PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=577-CL-BLB)

Interfaces in PDB 5cb7 crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.35 Å

CRYSTALLOGRAPHIC STRUCTURE OF HUMAN ROTAVIRUS K8 VP8* IN COMPLEX WITH A-TYPE HBGA

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`73`	`24`	`7603`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`73`	`24`	`7568`	`743.3`	`-1.3`	`0.467`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
2	`2`		B	`55`	`17`	`7603`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`55`	`17`	`7568`	`538.2`	`-3.1`	`0.289`	`11`	`0`	`0`	`0.000`
3	`3`		B	`39`	`11`	`7603`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`34`	`12`	`7568`	`333.2`	`4.2`	`0.883`	`7`	`5`	`0`	`0.000`
4	`4`		B	`36`	`11`	`7603`	`◊`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`34`	`11`	`7568`	`325.5`	`-3.9`	`0.139`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		B	`29`	`10`	`7603`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`26`	`8`	`7568`	`217.3`	`3.0`	`0.845`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
6	`6`		[A2G]A:301	`11`	`1`	`358`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`7568`	`167.1`	`5.1`	`0.403`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		[A2G]B:301	`11`	`1`	`359`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`9`	`7603`	`102.6`	`3.2`	`0.398`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		[A2G]B:304	`11`	`1`	`362`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`9`	`7603`	`101.7`	`3.1`	`0.404`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`123.8`	`3.8`	`0.402`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
7	`9`		B	`16`	`5`	`7603`	`◊`	[FUC]A:303	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`8`	`1`	`279`	`108.1`	`0.8`	`0.210`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		[FUC]B:306	`10`	`1`	`279`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`14`	`5`	`7568`	`81.0`	`0.1`	`0.153`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		[FUC]B:303	`9`	`1`	`280`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`14`	`5`	`7568`	`78.3`	`0.2`	`0.149`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`89.1`	`0.4`	`0.171`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		[GOL]B:308	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`7603`	`104.1`	`-0.2`	`0.515`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
9	`13`		[GLA]A:302	`9`	`1`	`302`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`7568`	`102.9`	`1.7`	`0.318`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		[GLA]B:302	`8`	`1`	`302`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`7603`	`61.2`	`1.0`	`0.339`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`82.1`	`1.3`	`0.329`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
10	`15`		[GOL]B:307	`6`	`1`	`222`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`23`	`8`	`7603`	`100.6`	`0.4`	`0.569`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
11	`16`		[A2G]B:304	`14`	`1`	`362`	`f`	[A2G]B:301	x,y,z	`1_555`	`14`	`1`	`359`	`94.0`	`4.0`	`0.049`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`17`		A	`8`	`4`	`7568`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`8`	`5`	`7568`	`89.1`	`-2.0`	`0.109`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`18`		[GOL]B:308	`6`	`1`	`219`	`f`	[GOL]B:307	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`222`	`80.3`	`-0.6`	`0.383`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`19`		[FUC]B:306	`9`	`1`	`279`	`f`	[FUC]B:303	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`280`	`79.1`	`2.8`	`0.197`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`20`		[GAL]B:305	`12`	`1`	`301`	`f`	[GLA]B:302	x,y,z	`1_555`	`12`	`1`	`302`	`76.3`	`2.6`	`0.109`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`21`		[CL]B:309	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`7603`	`64.2`	`-9.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`22`		[GLA]A:302	`6`	`1`	`302`	`cf`	[A2G]A:301	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`358`	`63.5`	`2.6`	`0.105`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`23`		[GLA]B:302	`7`	`1`	`302`	`cf`	[A2G]B:304	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`362`	`35.2`	`1.4`	`0.085`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		[GLA]B:302	`6`	`1`	`302`	`cf`	[A2G]B:301	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`359`	`34.1`	`1.4`	`0.136`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`44.3`	`1.8`	`0.109`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`25`		[GAL]B:305	`7`	`1`	`301`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`7603`	`60.9`	`1.0`	`0.360`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`26`		[FUC]A:303	`6`	`1`	`279`	`cf`	[GLA]A:302	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`302`	`57.5`	`2.6`	`0.243`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`27`		[CL]B:310	`1`	`1`	`125`	`f`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`12`	`6`	`7568`	`51.8`	`-7.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`28`		[CL]B:310	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`7603`	`47.8`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`29`		B	`4`	`3`	`7603`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`4`	`3`	`7568`	`43.5`	`0.4`	`0.590`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`30`		[A2G]B:301	`4`	`1`	`359`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`3`	`7568`	`42.2`	`0.5`	`0.316`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		[A2G]B:304	`5`	`1`	`362`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`3`	`7568`	`41.7`	`0.5`	`0.242`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`41.9`	`0.5`	`0.279`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`32`		B	`8`	`3`	`7603`	`◊`	[A2G]A:301	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`1`	`358`	`41.7`	`0.4`	`0.249`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`33`		[FUC]A:303	`3`	`1`	`279`	`f`	[A2G]A:301	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`358`	`40.9`	`2.1`	`0.155`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`34`		[FUC]B:303	`3`	`1`	`280`	`f`	[A2G]B:304	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`362`	`27.5`	`1.4`	`0.205`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		[FUC]B:306	`3`	`1`	`279`	`f`	[A2G]B:304	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`362`	`24.5`	`1.3`	`0.171`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`31.0`	`1.6`	`0.177`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`36`		A	`6`	`2`	`7568`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`3`	`1`	`7568`	`39.8`	`0.6`	`0.744`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`37`		[GAL]B:305	`5`	`1`	`301`	`cf`	[FUC]B:306	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`279`	`37.4`	`1.6`	`0.224`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`38`		[GAL]B:305	`5`	`1`	`301`	`cf`	[FUC]B:303	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`280`	`37.0`	`1.6`	`0.205`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`37.2`	`1.6`	`0.215`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`39`		[GAL]B:305	`7`	`1`	`301`	`cf`	[A2G]B:304	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`362`	`35.7`	`1.5`	`0.076`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`40`		[GAL]B:305	`6`	`1`	`301`	`cf`	[A2G]B:301	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`359`	`35.1`	`1.4`	`0.137`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`41`		[FUC]B:303	`6`	`1`	`280`	`cf`	[GLA]B:302	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`302`	`32.8`	`1.5`	`0.201`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`42`		[FUC]B:306	`6`	`1`	`279`	`cf`	[GLA]B:302	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`302`	`32.5`	`1.5`	`0.206`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`32.7`	`1.5`	`0.204`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`43`		[FUC]B:303	`3`	`1`	`280`	`f`	[A2G]B:301	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`359`	`26.9`	`1.5`	`0.192`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		[FUC]B:306	`3`	`1`	`279`	`f`	[A2G]B:301	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`359`	`23.8`	`1.3`	`0.155`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`25.4`	`1.4`	`0.173`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`45`		B	`2`	`1`	`7603`	`x`	B	-x,y-1/2,-z-1	`2_544`	`5`	`2`	`7603`	`26.7`	`0.6`	`0.776`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`46`		[A2G]B:304	`5`	`1`	`362`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`4`	`1`	`7568`	`20.2`	`0.5`	`0.266`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`47`		[A2G]B:301	`4`	`1`	`359`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`4`	`1`	`7568`	`20.0`	`0.5`	`0.293`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`20.1`	`0.5`	`0.280`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`48`		B	`2`	`1`	`7603`	`◊`	[A2G]A:301	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`3`	`1`	`358`	`17.5`	`0.6`	`0.306`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`49`		[GOL]B:308	`1`	`1`	`219`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`7568`	`8.0`	`0.4`	`0.676`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`50`		[GOL]B:307	`1`	`1`	`222`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`7568`	`7.1`	`0.4`	`0.673`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`51`		[GAL]B:305	`3`	`1`	`301`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`7568`	`5.3`	`0.0`	`0.115`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`52`		B	`1`	`1`	`7603`	`◊`	[GLA]A:302	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`2`	`1`	`302`	`4.8`	`0.0`	`0.284`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`53`		[GLA]B:302	`3`	`1`	`302`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`1`	`1`	`7568`	`3.6`	`-0.0`	`0.158`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`4.2`	`-0.0`	`0.221`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`54`		[FUC]B:303	`1`	`1`	`280`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`1`	`7568`	`1.7`	`-0.0`	`0.310`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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in Europe

Bringing Structure to Biology

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