PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=372-C1-HMA)

Interfaces in PDB 5a9k

STRUCTURAL BASIS FOR DNA STRAND SEPARATION BY A HEXAMERIC REPLICATIVE HELICASE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`188`	`52`	`14567`	`◊`	B	`208`	`56`	`13883`	`1840.6`	`-8.3`	`0.598`	`12`	`8`	`0`	`0.000`
	`2`		B	`193`	`56`	`13883`	`◊`	C	`205`	`52`	`13969`	`1776.0`	`-11.1`	`0.500`	`20`	`7`	`0`	`0.000`
	`3`		C	`182`	`53`	`13969`	`◊`	D	`185`	`52`	`14299`	`1711.0`	`-9.0`	`0.557`	`23`	`9`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1775.9`	`-9.5`	`0.552`	`18`	`8`	`0`	`0.000`
2	`4`		D	`177`	`54`	`14299`	`◊`	E	`183`	`51`	`14311`	`1696.9`	`-9.2`	`0.521`	`20`	`6`	`0`	`0.000`
	`5`		E	`170`	`52`	`14311`	`◊`	F	`173`	`45`	`14510`	`1547.0`	`-10.5`	`0.448`	`18`	`4`	`0`	`0.000`
	`6`		A	`159`	`44`	`14567`	`◊`	F	`157`	`45`	`14510`	`1401.1`	`-5.0`	`0.643`	`11`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1548.3`	`-8.3`	`0.538`	`16`	`5`	`0`	`0.000`
3	`7`		E	`19`	`9`	`14311`	`◊`	[PO4]E:1579	`5`	`1`	`190`	`111.2`	`-7.5`	`0.720`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
4	`8`		F	`18`	`8`	`14510`	`◊`	[PO4]F:1580	`5`	`1`	`189`	`104.6`	`-7.1`	`0.667`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
5	`9`		D	`21`	`9`	`14299`	`◊`	[PO4]D:1580	`5`	`1`	`188`	`104.3`	`-6.9`	`0.717`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
6	`10`		A	`18`	`9`	`14567`	`◊`	[PO4]A:1580	`5`	`1`	`188`	`80.7`	`-5.3`	`0.721`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
7	`11`		B	`22`	`9`	`13883`	`◊`	[PO4]B:1579	`5`	`1`	`188`	`80.3`	`-5.4`	`0.706`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		C	`17`	`7`	`13969`	`◊`	[PO4]C:1579	`5`	`1`	`187`	`79.7`	`-5.3`	`0.727`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
9	`13`		C	`20`	`7`	`13969`	`◊`	[PO4]C:1580	`5`	`1`	`185`	`74.7`	`-4.3`	`0.740`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
10	`14`		B	`17`	`7`	`13883`	`◊`	[PO4]B:1580	`5`	`1`	`188`	`73.5`	`-4.2`	`0.726`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
11	`15`		A	`14`	`7`	`14567`	`◊`	[PO4]A:1581	`5`	`1`	`186`	`73.2`	`-3.7`	`0.847`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
12	`16`		B	`10`	`4`	`13883`	`◊`	[PO4]A:1581	`5`	`1`	`186`	`50.1`	`-1.9`	`0.918`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
13	`17`		C	`11`	`5`	`13969`	`◊`	[PO4]B:1580	`4`	`1`	`188`	`45.6`	`-1.5`	`0.945`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
14	`18`		D	`9`	`5`	`14299`	`◊`	[PO4]C:1580	`4`	`1`	`185`	`41.4`	`-1.1`	`0.951`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`19`		E	`5`	`3`	`14311`	`◊`	[PO4]D:1580	`4`	`1`	`188`	`39.3`	`-1.9`	`0.845`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
16	`20`		A	`12`	`6`	`14567`	`◊`	[MG]A:1582	`1`	`1`	`98`	`33.2`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		C	`12`	`5`	`13969`	`◊`	[MG]C:1581	`1`	`1`	`98`	`32.8`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		B	`11`	`4`	`13883`	`◊`	[MG]B:1581	`1`	`1`	`98`	`31.8`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`32.6`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`23`		[PO4]C:1579	`4`	`1`	`187`	`◊`	[PO4]C:1580	`4`	`1`	`185`	`31.9`	`-2.9`	`0.973`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`24`		[PO4]B:1579	`4`	`1`	`188`	`◊`	[PO4]B:1580	`4`	`1`	`188`	`31.4`	`-3.0`	`0.973`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`25`		[PO4]A:1580	`4`	`1`	`188`	`◊`	[PO4]A:1581	`4`	`1`	`186`	`31.0`	`-2.9`	`0.973`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`26`		C	`4`	`3`	`13969`	`◊`	[PO4]B:1579	`4`	`1`	`188`	`23.8`	`-0.8`	`0.921`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`27`		A	`4`	`3`	`14567`	`◊`	[PO4]F:1580	`4`	`1`	`189`	`23.7`	`-0.8`	`0.897`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`28`		F	`4`	`2`	`14510`	`◊`	[PO4]E:1579	`3`	`1`	`190`	`23.5`	`-1.1`	`0.852`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`29`		[PO4]C:1579	`1`	`1`	`187`	`◊`	[MG]C:1581	`1`	`1`	`98`	`21.3`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		[PO4]B:1579	`3`	`1`	`188`	`◊`	[MG]B:1581	`1`	`1`	`98`	`21.2`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		[PO4]A:1580	`4`	`1`	`188`	`◊`	[MG]A:1582	`1`	`1`	`98`	`21.0`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`21.2`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`32`		[PO4]A:1581	`4`	`1`	`186`	`◊`	[MG]A:1582	`1`	`1`	`98`	`21.1`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`33`		[PO4]B:1580	`4`	`1`	`188`	`◊`	[MG]B:1581	`1`	`1`	`98`	`20.6`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		[PO4]C:1580	`3`	`1`	`185`	`◊`	[MG]C:1581	`1`	`1`	`98`	`20.2`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`20.6`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`35`		D	`4`	`3`	`14299`	`◊`	[PO4]C:1579	`3`	`1`	`187`	`20.0`	`-0.6`	`0.893`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`36`		B	`5`	`3`	`13883`	`◊`	[PO4]A:1580	`4`	`1`	`188`	`18.9`	`-0.6`	`0.923`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`37`		D	`3`	`3`	`14299`	`◊`	[MG]C:1581	`1`	`1`	`98`	`18.6`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		C	`3`	`3`	`13969`	`◊`	[MG]B:1581	`1`	`1`	`98`	`16.7`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`39`		B	`4`	`4`	`13883`	`◊`	[MG]A:1582	`1`	`1`	`98`	`16.0`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`17.1`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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