`	`0.783`	`11`	`3`	`0`	`0.000`
3	`7`		C	`45`	`11`	`9650`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`45`	`13`	`9793`	`421.1`	`-3.6`	`0.227`	`4`	`10`	`0`	`0.000`
4	`8`		A	`36`	`11`	`9734`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`30`	`10`	`9650`	`292.7`	`1.6`	`0.607`	`7`	`4`	`0`	`0.071`
	`9`		D	`24`	`8`	`9604`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`32`	`10`	`9793`	`274.1`	`1.4`	`0.618`	`7`	`4`	`0`	`0.071`
	*Average:*													`283.4`	`1.5`	`0.613`	`7`	`4`	`0`	`0.071`
5	`10`		G	`25`	`8`	`1342`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`34`	`10`	`9604`	`264.0`	`-3.6`	`0.302`	`2`	`0`	`0`	`0.161`
6	`11`		A	`31`	`13`	`9734`	`◊`	D	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`28`	`8`	`9604`	`231.7`	`-2.1`	`0.290`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
7	`12`		D	`25`	`6`	`9604`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`29`	`8`	`9793`	`225.0`	`-1.3`	`0.327`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		A	`24`	`7`	`9734`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`27`	`7`	`9650`	`209.3`	`-1.4`	`0.300`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`217.2`	`-1.4`	`0.314`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
8	`14`		A	`27`	`7`	`9734`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`21`	`5`	`9793`	`220.3`	`-0.7`	`0.421`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
	`15`		B	`26`	`7`	`9793`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`6`	`9734`	`210.3`	`-0.2`	`0.535`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`215.3`	`-0.4`	`0.478`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
9	`16`		[HEZ]D:302	`8`	`1`	`297`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`36`	`11`	`9604`	`195.8`	`6.1`	`0.250`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`17`		[HEZ]A:301	`8`	`1`	`296`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`31`	`10`	`9734`	`183.4`	`5.6`	`0.141`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`18`		B	`14`	`5`	`9793`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`21`	`9`	`9650`	`172.7`	`3.4`	`0.875`	`4`	`4`	`0`	`0.000`
	`19`		D	`21`	`10`	`9604`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`7`	`9734`	`134.0`	`0.5`	`0.624`	`0`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`153.3`	`1.9`	`0.750`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
12	`20`		[HEZ]D:303	`8`	`1`	`295`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`27`	`9`	`9604`	`160.3`	`5.3`	`0.032`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`21`		[GOL]B:304	`6`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`29`	`10`	`9793`	`149.5`	`-1.1`	`0.386`	`2`	`0`	`0`	`0.122`
14	`22`		A	`16`	`7`	`9734`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`17`	`6`	`9734`	`145.2`	`0.9`	`0.672`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		B	`15`	`7`	`9793`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`17`	`8`	`9793`	`139.0`	`0.9`	`0.671`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`142.1`	`0.9`	`0.672`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`24`		[GOL]C:304	`6`	`1`	`221`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`9650`	`129.7`	`-0.6`	`0.424`	`4`	`0`	`0`	`0.181`
16	`25`		[HEZ]B:302	`7`	`1`	`297`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`9793`	`122.9`	`3.9`	`0.005`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
17	`26`		[HEZ]B:301	`8`	`1`	`294`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`9650`	`122.7`	`3.6`	`0.004`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
18	`27`		[HEZ]B:301	`8`	`1`	`294`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`9793`	`121.5`	`3.9`	`0.004`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`28`		[HEZ]D:301	`8`	`1`	`294`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`6`	`9604`	`119.8`	`3.4`	`0.003`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
20	`29`		[HEZ]A:302	`8`	`1`	`292`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`9734`	`115.7`	`4.1`	`0.004`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`30`		[GOL]B:303	`6`	`1`	`222`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`9793`	`115.2`	`0.2`	`0.576`	`3`	`0`	`0`	`0.068`
22	`31`		[HEZ]D:301	`8`	`1`	`294`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`6`	`9734`	`113.5`	`3.9`	`0.007`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`32`		[HEZ]A:302	`8`	`1`	`292`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`9604`	`113.3`	`2.8`	`0.645`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`33`		[HEZ]B:302	`8`	`1`	`297`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`9650`	`112.6`	`3.1`	`0.596`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
25	`34`		[GOL]C:303	`6`	`1`	`219`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`9650`	`107.0`	`-0.6`	`0.449`	`2`	`0`	`0`	`0.112`
26	`35`		[GOL]D:305	`6`	`1`	`221`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`9604`	`104.2`	`0.2`	`0.559`	`4`	`0`	`0`	`0.167`
27	`36`		E	`10`	`3`	`1377`	`◊`	C	x,y,z-1	`1_554`	`8`	`4`	`9650`	`103.9`	`1.0`	`0.618`	`3`	`1`	`0`	`0.017`
	`37`		F	`8`	`3`	`1349`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`9604`	`76.9`	`-0.5`	`0.464`	`1`	`0`	`0`	`0.017`
	*Average:*													`90.4`	`0.2`	`0.541`	`2`	`1`	`0`	`0.017`
28	`38`		[GOL]H:101	`5`	`1`	`217`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`1349`	`97.5`	`-0.6`	`0.592`	`2`	`0`	`0`	`0.338`
29	`39`		[GOL]A:305	`6`	`1`	`221`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`9734`	`97.5`	`-0.6`	`0.455`	`1`	`0`	`0`	`0.108`
30	`40`		[GOL]B:306	`6`	`1`	`222`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`9793`	`95.4`	`0.6`	`0.633`	`5`	`0`	`0`	`0.097`
31	`41`		[GOL]C:302	`5`	`1`	`217`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`9650`	`90.0`	`0.2`	`0.561`	`3`	`0`	`0`	`0.086`
32	`42`		[GOL]D:304	`5`	`1`	`216`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`9604`	`89.9`	`-0.0`	`0.572`	`3`	`0`	`0`	`0.144`
33	`43`		A	`13`	`6`	`9734`	`◊`	[GOL]C:301	x,y,z-1	`1_554`	`6`	`1`	`223`	`89.9`	`-0.7`	`0.394`	`1`	`0`	`0`	`0.039`
34	`44`		[GOL]B:305	`5`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`9793`	`84.9`	`-0.3`	`0.541`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
35	`45`		[GOL]C:301	`6`	`1`	`223`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`9650`	`84.3`	`-0.3`	`0.443`	`2`	`0`	`0`	`0.092`
36	`46`		C	`7`	`2`	`9650`	`◊`	H	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`7`	`2`	`1349`	`69.8`	`-0.9`	`0.274`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`47`		[GOL]A:304	`5`	`1`	`220`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`9604`	`68.1`	`0.0`	`0.595`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
38	`48`		[GOL]A:303	`5`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`9734`	`63.7`	`0.6`	`0.675`	`2`	`0`	`0`	`0.032`
39	`49`		A	`8`	`2`	`9734`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`7`	`3`	`9604`	`63.2`	`-0.3`	`0.493`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`50`		[GOL]D:305	`4`	`1`	`221`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`3`	`9734`	`61.5`	`0.1`	`0.591`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
41	`51`		[GOL]A:303	`5`	`1`	`218`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`9604`	`60.8`	`0.7`	`0.641`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`52`		[NH2]F:13	`1`	`1`	`117`	`cf`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`1349`	`59.0`	`0.9`	`0.833`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		[NH2]E:13	`1`	`1`	`117`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`1377`	`58.5`	`0.6`	`0.802`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`54`		[NH2]H:13	`1`	`1`	`117`	`cf`	H	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`1349`	`53.2`	`0.4`	`0.820`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[NH2]G:13	`1`	`1`	`117`	`cf`	G	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`1342`	`48.1`	`0.5`	`0.820`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`54.7`	`0.6`	`0.819`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`56`		[GOL]B:303	`5`	`1`	`222`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`1349`	`58.9`	`-1.1`	`0.488`	`0`	`0`	`0`	`0.440`
44	`57`		[HEZ]A:301	`5`	`1`	`296`	`f`	D	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`6`	`2`	`9604`	`57.5`	`1.7`	`0.672`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`58`		[GOL]A:304	`5`	`1`	`220`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`9793`	`56.0`	`-0.1`	`0.574`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`59`		D	`5`	`2`	`9604`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`4`	`9793`	`54.5`	`1.3`	`0.751`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		C	`4`	`3`	`9650`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`9734`	`19.6`	`0.2`	`0.637`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`37.1`	`0.8`	`0.694`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
47	`61`		[GOL]B:305	`4`	`1`	`219`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`9650`	`50.4`	`-0.1`	`0.606`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`62`		C	`9`	`4`	`9650`	`◊`	[GOL]H:101	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`4`	`1`	`217`	`49.5`	`-0.4`	`0.475`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
49	`63`		[GOL]A:304	`5`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`9734`	`48.7`	`-0.3`	`0.480`	`2`	`0`	`0`	`0.127`
50	`64`		[GOL]C:302	`4`	`1`	`217`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`9793`	`46.0`	`0.2`	`0.653`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
51	`65`		[NH2]G:13	`1`	`1`	`117`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`7`	`3`	`9604`	`42.6`	`0.6`	`0.780`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`66`		E	`7`	`2`	`1377`	`◊`	[GOL]C:301	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`1`	`223`	`41.0`	`-0.2`	`0.587`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
53	`67`		[GOL]A:304	`3`	`1`	`220`	`f`	[HEZ]D:303	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`295`	`40.3`	`1.4`	`0.866`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
54	`68`		[GOL]D:304	`3`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`9734`	`39.4`	`-0.1`	`0.557`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`69`		B	`5`	`3`	`9793`	`◊`	[GOL]C:303	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`219`	`37.7`	`0.2`	`0.632`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
56	`70`		C	`2`	`1`	`9650`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`2`	`1`	`9604`	`35.0`	`-1.4`	`0.046`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
57	`71`		[HEZ]D:303	`4`	`1`	`295`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`9793`	`34.3`	`1.1`	`0.733`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`72`		[NH2]H:13	`1`	`1`	`117`	`f`	[GOL]H:101	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`217`	`33.0`	`0.6`	`0.866`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`73`		D	`2`	`1`	`9604`	`◊`	[GOL]A:305	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`221`	`23.8`	`0.3`	`0.643`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
60	`74`		[HEZ]D:301	`3`	`1`	`294`	`f`	[HEZ]A:302	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`292`	`23.5`	`1.2`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`75`		E	`2`	`1`	`1377`	`◊`	C	x-1,y,z-1	`1_454`	`4`	`2`	`9650`	`22.2`	`0.6`	`0.804`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`76`		D	`3`	`1`	`9604`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`1349`	`10.0`	`0.2`	`0.734`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`16.1`	`0.4`	`0.769`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`77`		[GOL]B:306	`2`	`1`	`222`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`9650`	`20.6`	`-0.2`	`0.451`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`78`		A	`2`	`1`	`9734`	`f`	[HEZ]D:302	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`3`	`1`	`297`	`19.9`	`0.6`	`0.642`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`79`		G	`1`	`1`	`1342`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`5`	`1`	`9793`	`16.3`	`0.3`	`0.724`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
65	`80`		G	`3`	`1`	`1342`	`◊`	H	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`3`	`1`	`1349`	`15.4`	`0.1`	`0.738`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
66	`81`		C	`7`	`4`	`9650`	`x`	C	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`4`	`9650`	`13.5`	`-0.0`	`0.548`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`82`		D	`2`	`2`	`9604`	`x`	D	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`2`	`9604`	`5.7`	`-0.2`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`9.6`	`-0.1`	`0.492`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
67	`83`		F	`1`	`1`	`1349`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`9734`	`5.8`	`0.1`	`0.771`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
68	`84`		[HEZ]B:302	`2`	`1`	`297`	`f`	[HEZ]B:301	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`294`	`5.0`	`0.3`	`1.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
69	`85`		G	`1`	`1`	`1342`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`9734`	`4.0`	`-0.0`	`0.586`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`86`		A	`1`	`1`	`9734`	`◊`	H	-x-1,y-1/2,-z	`2_445`	`1`	`1`	`1349`	`2.5`	`-0.0`	`0.632`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`87`		A	`1`	`1`	`9734`	`◊`	[GOL]B:305	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`219`	`0.3`	`-0.0`	`0.567`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`88`		C	`1`	`1`	`9650`	`◊`	[GOL]B:304	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`1`	`1`	`216`	`0.2`	`-0.0`	`0.546`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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