PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=435-G3-4F3)

Interfaces in PDB 5cm7 crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 1.55 Å

STRUCTURE OF THIAMINE-MONOPHOSPHATE KINASE FROM ACINETOBACTER BAUMANNII IN COMPLEX WITH ADENOSINE DIPHOSPHATE (ADP) AND THIAMINE DIPHOSPHATE (TPP)

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`252`	`73`	`14013`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`261`	`73`	`14190`	`2418.3`	`-32.3`	`0.027`	`36`	`10`	`0`	`0.204`
2	`2`		[TPP]A:405	`26`	`1`	`598`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`57`	`19`	`14190`	`358.2`	`-4.5`	`0.562`	`5`	`0`	`0`	`0.052`
	`3`		[TPP]B:401	`26`	`1`	`595`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`56`	`19`	`14013`	`357.2`	`-3.8`	`0.670`	`5`	`0`	`0`	`0.052`
	*Average:*													`357.7`	`-4.2`	`0.616`	`5`	`0`	`0`	`0.052`
3	`4`		A	`41`	`10`	`14190`	`◊`	B	-x+3,y-1/2,-z+3	`2_848`	`36`	`11`	`14013`	`351.4`	`1.2`	`0.833`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		A	`30`	`6`	`14190`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`48`	`11`	`14190`	`347.3`	`3.4`	`0.911`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
5	`6`		A	`40`	`12`	`14190`	`◊`	B	-x+2,y-1/2,-z+2	`2_747`	`35`	`13`	`14013`	`337.7`	`-0.7`	`0.649`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
6	`7`		[ADP]B:405	`24`	`1`	`555`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`49`	`16`	`14013`	`261.5`	`-1.4`	`0.768`	`4`	`0`	`0`	`0.027`
	`8`		[ADP]A:401	`26`	`1`	`554`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`48`	`17`	`14190`	`260.8`	`-1.5`	`0.727`	`4`	`0`	`0`	`0.027`
	*Average:*													`261.2`	`-1.5`	`0.748`	`4`	`0`	`0`	`0.027`
7	`9`		A	`18`	`7`	`14190`	`◊`	B	x-1,y,z-1	`1_454`	`24`	`8`	`14013`	`188.0`	`1.3`	`0.824`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
8	`10`		B	`22`	`6`	`14013`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`23`	`6`	`14013`	`184.7`	`-0.4`	`0.656`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
9	`11`		[ADP]A:401	`10`	`1`	`554`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`14013`	`91.4`	`-2.8`	`0.402`	`2`	`0`	`0`	`0.030`
	`12`		[ADP]B:405	`10`	`1`	`555`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`14190`	`89.0`	`-2.7`	`0.444`	`2`	`0`	`0`	`0.030`
	*Average:*													`90.2`	`-2.8`	`0.423`	`2`	`0`	`0`	`0.030`
10	`13`		[TPP]A:405	`4`	`1`	`598`	`f`	[ADP]B:405	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`555`	`41.9`	`-4.0`	`0.272`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
	`14`		[TPP]B:401	`4`	`1`	`595`	`f`	[ADP]A:401	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`554`	`41.9`	`-3.9`	`0.273`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
	*Average:*													`41.9`	`-4.0`	`0.272`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
11	`15`		[NA]B:408	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`14013`	`37.7`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
	`16`		[NA]A:404	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`14190`	`37.4`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
	*Average:*													`37.5`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.044`
12	`17`		[MG]A:408	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`14190`	`32.7`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
	`18`		[MG]B:404	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`14013`	`32.1`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
	*Average:*													`32.4`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
13	`19`		[TPP]B:401	`4`	`1`	`595`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`14190`	`31.5`	`-1.7`	`0.456`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	`20`		[TPP]A:405	`4`	`1`	`598`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`14013`	`31.3`	`-1.7`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	*Average:*													`31.4`	`-1.7`	`0.459`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
14	`21`		[NA]B:408	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`14190`	`27.6`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	`22`		[NA]A:404	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`14013`	`27.5`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
	*Average:*													`27.6`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
15	`23`		[CA]B:403	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`14013`	`26.4`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
	`24`		[CA]A:407	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`14190`	`25.8`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
	*Average:*													`26.1`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.038`
16	`25`		[CA]B:406	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`14190`	`25.7`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
	`26`		[CA]A:402	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`14013`	`25.4`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
	*Average:*													`25.5`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
17	`27`		[TPP]A:405	`5`	`1`	`598`	`f`	[CA]A:407	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`25.6`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
	`28`		[TPP]B:401	`5`	`1`	`595`	`f`	[CA]B:403	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`25.2`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
	*Average:*													`25.4`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.045`
18	`29`		[CA]B:402	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`14013`	`25.2`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	`30`		[CA]A:406	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`14190`	`25.0`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
	*Average:*													`25.1`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
19	`31`		[MG]B:407	`1`	`1`	`98`	`f`	[ADP]B:405	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`555`	`23.8`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
	`32`		[MG]A:403	`1`	`1`	`98`	`f`	[ADP]A:401	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`554`	`23.1`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
	*Average:*													`23.5`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
20	`33`		[TPP]A:405	`3`	`1`	`598`	`f`	[CA]B:406	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`23.2`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
	`34`		[TPP]B:401	`3`	`1`	`595`	`f`	[CA]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`22.9`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
	*Average:*													`23.1`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.039`
21	`35`		[NA]A:404	`1`	`1`	`125`	`f`	[ADP]B:405	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`555`	`22.5`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
	`36`		[NA]B:408	`1`	`1`	`125`	`f`	[ADP]A:401	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`554`	`21.6`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
	*Average:*													`22.1`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
22	`37`		[MG]A:408	`1`	`1`	`98`	`f`	[ADP]B:405	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`555`	`21.8`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
	`38`		[MG]B:404	`1`	`1`	`98`	`f`	[ADP]A:401	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`554`	`21.5`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
	*Average:*													`21.6`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
23	`39`		[MG]A:408	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`14013`	`20.8`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
	`40`		[MG]B:404	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`14190`	`20.7`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
	*Average:*													`20.7`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
24	`41`		[TPP]B:401	`4`	`1`	`595`	`f`	[MG]A:403	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`20.7`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
	`42`		[TPP]A:405	`4`	`1`	`598`	`f`	[MG]B:407	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`20.3`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
	*Average:*													`20.5`	`-2.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
25	`43`		[CA]B:406	`1`	`1`	`85`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`14013`	`18.9`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
	`44`		[CA]A:402	`1`	`1`	`85`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`14190`	`18.7`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
	*Average:*													`18.8`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
26	`45`		[TPP]A:405	`3`	`1`	`598`	`f`	[CA]A:406	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`18.1`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
	`46`		[TPP]B:401	`3`	`1`	`595`	`f`	[CA]B:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`18.0`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
	*Average:*													`18.1`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.026`
27	`47`		[MG]A:403	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`14190`	`17.1`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
	`48`		[MG]B:407	`1`	`1`	`98`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`14013`	`17.0`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
	*Average:*													`17.0`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`
28	`49`		[CA]B:402	`1`	`1`	`85`	`f`	[ADP]A:401	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`554`	`16.7`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
	`50`		[CA]A:406	`1`	`1`	`85`	`f`	[ADP]B:405	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`555`	`16.6`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
	*Average:*													`16.7`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
29	`51`		[MG]B:407	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`14190`	`13.6`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
	`52`		[MG]A:403	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`14013`	`13.6`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
	*Average:*													`13.6`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
30	`53`		[CA]B:403	`1`	`1`	`85`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`14190`	`13.4`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	`54`		[CA]A:407	`1`	`1`	`85`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`14013`	`13.3`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	*Average:*													`13.3`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
31	`55`		[CA]A:407	`1`	`1`	`85`	`f`	[ADP]B:405	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`555`	`12.7`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	`56`		[CA]B:403	`1`	`1`	`85`	`f`	[ADP]A:401	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`554`	`12.5`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
	*Average:*													`12.6`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.021`
32	`57`		[NA]A:404	`1`	`1`	`125`	`f`	[MG]B:407	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.7`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
33	`58`		[NA]B:408	`1`	`1`	`125`	`f`	[MG]A:403	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.7`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
34	`59`		[MG]A:403	`1`	`1`	`98`	`f`	[CA]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`8.0`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
35	`60`		[MG]B:407	`1`	`1`	`98`	`f`	[CA]B:406	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`8.0`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
36	`61`		[NA]A:404	`1`	`1`	`125`	`f`	[CA]A:406	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`7.8`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
37	`62`		[NA]B:408	`1`	`1`	`125`	`f`	[CA]B:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`7.6`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
38	`63`		[MG]A:403	`1`	`1`	`98`	`f`	[CA]B:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`6.8`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
39	`64`		[MG]B:407	`1`	`1`	`98`	`f`	[CA]A:406	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`6.7`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
40	`65`		[MG]B:404	`1`	`1`	`98`	`f`	[CA]B:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`6.6`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
41	`66`		[MG]A:408	`1`	`1`	`98`	`f`	[CA]A:406	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`6.4`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
42	`67`		[TPP]A:405	`3`	`1`	`598`	`f`	[NA]A:404	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`5.3`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
	`68`		[TPP]B:401	`3`	`1`	`595`	`f`	[NA]B:408	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`4.9`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
	*Average:*													`5.1`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
43	`69`		[CA]B:406	`1`	`1`	`85`	`f`	[ADP]B:405	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`555`	`3.9`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
	`70`		[CA]A:402	`1`	`1`	`85`	`f`	[ADP]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`554`	`3.9`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
	*Average:*													`3.9`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
44	`71`		[TPP]B:401	`1`	`1`	`595`	`f`	[MG]B:404	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`3.2`	`-0.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
	`72`		[TPP]A:405	`2`	`1`	`598`	`f`	[MG]A:408	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`3.0`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
	*Average:*													`3.1`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
45	`73`		A	`1`	`1`	`14190`	`x`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`1`	`1`	`14190`	`1.6`	`-0.0`	`0.585`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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