PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=856-E5-24B)

Interfaces in PDB 5ccg crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 3.50 Å

STRUCTURE OF THE CA2+-BOUND SYNAPTOTAGMIN-1 SNARE COMPLEX (LONG UNIT CELL FORM)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`157`	`37`	`6312`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`171`	`36`	`6324`	`1431.4`	`-23.2`	`0.318`	`10`	`9`	`0`	`0.897`
	`2`		H	`147`	`35`	`6210`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`156`	`36`	`6124`	`1332.2`	`-28.1`	`0.192`	`5`	`4`	`0`	`0.897`
	*Average:*													`1381.8`	`-25.7`	`0.255`	`8`	`7`	`0`	`0.897`
2	`3`		C	`154`	`40`	`7043`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`146`	`37`	`6312`	`1419.1`	`-27.2`	`0.264`	`10`	`6`	`0`	`1.000`
	`4`		I	`149`	`37`	`7021`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`143`	`36`	`6210`	`1390.3`	`-29.9`	`0.240`	`7`	`9`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1404.7`	`-28.5`	`0.252`	`9`	`8`	`0`	`1.000`
3	`5`		J	`139`	`33`	`6366`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`147`	`37`	`7021`	`1364.0`	`-22.0`	`0.250`	`8`	`2`	`0`	`1.000`
	`6`		D	`127`	`32`	`6143`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`141`	`37`	`7043`	`1324.1`	`-20.4`	`0.197`	`12`	`13`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1344.0`	`-21.2`	`0.223`	`10`	`8`	`0`	`1.000`
4	`7`		D	`144`	`36`	`6143`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`145`	`35`	`6324`	`1326.1`	`-21.0`	`0.138`	`11`	`5`	`0`	`0.810`
	`8`		J	`130`	`33`	`6366`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`136`	`32`	`6124`	`1228.7`	`-18.6`	`0.199`	`9`	`7`	`0`	`0.810`
	*Average:*													`1277.4`	`-19.8`	`0.168`	`10`	`6`	`0`	`0.810`
5	`9`		F	`79`	`22`	`14429`	`x`	F	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`92`	`25`	`14429`	`788.6`	`-0.3`	`0.688`	`10`	`3`	`0`	`0.000`
6	`10`		E	`60`	`18`	`15344`	`◊`	K	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`52`	`17`	`15127`	`487.7`	`0.4`	`0.727`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	`11`		E	`49`	`15`	`15344`	`◊`	K	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`53`	`15`	`15127`	`462.0`	`0.6`	`0.745`	`6`	`4`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`474.8`	`0.5`	`0.736`	`5`	`3`	`0`	`0.000`
7	`12`		E	`57`	`18`	`15344`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`44`	`12`	`7043`	`483.7`	`-3.7`	`0.558`	`2`	`4`	`0`	`0.032`
	`13`		K	`48`	`16`	`15127`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`38`	`10`	`7021`	`443.5`	`-2.4`	`0.652`	`2`	`5`	`0`	`0.032`
	*Average:*													`463.6`	`-3.1`	`0.605`	`2`	`5`	`0`	`0.032`
8	`14`		I	`31`	`15`	`7021`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`38`	`14`	`6124`	`306.6`	`-8.2`	`0.106`	`1`	`0`	`0`	`0.136`
	`15`		C	`31`	`14`	`7043`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`11`	`6324`	`255.1`	`-6.8`	`0.125`	`1`	`0`	`0`	`0.136`
	*Average:*													`280.8`	`-7.5`	`0.115`	`1`	`0`	`0`	`0.136`
9	`16`		D	`34`	`15`	`6143`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`30`	`13`	`6312`	`302.9`	`-8.8`	`0.071`	`1`	`1`	`0`	`0.122`
	`17`		J	`28`	`13`	`6366`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`25`	`11`	`6210`	`240.4`	`-8.4`	`0.061`	`0`	`0`	`0`	`0.122`
	*Average:*													`271.6`	`-8.6`	`0.066`	`1`	`1`	`0`	`0.122`
10	`18`		E	`42`	`12`	`15344`	`◊`	I	x,y-1,z	`1_545`	`20`	`6`	`7021`	`298.7`	`-5.9`	`0.150`	`1`	`0`	`0`	`0.042`
	`19`		C	`20`	`6`	`7043`	`◊`	K	x,y-1,z	`1_545`	`31`	`10`	`15127`	`262.1`	`-4.8`	`0.222`	`2`	`0`	`0`	`0.042`
	*Average:*													`280.4`	`-5.3`	`0.186`	`2`	`0`	`0`	`0.042`
11	`20`		F	`29`	`10`	`14429`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`29`	`7`	`6312`	`289.3`	`-1.1`	`0.732`	`5`	`7`	`0`	`0.000`
12	`21`		F	`37`	`11`	`14429`	`◊`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`28`	`8`	`6324`	`284.2`	`-2.6`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`22`		B	`27`	`6`	`6312`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`29`	`5`	`6124`	`250.1`	`0.4`	`0.849`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`23`		H	`27`	`6`	`6210`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`25`	`5`	`6324`	`228.4`	`0.1`	`0.791`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`239.2`	`0.2`	`0.820`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
14	`24`		B	`19`	`5`	`6312`	`◊`	K	x,y-1,z	`1_545`	`25`	`10`	`15127`	`217.9`	`-1.9`	`0.580`	`5`	`1`	`0`	`0.028`
	`25`		E	`24`	`10`	`15344`	`◊`	H	x,y-1,z	`1_545`	`20`	`5`	`6210`	`190.6`	`-1.9`	`0.591`	`4`	`1`	`0`	`0.028`
	*Average:*													`204.2`	`-1.9`	`0.586`	`5`	`1`	`0`	`0.028`
15	`26`		K	`22`	`7`	`15127`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`25`	`6`	`6366`	`214.9`	`-0.4`	`0.654`	`4`	`0`	`0`	`0.011`
	`27`		E	`25`	`7`	`15344`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`26`	`7`	`6143`	`193.6`	`-1.1`	`0.604`	`3`	`0`	`0`	`0.011`
	*Average:*													`204.2`	`-0.8`	`0.629`	`4`	`0`	`0`	`0.011`
16	`28`		F	`17`	`4`	`14429`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`14`	`6`	`6312`	`183.5`	`-1.1`	`0.495`	`0`	`4`	`0`	`0.000`
17	`29`		H	`17`	`5`	`6210`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`5`	`6312`	`155.3`	`1.6`	`0.937`	`2`	`7`	`0`	`0.000`
18	`30`		E	`16`	`6`	`15344`	`◊`	K	x-1,y-1,z	`1_445`	`18`	`6`	`15127`	`150.7`	`-0.1`	`0.636`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`31`		G	`8`	`5`	`6124`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`6324`	`80.9`	`2.9`	`0.917`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
20	`32`		K	`8`	`2`	`15127`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`6210`	`65.6`	`1.2`	`0.870`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
	`33`		E	`4`	`2`	`15344`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`6312`	`41.5`	`1.2`	`0.891`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`53.6`	`1.2`	`0.881`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
21	`34`		E	`7`	`3`	`15344`	`◊`	J	x,y-1,z	`1_545`	`6`	`2`	`6366`	`55.4`	`0.4`	`0.727`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`35`		[CA]E:503	`1`	`1`	`85`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`15344`	`49.4`	`-9.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.092`
	`36`		[CA]K:503	`1`	`1`	`85`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`15127`	`32.4`	`-9.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.092`
	`37`		[CA]K:504	`1`	`1`	`85`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`7`	`6`	`15127`	`31.3`	`-7.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.092`
	*Average:*													`37.7`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.092`
23	`38`		[CA]E:504	`1`	`1`	`85`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`15344`	`47.8`	`-11.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
24	`39`		[CA]F:503	`1`	`1`	`85`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`14429`	`44.2`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
25	`40`		[CA]E:501	`1`	`1`	`85`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`15344`	`43.0`	`-11.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.076`
	`41`		[CA]K:502	`1`	`1`	`85`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`15127`	`42.2`	`-10.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.076`
	*Average:*													`42.6`	`-10.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.076`
26	`42`		[CA]K:501	`1`	`1`	`85`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`15127`	`43.0`	`-12.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
27	`43`		[CA]F:504	`1`	`1`	`85`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`14429`	`42.5`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
28	`44`		[CA]A:101	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`6324`	`41.1`	`-7.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.170`
29	`45`		[CA]F:501	`1`	`1`	`85`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`14429`	`39.5`	`-11.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
30	`46`		[CA]C:102	`1`	`1`	`85`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`7043`	`39.4`	`-7.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.157`
31	`47`		[CA]A:102	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`6324`	`39.1`	`-6.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.139`
32	`48`		[CA]F:502	`1`	`1`	`85`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`14429`	`37.0`	`-10.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
33	`49`		[CA]C:101	`1`	`1`	`85`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`6143`	`29.5`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.086`
34	`50`		[CA]C:101	`1`	`1`	`85`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`7043`	`25.8`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.096`
35	`51`		F	`3`	`2`	`14429`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`7043`	`25.2`	`0.5`	`0.790`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`52`		[CA]G:101	`1`	`1`	`85`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`6124`	`22.8`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.122`
37	`53`		[CA]C:103	`1`	`1`	`85`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`7043`	`21.6`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.073`
38	`54`		[CA]C:102	`1`	`1`	`85`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`6143`	`20.7`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
39	`55`		E	`4`	`2`	`15344`	`◊`	[CA]K:504	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`1`	`1`	`85`	`20.0`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		[CA]E:503	`1`	`1`	`85`	`◊`	K	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`3`	`1`	`15127`	`17.7`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`18.9`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`57`		C	`3`	`1`	`7043`	`◊`	I	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`7021`	`19.5`	`0.1`	`0.674`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`58`		[CA]K:504	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]K:503	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`17.6`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.018`
42	`59`		F	`4`	`2`	`14429`	`◊`	[CA]F:504	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`85`	`14.5`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`60`		[CA]F:502	`1`	`1`	`85`	`◊`	F	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`2`	`1`	`14429`	`13.8`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`61`		[CA]G:101	`1`	`1`	`85`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`6366`	`13.4`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.068`
45	`62`		[CA]A:102	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]A:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`11.3`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.078`
46	`63`		[CA]E:502	`1`	`1`	`85`	`◊`	K	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`2`	`2`	`15127`	`10.6`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		E	`1`	`1`	`15344`	`◊`	[CA]K:503	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`1`	`1`	`85`	`2.4`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`6.5`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`65`		[CA]E:504	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]E:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`7.6`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
48	`66`		[CA]F:502	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]F:501	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`6.5`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
49	`67`		[CA]C:103	`1`	`1`	`85`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15344`	`4.7`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
50	`68`		[CA]F:501	`1`	`1`	`85`	`◊`	F	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`14429`	`4.2`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`69`		[CA]E:503	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]E:502	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`2.9`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
52	`70`		[CA]A:102	`1`	`1`	`85`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`6143`	`0.6`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`

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