PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=729-H6-2PA)

Interfaces in PDB 4ym0 crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.30 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN GALECTIN-4 C-TERMINAL CARBOHYDRATE RECOGNITION DOMAIN IN COMPLEX WITH LACTO-N-TETRAOSE (LNT)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`85`	`22`	`7130`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`75`	`17`	`6934`	`755.7`	`-4.7`	`0.352`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	`2`		C	`77`	`21`	`7025`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`75`	`19`	`7105`	`736.2`	`-4.6`	`0.330`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`746.0`	`-4.6`	`0.341`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
2	`3`		D	`58`	`17`	`7130`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`63`	`18`	`6934`	`556.1`	`-2.6`	`0.509`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`4`		C	`54`	`16`	`7025`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`52`	`15`	`7105`	`535.3`	`-4.7`	`0.288`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`545.7`	`-3.7`	`0.398`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
3	`5`		C	`43`	`10`	`7025`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z+2	`2_447`	`39`	`14`	`6934`	`368.0`	`-4.6`	`0.243`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		B	`39`	`13`	`7105`	`◊`	D	-x-2,y-1/2,-z+3	`2_348`	`40`	`9`	`7130`	`348.5`	`-4.7`	`0.216`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`358.3`	`-4.7`	`0.229`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`7`		D	`34`	`12`	`7130`	`◊`	C	x-1,y,z+1	`1_456`	`29`	`10`	`7025`	`309.4`	`0.8`	`0.680`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
5	`8`		B	`32`	`11`	`7105`	`◊`	C	x-1,y,z+1	`1_456`	`32`	`10`	`7025`	`296.9`	`0.3`	`0.679`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
	`9`		D	`28`	`8`	`7130`	`◊`	A	x-1,y,z+1	`1_456`	`33`	`12`	`6934`	`278.3`	`0.4`	`0.695`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`287.6`	`0.4`	`0.687`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
6	`10`		C	`33`	`9`	`7025`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`7`	`6934`	`260.5`	`-2.1`	`0.184`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
7	`11`		D	`26`	`7`	`7130`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`29`	`6`	`7105`	`220.1`	`-2.6`	`0.337`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		[LAT]A:401	`19`	`1`	`480`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`6934`	`178.2`	`1.8`	`0.506`	`7`	`0`	`0`	`0.100`
	`13`		[LAT]B:401	`17`	`1`	`479`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`7105`	`173.0`	`2.0`	`0.541`	`7`	`0`	`0`	`0.100`
	`14`		[LAT]C:401	`17`	`1`	`471`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`24`	`7`	`7025`	`169.5`	`2.0`	`0.566`	`6`	`0`	`0`	`0.100`
	*Average:*													`173.5`	`1.9`	`0.538`	`7`	`0`	`0`	`0.100`
9	`15`		B	`14`	`6`	`7105`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`25`	`8`	`7025`	`153.7`	`0.1`	`0.606`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		A	`15`	`5`	`6934`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`25`	`8`	`7130`	`139.0`	`0.6`	`0.710`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`146.3`	`0.3`	`0.658`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`17`		B	`16`	`7`	`7105`	`◊`	[LAT]C:401	x-1,y,z	`1_455`	`14`	`1`	`471`	`143.7`	`1.4`	`0.524`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`18`		[GAL]D:401	`10`	`1`	`299`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`7130`	`126.7`	`1.5`	`0.301`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
12	`19`		[GOL]A:404	`6`	`1`	`221`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`6934`	`111.7`	`1.5`	`0.766`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
13	`20`		[NAG]B:402	`8`	`1`	`364`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`7105`	`103.1`	`2.1`	`0.400`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		[NAG]A:402	`7`	`1`	`362`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`8`	`6934`	`102.8`	`2.0`	`0.434`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`103.0`	`2.0`	`0.417`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
14	`22`		A	`13`	`5`	`6934`	`◊`	[NAG]D:402	x,y,z-1	`1_554`	`8`	`1`	`374`	`98.8`	`1.9`	`0.410`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`23`		[NAG]D:402	`9`	`1`	`374`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`7130`	`84.6`	`1.3`	`0.218`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`24`		A	`10`	`3`	`6934`	`◊`	[GAL]D:401	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`1`	`299`	`67.6`	`1.1`	`0.432`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`25`		[GAL]A:403	`8`	`1`	`292`	`cf`	[NAG]A:402	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`362`	`66.7`	`1.9`	`0.114`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`26`		[NAG]B:402	`7`	`1`	`364`	`cf`	[LAT]B:401	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`479`	`65.7`	`2.1`	`0.325`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		[NAG]A:402	`7`	`1`	`362`	`cf`	[LAT]A:401	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`480`	`65.1`	`2.1`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`65.4`	`2.1`	`0.300`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`28`		[GAL]B:403	`6`	`1`	`293`	`cf`	[NAG]B:402	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`364`	`63.4`	`1.8`	`0.141`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`29`		[GAL]D:401	`7`	`1`	`299`	`cf`	[NAG]D:402	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`374`	`62.9`	`2.1`	`0.123`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`30`		D	`8`	`2`	`7130`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`3`	`7025`	`60.5`	`0.9`	`0.739`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`31`		[NAG]D:402	`4`	`1`	`374`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`7105`	`15.8`	`0.5`	`0.357`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`32`		A	`1`	`1`	`6934`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`7025`	`14.5`	`-0.1`	`0.350`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`33`		B	`3`	`1`	`7105`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z+3	`2_448`	`3`	`1`	`6934`	`13.1`	`0.1`	`0.654`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`34`		[LAT]B:401	`4`	`1`	`479`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`2`	`7025`	`11.7`	`-0.4`	`0.294`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		[LAT]A:401	`3`	`1`	`480`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`7130`	`3.6`	`-0.1`	`0.324`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`7.6`	`-0.2`	`0.309`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`36`		[GOL]A:404	`3`	`1`	`221`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`7025`	`8.0`	`0.0`	`0.518`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`37`		[GAL]B:403	`2`	`1`	`293`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`7105`	`5.2`	`0.3`	`0.461`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`38`		[GAL]A:403	`1`	`1`	`292`	`f`	[LAT]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`480`	`2.5`	`0.1`	`0.235`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`39`		[GAL]B:403	`1`	`1`	`293`	`f`	[LAT]B:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`479`	`1.9`	`0.1`	`0.235`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`40`		[GAL]A:403	`1`	`1`	`292`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`6934`	`1.7`	`0.1`	`0.355`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`41`		[GAL]A:403	`1`	`1`	`292`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`7130`	`1.0`	`0.0`	`0.363`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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