PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=437-EM-61L)

Interfaces in PDB 5c3y crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.60 Å

STRUCTURE OF HUMAN RIBOKINASE CRYSTALLIZED WITH AMPPNP

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`121`	`35`	`14510`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`120`	`35`	`14105`	`1263.8`	`-20.0`	`0.068`	`15`	`0`	`0`	`0.296`
	`2`		F	`118`	`35`	`14238`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`116`	`35`	`13984`	`1244.6`	`-18.6`	`0.104`	`13`	`0`	`0`	`0.296`
	`3`		D	`121`	`35`	`14065`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`119`	`36`	`14242`	`1237.6`	`-19.5`	`0.086`	`15`	`0`	`0`	`0.296`
	`4`		L	`115`	`35`	`13980`	`◊`	K	x,y,z	`1_555`	`115`	`35`	`14116`	`1232.2`	`-19.6`	`0.089`	`13`	`0`	`0`	`0.296`
	`5`		J	`118`	`35`	`14135`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`117`	`35`	`14380`	`1230.1`	`-19.3`	`0.082`	`15`	`0`	`0`	`0.296`
	`6`		H	`113`	`34`	`13989`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`118`	`35`	`14488`	`1219.3`	`-18.8`	`0.091`	`12`	`0`	`0`	`0.296`
	*Average:*													`1237.9`	`-19.3`	`0.087`	`14`	`0`	`0`	`0.296`
2	`7`		H	`59`	`18`	`13989`	`◊`	G	x-1,y,z	`1_455`	`51`	`15`	`14488`	`579.0`	`-6.6`	`0.227`	`5`	`3`	`0`	`0.000`
	`8`		E	`63`	`19`	`13984`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`48`	`15`	`14238`	`531.3`	`-6.4`	`0.172`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`555.1`	`-6.5`	`0.199`	`4`	`4`	`0`	`0.000`
3	`9`		I	`49`	`12`	`14380`	`◊`	J	x-1,y,z	`1_455`	`57`	`19`	`14135`	`528.4`	`-5.7`	`0.220`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	`10`		L	`60`	`19`	`13980`	`◊`	K	x-1,y,z	`1_455`	`45`	`13`	`14116`	`502.5`	`-7.0`	`0.180`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		D	`58`	`18`	`14065`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`46`	`15`	`14242`	`498.7`	`-6.4`	`0.192`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
	`12`		B	`40`	`11`	`14510`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`54`	`17`	`14105`	`457.4`	`-6.3`	`0.120`	`5`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`496.8`	`-6.4`	`0.178`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
4	`13`		H	`53`	`15`	`13989`	`◊`	K	x-1,y,z	`1_455`	`50`	`14`	`14116`	`463.7`	`-0.7`	`0.713`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		E	`51`	`16`	`13984`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`46`	`14`	`14242`	`438.8`	`-0.8`	`0.766`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`451.2`	`-0.8`	`0.739`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
5	`15`		[AN2]G:401	`26`	`1`	`567`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`55`	`22`	`14488`	`394.1`	`-4.9`	`0.519`	`5`	`0`	`0`	`0.156`
	`16`		[AN2]E:401	`27`	`1`	`562`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`50`	`20`	`13984`	`387.5`	`-3.6`	`0.571`	`6`	`0`	`0`	`0.156`
	`17`		[AN2]L:401	`27`	`1`	`558`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`51`	`20`	`13980`	`387.0`	`-4.4`	`0.542`	`4`	`0`	`0`	`0.156`
	`18`		[AN2]A:401	`27`	`1`	`558`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`50`	`20`	`14105`	`386.5`	`-4.6`	`0.504`	`5`	`0`	`0`	`0.156`
	`19`		[AN2]J:401	`27`	`1`	`559`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`51`	`21`	`14135`	`385.7`	`-4.8`	`0.543`	`5`	`0`	`0`	`0.156`
	`20`		[AN2]D:401	`27`	`1`	`556`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`51`	`20`	`14065`	`384.4`	`-4.6`	`0.537`	`5`	`0`	`0`	`0.156`
	`21`		[AN2]F:401	`27`	`1`	`572`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`51`	`20`	`14238`	`384.4`	`-5.0`	`0.496`	`5`	`0`	`0`	`0.156`
	`22`		[AN2]B:401	`27`	`1`	`561`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`53`	`20`	`14510`	`383.7`	`-4.8`	`0.509`	`4`	`0`	`0`	`0.156`
	`23`		[AN2]K:401	`27`	`1`	`558`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`51`	`20`	`14116`	`383.2`	`-5.1`	`0.519`	`5`	`0`	`0`	`0.156`
	`24`		[AN2]I:401	`27`	`1`	`558`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`51`	`20`	`14380`	`381.8`	`-4.8`	`0.488`	`5`	`0`	`0`	`0.156`
	`25`		[AN2]C:401	`27`	`1`	`557`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`49`	`20`	`14242`	`381.2`	`-4.7`	`0.484`	`4`	`0`	`0`	`0.156`
	`26`		[AN2]H:401	`27`	`1`	`551`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`52`	`20`	`13989`	`381.0`	`-4.5`	`0.523`	`3`	`0`	`0`	`0.156`
	*Average:*													`385.1`	`-4.6`	`0.520`	`5`	`0`	`0`	`0.156`
6	`27`		E	`37`	`13`	`13984`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`41`	`12`	`14510`	`369.8`	`-1.9`	`0.542`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		I	`40`	`13`	`14380`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`37`	`13`	`13989`	`359.1`	`-1.8`	`0.519`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`364.4`	`-1.9`	`0.530`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`29`		I	`46`	`11`	`14380`	`◊`	L	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`38`	`9`	`13980`	`345.4`	`3.1`	`0.898`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
	`30`		D	`33`	`10`	`14065`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`34`	`7`	`14510`	`288.8`	`1.0`	`0.767`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`317.1`	`2.0`	`0.833`	`4`	`1`	`0`	`0.000`
8	`31`		G	`39`	`15`	`14488`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`38`	`10`	`14510`	`333.3`	`-1.1`	`0.703`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`32`		G	`30`	`11`	`14488`	`◊`	L	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`39`	`13`	`13980`	`332.7`	`-0.3`	`0.756`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
10	`33`		J	`33`	`10`	`14135`	`◊`	E	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`34`	`8`	`13984`	`297.8`	`-0.4`	`0.786`	`5`	`3`	`0`	`0.000`
11	`34`		D	`36`	`12`	`14065`	`◊`	F	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`29`	`8`	`14238`	`294.4`	`-0.4`	`0.760`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
12	`35`		H	`29`	`6`	`13989`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`24`	`9`	`14105`	`256.3`	`-2.2`	`0.457`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`36`		H	`31`	`9`	`13989`	`◊`	F	x-1,y,z	`1_455`	`29`	`9`	`14238`	`255.3`	`0.3`	`0.812`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
14	`37`		G	`27`	`14`	`14488`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`23`	`11`	`14105`	`243.8`	`-3.9`	`0.261`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`38`		I	`26`	`8`	`14380`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`24`	`10`	`14238`	`215.1`	`0.4`	`0.708`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`39`		L	`18`	`5`	`13980`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`25`	`7`	`14380`	`168.3`	`-0.8`	`0.648`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		D	`17`	`5`	`14065`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`21`	`6`	`14510`	`146.0`	`-0.7`	`0.659`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`41`		C	`21`	`6`	`14242`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`5`	`14105`	`136.5`	`-1.7`	`0.485`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		K	`19`	`6`	`14116`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`14135`	`121.1`	`-1.7`	`0.481`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`143.0`	`-1.2`	`0.568`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`43`		G	`19`	`6`	`14488`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`17`	`5`	`13984`	`166.6`	`1.4`	`0.849`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
18	`44`		J	`20`	`11`	`14135`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`20`	`7`	`14238`	`157.4`	`-2.6`	`0.385`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`45`		K	`17`	`8`	`14116`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`14380`	`150.6`	`1.1`	`0.847`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
	`46`		C	`15`	`7`	`14242`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`15`	`7`	`14510`	`117.0`	`0.5`	`0.761`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`133.8`	`0.8`	`0.804`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
20	`47`		C	`10`	`4`	`14242`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`14`	`4`	`14105`	`97.8`	`2.3`	`0.915`	`1`	`3`	`0`	`0.000`
	`48`		J	`11`	`4`	`14135`	`◊`	K	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`10`	`4`	`14116`	`76.9`	`2.1`	`0.902`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`87.4`	`2.2`	`0.909`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
21	`49`		[NA]F:403	`1`	`1`	`125`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`14238`	`87.5`	`-10.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.237`
	`50`		[NA]K:403	`1`	`1`	`125`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`17`	`10`	`14116`	`86.0`	`-10.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.237`
	`51`		[NA]D:403	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`14065`	`85.5`	`-10.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.237`
	`52`		[NA]E:403	`1`	`1`	`125`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`17`	`10`	`13984`	`84.9`	`-10.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.237`
	`53`		[NA]J:403	`1`	`1`	`125`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`14135`	`84.7`	`-10.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.237`
	`54`		[NA]H:403	`1`	`1`	`125`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`13989`	`84.7`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.237`
	`55`		[NA]B:403	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`14510`	`84.3`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.237`
	`56`		[NA]C:403	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`14242`	`84.3`	`-10.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.237`
	`57`		[NA]A:403	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`14105`	`84.2`	`-10.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.237`
	`58`		[NA]I:403	`1`	`1`	`125`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`14380`	`83.6`	`-9.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.237`
	`59`		[NA]L:403	`1`	`1`	`125`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`13980`	`83.5`	`-9.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.237`
	`60`		[NA]G:403	`1`	`1`	`125`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`18`	`9`	`14488`	`82.5`	`-9.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.237`
	*Average:*													`84.6`	`-10.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.237`
22	`61`		H	`6`	`3`	`13989`	`◊`	L	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`11`	`4`	`13980`	`78.3`	`-1.4`	`0.326`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		D	`10`	`3`	`14065`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`5`	`2`	`13984`	`73.5`	`-1.3`	`0.318`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`75.9`	`-1.4`	`0.322`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`63`		J	`8`	`2`	`14135`	`◊`	L	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`11`	`5`	`13980`	`77.2`	`-1.2`	`0.432`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		D	`1`	`1`	`14065`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`1`	`1`	`14105`	`0.6`	`0.0`	`0.699`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`38.9`	`-0.6`	`0.565`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`65`		[NA]A:402	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`9`	`14105`	`66.7`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.284`
	`66`		[NA]B:402	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`8`	`14510`	`66.4`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.284`
	`67`		[NA]J:402	`1`	`1`	`125`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`12`	`8`	`14135`	`66.3`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.284`
	`68`		[NA]D:402	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`9`	`14065`	`66.2`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.284`
	`69`		[NA]C:402	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`14242`	`66.1`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.284`
	`70`		[NA]I:402	`1`	`1`	`125`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`14380`	`66.0`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.284`
	`71`		[NA]L:402	`1`	`1`	`125`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`14`	`9`	`13980`	`65.9`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.284`
	`72`		[NA]F:402	`1`	`1`	`125`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`14238`	`65.8`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.284`
	`73`		[NA]K:402	`1`	`1`	`125`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`14116`	`65.8`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.284`
	`74`		[NA]H:402	`1`	`1`	`125`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`12`	`8`	`13989`	`65.8`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.284`
	`75`		[NA]E:402	`1`	`1`	`125`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`12`	`8`	`13984`	`65.8`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.284`
	`76`		[NA]G:402	`1`	`1`	`125`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`14488`	`65.5`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.284`
	*Average:*													`66.0`	`-12.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.284`
25	`77`		[NA]G:403	`1`	`1`	`125`	`f`	[AN2]G:401	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`567`	`25.7`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`78`		[NA]L:403	`1`	`1`	`125`	`f`	[AN2]L:401	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`558`	`24.0`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`79`		[NA]H:403	`1`	`1`	`125`	`f`	[AN2]H:401	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`551`	`22.6`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`80`		[NA]I:403	`1`	`1`	`125`	`f`	[AN2]I:401	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`558`	`22.1`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`81`		[NA]B:403	`1`	`1`	`125`	`f`	[AN2]B:401	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`561`	`22.1`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`82`		[NA]J:403	`1`	`1`	`125`	`f`	[AN2]J:401	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`559`	`20.4`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`83`		[NA]A:403	`1`	`1`	`125`	`f`	[AN2]A:401	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`558`	`19.7`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`84`		[NA]C:403	`1`	`1`	`125`	`f`	[AN2]C:401	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`557`	`19.7`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`85`		[NA]D:403	`1`	`1`	`125`	`f`	[AN2]D:401	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`556`	`19.7`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`86`		[NA]K:403	`1`	`1`	`125`	`f`	[AN2]K:401	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`558`	`19.5`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`87`		[NA]F:403	`1`	`1`	`125`	`f`	[AN2]F:401	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`572`	`18.8`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	`88`		[NA]E:403	`1`	`1`	`125`	`f`	[AN2]E:401	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`562`	`15.0`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
	*Average:*													`20.8`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
26	`89`		H	`4`	`3`	`13989`	`◊`	J	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`2`	`14135`	`15.1`	`-0.3`	`0.527`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`90`		E	`2`	`1`	`13984`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`14105`	`9.5`	`-0.3`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`12.3`	`-0.3`	`0.457`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`91`		L	`3`	`1`	`13980`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`13989`	`10.5`	`0.2`	`0.663`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`92`		D	`1`	`1`	`14065`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`13984`	`7.4`	`0.1`	`0.474`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`8.9`	`0.2`	`0.569`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`93`		D	`2`	`2`	`14065`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`2`	`2`	`14105`	`4.9`	`0.2`	`0.748`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`94`		J	`1`	`1`	`14135`	`◊`	L	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`1`	`1`	`13980`	`0.2`	`-0.0`	`0.638`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`2.5`	`0.1`	`0.693`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`95`		[AN2]L:401	`1`	`1`	`558`	`◊`	K	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`14116`	`0.9`	`0.0`	`0.486`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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