PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=686-4H-644)

Interfaces in PDB 5cx6 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 2. Resolution: 2.10 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF THOSEA ASIGNA VIRUS RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE (RDRP) COMPLEXED WITH CDP

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`319`	`77`	`30562`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`321`	`77`	`30442`	`3012.1`	`-39.7`	`0.003`	`47`	`5`	`0`	`0.206`
2	`2`		A	`62`	`21`	`30442`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`63`	`22`	`30562`	`585.8`	`-1.8`	`0.516`	`10`	`4`	`0`	`0.000`
3	`3`		B	`53`	`18`	`30562`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`43`	`14`	`30442`	`444.0`	`-1.5`	`0.513`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
4	`4`		A	`40`	`12`	`30442`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`37`	`11`	`30562`	`336.8`	`0.4`	`0.622`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		A	`44`	`13`	`30442`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`31`	`8`	`30562`	`310.0`	`-3.5`	`0.220`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`6`		[CDP]A:721	`25`	`1`	`521`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`43`	`17`	`30442`	`302.9`	`-6.2`	`0.483`	`2`	`0`	`0`	`0.024`
7	`7`		[CDP]B:713	`21`	`1`	`461`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`37`	`16`	`30562`	`293.1`	`-5.4`	`0.355`	`2`	`0`	`0`	`0.021`
8	`8`		[GOL]A:709	`6`	`1`	`217`	`f`	B	x,y,z-1	`1_554`	`17`	`7`	`30562`	`121.2`	`0.8`	`0.713`	`6`	`0`	`0`	`0.006`
9	`9`		[GOL]B:707	`6`	`1`	`221`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`30562`	`120.8`	`0.9`	`0.694`	`6`	`0`	`0`	`0.006`
10	`10`		[GOL]A:719	`6`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`30442`	`120.4`	`-0.9`	`0.482`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
11	`11`		[GOL]B:708	`6`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`24`	`7`	`30562`	`118.7`	`-0.4`	`0.515`	`3`	`0`	`0`	`0.006`
12	`12`		[GOL]A:708	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`30442`	`117.5`	`-0.5`	`0.494`	`1`	`0`	`0`	`0.003`
13	`13`		[GOL]B:710	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`30562`	`115.7`	`-1.0`	`0.423`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
14	`14`		[SO4]A:702	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`30442`	`115.2`	`-16.0`	`0.792`	`7`	`0`	`0`	`0.064`
15	`15`		[GOL]B:706	`6`	`1`	`217`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`30562`	`115.1`	`-0.2`	`0.567`	`6`	`0`	`0`	`0.009`
16	`16`		[GOL]A:713	`6`	`1`	`220`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`30442`	`114.4`	`0.9`	`0.728`	`4`	`0`	`0`	`0.003`
17	`17`		[SO4]B:702	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`30562`	`113.0`	`-15.8`	`0.800`	`5`	`0`	`0`	`0.061`
18	`18`		[GOL]A:710	`6`	`1`	`217`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`7`	`30442`	`111.4`	`0.1`	`0.632`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		[GOL]A:711	`6`	`1`	`217`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`6`	`30562`	`71.1`	`0.1`	`0.683`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`91.3`	`0.1`	`0.657`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		[SO4]B:705	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`30562`	`108.4`	`-16.8`	`0.794`	`8`	`0`	`0`	`0.068`
20	`21`		[SO4]A:707	`5`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`30442`	`105.8`	`-16.0`	`0.791`	`5`	`0`	`0`	`0.061`
21	`22`		[GOL]B:709	`6`	`1`	`216`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`30562`	`102.8`	`0.3`	`0.611`	`3`	`0`	`0`	`0.003`
22	`23`		[GOL]A:714	`6`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`30442`	`100.8`	`0.8`	`0.697`	`4`	`0`	`0`	`0.003`
23	`24`		[SO4]B:703	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`30562`	`100.4`	`-14.0`	`0.742`	`4`	`0`	`0`	`0.053`
24	`25`		[SO4]A:705	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`30442`	`98.6`	`-14.1`	`0.729`	`3`	`0`	`0`	`0.052`
25	`26`		[GOL]A:716	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`30442`	`97.6`	`-0.7`	`0.470`	`1`	`0`	`0`	`0.004`
26	`27`		[GOL]A:712	`6`	`1`	`219`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`30442`	`96.9`	`-1.1`	`0.395`	`2`	`0`	`0`	`0.007`
27	`28`		[GOL]B:711	`5`	`1`	`220`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`30562`	`94.9`	`-1.4`	`0.337`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
28	`29`		[SO4]A:703	`5`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`30442`	`94.1`	`-11.9`	`0.850`	`5`	`0`	`0`	`0.047`
29	`30`		[GOL]A:717	`6`	`1`	`215`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`30442`	`93.5`	`-0.7`	`0.493`	`2`	`0`	`0`	`0.005`
30	`31`		[GOL]A:718	`6`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`30442`	`92.6`	`-0.1`	`0.552`	`2`	`0`	`0`	`0.003`
31	`32`		[SO4]B:704	`5`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`8`	`30562`	`92.1`	`-13.4`	`0.779`	`4`	`0`	`0`	`0.051`
32	`33`		[SO4]A:704	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`30442`	`90.1`	`-13.2`	`0.766`	`4`	`0`	`0`	`0.050`
33	`34`		[SO4]B:701	`5`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`30562`	`89.6`	`-13.5`	`0.701`	`1`	`0`	`0`	`0.047`
34	`35`		[GOL]B:712	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`30562`	`73.7`	`-1.1`	`0.343`	`1`	`0`	`0`	`0.005`
35	`36`		[SO4]A:701	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`30442`	`73.1`	`-9.0`	`0.838`	`3`	`0`	`0`	`0.035`
36	`37`		[SO4]A:706	`5`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`30442`	`59.1`	`-6.8`	`0.922`	`3`	`0`	`0`	`0.027`
37	`38`		A	`9`	`4`	`30442`	`x`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`6`	`3`	`30442`	`57.5`	`-0.1`	`0.386`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`39`		[GOL]B:712	`3`	`1`	`219`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`7`	`3`	`30442`	`54.5`	`-0.0`	`0.492`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`40`		[GOL]A:710	`5`	`1`	`217`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`3`	`30562`	`50.0`	`0.8`	`0.796`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
40	`41`		[GOL]A:711	`5`	`1`	`217`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`30442`	`49.7`	`1.3`	`0.844`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
41	`42`		[GOL]A:715	`4`	`1`	`218`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`30562`	`49.2`	`-0.2`	`0.413`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
42	`43`		[GOL]A:711	`4`	`1`	`217`	`f`	[GOL]A:710	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`217`	`46.5`	`-1.0`	`0.441`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
43	`44`		[MG]A:720	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`30562`	`45.9`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
44	`45`		[SO4]A:703	`4`	`1`	`183`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`2`	`30562`	`44.0`	`-5.0`	`0.866`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
45	`46`		[GOL]A:715	`4`	`1`	`218`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`30442`	`43.0`	`1.0`	`0.792`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
46	`47`		[SO4]B:701	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`3`	`2`	`30442`	`40.2`	`-3.2`	`0.969`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
47	`48`		[MG]A:720	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`30442`	`40.1`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.015`
48	`49`		[GOL]B:709	`4`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`30442`	`39.9`	`-0.5`	`0.472`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
49	`50`		[SO4]A:701	`3`	`1`	`185`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`2`	`1`	`30562`	`39.4`	`-3.8`	`0.977`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
50	`51`		[GOL]A:709	`3`	`1`	`217`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`30442`	`35.5`	`0.5`	`0.755`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
51	`52`		[GOL]A:716	`3`	`1`	`218`	`f`	[GOL]A:713	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`220`	`31.8`	`0.5`	`0.736`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
52	`53`		B	`5`	`2`	`30562`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z+1	`3_546`	`3`	`2`	`30442`	`31.2`	`0.3`	`0.671`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`54`		[GOL]A:714	`2`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`30562`	`30.9`	`0.3`	`0.666`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`55`		[SO4]A:701	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`3`	`2`	`30442`	`29.9`	`-3.5`	`0.510`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`56`		[SO4]A:704	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`30562`	`23.0`	`-2.5`	`0.741`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
56	`57`		[SO4]A:706	`3`	`1`	`185`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`2`	`1`	`30562`	`22.5`	`-2.2`	`0.964`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
57	`58`		[GOL]A:712	`3`	`1`	`219`	`f`	[GOL]A:708	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`218`	`22.2`	`-0.2`	`0.517`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`59`		[GOL]B:711	`4`	`1`	`220`	`f`	[GOL]B:710	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`219`	`20.2`	`0.1`	`0.547`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`60`		[SO4]B:704	`3`	`1`	`186`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`30442`	`16.9`	`-1.9`	`0.761`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
60	`61`		B	`3`	`1`	`30562`	`x`	B	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`2`	`30562`	`14.4`	`0.3`	`0.729`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
61	`62`		[GOL]B:708	`2`	`1`	`218`	`f`	[GOL]B:707	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`221`	`12.0`	`0.1`	`0.583`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`63`		B	`1`	`1`	`30562`	`◊`	B	-x+1,-y,z	`2_655`	`1`	`1`	`30562`	`7.4`	`-0.2`	`0.255`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
63	`64`		[GOL]A:717	`1`	`1`	`215`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`30562`	`6.1`	`0.3`	`0.668`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
64	`65`		[GOL]B:707	`1`	`1`	`221`	`f`	[SO4]B:703	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`186`	`3.4`	`-0.4`	`0.707`	`0`	`0`	`0`	`0.001`
65	`66`		A	`2`	`2`	`30442`	`◊`	A	-x,-y+1,z	`2_565`	`2`	`2`	`30442`	`2.3`	`0.0`	`0.637`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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