PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=454-G2-GBD)

Interfaces in PDB 5dww crystal.
Space symmetry group: I 2 2 2. Resolution: 2.79 Å

STRUCTURAL INSIGHTS INTO THE QUADRUPLEX-DUPLEX 3' INTERFACE FORMED FROM A TELOMERIC REPEAT - TTLOOP

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`56`	`8`	`1980`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`78`	`13`	`5152`	`558.5`	`3.2`	`0.879`	`17`	`0`	`0`	`0.060`
	`2`		D	`51`	`8`	`1898`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`70`	`11`	`4939`	`535.0`	`1.2`	`0.815`	`19`	`0`	`0`	`0.060`
	`3`		H	`53`	`8`	`1936`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`63`	`11`	`5052`	`524.4`	`1.1`	`0.824`	`14`	`0`	`0`	`0.060`
	*Average:*													`539.3`	`1.9`	`0.840`	`17`	`0`	`0`	`0.060`
2	`4`		F	`50`	`7`	`1772`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`70`	`11`	`5029`	`526.1`	`3.0`	`0.810`	`18`	`0`	`0`	`0.042`
3	`5`		G	`76`	`8`	`5052`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`84`	`8`	`5029`	`470.2`	`15.4`	`0.996`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		C	`80`	`8`	`4939`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`83`	`8`	`5152`	`459.8`	`15.2`	`0.996`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`465.0`	`15.3`	`0.996`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
4	`7`		A	`21`	`3`	`5152`	`◊`	A	-x+2,-y,z	`2_755`	`21`	`3`	`5152`	`162.0`	`-4.1`	`0.464`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
5	`8`		G	`21`	`3`	`5052`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`21`	`3`	`4939`	`158.0`	`-4.1`	`0.481`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
	`9`		G	`22`	`3`	`5052`	`◊`	C	-x+3,-y,z	`2_855`	`21`	`3`	`4939`	`157.5`	`-3.9`	`0.497`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
	*Average:*													`157.7`	`-4.0`	`0.489`	`2`	`0`	`0`	`0.001`
6	`10`		E	`20`	`3`	`5029`	`◊`	A	-x+3,-y,z	`2_855`	`15`	`3`	`5152`	`152.6`	`-5.4`	`0.329`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`11`		C	`17`	`2`	`4939`	`◊`	E	-x+5/2,y-1/2,-z+1/2	`7_745`	`16`	`3`	`5029`	`129.7`	`-2.9`	`0.497`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		H	`19`	`2`	`1936`	`◊`	G	-x+3,y,-z	`3_855`	`16`	`2`	`5052`	`121.3`	`1.9`	`0.761`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		D	`19`	`2`	`1898`	`◊`	C	x,-y,-z	`4_555`	`14`	`2`	`4939`	`105.1`	`0.6`	`0.678`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`113.2`	`1.3`	`0.720`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`14`		A	`14`	`1`	`5152`	`◊`	A	x,-y,-z+1	`4_556`	`14`	`1`	`5152`	`109.5`	`4.2`	`0.912`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		E	`13`	`1`	`5029`	`◊`	E	-x+3,y,-z+1	`3_856`	`13`	`1`	`5029`	`91.4`	`4.5`	`0.932`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`100.4`	`4.3`	`0.922`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`16`		A	`12`	`1`	`5152`	`◊`	G	-x+5/2,y-1/2,-z+1/2	`7_745`	`14`	`2`	`5052`	`101.7`	`-1.2`	`0.546`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`17`		E	`17`	`4`	`5029`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`4`	`5152`	`88.1`	`-2.4`	`0.516`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`18`		G	`10`	`1`	`5052`	`◊`	G	-x+3,y,-z	`3_855`	`10`	`1`	`5052`	`72.3`	`3.4`	`0.897`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		C	`9`	`1`	`4939`	`◊`	C	x,-y,-z	`4_555`	`9`	`1`	`4939`	`65.6`	`3.1`	`0.894`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`69.0`	`3.2`	`0.895`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`20`		[K]A:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`23`	`4`	`4939`	`61.3`	`-33.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.171`
	`21`		[K]A:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`4`	`5152`	`61.1`	`-33.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.171`
	`22`		[K]E:103	`1`	`1`	`216`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`16`	`4`	`5052`	`61.1`	`-36.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.171`
	`23`		[K]E:103	`1`	`1`	`216`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`24`	`4`	`5029`	`60.1`	`-31.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.171`
	*Average:*													`60.9`	`-33.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.171`
14	`24`		[K]A:103	`1`	`1`	`216`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`5152`	`58.3`	`-56.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.481`
	`25`		[K]C:102	`1`	`1`	`216`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`4`	`4939`	`58.1`	`-56.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.481`
	`26`		[K]E:102	`1`	`1`	`216`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`5029`	`58.0`	`-53.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.481`
	`27`		[K]G:102	`1`	`1`	`216`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`3`	`3`	`5052`	`57.1`	`-57.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.481`
	*Average:*													`57.9`	`-55.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.481`
15	`28`		[K]G:102	`1`	`1`	`216`	`f`	[K]G:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`50.0`	`-50.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.414`
16	`29`		B	`7`	`1`	`1980`	`◊`	B	x,-y,-z+1	`4_556`	`7`	`1`	`1980`	`49.6`	`-1.4`	`0.415`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`30`		[K]C:102	`1`	`1`	`216`	`f`	[K]C:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`48.6`	`-48.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.403`
18	`31`		[K]A:103	`1`	`1`	`216`	`f`	[K]A:102	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`48.5`	`-48.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.417`
19	`32`		[K]E:102	`1`	`1`	`216`	`f`	[K]E:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`48.3`	`-48.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.410`
20	`33`		A	`6`	`1`	`5152`	`◊`	A	-x+3,-y,z	`2_855`	`6`	`1`	`5152`	`45.3`	`-2.4`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`34`		B	`6`	`1`	`1980`	`◊`	A	x,-y,-z+1	`4_556`	`5`	`3`	`5152`	`43.3`	`-1.1`	`0.427`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`35`		C	`12`	`4`	`4939`	`◊`	C	-x+2,-y,z	`2_755`	`12`	`4`	`4939`	`41.5`	`-2.3`	`0.488`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`36`		[K]E:102	`1`	`1`	`216`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`14`	`4`	`5052`	`41.2`	`-16.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.070`
	`37`		[K]A:103	`1`	`1`	`216`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`4939`	`35.7`	`-13.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.070`
	`38`		[K]C:102	`1`	`1`	`216`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`5152`	`34.8`	`-12.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.070`
	`39`		[K]G:102	`1`	`1`	`216`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`5029`	`30.7`	`-11.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.070`
	*Average:*													`35.6`	`-13.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.070`
24	`40`		[K]C:102	`1`	`1`	`216`	`◊`	[K]A:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`32.6`	`-32.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.083`
25	`41`		[K]G:102	`1`	`1`	`216`	`◊`	[K]E:103	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`32.4`	`-32.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.082`
26	`42`		[K]E:103	`1`	`1`	`216`	`◊`	[K]E:102	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`32.0`	`-32.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
27	`43`		[K]A:103	`1`	`1`	`216`	`◊`	[K]A:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`31.9`	`-31.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.081`
28	`44`		[K]E:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1772`	`19.5`	`-10.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.089`
29	`45`		F	`3`	`1`	`1772`	`◊`	E	-x+3,y,-z+1	`3_856`	`4`	`1`	`5029`	`18.4`	`0.8`	`0.620`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`46`		[K]G:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1936`	`17.1`	`-8.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
	`47`		[K]C:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1898`	`16.0`	`-8.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
	`48`		[K]A:102	`1`	`1`	`216`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1980`	`15.0`	`-7.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
	*Average:*													`16.1`	`-8.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.072`
31	`49`		[K]G:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	[K]E:103	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`16.2`	`-16.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
32	`50`		[K]C:101	`1`	`1`	`216`	`◊`	[K]A:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`14.7`	`-14.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
33	`51`		[K]A:102	`1`	`1`	`216`	`◊`	[K]A:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`14.6`	`-14.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
34	`52`		[K]E:103	`1`	`1`	`216`	`◊`	[K]E:101	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`14.6`	`-14.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.037`
35	`53`		[K]G:102	`1`	`1`	`216`	`◊`	[K]E:102	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`11.0`	`-11.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
36	`54`		[K]C:102	`1`	`1`	`216`	`◊`	[K]A:103	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`216`	`10.7`	`-10.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
37	`55`		D	`1`	`1`	`1898`	`◊`	D	x,-y,-z	`4_555`	`1`	`1`	`1898`	`3.9`	`-0.4`	`0.203`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		H	`1`	`1`	`1936`	`◊`	H	-x+3,y,-z	`3_855`	`1`	`1`	`1936`	`0.4`	`-0.0`	`0.301`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`2.1`	`-0.2`	`0.252`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`57`		E	`1`	`1`	`5029`	`◊`	E	-x+3,-y,z	`2_855`	`1`	`1`	`5029`	`0.2`	`-0.0`	`0.308`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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